MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 49578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010999	TCA	2	6	220233	220238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637045
3502	NC_010999	CAAAA	2	10	220265	220274	80 %	0 %	0 %	20 %	191637045
3503	NC_010999	A	6	6	220336	220341	100 %	0 %	0 %	0 %	191637046
3504	NC_010999	TTG	2	6	220357	220362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637046
3505	NC_010999	CGA	2	6	220402	220407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637046
3506	NC_010999	GCG	2	6	220431	220436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637046
3507	NC_010999	ACTGG	2	10	220457	220466	20 %	20 %	40 %	20 %	191637046
3508	NC_010999	A	6	6	220469	220474	100 %	0 %	0 %	0 %	191637046
3509	NC_010999	GAC	2	6	220509	220514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637046
3510	NC_010999	GCG	2	6	220712	220717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637046
3511	NC_010999	TGA	2	6	220721	220726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637046
3512	NC_010999	CGG	3	9	220807	220815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637046
3513	NC_010999	GTT	2	6	220862	220867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637046
3514	NC_010999	ATT	2	6	221085	221090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637046
3515	NC_010999	GAA	2	6	221129	221134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637046
3516	NC_010999	ATGA	2	8	221148	221155	50 %	25 %	25 %	0 %	191637046
3517	NC_010999	TAT	2	6	221162	221167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637046
3518	NC_010999	GAA	2	6	221220	221225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637046
3519	NC_010999	CAG	2	6	221272	221277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637046
3520	NC_010999	GGC	2	6	221300	221305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637046
3521	NC_010999	AAG	2	6	221317	221322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637046
3522	NC_010999	AGGT	2	8	221368	221375	25 %	25 %	50 %	0 %	191637046
3523	NC_010999	ATG	2	6	221423	221428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637047
3524	NC_010999	TGA	2	6	221472	221477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637047
3525	NC_010999	AATA	2	8	221515	221522	75 %	25 %	0 %	0 %	191637047
3526	NC_010999	T	6	6	221598	221603	0 %	100 %	0 %	0 %	191637047
3527	NC_010999	GAA	2	6	221620	221625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637047
3528	NC_010999	TTA	2	6	221639	221644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637047
3529	NC_010999	CCATG	2	10	221661	221670	20 %	20 %	20 %	40 %	191637047
3530	NC_010999	TTG	2	6	221684	221689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637047
3531	NC_010999	TTA	2	6	221719	221724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637047
3532	NC_010999	GAC	2	6	221740	221745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637047
3533	NC_010999	CGA	2	6	221760	221765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637047
3534	NC_010999	AAC	2	6	221868	221873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637047
3535	NC_010999	AATGAC	2	12	221892	221903	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	191637047
3536	NC_010999	GCT	2	6	221922	221927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637047
3537	NC_010999	CAG	2	6	222031	222036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637047
3538	NC_010999	T	6	6	222066	222071	0 %	100 %	0 %	0 %	191637047
3539	NC_010999	ATG	2	6	222161	222166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637047
3540	NC_010999	ATT	2	6	222172	222177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637047
3541	NC_010999	AGCCAA	2	12	222198	222209	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	191637047
3542	NC_010999	GAA	2	6	222234	222239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637047
3543	NC_010999	TCAG	2	8	222267	222274	25 %	25 %	25 %	25 %	191637047
3544	NC_010999	GGC	2	6	222473	222478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637048
3545	NC_010999	TACG	2	8	222497	222504	25 %	25 %	25 %	25 %	191637048
3546	NC_010999	ATG	2	6	222509	222514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637048
3547	NC_010999	AAG	2	6	222663	222668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637048
3548	NC_010999	CAT	2	6	222689	222694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637048
3549	NC_010999	GGT	2	6	222725	222730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637048
3550	NC_010999	GTCG	2	8	222848	222855	0 %	25 %	50 %	25 %	191637048
3551	NC_010999	CTA	2	6	222897	222902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637048
3552	NC_010999	GAT	2	6	222941	222946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637048
3553	NC_010999	ATCAAT	2	12	222983	222994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	191637048
3554	NC_010999	CTG	2	6	223080	223085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637048
3555	NC_010999	AAGC	2	8	223088	223095	50 %	0 %	25 %	25 %	191637048
3556	NC_010999	TCT	2	6	223160	223165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637048
3557	NC_010999	AGC	2	6	223298	223303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637049
3558	NC_010999	CCA	2	6	223314	223319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191637049
3559	NC_010999	TCA	2	6	223340	223345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637049
3560	NC_010999	GTC	2	6	223365	223370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637049
