MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 1074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012488	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222644
2	NC_012488	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226222645
3	NC_012488	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222645
4	NC_012488	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222645
5	NC_012488	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226222646
6	NC_012488	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226222647
7	NC_012488	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226222650
8	NC_012488	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222650
9	NC_012488	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	226222652
10	NC_012488	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222652
11	NC_012488	ATTTTC	2	12	21959	21970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226222655
12	NC_012488	CTTCAT	2	12	22975	22986	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	226222657
13	NC_012488	TTTTGG	2	12	23339	23350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222657
14	NC_012488	ATTGAA	2	12	26988	26999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226222660
15	NC_012488	CCAAAA	2	12	37138	37149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222672
16	NC_012488	AATTAT	2	12	37752	37763	50 %	50 %	0 %	0 %	226222673
17	NC_012488	TCACCA	2	12	38899	38910	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	226222675
18	NC_012488	CGATTA	2	12	44329	44340	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222679
19	NC_012488	TTATGT	2	12	48818	48829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222682
20	NC_012488	AAAGAT	2	12	52470	52481	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222685
21	NC_012488	TGAAAT	2	12	53307	53318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226222686
22	NC_012488	TGGCGG	2	12	56440	56451	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	226222690
23	NC_012488	TCAAAA	2	12	56560	56571	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226222690
24	NC_012488	AAAAAT	2	12	59007	59018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222695
25	NC_012488	GCAGAA	2	12	62931	62942	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	226222697
26	NC_012488	AGGTAA	2	12	63022	63033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226222698
27	NC_012488	TGATTG	2	12	64410	64421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226222699
28	NC_012488	TGATTT	2	12	69741	69752	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222702
29	NC_012488	TTTTGC	2	12	70346	70357	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226222703
30	NC_012488	AAAATA	2	12	79378	79389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222712
31	NC_012488	CTTTTT	2	12	87538	87549	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	226222721
32	NC_012488	ATCACT	2	12	90598	90609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222724
33	NC_012488	GATATT	2	12	90657	90668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226222724
34	NC_012488	CAGATT	2	12	94174	94185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222724
35	NC_012488	AACTAT	2	12	96950	96961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226222725
36	NC_012488	AACCAG	2	12	102188	102199	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	226222730
37	NC_012488	TATTAG	2	12	106481	106492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226222735
38	NC_012488	TAGCAG	2	12	106544	106555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226222735
39	NC_012488	TTATTT	2	12	110007	110018	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226222739
40	NC_012488	ATTACA	2	12	114201	114212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226222744
41	NC_012488	TAAAAT	2	12	117925	117936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222747
42	NC_012488	CAAAAT	2	12	118066	118077	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226222747
43	NC_012488	CAAGCG	2	12	119067	119078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222747
44	NC_012488	GTTTTA	2	12	124833	124844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222755
45	NC_012488	TGATTT	2	12	126849	126860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222759
46	NC_012488	AAGTAA	2	12	130820	130831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222762
47	NC_012488	CCGTTA	2	12	134327	134338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222769
48	NC_012488	CAACTG	2	12	144074	144085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	226222778
49	NC_012488	TCTGAA	2	12	147056	147067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222783
50	NC_012488	GAATAA	2	12	148871	148882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222785
51	NC_012488	GTTGCA	2	12	153130	153141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222789
52	NC_012488	GATTGC	2	12	153192	153203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222789
53	NC_012488	AGGCGG	2	12	158840	158851	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	226222793
54	NC_012488	GTTTTC	2	12	162729	162740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226222794
55	NC_012488	GTTGAT	2	12	164345	164356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226222796
56	NC_012488	GTAAAA	2	12	164708	164719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222796
57	NC_012488	TTTTAC	2	12	166752	166763	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226222800
58	NC_012488	TTTTTA	2	12	167789	167800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226222802
59	NC_012488	GCATTA	2	12	168019	168030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222802
60	NC_012488	AAAGTA	2	12	169001	169012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222803
