MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 51936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012984	ATA	2	6	181196	181201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555343
3002	NC_012984	TGT	2	6	181212	181217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3003	NC_012984	GT	3	6	181229	181234	0 %	50 %	50 %	0 %	254555343
3004	NC_012984	AAT	2	6	181276	181281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555343
3005	NC_012984	AGT	2	6	181313	181318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555343
3006	NC_012984	CAG	2	6	181336	181341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555343
3007	NC_012984	TGG	2	6	181365	181370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555343
3008	NC_012984	TGT	2	6	181419	181424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3009	NC_012984	GCTG	2	8	181432	181439	0 %	25 %	50 %	25 %	254555343
3010	NC_012984	GTG	2	6	181443	181448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555343
3011	NC_012984	GAT	3	9	181486	181494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555343
3012	NC_012984	TTG	2	6	181499	181504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3013	NC_012984	CGT	2	6	181597	181602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555343
3014	NC_012984	TGG	2	6	181629	181634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555343
3015	NC_012984	GGC	2	6	181876	181881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555343
3016	NC_012984	TAG	2	6	182173	182178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555343
3017	NC_012984	ATGA	2	8	182279	182286	50 %	25 %	25 %	0 %	254555343
3018	NC_012984	GTT	2	6	182292	182297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3019	NC_012984	GT	3	6	182304	182309	0 %	50 %	50 %	0 %	254555343
3020	NC_012984	GGTG	2	8	182318	182325	0 %	25 %	75 %	0 %	254555343
3021	NC_012984	ATTG	2	8	182392	182399	25 %	50 %	25 %	0 %	254555343
3022	NC_012984	TAA	2	6	182410	182415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555343
3023	NC_012984	GCTG	2	8	182421	182428	0 %	25 %	50 %	25 %	254555343
3024	NC_012984	CAC	2	6	182437	182442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555343
3025	NC_012984	GTT	2	6	182551	182556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3026	NC_012984	GATT	2	8	182641	182648	25 %	50 %	25 %	0 %	254555343
3027	NC_012984	AGC	2	6	182712	182717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3028	NC_012984	AGCT	2	8	182723	182730	25 %	25 %	25 %	25 %	254555344
3029	NC_012984	TCAG	2	8	182737	182744	25 %	25 %	25 %	25 %	254555344
3030	NC_012984	GAC	2	6	182820	182825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3031	NC_012984	TGA	2	6	182896	182901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3032	NC_012984	TAG	2	6	182924	182929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3033	NC_012984	CAG	2	6	182990	182995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3034	NC_012984	ATG	2	6	183015	183020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3035	NC_012984	TGA	2	6	183038	183043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3036	NC_012984	CGA	2	6	183059	183064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3037	NC_012984	GCG	2	6	183088	183093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555344
3038	NC_012984	TCA	2	6	183181	183186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555344
3039	NC_012984	TGA	2	6	183194	183199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3040	NC_012984	CGA	3	9	183284	183292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3041	NC_012984	GAA	2	6	183520	183525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555344
3042	NC_012984	GGC	2	6	183576	183581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555344
3043	NC_012984	TGG	2	6	183682	183687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555344
3044	NC_012984	TA	3	6	183755	183760	50 %	50 %	0 %	0 %	254555344
3045	NC_012984	CTA	2	6	183764	183769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555344
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3047	NC_012984	CGA	2	6	183812	183817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3048	NC_012984	TGA	2	6	183839	183844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
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3050	NC_012984	CAA	2	6	184217	184222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555344
3051	NC_012984	GTT	2	6	184260	184265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555344
3052	NC_012984	CTT	2	6	184403	184408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555344
3053	NC_012984	AAT	2	6	184464	184469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555344
3054	NC_012984	CGT	2	6	184514	184519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3055	NC_012984	TTG	2	6	184530	184535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555344
3056	NC_012984	TGA	2	6	184556	184561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3057	NC_012984	GCG	2	6	184588	184593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555344
3058	NC_012984	TGT	2	6	184601	184606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555344
3059	NC_012984	CTT	2	6	184640	184645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555344
