MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 51936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012984	TCG	2	6	29170	29175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555191
502	NC_012984	ACC	2	6	29225	29230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555191
503	NC_012984	TTC	2	6	29243	29248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555191
504	NC_012984	CAA	2	6	29319	29324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555191
505	NC_012984	TCT	2	6	29352	29357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555191
506	NC_012984	CGTG	2	8	29375	29382	0 %	25 %	50 %	25 %	254555191
507	NC_012984	GAT	2	6	29474	29479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555191
508	NC_012984	ACG	2	6	29532	29537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555191
509	NC_012984	ATT	2	6	29634	29639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555191
510	NC_012984	AAC	2	6	29665	29670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555191
511	NC_012984	CCTA	2	8	29740	29747	25 %	25 %	0 %	50 %	254555191
512	NC_012984	TAA	3	9	29852	29860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555191
513	NC_012984	CGG	2	6	29880	29885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555191
514	NC_012984	AACC	2	8	29901	29908	50 %	0 %	0 %	50 %	254555191
515	NC_012984	ATTG	2	8	29918	29925	25 %	50 %	25 %	0 %	254555191
516	NC_012984	GGC	3	9	29947	29955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555191
517	NC_012984	TTA	2	6	29964	29969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555191
518	NC_012984	CAA	2	6	29988	29993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555191
519	NC_012984	GAT	2	6	29994	29999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555191
520	NC_012984	CAAG	2	8	30038	30045	50 %	0 %	25 %	25 %	254555191
521	NC_012984	TCAAA	2	10	30110	30119	60 %	20 %	0 %	20 %	254555191
522	NC_012984	ATC	2	6	30190	30195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555191
523	NC_012984	GGC	2	6	30239	30244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555191
524	NC_012984	GTC	2	6	30288	30293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555191
525	NC_012984	CGC	2	6	30389	30394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555191
526	NC_012984	AAG	2	6	30427	30432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555191
527	NC_012984	GCG	2	6	30519	30524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555191
528	NC_012984	CGC	2	6	30599	30604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555191
529	NC_012984	TGAT	2	8	30652	30659	25 %	50 %	25 %	0 %	254555191
530	NC_012984	ATG	2	6	30721	30726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555191
531	NC_012984	CAA	2	6	30765	30770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555191
532	NC_012984	CAG	2	6	30771	30776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555191
533	NC_012984	CAA	2	6	30810	30815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555191
534	NC_012984	ACGA	2	8	30904	30911	50 %	0 %	25 %	25 %	254555191
535	NC_012984	GATT	2	8	31054	31061	25 %	50 %	25 %	0 %	254555192
536	NC_012984	ATG	2	6	31074	31079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555192
537	NC_012984	GAT	2	6	31088	31093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555192
538	NC_012984	CTA	2	6	31174	31179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555192
539	NC_012984	ACG	2	6	31193	31198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555192
540	NC_012984	TTA	2	6	31210	31215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555192
541	NC_012984	TGG	2	6	31228	31233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555192
542	NC_012984	TGG	2	6	31237	31242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555192
543	NC_012984	TTG	2	6	31356	31361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555192
544	NC_012984	AAT	2	6	31370	31375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555192
545	NC_012984	TTTA	2	8	31418	31425	25 %	75 %	0 %	0 %	254555192
546	NC_012984	CGTG	2	8	31453	31460	0 %	25 %	50 %	25 %	254555192
547	NC_012984	GGT	2	6	31496	31501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555192
548	NC_012984	ATT	2	6	31556	31561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555192
549	NC_012984	CAG	2	6	31585	31590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555192
550	NC_012984	ATC	2	6	31593	31598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555192
551	NC_012984	GTC	2	6	31634	31639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555192
552	NC_012984	TAC	2	6	31802	31807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555192
553	NC_012984	CATT	3	12	31818	31829	25 %	50 %	0 %	25 %	254555192
554	NC_012984	TGG	2	6	31850	31855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555192
555	NC_012984	ATT	2	6	31938	31943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555192
556	NC_012984	TGGC	2	8	31963	31970	0 %	25 %	50 %	25 %	254555192
557	NC_012984	GGA	2	6	32068	32073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555192
558	NC_012984	ACT	2	6	32109	32114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555192
559	NC_012984	GCG	2	6	32121	32126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555192
560	NC_012984	TCCGC	2	10	32149	32158	0 %	20 %	20 %	60 %	254555192
561	NC_012984	ATT	2	6	32165	32170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555192
562	NC_012984	TGG	2	6	32204	32209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555192
563	NC_012984	ACG	2	6	32246	32251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555192
564	NC_012984	ACT	2	6	32347	32352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555192
