MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 1558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	254555170
2	NC_012984	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	254555173
3	NC_012984	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	254555174
4	NC_012984	TTAAC	2	10	10055	10064	40 %	40 %	0 %	20 %	254555176
5	NC_012984	TCGTA	2	10	11484	11493	20 %	40 %	20 %	20 %	254555179
6	NC_012984	GACCA	2	10	11556	11565	40 %	0 %	20 %	40 %	254555179
7	NC_012984	GCTGA	2	10	11772	11781	20 %	20 %	40 %	20 %	254555179
8	NC_012984	ATCGT	2	10	16381	16390	20 %	40 %	20 %	20 %	254555182
9	NC_012984	AAAAC	2	10	18797	18806	80 %	0 %	0 %	20 %	254555184
10	NC_012984	TTCAC	2	10	22487	22496	20 %	40 %	0 %	40 %	254555186
11	NC_012984	GGCGT	2	10	27641	27650	0 %	20 %	60 %	20 %	254555190
12	NC_012984	TCAAA	2	10	30110	30119	60 %	20 %	0 %	20 %	254555191
13	NC_012984	TCCGC	2	10	32149	32158	0 %	20 %	20 %	60 %	254555192
14	NC_012984	CGCAC	2	10	33480	33489	20 %	0 %	20 %	60 %	254555193
15	NC_012984	TGATT	2	10	33843	33852	20 %	60 %	20 %	0 %	254555193
16	NC_012984	TTAGT	2	10	34007	34016	20 %	60 %	20 %	0 %	254555194
17	NC_012984	CCATA	2	10	35703	35712	40 %	20 %	0 %	40 %	254555195
18	NC_012984	GAAAC	2	10	36110	36119	60 %	0 %	20 %	20 %	254555195
19	NC_012984	ACTGG	2	10	36238	36247	20 %	20 %	40 %	20 %	254555195
20	NC_012984	GGTTT	2	10	38492	38501	0 %	60 %	40 %	0 %	254555197
21	NC_012984	TCAAG	2	10	44789	44798	40 %	20 %	20 %	20 %	254555206
22	NC_012984	TGGTG	2	10	45251	45260	0 %	40 %	60 %	0 %	254555208
23	NC_012984	AGACT	2	10	45811	45820	40 %	20 %	20 %	20 %	254555209
24	NC_012984	TATTT	2	10	49559	49568	20 %	80 %	0 %	0 %	254555213
25	NC_012984	ATTAT	2	10	53830	53839	40 %	60 %	0 %	0 %	254555217
26	NC_012984	TTAAA	2	10	53932	53941	60 %	40 %	0 %	0 %	254555217
27	NC_012984	TGATT	2	10	55340	55349	20 %	60 %	20 %	0 %	254555220
28	NC_012984	TGATT	2	10	56901	56910	20 %	60 %	20 %	0 %	254555221
29	NC_012984	GTATG	2	10	60568	60577	20 %	40 %	40 %	0 %	254555224
30	NC_012984	ATGTC	2	10	60646	60655	20 %	40 %	20 %	20 %	254555224
31	NC_012984	TATTT	2	10	63644	63653	20 %	80 %	0 %	0 %	254555227
32	NC_012984	TGCGG	2	10	67289	67298	0 %	20 %	60 %	20 %	254555231
33	NC_012984	GATTG	2	10	68158	68167	20 %	40 %	40 %	0 %	254555233
34	NC_012984	GCACG	2	10	70683	70692	20 %	0 %	40 %	40 %	254555234
35	NC_012984	TTACA	2	10	72620	72629	40 %	40 %	0 %	20 %	254555235
36	NC_012984	GGCAA	2	10	73433	73442	40 %	0 %	40 %	20 %	254555236
37	NC_012984	GACCT	2	10	74940	74949	20 %	20 %	20 %	40 %	254555238
38	NC_012984	GATCA	2	10	75111	75120	40 %	20 %	20 %	20 %	254555238
39	NC_012984	GCTTG	2	10	80431	80440	0 %	40 %	40 %	20 %	254555244
40	NC_012984	ACTTC	2	10	80559	80568	20 %	40 %	0 %	40 %	254555244
41	NC_012984	AACGG	2	10	80776	80785	40 %	0 %	40 %	20 %	254555245
42	NC_012984	GTTAA	2	10	80809	80818	40 %	40 %	20 %	0 %	254555245
43	NC_012984	GCTTA	2	10	82785	82794	20 %	40 %	20 %	20 %	254555246
44	NC_012984	TTGAC	2	10	83034	83043	20 %	40 %	20 %	20 %	254555246
45	NC_012984	ATGCC	2	10	87559	87568	20 %	20 %	20 %	40 %	254555251