3060	NC_012984	GAT	2	6	184646	184651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3061	NC_012984	ATA	2	6	184654	184659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555344
3062	NC_012984	CAT	2	6	185016	185021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555345
3063	NC_012984	TGG	2	6	185161	185166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555345
3064	NC_012984	ATG	2	6	185173	185178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555345
3065	NC_012984	TGA	2	6	185249	185254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555345
3066	NC_012984	TTAT	2	8	185259	185266	25 %	75 %	0 %	0 %	254555345
3067	NC_012984	TGGA	2	8	185328	185335	25 %	25 %	50 %	0 %	254555345
3068	NC_012984	TTCGT	2	10	185402	185411	0 %	60 %	20 %	20 %	254555345
3069	NC_012984	CTA	2	6	185441	185446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555345
3070	NC_012984	GAC	2	6	185465	185470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555345
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3072	NC_012984	TCTGG	2	10	185585	185594	0 %	40 %	40 %	20 %	254555345
3073	NC_012984	AAC	2	6	185642	185647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555345
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3076	NC_012984	CG	3	6	185799	185804	0 %	0 %	50 %	50 %	254555345
3077	NC_012984	GAT	2	6	185940	185945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555345
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3079	NC_012984	CAG	2	6	186072	186077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555345
3080	NC_012984	TGAT	2	8	186127	186134	25 %	50 %	25 %	0 %	254555345
3081	NC_012984	CGG	2	6	186135	186140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555345
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3084	NC_012984	ATG	2	6	186413	186418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555345
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3088	NC_012984	A	6	6	186644	186649	100 %	0 %	0 %	0 %	254555346
3089	NC_012984	GAT	2	6	186694	186699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555346
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3092	NC_012984	GAA	2	6	186784	186789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555346
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3094	NC_012984	ATT	2	6	186811	186816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555346
3095	NC_012984	G	6	6	186873	186878	0 %	0 %	100 %	0 %	254555346
3096	NC_012984	GAT	2	6	187059	187064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555346
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3100	NC_012984	TGA	2	6	187116	187121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555346
3101	NC_012984	CG	3	6	187149	187154	0 %	0 %	50 %	50 %	254555346
3102	NC_012984	GTT	2	6	187189	187194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555346
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3105	NC_012984	AAC	2	6	187250	187255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555346
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3107	NC_012984	TCA	2	6	187355	187360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555346
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3110	NC_012984	CAA	2	6	187422	187427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555347
3111	NC_012984	ATG	2	6	187474	187479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555347
3112	NC_012984	ACT	2	6	187516	187521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555347
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3118	NC_012984	TCA	2	6	187687	187692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555347
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3241	NC_012984	CGG	2	6	196167	196172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555352
3242	NC_012984	CCACTG	2	12	196182	196193	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254555352
3243	NC_012984	ACG	2	6	196196	196201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555352
3244	NC_012984	GTG	2	6	196235	196240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555352
3245	NC_012984	AGCAGT	9	54	196256	196309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254555352
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3248	NC_012984	TCA	2	6	196379	196384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555352
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3252	NC_012984	AAC	2	6	196532	196537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555352
3253	NC_012984	AGCA	2	8	196539	196546	50 %	0 %	25 %	25 %	254555352
3254	NC_012984	CAA	2	6	196562	196567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555352
3255	NC_012984	GTG	2	6	196584	196589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555352
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3259	NC_012984	GAT	2	6	196838	196843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555352
3260	NC_012984	CTG	2	6	196854	196859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555352
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3264	NC_012984	ATT	2	6	197004	197009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555352
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3277	NC_012984	CAGT	2	8	197663	197670	25 %	25 %	25 %	25 %	254555352
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3347	NC_012984	GTGATA	2	12	203930	203941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555356