565	NC_012984	TGA	2	6	32389	32394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555192
566	NC_012984	TGA	2	6	32400	32405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555192
567	NC_012984	G	7	7	32407	32413	0 %	0 %	100 %	0 %	254555192
568	NC_012984	ACT	2	6	32615	32620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555192
569	NC_012984	GTG	2	6	32658	32663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555192
570	NC_012984	GTG	2	6	32718	32723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555192
571	NC_012984	AGT	2	6	33099	33104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555193
572	NC_012984	T	6	6	33106	33111	0 %	100 %	0 %	0 %	254555193
573	NC_012984	TGGA	2	8	33116	33123	25 %	25 %	50 %	0 %	254555193
574	NC_012984	CAG	2	6	33156	33161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555193
575	NC_012984	TGA	2	6	33245	33250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555193
576	NC_012984	ACG	2	6	33253	33258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555193
577	NC_012984	TTA	2	6	33393	33398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555193
578	NC_012984	TAA	2	6	33399	33404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555193
579	NC_012984	CAGA	2	8	33462	33469	50 %	0 %	25 %	25 %	254555193
580	NC_012984	CGCAC	2	10	33480	33489	20 %	0 %	20 %	60 %	254555193
581	NC_012984	GCG	2	6	33541	33546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555193
582	NC_012984	TAA	2	6	33588	33593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555193
583	NC_012984	CG	3	6	33783	33788	0 %	0 %	50 %	50 %	254555193
584	NC_012984	ACA	2	6	33803	33808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555193
585	NC_012984	CGG	2	6	33813	33818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555193
586	NC_012984	TGATT	2	10	33843	33852	20 %	60 %	20 %	0 %	254555193
587	NC_012984	TTAGT	2	10	34007	34016	20 %	60 %	20 %	0 %	254555194
588	NC_012984	GCC	2	6	34071	34076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555194
589	NC_012984	GCC	2	6	34143	34148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555194
590	NC_012984	AGT	2	6	34267	34272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555194
591	NC_012984	T	6	6	34308	34313	0 %	100 %	0 %	0 %	254555194
592	NC_012984	AGCC	2	8	34339	34346	25 %	0 %	25 %	50 %	254555194
593	NC_012984	GTT	2	6	34347	34352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555194
594	NC_012984	AAT	2	6	34420	34425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555194
595	NC_012984	TAGC	2	8	34441	34448	25 %	25 %	25 %	25 %	254555194
596	NC_012984	ATCC	2	8	34514	34521	25 %	25 %	0 %	50 %	254555194
597	NC_012984	TGC	2	6	34661	34666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555194
598	NC_012984	TGA	2	6	34799	34804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555195
599	NC_012984	GTC	2	6	34931	34936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555195
600	NC_012984	CA	3	6	34950	34955	50 %	0 %	0 %	50 %	254555195
601	NC_012984	GTC	2	6	34982	34987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555195
602	NC_012984	CAT	2	6	35043	35048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555195
603	NC_012984	CGT	2	6	35049	35054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555195
604	NC_012984	GA	3	6	35093	35098	50 %	0 %	50 %	0 %	254555195
605	NC_012984	GC	3	6	35116	35121	0 %	0 %	50 %	50 %	254555195
606	NC_012984	T	6	6	35175	35180	0 %	100 %	0 %	0 %	254555195
607	NC_012984	AAT	2	6	35182	35187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555195
608	NC_012984	CGA	2	6	35387	35392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555195
609	NC_012984	TGA	2	6	35411	35416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555195
610	NC_012984	TCG	2	6	35421	35426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555195
611	NC_012984	AGC	2	6	35482	35487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555195
612	NC_012984	GTG	2	6	35510	35515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555195
613	NC_012984	ATT	2	6	35557	35562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555195
614	NC_012984	CGAT	2	8	35685	35692	25 %	25 %	25 %	25 %	254555195
615	NC_012984	CCATA	2	10	35703	35712	40 %	20 %	0 %	40 %	254555195
616	NC_012984	GTA	2	6	35746	35751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555195
617	NC_012984	TAT	2	6	35802	35807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555195
618	NC_012984	AGTG	2	8	35838	35845	25 %	25 %	50 %	0 %	254555195
619	NC_012984	TCA	2	6	35858	35863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555195
620	NC_012984	GTT	2	6	35964	35969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555195
621	NC_012984	CGGT	2	8	35980	35987	0 %	25 %	50 %	25 %	254555195
622	NC_012984	GAAAC	2	10	36110	36119	60 %	0 %	20 %	20 %	254555195
623	NC_012984	GC	3	6	36185	36190	0 %	0 %	50 %	50 %	254555195
624	NC_012984	ACTGG	2	10	36238	36247	20 %	20 %	40 %	20 %	254555195
625	NC_012984	GAC	2	6	36307	36312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555195
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627	NC_012984	TAGT	2	8	36426	36433	25 %	50 %	25 %	0 %	254555195
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745	NC_012984	TCAAG	2	10	44789	44798	40 %	20 %	20 %	20 %	254555206
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751	NC_012984	GAA	2	6	45136	45141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555208
752	NC_012984	CAA	2	6	45224	45229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555208
753	NC_012984	TGGTG	2	10	45251	45260	0 %	40 %	60 %	0 %	254555208
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