46	NC_012984	AAAGC	2	10	96272	96281	60 %	0 %	20 %	20 %	254555261
47	NC_012984	GTTAG	2	10	96398	96407	20 %	40 %	40 %	0 %	254555261
48	NC_012984	CTAAG	2	10	96828	96837	40 %	20 %	20 %	20 %	254555261
49	NC_012984	AGGTG	2	10	100189	100198	20 %	20 %	60 %	0 %	254555264
50	NC_012984	TTGAA	2	10	100843	100852	40 %	40 %	20 %	0 %	254555265
51	NC_012984	GGGGC	2	10	103454	103463	0 %	0 %	80 %	20 %	254555267
52	NC_012984	GCACG	2	10	104703	104712	20 %	0 %	40 %	40 %	254555268
53	NC_012984	TGATT	2	10	110029	110038	20 %	60 %	20 %	0 %	254555274
54	NC_012984	TGGGA	2	10	112715	112724	20 %	20 %	60 %	0 %	254555278
55	NC_012984	TAAGC	2	10	114257	114266	40 %	20 %	20 %	20 %	254555281
56	NC_012984	GATCA	2	10	114304	114313	40 %	20 %	20 %	20 %	254555281
57	NC_012984	TTGAT	2	10	116028	116037	20 %	60 %	20 %	0 %	254555282
58	NC_012984	CACGT	2	10	116209	116218	20 %	20 %	20 %	40 %	254555283
59	NC_012984	GATTT	2	10	116410	116419	20 %	60 %	20 %	0 %	254555283
60	NC_012984	GGCGG	2	10	116457	116466	0 %	0 %	80 %	20 %	254555283
61	NC_012984	CACGG	2	10	116751	116760	20 %	0 %	40 %	40 %	254555283
62	NC_012984	TTCAT	2	10	119408	119417	20 %	60 %	0 %	20 %	254555286
63	NC_012984	GGTTA	2	10	121554	121563	20 %	40 %	40 %	0 %	254555288
64	NC_012984	ATTGA	2	10	122888	122897	40 %	40 %	20 %	0 %	254555289
65	NC_012984	ACCGT	2	10	125057	125066	20 %	20 %	20 %	40 %	254555291
66	NC_012984	TCATT	2	10	127096	127105	20 %	60 %	0 %	20 %	254555292
67	NC_012984	TTCGA	2	10	132218	132227	20 %	40 %	20 %	20 %	254555299
68	NC_012984	ATGTT	2	10	132384	132393	20 %	60 %	20 %	0 %	254555299
69	NC_012984	GGCGT	2	10	134222	134231	0 %	20 %	60 %	20 %	254555301
70	NC_012984	CATGC	2	10	135406	135415	20 %	20 %	20 %	40 %	254555302
71	NC_012984	CAACC	2	10	135669	135678	40 %	0 %	0 %	60 %	254555302
72	NC_012984	ATCAA	2	10	136272	136281	60 %	20 %	0 %	20 %	254555303
73	NC_012984	CTTGG	2	10	136489	136498	0 %	40 %	40 %	20 %	254555303
74	NC_012984	TAATC	2	10	142408	142417	40 %	40 %	0 %	20 %	254555308
75	NC_012984	CGGTG	2	10	142613	142622	0 %	20 %	60 %	20 %	254555308
76	NC_012984	TCGAT	2	10	143606	143615	20 %	40 %	20 %	20 %	254555309
77	NC_012984	AAATT	2	10	143897	143906	60 %	40 %	0 %	0 %	254555309
78	NC_012984	GAGGT	2	10	145125	145134	20 %	20 %	60 %	0 %	254555310
79	NC_012984	GTACC	2	10	145690	145699	20 %	20 %	20 %	40 %	254555310
80	NC_012984	GAATT	2	10	146501	146510	40 %	40 %	20 %	0 %	254555311
81	NC_012984	AATCA	2	10	149681	149690	60 %	20 %	0 %	20 %	254555316
82	NC_012984	CGGAG	2	10	150610	150619	20 %	0 %	60 %	20 %	254555317
83	NC_012984	TAAAC	2	10	152338	152347	60 %	20 %	0 %	20 %	254555319
84	NC_012984	ATGAA	2	10	154901	154910	60 %	20 %	20 %	0 %	254555321
85	NC_012984	GGAAT	2	10	155411	155420	40 %	20 %	40 %	0 %	254555322
86	NC_012984	ATTAA	2	10	156946	156955	60 %	40 %	0 %	0 %	254555322
87	NC_012984	TGACG	2	10	158172	158181	20 %	20 %	40 %	20 %	254555324
88	NC_012984	TCACC	2	10	159774	159783	20 %	20 %	0 %	60 %	254555326
89	NC_012984	AACTA	2	10	160724	160733	60 %	20 %	0 %	20 %	254555327
90	NC_012984	GCAAA	2	10	160815	160824	60 %	0 %	20 %	20 %	254555327