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3360	NC_012984	GC	3	6	204616	204621	0 %	0 %	50 %	50 %	254555357
3361	NC_012984	TG	3	6	204626	204631	0 %	50 %	50 %	0 %	254555357
3362	NC_012984	GCC	2	6	204661	204666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555357
3363	NC_012984	TTGG	2	8	204694	204701	0 %	50 %	50 %	0 %	254555357
3364	NC_012984	GTA	2	6	204727	204732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555357
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3366	NC_012984	AAT	2	6	204806	204811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555357
3367	NC_012984	GGC	2	6	204829	204834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555357
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3372	NC_012984	TGC	2	6	205018	205023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555357
3373	NC_012984	GAT	2	6	205204	205209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555357
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3377	NC_012984	GATT	2	8	205394	205401	25 %	50 %	25 %	0 %	254555357
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3385	NC_012984	TGA	2	6	206043	206048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555358
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3393	NC_012984	ATG	2	6	206480	206485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555358
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3452	NC_012984	TCA	2	6	210958	210963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555364
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3459	NC_012984	CAAG	2	8	211218	211225	50 %	0 %	25 %	25 %	254555364
3460	NC_012984	ACCG	2	8	211335	211342	25 %	0 %	25 %	50 %	254555364
3461	NC_012984	AATG	2	8	211392	211399	50 %	25 %	25 %	0 %	254555364
3462	NC_012984	CTG	2	6	211501	211506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555364
3463	NC_012984	A	6	6	211575	211580	100 %	0 %	0 %	0 %	254555364
3464	NC_012984	CG	4	8	211640	211647	0 %	0 %	50 %	50 %	254555364
3465	NC_012984	GAT	2	6	211699	211704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555364
3466	NC_012984	ATG	3	9	211717	211725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555364
3467	NC_012984	GTT	2	6	211743	211748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555364
3468	NC_012984	AAG	2	6	211793	211798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555364
3469	NC_012984	GCGG	2	8	211906	211913	0 %	0 %	75 %	25 %	254555364
3470	NC_012984	ATT	2	6	211948	211953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555364
3471	NC_012984	AAG	2	6	212009	212014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555364
3472	NC_012984	TCA	2	6	212018	212023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555364
3473	NC_012984	GAA	2	6	212068	212073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555364
3474	NC_012984	GCG	2	6	212095	212100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555364
3475	NC_012984	ATG	2	6	212185	212190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555365
3476	NC_012984	AGG	2	6	212200	212205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555365
3477	NC_012984	CT	3	6	212210	212215	0 %	50 %	0 %	50 %	254555365
3478	NC_012984	GAT	2	6	212230	212235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555365
3479	NC_012984	ATTG	2	8	212242	212249	25 %	50 %	25 %	0 %	254555365
3480	NC_012984	TGATTG	2	12	212322	212333	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254555365
3481	NC_012984	GTT	2	6	212335	212340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555365
3482	NC_012984	TTTA	2	8	212341	212348	25 %	75 %	0 %	0 %	254555365
3483	NC_012984	TCG	2	6	212373	212378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555365
3484	NC_012984	ATT	2	6	212398	212403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555365
3485	NC_012984	CCA	2	6	212412	212417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555365
3486	NC_012984	CGA	2	6	212599	212604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555367
3487	NC_012984	TGG	2	6	212640	212645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555367
3488	NC_012984	TTG	2	6	212677	212682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555367
3489	NC_012984	ATAA	2	8	212790	212797	75 %	25 %	0 %	0 %	254555367
3490	NC_012984	ATG	2	6	212844	212849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555367
3491	NC_012984	TCC	2	6	212918	212923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254555368
3492	NC_012984	AACCC	2	10	212973	212982	40 %	0 %	0 %	60 %	254555368
3493	NC_012984	AGC	2	6	212989	212994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555368
3494	NC_012984	AGT	2	6	213067	213072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555368
3495	NC_012984	ACC	3	9	213247	213255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555368
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3497	NC_012984	TGG	2	6	213776	213781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555369
3498	NC_012984	GTG	2	6	213830	213835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555369
3499	NC_012984	CAA	2	6	213881	213886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555369
3500	NC_012984	TTA	2	6	213941	213946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555369

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