MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 58903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011660	GCG	2	6	49207	49212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963351
1002	NC_011660	GTT	2	6	49213	49218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963351
1003	NC_011660	GCT	2	6	49285	49290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963351
1004	NC_011660	CTT	2	6	49432	49437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963351
1005	NC_011660	GTG	2	6	49451	49456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963351
1006	NC_011660	AAG	2	6	49481	49486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963351
1007	NC_011660	TAG	2	6	49497	49502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963351
1008	NC_011660	ATG	2	6	49561	49566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963351
1009	NC_011660	TGC	2	6	49656	49661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963351
1010	NC_011660	GCG	2	6	49670	49675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963351
1011	NC_011660	CTC	2	6	49700	49705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217963351
1012	NC_011660	GAAG	2	8	49780	49787	50 %	0 %	50 %	0 %	217963351
1013	NC_011660	GAA	2	6	49999	50004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963352
1014	NC_011660	CTTCA	2	10	50025	50034	20 %	40 %	0 %	40 %	217963352
1015	NC_011660	A	6	6	50262	50267	100 %	0 %	0 %	0 %	217963352
1016	NC_011660	TGC	2	6	50306	50311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963352
1017	NC_011660	AGA	2	6	50328	50333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963352
1018	NC_011660	TGA	2	6	50388	50393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963352
1019	NC_011660	TG	3	6	50457	50462	0 %	50 %	50 %	0 %	217963352
1020	NC_011660	CCA	2	6	50482	50487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963352
1021	NC_011660	AAT	2	6	50492	50497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963352
1022	NC_011660	ATG	2	6	50553	50558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963353
1023	NC_011660	TTA	2	6	50570	50575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963353
1024	NC_011660	GTA	2	6	50588	50593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963353
1025	NC_011660	AGA	2	6	50752	50757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963353
1026	NC_011660	AAAAG	2	10	50773	50782	80 %	0 %	20 %	0 %	217963353
1027	NC_011660	AGA	2	6	50791	50796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963353
1028	NC_011660	ATG	2	6	50832	50837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963353
1029	NC_011660	AGC	2	6	50866	50871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963353
1030	NC_011660	TGG	2	6	50872	50877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963353
1031	NC_011660	AGC	2	6	50884	50889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963353
1032	NC_011660	TGG	2	6	50983	50988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963353
1033	NC_011660	ATT	2	6	50999	51004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963353
1034	NC_011660	GAT	2	6	51007	51012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963353
1035	NC_011660	ATG	2	6	51021	51026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963353
1036	NC_011660	GGT	2	6	51092	51097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963353
1037	NC_011660	GAA	2	6	51143	51148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963353
1038	NC_011660	ACG	2	6	51227	51232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963353
1039	NC_011660	GAA	2	6	51374	51379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963353
1040	NC_011660	ATG	2	6	51381	51386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963353
1041	NC_011660	CTG	2	6	51399	51404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963353
1042	NC_011660	AGA	2	6	51550	51555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963353
1043	NC_011660	A	6	6	51605	51610	100 %	0 %	0 %	0 %	217963354
1044	NC_011660	CTT	2	6	51624	51629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963354
1045	NC_011660	GCA	2	6	51651	51656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963354
1046	NC_011660	TGGA	2	8	51702	51709	25 %	25 %	50 %	0 %	217963354
1047	NC_011660	T	6	6	51827	51832	0 %	100 %	0 %	0 %	217963354
1048	NC_011660	AGA	2	6	51839	51844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963354
1049	NC_011660	AGA	2	6	51869	51874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963354
1050	NC_011660	GGA	2	6	51890	51895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963354
1051	NC_011660	T	6	6	51896	51901	0 %	100 %	0 %	0 %	217963354
1052	NC_011660	A	6	6	51903	51908	100 %	0 %	0 %	0 %	217963354
1053	NC_011660	A	6	6	51969	51974	100 %	0 %	0 %	0 %	217963354
1054	NC_011660	TTA	2	6	52050	52055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963354
1055	NC_011660	GAA	2	6	52110	52115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963354
1056	NC_011660	A	6	6	52190	52195	100 %	0 %	0 %	0 %	217963354
1057	NC_011660	ATT	2	6	52211	52216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963354
1058	NC_011660	ATG	2	6	52225	52230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963354
