MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 58040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012488	GAA	2	6	263397	263402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222878
5002	NC_012488	CTAT	2	8	263442	263449	25 %	50 %	0 %	25 %	226222878
5003	NC_012488	CTA	2	6	263494	263499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222878
5004	NC_012488	AAG	2	6	263518	263523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222878
5005	NC_012488	AAG	2	6	263527	263532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222878
5006	NC_012488	GAA	2	6	263631	263636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222879
5007	NC_012488	AAG	2	6	263653	263658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222879
5008	NC_012488	GAA	3	9	263697	263705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222879
5009	NC_012488	CTG	2	6	263716	263721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222879
5010	NC_012488	CTGTAG	2	12	263728	263739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222879
5011	NC_012488	CTG	3	9	263740	263748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222879
5012	NC_012488	GCT	3	9	263754	263762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222879
5013	NC_012488	CTG	2	6	263794	263799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222879
5014	NC_012488	AAG	2	6	263857	263862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222879
5015	NC_012488	AAG	2	6	263899	263904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222879
5016	NC_012488	AGA	2	6	263915	263920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222879
5017	NC_012488	GAA	2	6	263925	263930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222879
5018	NC_012488	GAA	2	6	263946	263951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222879
5019	NC_012488	TAC	2	6	264136	264141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222880
5020	NC_012488	ACG	2	6	264146	264151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222880
5021	NC_012488	ATT	2	6	264264	264269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222880
5022	NC_012488	GTTG	2	8	264316	264323	0 %	50 %	50 %	0 %	226222880
5023	NC_012488	TGG	2	6	264383	264388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222880
5024	NC_012488	GC	3	6	264399	264404	0 %	0 %	50 %	50 %	226222880
5025	NC_012488	GAAA	2	8	264417	264424	75 %	0 %	25 %	0 %	226222880
5026	NC_012488	ATT	2	6	264508	264513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222880
5027	NC_012488	GGC	2	6	264625	264630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222880
5028	NC_012488	CTG	2	6	264635	264640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222880
5029	NC_012488	GAA	2	6	264652	264657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222880
5030	NC_012488	TATTT	2	10	264697	264706	20 %	80 %	0 %	0 %	226222880
5031	NC_012488	GAC	2	6	265127	265132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222881
5032	NC_012488	ATT	2	6	265148	265153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222881
5033	NC_012488	GGT	2	6	265214	265219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222881
5034	NC_012488	TG	3	6	265226	265231	0 %	50 %	50 %	0 %	226222881
5035	NC_012488	GACAAT	2	12	265240	265251	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222881
5036	NC_012488	TTGG	2	8	265274	265281	0 %	50 %	50 %	0 %	226222881
5037	NC_012488	TGTA	2	8	265302	265309	25 %	50 %	25 %	0 %	226222881
5038	NC_012488	ATTTG	2	10	265417	265426	20 %	60 %	20 %	0 %	226222881
5039	NC_012488	TCA	2	6	265447	265452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222881
5040	NC_012488	TGG	2	6	265483	265488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222881
5041	NC_012488	ACC	2	6	265584	265589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226222881
5042	NC_012488	AAG	2	6	265590	265595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222881
5043	NC_012488	CTG	2	6	265647	265652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222881
5044	NC_012488	A	6	6	265655	265660	100 %	0 %	0 %	0 %	226222881
5045	NC_012488	CAA	2	6	265681	265686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222881
5046	NC_012488	GTGAGC	2	12	265695	265706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226222881
5047	NC_012488	ATT	2	6	265758	265763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222881
5048	NC_012488	GTT	2	6	265856	265861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222881
5049	NC_012488	TG	3	6	265874	265879	0 %	50 %	50 %	0 %	226222881
5050	NC_012488	ATTGAT	2	12	265889	265900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226222881
5051	NC_012488	GCA	2	6	265977	265982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222881
5052	NC_012488	GCA	2	6	266096	266101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222881
5053	NC_012488	ACT	2	6	266117	266122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222881
5054	NC_012488	A	7	7	266132	266138	100 %	0 %	0 %	0 %	226222881
5055	NC_012488	TGA	2	6	266143	266148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222881
5056	NC_012488	AGA	2	6	266194	266199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222881
5057	NC_012488	AAT	2	6	266218	266223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222881
