MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010610	AAG	2	6	242231	242236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154673
4002	NC_010610	CCG	2	6	242250	242255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154673
4003	NC_010610	TGC	2	6	242278	242283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154673
4004	NC_010610	CAG	2	6	242314	242319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154673
4005	NC_010610	CTC	2	6	242335	242340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154673
4006	NC_010610	A	6	6	242350	242355	100 %	0 %	0 %	0 %	184154673
4007	NC_010610	CGG	2	6	242364	242369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154673
4008	NC_010610	CGC	2	6	242380	242385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154673
4009	NC_010610	TTGA	2	8	242396	242403	25 %	50 %	25 %	0 %	184154673
4010	NC_010610	CAA	2	6	242417	242422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154673
4011	NC_010610	ACA	2	6	242517	242522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154673
4012	NC_010610	CTT	2	6	242562	242567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154673
4013	NC_010610	CTC	2	6	242572	242577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154673
4014	NC_010610	GCG	2	6	242618	242623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154673
4015	NC_010610	AGC	2	6	242633	242638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154673
4016	NC_010610	CTT	2	6	242661	242666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154673
4017	NC_010610	CTA	2	6	242694	242699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154673
4018	NC_010610	CAG	2	6	242707	242712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154673
4019	NC_010610	CAA	2	6	242792	242797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154673
4020	NC_010610	ACA	2	6	242868	242873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154673
4021	NC_010610	CGT	2	6	243156	243161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154674
4022	NC_010610	TCG	2	6	243182	243187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154674
4023	NC_010610	TCG	2	6	243198	243203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154674
4024	NC_010610	ATC	2	6	243248	243253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154674
4025	NC_010610	TCG	2	6	243257	243262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154674
4026	NC_010610	CAT	2	6	243283	243288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154674
4027	NC_010610	GCC	2	6	243332	243337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154674
4028	NC_010610	GTA	2	6	243370	243375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154674
4029	NC_010610	GGC	2	6	243445	243450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154674
4030	NC_010610	ATC	2	6	243464	243469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154674
4031	NC_010610	ACAT	2	8	243590	243597	50 %	25 %	0 %	25 %	184154674
4032	NC_010610	CGG	2	6	243603	243608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154674
4033	NC_010610	AGG	2	6	243617	243622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154674
4034	NC_010610	CGG	2	6	243645	243650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154674
4035	NC_010610	CGA	2	6	243657	243662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154674
4036	NC_010610	GGT	2	6	243706	243711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154674
4037	NC_010610	GAAA	2	8	243730	243737	75 %	0 %	25 %	0 %	184154674
4038	NC_010610	GTT	2	6	243757	243762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154674
4039	NC_010610	GCC	2	6	243804	243809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154674
4040	NC_010610	ACC	2	6	243821	243826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154674
4041	NC_010610	GTCAAT	2	12	243907	243918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184154674
4042	NC_010610	TTAAT	2	10	243924	243933	40 %	60 %	0 %	0 %	184154674
4043	NC_010610	CCT	2	6	243946	243951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154675
4044	NC_010610	ATG	3	9	243961	243969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154675
4045	NC_010610	GTT	2	6	243972	243977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154675
4046	NC_010610	TGT	2	6	244025	244030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154675
4047	NC_010610	AAG	2	6	244060	244065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154675
4048	NC_010610	GCC	2	6	244096	244101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154675
4049	NC_010610	AACT	2	8	244128	244135	50 %	25 %	0 %	25 %	184154675
4050	NC_010610	GGTA	2	8	244190	244197	25 %	25 %	50 %	0 %	184154675
4051	NC_010610	GTA	2	6	244233	244238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154675
4052	NC_010610	CCG	2	6	244253	244258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154675
4053	NC_010610	GGTC	2	8	244268	244275	0 %	25 %	50 %	25 %	184154675
4054	NC_010610	GTC	2	6	244368	244373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154675
4055	NC_010610	CAT	2	6	244415	244420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154675
4056	NC_010610	GTT	2	6	244452	244457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154675
4057	NC_010610	GAT	2	6	244614	244619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154675
4058	NC_010610	GGTCGA	2	12	244697	244708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184154675
4059	NC_010610	GTAG	2	8	244748	244755	25 %	25 %	50 %	0 %	184154675
4060	NC_010610	ATC	2	6	244786	244791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154675
4061	NC_010610	ACT	2	6	244795	244800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154675
4062	NC_010610	TGG	3	9	244886	244894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154675
4063	NC_010610	GGC	2	6	244907	244912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154675
4064	NC_010610	GT	3	6	244954	244959	0 %	50 %	50 %	0 %	184154675
4065	NC_010610	ATC	2	6	245022	245027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154675
4066	NC_010610	GTG	2	6	245046	245051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154675
4067	NC_010610	CGG	2	6	245086	245091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154675
4068	NC_010610	CCG	2	6	245178	245183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154675
4069	NC_010610	TGA	2	6	245207	245212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154675
4070	NC_010610	CAA	2	6	245234	245239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154675
4071	NC_010610	TCT	2	6	245270	245275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154675
4072	NC_010610	ACC	2	6	245454	245459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154676
4073	NC_010610	AAG	2	6	245479	245484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154676