3561	NC_010999	GAGTC	2	10	223427	223436	20 %	20 %	40 %	20 %	191637049
3562	NC_010999	ATG	2	6	223540	223545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637049
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3564	NC_010999	TTC	2	6	223968	223973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637050
3565	NC_010999	CAA	2	6	223982	223987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637050
3566	NC_010999	GCA	2	6	223990	223995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637050
3567	NC_010999	TTG	2	6	224052	224057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637050
3568	NC_010999	ATC	2	6	224119	224124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637050
3569	NC_010999	CG	3	6	224129	224134	0 %	0 %	50 %	50 %	191637050
3570	NC_010999	TG	3	6	224143	224148	0 %	50 %	50 %	0 %	191637050
3571	NC_010999	CAA	2	6	224231	224236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637050
3572	NC_010999	GTT	2	6	224332	224337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637050
3573	NC_010999	T	6	6	224366	224371	0 %	100 %	0 %	0 %	191637050
3574	NC_010999	ACTCA	2	10	224400	224409	40 %	20 %	0 %	40 %	191637050
3575	NC_010999	ATC	2	6	224424	224429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637050
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3577	NC_010999	AGCT	2	8	224592	224599	25 %	25 %	25 %	25 %	191637050
3578	NC_010999	TGGT	2	8	224976	224983	0 %	50 %	50 %	0 %	191637051
3579	NC_010999	ATTTG	2	10	225046	225055	20 %	60 %	20 %	0 %	191637051
3580	NC_010999	ATC	2	6	225146	225151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637051
3581	NC_010999	CTG	2	6	225165	225170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637051
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3583	NC_010999	TGAT	2	8	225231	225238	25 %	50 %	25 %	0 %	191637051
3584	NC_010999	GGC	2	6	225239	225244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637051
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3586	NC_010999	GCT	2	6	225280	225285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637051
3587	NC_010999	GCT	2	6	225287	225292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637051
3588	NC_010999	GGC	2	6	225326	225331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637051
3589	NC_010999	TGG	2	6	225367	225372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637051
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3591	NC_010999	GCG	2	6	225566	225571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637051
3592	NC_010999	GCTG	2	8	225609	225616	0 %	25 %	50 %	25 %	191637051
3593	NC_010999	GCC	2	6	225626	225631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191637051
3594	NC_010999	GAA	2	6	225710	225715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637051
3595	NC_010999	TGA	2	6	225759	225764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637051
3596	NC_010999	GAA	2	6	225779	225784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637051
3597	NC_010999	GGC	2	6	225833	225838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637051
3598	NC_010999	AT	3	6	225949	225954	50 %	50 %	0 %	0 %	191637052
3599	NC_010999	ACT	2	6	225974	225979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637052
3600	NC_010999	TTTG	2	8	225994	226001	0 %	75 %	25 %	0 %	191637052
3601	NC_010999	TGG	2	6	226159	226164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637052
3602	NC_010999	CG	3	6	226227	226232	0 %	0 %	50 %	50 %	191637052
3603	NC_010999	TCA	2	6	226233	226238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637052
3604	NC_010999	AGC	3	9	226255	226263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637052
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3606	NC_010999	GCG	2	6	226610	226615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637052
3607	NC_010999	TTGGCG	2	12	226680	226691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	191637052
3608	NC_010999	TGAC	2	8	226749	226756	25 %	25 %	25 %	25 %	191637052
3609	NC_010999	TAC	2	6	226793	226798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637052
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3613	NC_010999	AAC	2	6	226902	226907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637052
3614	NC_010999	TCCA	2	8	226980	226987	25 %	25 %	0 %	50 %	191637052
3615	NC_010999	GCA	2	6	227056	227061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637052
3616	NC_010999	AGC	2	6	227083	227088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637052
3617	NC_010999	TA	3	6	227112	227117	50 %	50 %	0 %	0 %	191637052
3618	NC_010999	TGA	2	6	227127	227132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637052
3619	NC_010999	GC	3	6	227183	227188	0 %	0 %	50 %	50 %	191637052
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3621	NC_010999	GTT	2	6	227392	227397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637052
3622	NC_010999	GCT	2	6	227492	227497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637052
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3986	NC_010999	TGA	2	6	247389	247394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637069
3987	NC_010999	GCG	2	6	247773	247778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637070
3988	NC_010999	ATCC	2	8	247820	247827	25 %	25 %	0 %	50 %	191637070
3989	NC_010999	TTG	2	6	247862	247867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637070
3990	NC_010999	ATGG	2	8	247913	247920	25 %	25 %	50 %	0 %	191637070
3991	NC_010999	ATC	2	6	247938	247943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637070
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