5058	NC_012488	ATG	2	6	266248	266253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222881
5059	NC_012488	GATA	2	8	266389	266396	50 %	25 %	25 %	0 %	226222882
5060	NC_012488	ACT	2	6	266450	266455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222882
5061	NC_012488	A	6	6	266500	266505	100 %	0 %	0 %	0 %	226222882
5062	NC_012488	TGC	2	6	266515	266520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222882
5063	NC_012488	ATT	2	6	266535	266540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222882
5064	NC_012488	TAA	2	6	266545	266550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222882
5065	NC_012488	CAA	2	6	266558	266563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222882
5066	NC_012488	GAT	2	6	266584	266589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222882
5067	NC_012488	T	7	7	266620	266626	0 %	100 %	0 %	0 %	226222882
5068	NC_012488	TTG	2	6	266634	266639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222882
5069	NC_012488	CTAT	2	8	266653	266660	25 %	50 %	0 %	25 %	226222882
5070	NC_012488	GATT	2	8	266757	266764	25 %	50 %	25 %	0 %	226222882
5071	NC_012488	AGA	2	6	266788	266793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222882
5072	NC_012488	ATT	2	6	266864	266869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222882
5073	NC_012488	TGA	2	6	266875	266880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222882
5074	NC_012488	ATT	2	6	266907	266912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222882
5075	NC_012488	TAA	2	6	266913	266918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222882
5076	NC_012488	TACTG	2	10	266942	266951	20 %	40 %	20 %	20 %	226222882
5077	NC_012488	TAAAAA	2	12	266959	266970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222882
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5079	NC_012488	TGA	2	6	267025	267030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222882
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5083	NC_012488	TGC	2	6	267145	267150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222882
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5085	NC_012488	A	7	7	267169	267175	100 %	0 %	0 %	0 %	226222882
5086	NC_012488	AAC	2	6	267267	267272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222882
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5088	NC_012488	GA	3	6	267375	267380	50 %	0 %	50 %	0 %	226222882
5089	NC_012488	TAT	2	6	267555	267560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222883
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5092	NC_012488	A	6	6	267703	267708	100 %	0 %	0 %	0 %	226222883
5093	NC_012488	TGAATC	2	12	267744	267755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222883
5094	NC_012488	GCG	2	6	267796	267801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222883
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5099	NC_012488	TAT	2	6	267979	267984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222883
5100	NC_012488	T	6	6	267995	268000	0 %	100 %	0 %	0 %	226222883
5101	NC_012488	GAT	2	6	268006	268011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222883
5102	NC_012488	AAT	2	6	268210	268215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222883
5103	NC_012488	AAAT	2	8	268268	268275	75 %	25 %	0 %	0 %	226222883
5104	NC_012488	ATG	2	6	268384	268389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222883
5105	NC_012488	TG	3	6	268414	268419	0 %	50 %	50 %	0 %	226222883
5106	NC_012488	T	6	6	268640	268645	0 %	100 %	0 %	0 %	226222883
5107	NC_012488	TAG	2	6	268667	268672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222883
5108	NC_012488	AAGA	2	8	268693	268700	75 %	0 %	25 %	0 %	226222883
5109	NC_012488	ATG	2	6	268773	268778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222884
5110	NC_012488	AAG	2	6	268782	268787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222884
5111	NC_012488	ATT	2	6	268789	268794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222884
5112	NC_012488	TAT	2	6	269012	269017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222884
5113	NC_012488	AT	3	6	269055	269060	50 %	50 %	0 %	0 %	226222884
5114	NC_012488	GTT	2	6	269073	269078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222884
5115	NC_012488	TCT	2	6	269095	269100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222884
5116	NC_012488	A	7	7	269157	269163	100 %	0 %	0 %	0 %	226222884
5117	NC_012488	GAT	2	6	269234	269239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222884
5118	NC_012488	ATTT	2	8	269329	269336	25 %	75 %	0 %	0 %	226222884
5119	NC_012488	TGGA	2	8	269408	269415	25 %	25 %	50 %	0 %	226222884
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5121	NC_012488	T	6	6	269454	269459	0 %	100 %	0 %	0 %	226222884
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5489	NC_012488	TTA	2	6	287155	287160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222896
5490	NC_012488	TAT	2	6	287178	287183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222896
5491	NC_012488	AGA	2	6	287202	287207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222896
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5500	NC_012488	ATG	2	6	287585	287590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222896

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