MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 58903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011660	T	6	6	152538	152543	0 %	100 %	0 %	0 %	217963452
3002	NC_011660	TAA	2	6	152552	152557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963452
3003	NC_011660	ATGT	2	8	152565	152572	25 %	50 %	25 %	0 %	217963452
3004	NC_011660	AGA	2	6	152615	152620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963452
3005	NC_011660	ATG	2	6	152644	152649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3006	NC_011660	TTA	2	6	152680	152685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963452
3007	NC_011660	TGA	2	6	152879	152884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3008	NC_011660	TGG	2	6	152995	153000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963452
3009	NC_011660	ATG	2	6	153010	153015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3010	NC_011660	GAT	2	6	153057	153062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3011	NC_011660	ATG	2	6	153088	153093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3012	NC_011660	TAA	2	6	153200	153205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963452
3013	NC_011660	TGG	2	6	153219	153224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963452
3014	NC_011660	TATT	2	8	153240	153247	25 %	75 %	0 %	0 %	217963452
3015	NC_011660	TGG	2	6	153281	153286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963452
3016	NC_011660	ATTTTG	2	12	153379	153390	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	217963452
3017	NC_011660	CAG	2	6	153592	153597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963452
3018	NC_011660	TA	3	6	153601	153606	50 %	50 %	0 %	0 %	217963452
3019	NC_011660	GAA	2	6	153681	153686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963452
3020	NC_011660	CGA	2	6	153719	153724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963452
3021	NC_011660	AC	3	6	153757	153762	50 %	0 %	0 %	50 %	217963452
3022	NC_011660	GAAT	2	8	153763	153770	50 %	25 %	25 %	0 %	217963452
3023	NC_011660	CGG	2	6	153805	153810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963452
3024	NC_011660	GAT	2	6	153824	153829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3025	NC_011660	AAG	2	6	153928	153933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963452
3026	NC_011660	AAG	2	6	153946	153951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963452
3027	NC_011660	CGG	2	6	153989	153994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963452
3028	NC_011660	TAT	2	6	154023	154028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963452
3029	NC_011660	ATT	2	6	154071	154076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963452
3030	NC_011660	ATG	3	9	154192	154200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3031	NC_011660	CGG	2	6	154205	154210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963452
3032	NC_011660	TG	3	6	154216	154221	0 %	50 %	50 %	0 %	217963452
3033	NC_011660	AAC	2	6	154289	154294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963452
3034	NC_011660	TAC	2	6	154395	154400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963452
3035	NC_011660	AGC	2	6	154433	154438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963452
3036	NC_011660	TACTGG	2	12	154550	154561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	217963452
3037	NC_011660	AAG	2	6	154588	154593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963452
3038	NC_011660	AGA	2	6	154667	154672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963452
3039	NC_011660	TA	3	6	154687	154692	50 %	50 %	0 %	0 %	217963452
3040	NC_011660	A	6	6	154701	154706	100 %	0 %	0 %	0 %	217963452
3041	NC_011660	CAA	2	6	154707	154712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963452
3042	NC_011660	TAA	2	6	154784	154789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963452
3043	NC_011660	GAT	2	6	154815	154820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3044	NC_011660	GTA	2	6	154845	154850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3045	NC_011660	AAAT	2	8	154857	154864	75 %	25 %	0 %	0 %	217963452
3046	NC_011660	TGAA	2	8	154920	154927	50 %	25 %	25 %	0 %	217963453
3047	NC_011660	A	7	7	154926	154932	100 %	0 %	0 %	0 %	217963453
3048	NC_011660	TTG	2	6	154958	154963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963453
3049	NC_011660	ATT	2	6	154967	154972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963453
3050	NC_011660	TAT	2	6	155021	155026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963453
3051	NC_011660	TAA	2	6	155225	155230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963453
3052	NC_011660	AAT	2	6	155358	155363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963453
3053	NC_011660	TGGAA	2	10	155390	155399	40 %	20 %	40 %	0 %	217963453
3054	NC_011660	ACT	2	6	155486	155491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963453
3055	NC_011660	CATT	2	8	155556	155563	25 %	50 %	0 %	25 %	217963453
3056	NC_011660	GA	3	6	155608	155613	50 %	0 %	50 %	0 %	217963453
3057	NC_011660	TTTA	2	8	155634	155641	25 %	75 %	0 %	0 %	217963453
3058	NC_011660	ATT	3	9	155682	155690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963453
3059	NC_011660	ACC	2	6	155717	155722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963453
3060	NC_011660	ATG	2	6	155734	155739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963453
3061	NC_011660	GAT	2	6	155878	155883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963454
3062	NC_011660	A	6	6	155885	155890	100 %	0 %	0 %	0 %	217963454
3063	NC_011660	TGT	2	6	155920	155925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963454
3064	NC_011660	GAAA	2	8	155992	155999	75 %	0 %	25 %	0 %	217963454