61	NC_012488	TTGCAC	2	12	171895	171906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222805
62	NC_012488	AGAAGT	2	12	174043	174054	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226222806
63	NC_012488	CAATCC	2	12	175959	175970	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	226222808
64	NC_012488	AAAGAT	2	12	177970	177981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222810
65	NC_012488	TGAAGT	2	12	182215	182226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222811
66	NC_012488	CATTGA	2	12	190336	190347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222818
67	NC_012488	TGCAGC	2	12	190991	191002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226222819
68	NC_012488	TAAAAA	2	12	193229	193240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222821
69	NC_012488	AAAGCA	2	12	206443	206454	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226222833
70	NC_012488	TTCTTT	2	12	211142	211153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	226222839
71	NC_012488	GAAAAA	2	12	213231	213242	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226222841
72	NC_012488	GAAAAA	2	12	214455	214466	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226222843
73	NC_012488	GCAAGT	2	12	220282	220293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226222846
74	NC_012488	TGTCGG	2	12	224201	224212	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	226222849
75	NC_012488	AAAAAC	2	12	225698	225709	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	226222850
76	NC_012488	GCAGAA	2	12	227242	227253	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	226222851
77	NC_012488	TAAAAT	2	12	230556	230567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222855
78	NC_012488	CCAGAA	2	12	231769	231780	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	226222856
79	NC_012488	AGTAAA	2	12	252800	252811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222864
80	NC_012488	GTACGT	2	12	253606	253617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222866
81	NC_012488	ACAGTA	2	12	260228	260239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222873
82	NC_012488	AAAACA	2	12	260603	260614	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	226222874
83	NC_012488	GCATGG	2	12	260784	260795	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226222874
84	NC_012488	CTGTAG	2	12	263728	263739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222879
85	NC_012488	GACAAT	2	12	265240	265251	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222881
86	NC_012488	GTGAGC	2	12	265695	265706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226222881
87	NC_012488	ATTGAT	2	12	265889	265900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226222881
88	NC_012488	TAAAAA	2	12	266959	266970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222882
89	NC_012488	TGAATC	2	12	267744	267755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222883
90	NC_012488	GCTACT	2	12	269436	269447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222884
91	NC_012488	TTCTGA	2	12	272510	272521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	226222886
92	NC_012488	AAGAAA	2	12	275726	275737	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226222889
93	NC_012488	TTCGTG	2	12	281482	281493	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	226222890
94	NC_012488	TAACAA	2	12	284789	284800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226222894
95	NC_012488	TTTAAC	2	12	285862	285873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	226222895
96	NC_012488	GTTGAG	2	12	287716	287727	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	226222896
97	NC_012488	ATTTTT	2	12	287989	288000	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226222896
98	NC_012488	CCAAAT	2	12	290522	290533	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	226222897
99	NC_012488	AGAACT	2	12	293136	293147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222899
100	NC_012488	TACAAG	2	12	297380	297391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222903
101	NC_012488	CGAAAT	2	12	297434	297445	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222903
102	NC_012488	CATTAT	2	12	301164	301175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	226222906
103	NC_012488	TCTTTT	2	12	301625	301636	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	226222906
104	NC_012488	ATCAAT	2	12	304032	304043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226222908
105	NC_012488	ATGAAA	2	12	304390	304401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222909
106	NC_012488	GCTTTT	2	12	305733	305744	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226222911
107	NC_012488	CTTTTA	2	12	306262	306273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226222911
108	NC_012488	TAGAAA	2	12	307208	307219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222912
109	NC_012488	ACGTTG	2	12	309137	309148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222914
110	NC_012488	GAAAAC	2	12	311044	311055	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226222915
111	NC_012488	TTTTGA	2	12	316706	316717	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222921
112	NC_012488	GAAGGG	2	12	321808	321819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226222925
113	NC_012488	AGAACC	2	12	324842	324853	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	226222928
114	NC_012488	GATTCA	2	12	325449	325460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222928
115	NC_012488	GCAATT	2	12	325479	325490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222928
116	NC_012488	TCTGTT	2	12	330389	330400	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226222933
117	NC_012488	GAACCA	2	12	332284	332295	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	226222934
118	NC_012488	TCCATT	2	12	334892	334903	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	226222937
