MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 58903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011660	CGG	2	6	126628	126633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963428
2502	NC_011660	TTA	2	6	126668	126673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963428
2503	NC_011660	GAT	2	6	126724	126729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963428
2504	NC_011660	AATT	2	8	126786	126793	50 %	50 %	0 %	0 %	217963428
2505	NC_011660	GTT	2	6	126805	126810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963428
2506	NC_011660	GAA	2	6	126849	126854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963428
2507	NC_011660	CTT	2	6	126916	126921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963428
2508	NC_011660	TG	3	6	126924	126929	0 %	50 %	50 %	0 %	217963428
2509	NC_011660	TTTA	2	8	126930	126937	25 %	75 %	0 %	0 %	217963428
2510	NC_011660	AAC	2	6	126955	126960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963428
2511	NC_011660	GAA	2	6	127017	127022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963428
2512	NC_011660	ATG	2	6	127121	127126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963429
2513	NC_011660	ATC	2	6	127129	127134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963429
2514	NC_011660	CTT	2	6	127155	127160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963429
2515	NC_011660	T	6	6	127221	127226	0 %	100 %	0 %	0 %	217963429
2516	NC_011660	AGC	2	6	127273	127278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963429
2517	NC_011660	GATTTC	2	12	127279	127290	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217963429
2518	NC_011660	TGGT	2	8	127318	127325	0 %	50 %	50 %	0 %	217963429
2519	NC_011660	TAG	2	6	127381	127386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963429
2520	NC_011660	AGC	2	6	127402	127407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963429
2521	NC_011660	AT	3	6	127502	127507	50 %	50 %	0 %	0 %	217963429
2522	NC_011660	AAT	3	9	127544	127552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963429
2523	NC_011660	ATC	2	6	127579	127584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963429
2524	NC_011660	ATA	2	6	127601	127606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963429
2525	NC_011660	TAA	2	6	127618	127623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963429
2526	NC_011660	CAT	2	6	127845	127850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963430
2527	NC_011660	GAA	2	6	127851	127856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963430
2528	NC_011660	T	6	6	127876	127881	0 %	100 %	0 %	0 %	217963430
2529	NC_011660	AAC	2	6	127914	127919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963430
2530	NC_011660	CAA	2	6	127971	127976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963430
2531	NC_011660	CTG	2	6	128057	128062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963430
2532	NC_011660	GCGG	2	8	128074	128081	0 %	0 %	75 %	25 %	217963430
2533	NC_011660	CA	3	6	128180	128185	50 %	0 %	0 %	50 %	217963430
2534	NC_011660	TTA	2	6	128207	128212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963430
2535	NC_011660	CAT	2	6	128252	128257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963430
2536	NC_011660	AACAA	2	10	128307	128316	80 %	0 %	0 %	20 %	217963430
2537	NC_011660	TAC	2	6	128347	128352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963430
2538	NC_011660	ATT	2	6	128419	128424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963430
2539	NC_011660	AGC	2	6	128481	128486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963430
2540	NC_011660	ACT	2	6	128488	128493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963430
2541	NC_011660	A	6	6	128500	128505	100 %	0 %	0 %	0 %	217963430
2542	NC_011660	GTA	2	6	128575	128580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963430
2543	NC_011660	CTT	2	6	128600	128605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963430
2544	NC_011660	TAC	2	6	128613	128618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963430
2545	NC_011660	AAAT	2	8	128673	128680	75 %	25 %	0 %	0 %	217963430
2546	NC_011660	GAC	2	6	128706	128711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963430
2547	NC_011660	AAG	2	6	128714	128719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963430
2548	NC_011660	AAT	2	6	128854	128859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963430
2549	NC_011660	CCA	2	6	128876	128881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963430
2550	NC_011660	TGA	2	6	128892	128897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963430
2551	NC_011660	AGTA	2	8	128907	128914	50 %	25 %	25 %	0 %	217963430
2552	NC_011660	AGTA	2	8	128970	128977	50 %	25 %	25 %	0 %	217963430
2553	NC_011660	TAC	2	6	129040	129045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963430
2554	NC_011660	TAT	2	6	129061	129066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963430
2555	NC_011660	GTG	2	6	129090	129095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963430
2556	NC_011660	AC	3	6	129107	129112	50 %	0 %	0 %	50 %	217963430
2557	NC_011660	TTAT	2	8	129197	129204	25 %	75 %	0 %	0 %	217963430
2558	NC_011660	TGG	2	6	129229	129234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963430
