MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 58903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011660	AGA	2	6	258943	258948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963552
5002	NC_011660	CGC	2	6	259037	259042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963552
5003	NC_011660	ATG	2	6	259091	259096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963552
5004	NC_011660	ACT	2	6	259132	259137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963552
5005	NC_011660	A	6	6	259158	259163	100 %	0 %	0 %	0 %	217963552
5006	NC_011660	CATTAA	2	12	259219	259230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	217963553
5007	NC_011660	GGA	2	6	259239	259244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963553
5008	NC_011660	AGA	2	6	259247	259252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963553
5009	NC_011660	AGC	2	6	259259	259264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963553
5010	NC_011660	ACAA	2	8	259277	259284	75 %	0 %	0 %	25 %	217963553
5011	NC_011660	TAAATT	2	12	259400	259411	50 %	50 %	0 %	0 %	217963553
5012	NC_011660	A	6	6	259486	259491	100 %	0 %	0 %	0 %	217963553
5013	NC_011660	GAA	2	6	259505	259510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963553
5014	NC_011660	ATG	2	6	259522	259527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963553
5015	NC_011660	AAT	2	6	259536	259541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963553
5016	NC_011660	TAA	2	6	259571	259576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963553
5017	NC_011660	GAA	2	6	259652	259657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963553
5018	NC_011660	GAA	2	6	259665	259670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963553
5019	NC_011660	AAT	2	6	259677	259682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963553
5020	NC_011660	AGT	2	6	259814	259819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963553
5021	NC_011660	TCTA	2	8	259829	259836	25 %	50 %	0 %	25 %	217963553
5022	NC_011660	AAACT	2	10	259870	259879	60 %	20 %	0 %	20 %	217963553
5023	NC_011660	TAT	2	6	259910	259915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963553
5024	NC_011660	TGA	2	6	259916	259921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963553
5025	NC_011660	A	6	6	259932	259937	100 %	0 %	0 %	0 %	217963553
5026	NC_011660	ATT	2	6	259963	259968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963553
5027	NC_011660	CTA	2	6	260127	260132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963554
5028	NC_011660	TATT	2	8	260224	260231	25 %	75 %	0 %	0 %	217963554
5029	NC_011660	TGC	2	6	260300	260305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963554
5030	NC_011660	TCGC	2	8	260514	260521	0 %	25 %	25 %	50 %	217963554
5031	NC_011660	ATT	2	6	260613	260618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963554
5032	NC_011660	A	6	6	260676	260681	100 %	0 %	0 %	0 %	217963554
5033	NC_011660	ATG	2	6	260734	260739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963555
5034	NC_011660	CTG	2	6	260765	260770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963555
5035	NC_011660	CTT	2	6	260814	260819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963555
5036	NC_011660	ATT	2	6	260826	260831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963555
5037	NC_011660	T	7	7	260916	260922	0 %	100 %	0 %	0 %	217963555
5038	NC_011660	TGG	2	6	260978	260983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963555
5039	NC_011660	T	6	6	260985	260990	0 %	100 %	0 %	0 %	217963555
5040	NC_011660	AAATA	2	10	261021	261030	80 %	20 %	0 %	0 %	217963555
5041	NC_011660	GTT	2	6	261037	261042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963555
5042	NC_011660	CGG	2	6	261068	261073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963555
5043	NC_011660	TAT	2	6	261105	261110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963555
5044	NC_011660	GCT	2	6	261136	261141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963555
5045	NC_011660	CGC	2	6	261261	261266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963555
5046	NC_011660	TCG	2	6	261269	261274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963555
5047	NC_011660	AATT	2	8	261390	261397	50 %	50 %	0 %	0 %	217963555
5048	NC_011660	AGG	2	6	261429	261434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963555
5049	NC_011660	A	6	6	261463	261468	100 %	0 %	0 %	0 %	217963556
5050	NC_011660	T	6	6	261566	261571	0 %	100 %	0 %	0 %	217963556
5051	NC_011660	AAT	2	6	261629	261634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963556
5052	NC_011660	CAA	2	6	261699	261704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963556
5053	NC_011660	TCC	2	6	261730	261735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217963556
5054	NC_011660	A	7	7	261777	261783	100 %	0 %	0 %	0 %	217963556
5055	NC_011660	CGG	2	6	261863	261868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963556
5056	NC_011660	TGA	2	6	261929	261934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963556
5057	NC_011660	CCG	2	6	261940	261945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963556
5058	NC_011660	CGA	2	6	262009	262014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963556
5059	NC_011660	CGG	2	6	262079	262084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963556
5060	NC_011660	TTG	2	6	262090	262095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963556
5061	NC_011660	AGA	2	6	262133	262138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963556
5062	NC_011660	ATT	2	6	262174	262179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963556
5063	NC_011660	AAG	2	6	262192	262197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963556
5064	NC_011660	CGATT	2	10	262221	262230	20 %	40 %	20 %	20 %	217963557
5065	NC_011660	TAT	2	6	262249	262254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963557
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5068	NC_011660	CAT	2	6	262352	262357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963557
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5070	NC_011660	AT	3	6	262402	262407	50 %	50 %	0 %	0 %	217963557
5071	NC_011660	TGC	2	6	262408	262413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963557
5072	NC_011660	TGC	2	6	262452	262457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963557
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5079	NC_011660	GGA	2	6	262715	262720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963557
5080	NC_011660	AGCG	2	8	262726	262733	25 %	0 %	50 %	25 %	217963557
5081	NC_011660	TTATT	2	10	262774	262783	20 %	80 %	0 %	0 %	217963557
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5086	NC_011660	GTA	2	6	262877	262882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963557
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5088	NC_011660	AATC	2	8	262926	262933	50 %	25 %	0 %	25 %	217963557
5089	NC_011660	GACG	2	8	262949	262956	25 %	0 %	50 %	25 %	217963557
5090	NC_011660	TTA	2	6	263025	263030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963557
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5092	NC_011660	AATAT	2	10	263100	263109	60 %	40 %	0 %	0 %	217963557
5093	NC_011660	TGT	2	6	263119	263124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963557
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5103	NC_011660	ATT	2	6	263501	263506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963559
5104	NC_011660	GGA	2	6	263516	263521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963559
5105	NC_011660	CG	3	6	263591	263596	0 %	0 %	50 %	50 %	217963559
5106	NC_011660	TTTATA	2	12	263624	263635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963559
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5115	NC_011660	A	7	7	264016	264022	100 %	0 %	0 %	0 %	217963559
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5118	NC_011660	GTT	2	6	264104	264109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963559
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5120	NC_011660	CG	3	6	264227	264232	0 %	0 %	50 %	50 %	217963559
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5122	NC_011660	GAA	2	6	264305	264310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963559
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5492	NC_011660	ATT	2	6	283512	283517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963574
5493	NC_011660	TA	3	6	283624	283629	50 %	50 %	0 %	0 %	217963575
5494	NC_011660	A	7	7	283641	283647	100 %	0 %	0 %	0 %	217963575
5495	NC_011660	AAT	2	6	283658	283663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963575
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