MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang plasmid plca36

Total Repeats: 607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011352	AAT	2	6	28564	28569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401042
502	NC_011352	AGG	2	6	28615	28620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209401042
503	NC_011352	AT	3	6	28630	28635	50 %	50 %	0 %	0 %	209401042
504	NC_011352	T	7	7	28637	28643	0 %	100 %	0 %	0 %	209401042
505	NC_011352	T	6	6	28745	28750	0 %	100 %	0 %	0 %	209401042
506	NC_011352	GAT	2	6	28755	28760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209401042
507	NC_011352	ATT	2	6	28790	28795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209401042
508	NC_011352	TAC	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209401042
509	NC_011352	ATTTGA	2	12	29074	29085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209401043
510	NC_011352	ACG	2	6	29167	29172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209401043
511	NC_011352	A	7	7	29233	29239	100 %	0 %	0 %	0 %	209401043
512	NC_011352	TAT	2	6	29282	29287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209401043
513	NC_011352	TAG	2	6	29331	29336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209401043
514	NC_011352	TTG	2	6	29346	29351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209401043
515	NC_011352	CGA	2	6	29374	29379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209401043
516	NC_011352	AGC	2	6	29383	29388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209401043
517	NC_011352	TAA	2	6	29464	29469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401043
518	NC_011352	TGG	2	6	29500	29505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209401043
519	NC_011352	AAT	2	6	29630	29635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401043
520	NC_011352	CGA	2	6	29641	29646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209401043
521	NC_011352	GAAA	2	8	29713	29720	75 %	0 %	25 %	0 %	209401043
522	NC_011352	TG	3	6	29721	29726	0 %	50 %	50 %	0 %	209401043
523	NC_011352	TTAA	2	8	29729	29736	50 %	50 %	0 %	0 %	209401043
524	NC_011352	TTA	2	6	29792	29797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209401043
525	NC_011352	AAAG	2	8	29803	29810	75 %	0 %	25 %	0 %	209401043
526	NC_011352	A	6	6	29889	29894	100 %	0 %	0 %	0 %	209401043
527	NC_011352	TGGT	2	8	30006	30013	0 %	50 %	50 %	0 %	209401043
528	NC_011352	GTT	2	6	30020	30025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209401043
529	NC_011352	GGA	2	6	30034	30039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209401043
530	NC_011352	AAAT	2	8	30699	30706	75 %	25 %	0 %	0 %	209401044
531	NC_011352	TAA	2	6	30727	30732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401044
532	NC_011352	ATGT	2	8	30753	30760	25 %	50 %	25 %	0 %	209401044
533	NC_011352	AAG	2	6	30803	30808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209401044
534	NC_011352	TGT	2	6	30826	30831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209401044
535	NC_011352	TTA	2	6	30846	30851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209401044
536	NC_011352	TAAC	2	8	30858	30865	50 %	25 %	0 %	25 %	209401044
537	NC_011352	AT	3	6	30877	30882	50 %	50 %	0 %	0 %	209401044
538	NC_011352	ACA	2	6	30885	30890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209401044
539	NC_011352	T	7	7	30920	30926	0 %	100 %	0 %	0 %	209401044
540	NC_011352	TAA	2	6	31047	31052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401044
541	NC_011352	A	7	7	31099	31105	100 %	0 %	0 %	0 %	209401044
542	NC_011352	TAAAA	2	10	31123	31132	80 %	20 %	0 %	0 %	209401044
543	NC_011352	ATT	2	6	31452	31457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209401045
544	NC_011352	A	6	6	31502	31507	100 %	0 %	0 %	0 %	209401045
545	NC_011352	TGA	2	6	31682	31687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209401045
546	NC_011352	TCA	2	6	31694	31699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209401045
547	NC_011352	ATC	2	6	31741	31746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209401045
548	NC_011352	CAA	2	6	31756	31761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209401045
549	NC_011352	AGC	2	6	31778	31783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209401045
550	NC_011352	GAC	2	6	31908	31913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209401045
551	NC_011352	TTC	2	6	32259	32264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209401046
552	NC_011352	AAT	2	6	32281	32286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401046
553	NC_011352	CAA	2	6	32329	32334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209401046