119	NC_012488	TGCGGG	2	12	338242	338253	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	226222941
120	NC_012488	CTGGTT	2	12	339767	339778	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	226222943
121	NC_012488	GCCAAA	2	12	339970	339981	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	226222943
122	NC_012488	TAGTTG	2	12	343931	343942	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226222947
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128	NC_012488	CGCCAG	2	12	359098	359109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	226222957
129	NC_012488	CACCAG	2	12	359338	359349	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	226222957
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138	NC_012488	CTGACC	2	12	389196	389207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	226222986
139	NC_012488	AATGAA	2	12	389871	389882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222987
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144	NC_012488	GCAGAA	2	12	417441	417452	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	226223017
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147	NC_012488	GGTATT	2	12	425265	425276	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226223025
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152	NC_012488	TGCAGC	2	12	442064	442075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226223041
153	NC_012488	TTGGTA	2	12	443810	443821	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226223043
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189	NC_012488	ATATTA	2	12	556469	556480	50 %	50 %	0 %	0 %	226223147
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203	NC_012488	ATCCAG	2	12	593221	593232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	226223180
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217	NC_012488	AAACAA	2	12	629280	629291	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	226223215
218	NC_012488	ATTTTG	2	12	629869	629880	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226223215
219	NC_012488	AATTTT	2	12	639173	639184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226223223
220	NC_012488	GGCTGG	2	12	642162	642173	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	226223225
221	NC_012488	AATTTC	2	12	643724	643735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	226223227
222	NC_012488	GGTCCA	2	12	651236	651247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226223237
223	NC_012488	AGATGC	2	12	653238	653249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226223238
224	NC_012488	GTCAAA	2	12	656384	656395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226223241
225	NC_012488	GAAAAA	2	12	656563	656574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226223241
226	NC_012488	AAAAGA	2	12	656726	656737	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226223242
227	NC_012488	TGCTGG	2	12	657134	657145	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	226223242
228	NC_012488	CTGTTT	2	12	660770	660781	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226223246
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344	NC_012488	CAAGAA	2	12	992360	992371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226223576
345	NC_012488	AATTTT	2	12	993573	993584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226223577
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452	NC_012488	AAGAAA	2	12	1295860	1295871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226223889
453	NC_012488	CCAACA	2	12	1301848	1301859	50 %	0 %	0 %	50 %	226223892
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455	NC_012488	GTCATC	2	12	1306974	1306985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226223896
456	NC_012488	TATGAT	2	12	1307289	1307300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226223896
457	NC_012488	ATTTTC	2	12	1309688	1309699	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226223899
458	NC_012488	TATTTT	2	12	1313491	1313502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226223902
459	NC_012488	AGAAAA	2	12	1315770	1315781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226223905
460	NC_012488	ATTAGA	2	12	1316603	1316614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226223907
461	NC_012488	TATGGC	2	12	1316735	1316746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226223907
462	NC_012488	TCTACA	2	12	1317879	1317890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226223907
463	NC_012488	TTCAAG	2	12	1318072	1318083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226223907
464	NC_012488	AAGAAA	2	12	1318775	1318786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226223908
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480	NC_012488	GAACAT	2	12	1370711	1370722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226223965
481	NC_012488	TACTTC	2	12	1371198	1371209	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	226223966
482	NC_012488	ATGATA	2	12	1371614	1371625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226223966
483	NC_012488	GGACAA	2	12	1379891	1379902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	226223973
484	NC_012488	TATATG	2	12	1380723	1380734	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226223973
485	NC_012488	CGATTG	2	12	1382623	1382634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226223975
486	NC_012488	TAAAAG	2	12	1385359	1385370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226223977
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493	NC_012488	ACTTAG	2	12	1403656	1403667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226223993
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500	NC_012488	TGGATA	2	12	1419538	1419549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226224007

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