1059	NC_011660	ATT	2	6	52337	52342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963354
1060	NC_011660	A	6	6	52345	52350	100 %	0 %	0 %	0 %	217963354
1061	NC_011660	ATT	2	6	52368	52373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963354
1062	NC_011660	AT	3	6	52420	52425	50 %	50 %	0 %	0 %	217963354
1063	NC_011660	CATT	2	8	52742	52749	25 %	50 %	0 %	25 %	217963355
1064	NC_011660	ACA	2	6	52763	52768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963355
1065	NC_011660	ATCAA	2	10	52769	52778	60 %	20 %	0 %	20 %	217963355
1066	NC_011660	CTAT	2	8	52780	52787	25 %	50 %	0 %	25 %	217963355
1067	NC_011660	AAG	2	6	52789	52794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963355
1068	NC_011660	CAG	2	6	52795	52800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963355
1069	NC_011660	TAC	2	6	52804	52809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963355
1070	NC_011660	A	6	6	52888	52893	100 %	0 %	0 %	0 %	217963355
1071	NC_011660	GCA	2	6	52899	52904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963355
1072	NC_011660	CGCC	2	8	52943	52950	0 %	0 %	25 %	75 %	217963355
1073	NC_011660	TCCT	2	8	53038	53045	0 %	50 %	0 %	50 %	217963355
1074	NC_011660	A	6	6	53049	53054	100 %	0 %	0 %	0 %	217963355
1075	NC_011660	TAA	2	6	53134	53139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963355
1076	NC_011660	CAA	2	6	53197	53202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963355
1077	NC_011660	AGA	2	6	53219	53224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963355
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1079	NC_011660	ATTG	2	8	53292	53299	25 %	50 %	25 %	0 %	217963355
1080	NC_011660	ATT	2	6	53316	53321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963355
1081	NC_011660	AT	3	6	53377	53382	50 %	50 %	0 %	0 %	217963355
1082	NC_011660	ACAA	2	8	53385	53392	75 %	0 %	0 %	25 %	217963355
1083	NC_011660	GAAA	2	8	53396	53403	75 %	0 %	25 %	0 %	217963355
1084	NC_011660	AAAT	2	8	53500	53507	75 %	25 %	0 %	0 %	217963355
1085	NC_011660	CGA	2	6	53545	53550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963355
1086	NC_011660	GCG	2	6	53580	53585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963355
1087	NC_011660	AAC	2	6	53591	53596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963355
1088	NC_011660	ATT	2	6	53676	53681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963355
1089	NC_011660	GCT	2	6	53742	53747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963355
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1091	NC_011660	TGAA	2	8	53765	53772	50 %	25 %	25 %	0 %	217963355
1092	NC_011660	TTTG	2	8	53780	53787	0 %	75 %	25 %	0 %	217963356
1093	NC_011660	A	6	6	53820	53825	100 %	0 %	0 %	0 %	217963356
1094	NC_011660	GTTC	2	8	53855	53862	0 %	50 %	25 %	25 %	217963356
1095	NC_011660	CAA	2	6	53937	53942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963356
1096	NC_011660	A	6	6	53954	53959	100 %	0 %	0 %	0 %	217963356
1097	NC_011660	AGCG	2	8	54046	54053	25 %	0 %	50 %	25 %	217963356
1098	NC_011660	T	6	6	54166	54171	0 %	100 %	0 %	0 %	217963356
1099	NC_011660	CG	3	6	54377	54382	0 %	0 %	50 %	50 %	217963357
1100	NC_011660	AATA	2	8	54455	54462	75 %	25 %	0 %	0 %	217963357
1101	NC_011660	CGG	2	6	54493	54498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963357
1102	NC_011660	CG	3	6	54539	54544	0 %	0 %	50 %	50 %	217963357
1103	NC_011660	A	6	6	54545	54550	100 %	0 %	0 %	0 %	217963357
1104	NC_011660	TGG	2	6	54667	54672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963357
1105	NC_011660	TTG	2	6	54723	54728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963357
1106	NC_011660	GAAA	2	8	54751	54758	75 %	0 %	25 %	0 %	217963357
1107	NC_011660	TCGT	2	8	54771	54778	0 %	50 %	25 %	25 %	217963357
1108	NC_011660	GCT	2	6	54782	54787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963357
1109	NC_011660	GGCG	2	8	54814	54821	0 %	0 %	75 %	25 %	217963357
1110	NC_011660	TGA	2	6	54871	54876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963357
1111	NC_011660	TTG	2	6	54921	54926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963357
1112	NC_011660	CTG	2	6	54927	54932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963357
1113	NC_011660	CGG	2	6	55006	55011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963357
1114	NC_011660	TAAA	2	8	55047	55054	75 %	25 %	0 %	0 %	217963357
1115	NC_011660	ATT	2	6	55163	55168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963357
1116	NC_011660	A	6	6	55178	55183	100 %	0 %	0 %	0 %	217963357
1117	NC_011660	ATG	2	6	55206	55211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963357
1118	NC_011660	GGT	2	6	55226	55231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963357
1119	NC_011660	AGC	2	6	55285	55290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963357
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1121	NC_011660	TGC	2	6	55390	55395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963357
1122	NC_011660	TGA	2	6	55414	55419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963357
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1125	NC_011660	ACA	2	6	55725	55730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963358
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