3065	NC_011660	AAG	2	6	156000	156005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3066	NC_011660	A	6	6	156008	156013	100 %	0 %	0 %	0 %	217963454
3067	NC_011660	AGA	2	6	156049	156054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3068	NC_011660	GGA	2	6	156073	156078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963454
3069	NC_011660	TCA	2	6	156120	156125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963454
3070	NC_011660	AGA	2	6	156154	156159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3071	NC_011660	AAT	2	6	156188	156193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963454
3072	NC_011660	TGAT	2	8	156249	156256	25 %	50 %	25 %	0 %	217963454
3073	NC_011660	CAG	2	6	156408	156413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963454
3074	NC_011660	GCG	2	6	156450	156455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963454
3075	NC_011660	ATA	2	6	156522	156527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963454
3076	NC_011660	TAA	2	6	156541	156546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963454
3077	NC_011660	AGG	2	6	156577	156582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963454
3078	NC_011660	CAG	2	6	156600	156605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963454
3079	NC_011660	GAA	2	6	156659	156664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3080	NC_011660	TTA	2	6	156676	156681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963454
3081	NC_011660	GTC	2	6	156702	156707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963454
3082	NC_011660	GAAA	2	8	156715	156722	75 %	0 %	25 %	0 %	217963454
3083	NC_011660	GAA	2	6	156755	156760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3084	NC_011660	TCT	2	6	156767	156772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963454
3085	NC_011660	ATG	2	6	156800	156805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963454
3086	NC_011660	TGG	2	6	156955	156960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963454
3087	NC_011660	AGA	2	6	157090	157095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3088	NC_011660	ACA	2	6	157108	157113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963454
3089	NC_011660	AAG	2	6	157192	157197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3090	NC_011660	TGG	3	9	157229	157237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963454
3091	NC_011660	TGG	2	6	157277	157282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963454
3092	NC_011660	ATG	2	6	157284	157289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963454
3093	NC_011660	TCT	2	6	157304	157309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963454
3094	NC_011660	ATT	2	6	157320	157325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963454
3095	NC_011660	TATG	2	8	157363	157370	25 %	50 %	25 %	0 %	217963454
3096	NC_011660	GAA	2	6	157413	157418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3097	NC_011660	TTCTAC	2	12	157444	157455	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	217963454
3098	NC_011660	A	6	6	157484	157489	100 %	0 %	0 %	0 %	217963454
3099	NC_011660	AAC	2	6	157524	157529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963454
3100	NC_011660	AATT	2	8	157549	157556	50 %	50 %	0 %	0 %	217963454
3101	NC_011660	GACA	2	8	157560	157567	50 %	0 %	25 %	25 %	217963454
3102	NC_011660	GGT	2	6	157586	157591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963454
3103	NC_011660	TGGA	2	8	157646	157653	25 %	25 %	50 %	0 %	217963454
3104	NC_011660	AATCAA	2	12	157691	157702	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217963454
3105	NC_011660	TGG	2	6	157723	157728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963454
3106	NC_011660	CGG	2	6	157731	157736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963454
3107	NC_011660	AAG	2	6	157737	157742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3108	NC_011660	TATG	2	8	157786	157793	25 %	50 %	25 %	0 %	217963454
3109	NC_011660	TGA	2	6	157861	157866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963454
3110	NC_011660	AGA	2	6	157930	157935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963454
3111	NC_011660	ATTT	2	8	157955	157962	25 %	75 %	0 %	0 %	217963454
3112	NC_011660	CAG	2	6	157965	157970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963454
3113	NC_011660	ATG	2	6	158037	158042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963454
3114	NC_011660	TGTT	2	8	158064	158071	0 %	75 %	25 %	0 %	217963454
3115	NC_011660	CAA	2	6	158096	158101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963454
3116	NC_011660	ATTT	2	8	158138	158145	25 %	75 %	0 %	0 %	217963454
3117	NC_011660	CCT	2	6	158172	158177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217963454
3118	NC_011660	ACG	4	12	158187	158198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963454
3119	NC_011660	A	6	6	158238	158243	100 %	0 %	0 %	0 %	217963454
3120	NC_011660	ACT	2	6	158246	158251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963454
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3491	NC_011660	TG	3	6	177468	177473	0 %	50 %	50 %	0 %	217963476
3492	NC_011660	ATG	2	6	177657	177662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963476
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3494	NC_011660	GTA	2	6	177923	177928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963477
3495	NC_011660	TTG	2	6	177938	177943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963477
3496	NC_011660	ATTG	2	8	177951	177958	25 %	50 %	25 %	0 %	217963477
3497	NC_011660	T	6	6	177964	177969	0 %	100 %	0 %	0 %	217963477
3498	NC_011660	ATC	2	6	178030	178035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963477
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3500	NC_011660	CCAT	2	8	178080	178087	25 %	25 %	0 %	50 %	217963477

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