554	NC_011352	CTT	2	6	32351	32356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209401046
555	NC_011352	CTTC	2	8	32485	32492	0 %	50 %	0 %	50 %	209401046
556	NC_011352	CATC	2	8	32575	32582	25 %	25 %	0 %	50 %	209401046
557	NC_011352	AAT	2	6	32597	32602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401046
558	NC_011352	TTTC	2	8	32677	32684	0 %	75 %	0 %	25 %	209401046
559	NC_011352	CCT	2	6	33072	33077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209401047
560	NC_011352	CGA	2	6	33114	33119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209401047
561	NC_011352	GAG	2	6	33209	33214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209401047
562	NC_011352	GGT	2	6	33262	33267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209401047
563	NC_011352	AGA	2	6	33290	33295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209401047
564	NC_011352	CTT	2	6	33517	33522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209401047
565	NC_011352	G	6	6	33531	33536	0 %	0 %	100 %	0 %	209401047
566	NC_011352	GGA	2	6	33544	33549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209401047
567	NC_011352	GGA	2	6	33583	33588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209401047
568	NC_011352	GGC	2	6	33595	33600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209401047
569	NC_011352	TCTT	2	8	33678	33685	0 %	75 %	0 %	25 %	209401047
570	NC_011352	TAA	2	6	33902	33907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401048
571	NC_011352	T	6	6	33945	33950	0 %	100 %	0 %	0 %	209401048
572	NC_011352	ATTT	2	8	33986	33993	25 %	75 %	0 %	0 %	209401048
573	NC_011352	T	6	6	34064	34069	0 %	100 %	0 %	0 %	209401048
574	NC_011352	A	6	6	34111	34116	100 %	0 %	0 %	0 %	209401049
575	NC_011352	TAT	2	6	34133	34138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209401049
576	NC_011352	CAT	2	6	34151	34156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209401049
577	NC_011352	AAT	2	6	34161	34166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401049
578	NC_011352	GCC	2	6	34186	34191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209401049
579	NC_011352	TCAG	2	8	34231	34238	25 %	25 %	25 %	25 %	209401049
580	NC_011352	TCT	2	6	34253	34258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209401049
581	NC_011352	GCC	2	6	34279	34284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209401049
582	NC_011352	GTT	2	6	34369	34374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209401049
583	NC_011352	AAT	2	6	34520	34525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401050
584	NC_011352	TGC	2	6	34532	34537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209401050
585	NC_011352	AGG	2	6	34544	34549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209401050
586	NC_011352	ACA	2	6	34560	34565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209401050
587	NC_011352	TGAT	2	8	34618	34625	25 %	50 %	25 %	0 %	209401050
588	NC_011352	ACC	2	6	34630	34635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209401050
589	NC_011352	ATT	2	6	34722	34727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209401050
590	NC_011352	GTT	2	6	34814	34819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209401050
591	NC_011352	GAA	2	6	34856	34861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209401050
592	NC_011352	AC	3	6	34884	34889	50 %	0 %	0 %	50 %	209401050
593	NC_011352	GTC	2	6	35038	35043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209401050
594	NC_011352	ACA	2	6	35092	35097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209401050
595	NC_011352	AAC	2	6	35183	35188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209401050
596	NC_011352	GAA	3	9	35217	35225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209401050
597	NC_011352	AAT	2	6	35226	35231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401050
598	NC_011352	T	6	6	35253	35258	0 %	100 %	0 %	0 %	209401050
599	NC_011352	AAT	2	6	35296	35301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209401050
600	NC_011352	AAG	2	6	35408	35413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209401051
601	NC_011352	A	6	6	35562	35567	100 %	0 %	0 %	0 %	209401051
602	NC_011352	AGAA	2	8	35594	35601	75 %	0 %	25 %	0 %	209401052
603	NC_011352	ATT	2	6	35605	35610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209401052
604	NC_011352	CAAA	2	8	35620	35627	75 %	0 %	0 %	25 %	209401052
605	NC_011352	T	6	6	35635	35640	0 %	100 %	0 %	0 %	209401052
606	NC_011352	TTGTA	2	10	35646	35655	20 %	60 %	20 %	0 %	209401052
607	NC_011352	T	6	6	35657	35662	0 %	100 %	0 %	0 %	209401052

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