91	NC_012984	ACCGA	2	10	160998	161007	40 %	0 %	20 %	40 %	254555327
92	NC_012984	TTTTA	2	10	162735	162744	20 %	80 %	0 %	0 %	254555330
93	NC_012984	TATCT	2	10	164668	164677	20 %	60 %	0 %	20 %	254555332
94	NC_012984	CAACG	2	10	166674	166683	40 %	0 %	20 %	40 %	254555333
95	NC_012984	ATTGG	3	15	168172	168186	20 %	40 %	40 %	0 %	254555334
96	NC_012984	AAAAC	2	10	169900	169909	80 %	0 %	0 %	20 %	254555336
97	NC_012984	TCCGG	2	10	169919	169928	0 %	20 %	40 %	40 %	254555336
98	NC_012984	TTAAC	2	10	170536	170545	40 %	40 %	0 %	20 %	254555336
99	NC_012984	GTTGT	2	10	170649	170658	0 %	60 %	40 %	0 %	254555336
100	NC_012984	AGGTC	2	10	171902	171911	20 %	20 %	40 %	20 %	254555337
101	NC_012984	GATCG	2	10	172787	172796	20 %	20 %	40 %	20 %	254555338
102	NC_012984	TTCGT	2	10	185402	185411	0 %	60 %	20 %	20 %	254555345
103	NC_012984	TCTGG	2	10	185585	185594	0 %	40 %	40 %	20 %	254555345
104	NC_012984	GGTTA	2	10	190026	190035	20 %	40 %	40 %	0 %	254555348
105	NC_012984	AACTG	2	10	191732	191741	40 %	20 %	20 %	20 %	254555349
106	NC_012984	GGCGT	2	10	199453	199462	0 %	20 %	60 %	20 %	254555353
107	NC_012984	TGTGA	2	10	199552	199561	20 %	40 %	40 %	0 %	254555353
108	NC_012984	TTTGG	2	10	200612	200621	0 %	60 %	40 %	0 %	254555354
109	NC_012984	ATCTG	2	10	202483	202492	20 %	40 %	20 %	20 %	254555355
110	NC_012984	AACCC	2	10	212973	212982	40 %	0 %	0 %	60 %	254555368
111	NC_012984	TCCAA	2	10	215298	215307	40 %	20 %	0 %	40 %	254555370
112	NC_012984	AGGAC	2	10	215445	215454	40 %	0 %	40 %	20 %	254555370
113	NC_012984	AGTTG	2	10	216182	216191	20 %	40 %	40 %	0 %	254555371
114	NC_012984	TTGTG	2	10	216460	216469	0 %	60 %	40 %	0 %	254555371
115	NC_012984	ACTTG	2	10	218288	218297	20 %	40 %	20 %	20 %	254555373
116	NC_012984	TACGT	2	10	218785	218794	20 %	40 %	20 %	20 %	254555374
117	NC_012984	AAAAT	2	10	220978	220987	80 %	20 %	0 %	0 %	254555376
118	NC_012984	CTTTG	2	10	223748	223757	0 %	60 %	20 %	20 %	254555380
119	NC_012984	ACCAT	2	10	227002	227011	40 %	20 %	0 %	40 %	254555382
120	NC_012984	ATGCA	2	10	232202	232211	40 %	20 %	20 %	20 %	254555385
121	NC_012984	GGCGC	2	10	237750	237759	0 %	0 %	60 %	40 %	254555393
122	NC_012984	AGCGC	2	10	241829	241838	20 %	0 %	40 %	40 %	254555397
123	NC_012984	TCTAT	2	10	244465	244474	20 %	60 %	0 %	20 %	254555400
124	NC_012984	GGTCA	2	10	248815	248824	20 %	20 %	40 %	20 %	254555405
125	NC_012984	GTGAC	2	10	249104	249113	20 %	20 %	40 %	20 %	254555405
126	NC_012984	TAATT	2	10	249525	249534	40 %	60 %	0 %	0 %	254555405
127	NC_012984	GTGAC	2	10	254595	254604	20 %	20 %	40 %	20 %	254555409
128	NC_012984	ACAAT	2	10	255329	255338	60 %	20 %	0 %	20 %	254555410
129	NC_012984	TAAAG	2	10	260963	260972	60 %	20 %	20 %	0 %	254555416
130	NC_012984	TAAGA	2	10	262805	262814	60 %	20 %	20 %	0 %	254555418
131	NC_012984	CTGGC	2	10	264803	264812	0 %	20 %	40 %	40 %	254555421
132	NC_012984	CCGTT	2	10	266505	266514	0 %	40 %	20 %	40 %	254555422
133	NC_012984	AACGG	2	10	267528	267537	40 %	0 %	40 %	20 %	254555424
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