2559	NC_011660	TTA	2	6	129703	129708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963431
2560	NC_011660	TAG	2	6	129719	129724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963431
2561	NC_011660	ATTA	2	8	129745	129752	50 %	50 %	0 %	0 %	217963431
2562	NC_011660	GTT	2	6	129756	129761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963431
2563	NC_011660	GATA	2	8	129807	129814	50 %	25 %	25 %	0 %	217963431
2564	NC_011660	ATT	2	6	129841	129846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963431
2565	NC_011660	TAA	2	6	129867	129872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963431
2566	NC_011660	TTTA	2	8	130011	130018	25 %	75 %	0 %	0 %	217963432
2567	NC_011660	T	6	6	130028	130033	0 %	100 %	0 %	0 %	217963432
2568	NC_011660	TCT	2	6	130043	130048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963432
2569	NC_011660	CTTC	2	8	130160	130167	0 %	50 %	0 %	50 %	217963432
2570	NC_011660	TGAT	2	8	130178	130185	25 %	50 %	25 %	0 %	217963432
2571	NC_011660	CATA	2	8	130201	130208	50 %	25 %	0 %	25 %	217963432
2572	NC_011660	CCAA	2	8	130267	130274	50 %	0 %	0 %	50 %	217963432
2573	NC_011660	A	6	6	130297	130302	100 %	0 %	0 %	0 %	217963432
2574	NC_011660	GCT	2	6	130581	130586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963433
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2577	NC_011660	GTTT	2	8	130736	130743	0 %	75 %	25 %	0 %	217963433
2578	NC_011660	TA	3	6	130831	130836	50 %	50 %	0 %	0 %	217963433
2579	NC_011660	GAA	2	6	130851	130856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963433
2580	NC_011660	TAAT	2	8	130936	130943	50 %	50 %	0 %	0 %	217963433
2581	NC_011660	CAA	2	6	130966	130971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963433
2582	NC_011660	TGA	2	6	130988	130993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963434
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2586	NC_011660	AGT	2	6	131181	131186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963434
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2588	NC_011660	AAG	2	6	131249	131254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963434
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2591	NC_011660	CCAA	2	8	131296	131303	50 %	0 %	0 %	50 %	217963434
2592	NC_011660	AATGA	2	10	131332	131341	60 %	20 %	20 %	0 %	217963434
2593	NC_011660	A	6	6	131378	131383	100 %	0 %	0 %	0 %	217963434
2594	NC_011660	T	6	6	131407	131412	0 %	100 %	0 %	0 %	217963434
2595	NC_011660	T	6	6	131498	131503	0 %	100 %	0 %	0 %	217963434
2596	NC_011660	ATG	2	6	131569	131574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963434
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2599	NC_011660	ATT	3	9	131767	131775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963435
2600	NC_011660	TTTC	2	8	131784	131791	0 %	75 %	0 %	25 %	217963435
2601	NC_011660	AGC	2	6	131796	131801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963435
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2603	NC_011660	TGT	2	6	131850	131855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963435
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2605	NC_011660	ACGG	2	8	131890	131897	25 %	0 %	50 %	25 %	217963435
2606	NC_011660	A	6	6	132005	132010	100 %	0 %	0 %	0 %	217963435
2607	NC_011660	ACA	2	6	132051	132056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963435
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2610	NC_011660	TGA	2	6	132204	132209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963435
2611	NC_011660	TTG	2	6	132215	132220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963435
2612	NC_011660	GCT	2	6	132288	132293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963435
2613	NC_011660	CTT	2	6	132307	132312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963435
2614	NC_011660	TTA	2	6	132325	132330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963435
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2620	NC_011660	TTTAG	2	10	132685	132694	20 %	60 %	20 %	0 %	217963435
2621	NC_011660	ATG	2	6	132706	132711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963435
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2623	NC_011660	GAA	2	6	132799	132804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963435
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2990	NC_011660	AC	3	6	152140	152145	50 %	0 %	0 %	50 %	217963452
2991	NC_011660	AGA	2	6	152210	152215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963452
2992	NC_011660	CGG	2	6	152218	152223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963452
2993	NC_011660	AAC	2	6	152237	152242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963452
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2995	NC_011660	ACA	2	6	152328	152333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963452
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2997	NC_011660	A	6	6	152363	152368	100 %	0 %	0 %	0 %	217963452
2998	NC_011660	CGA	2	6	152408	152413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963452
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3000	NC_011660	CAGA	2	8	152508	152515	50 %	0 %	25 %	25 %	217963452

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