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4075	NC_010610	ACC	2	6	245670	245675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154676
4076	NC_010610	CGA	2	6	245723	245728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154676
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4078	NC_010610	AATTG	2	10	245822	245831	40 %	40 %	20 %	0 %	184154676
4079	NC_010610	TGATA	2	10	245844	245853	40 %	40 %	20 %	0 %	184154676
4080	NC_010610	CAA	2	6	246012	246017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154677
4081	NC_010610	ATCG	2	8	246146	246153	25 %	25 %	25 %	25 %	184154677
4082	NC_010610	CGAAGA	2	12	246176	246187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	184154677
4083	NC_010610	AAG	2	6	246198	246203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154677
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4087	NC_010610	AGA	2	6	246281	246286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154677
4088	NC_010610	GAT	3	9	246297	246305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154677
4089	NC_010610	GAC	2	6	246321	246326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154677
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4091	NC_010610	GAC	2	6	246339	246344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154677
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4093	NC_010610	CGA	2	6	246419	246424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154677
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4101	NC_010610	GTT	2	6	246676	246681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154678
4102	NC_010610	GGC	2	6	246705	246710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154678
4103	NC_010610	ACG	2	6	246833	246838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154678
4104	NC_010610	GAC	2	6	246912	246917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154678
4105	NC_010610	GGAC	2	8	246970	246977	25 %	0 %	50 %	25 %	184154678
4106	NC_010610	CA	3	6	246992	246997	50 %	0 %	0 %	50 %	184154678
4107	NC_010610	GCCGG	2	10	247025	247034	0 %	0 %	60 %	40 %	184154678
4108	NC_010610	A	6	6	247129	247134	100 %	0 %	0 %	0 %	184154678
4109	NC_010610	GGCG	2	8	247137	247144	0 %	0 %	75 %	25 %	184154678
4110	NC_010610	GCC	2	6	247192	247197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154678
4111	NC_010610	CCAAC	2	10	247216	247225	40 %	0 %	0 %	60 %	184154678
4112	NC_010610	TGG	2	6	247271	247276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154678
4113	NC_010610	GAA	2	6	247285	247290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154678
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4115	NC_010610	TGG	2	6	247484	247489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154678
4116	NC_010610	TGGT	2	8	247532	247539	0 %	50 %	50 %	0 %	184154678
4117	NC_010610	ATG	2	6	247685	247690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154678
4118	NC_010610	GGT	2	6	247705	247710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154678
4119	NC_010610	GAT	2	6	247734	247739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154678
4120	NC_010610	CGTAC	2	10	247770	247779	20 %	20 %	20 %	40 %	184154678
4121	NC_010610	CAT	2	6	247887	247892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154678
4122	NC_010610	AAG	2	6	247910	247915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154678
4123	NC_010610	G	6	6	247929	247934	0 %	0 %	100 %	0 %	184154678
4124	NC_010610	AAC	2	6	248047	248052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154678
4125	NC_010610	TTC	2	6	248149	248154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154678
4126	NC_010610	GCC	2	6	248158	248163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154678
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4128	NC_010610	ATT	2	6	248208	248213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154678
4129	NC_010610	GCC	2	6	248215	248220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154678
4130	NC_010610	A	7	7	248461	248467	100 %	0 %	0 %	0 %	184154679
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4132	NC_010610	AACCTT	2	12	248781	248792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154679
4133	NC_010610	AAC	2	6	248875	248880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154679
4134	NC_010610	GGC	2	6	248973	248978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154679
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4137	NC_010610	GCC	2	6	249190	249195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154679
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4141	NC_010610	GCC	2	6	249409	249414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154679
4142	NC_010610	GGT	2	6	249426	249431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154679
4143	NC_010610	ACA	2	6	249638	249643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154679
4144	NC_010610	CAA	2	6	250042	250047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154680
4145	NC_010610	AACC	2	8	250066	250073	50 %	0 %	0 %	50 %	184154680
4146	NC_010610	ATG	2	6	250797	250802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154681
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4150	NC_010610	TGG	2	6	250942	250947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154681
4151	NC_010610	A	6	6	250949	250954	100 %	0 %	0 %	0 %	184154681
4152	NC_010610	GAA	2	6	250958	250963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154681
4153	NC_010610	CAG	2	6	250982	250987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154681
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4156	NC_010610	TTG	2	6	251403	251408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154681
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4159	NC_010610	ATT	3	9	252197	252205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154682
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4161	NC_010610	ATG	2	6	252239	252244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154682
4162	NC_010610	AAG	2	6	252279	252284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154682
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4227	NC_010610	CGGGC	3	15	256365	256379	0 %	0 %	60 %	40 %	184154685
4228	NC_010610	GAA	3	9	256484	256492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154685
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4230	NC_010610	CGA	2	6	256551	256556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154685
4231	NC_010610	CGC	2	6	256576	256581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154685
4232	NC_010610	GTT	2	6	256585	256590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154685
4233	NC_010610	ACG	2	6	256599	256604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154685
4234	NC_010610	TGG	2	6	256614	256619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154685
4235	NC_010610	TCGCAA	2	12	256699	256710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	184154685
4236	NC_010610	CGG	2	6	256735	256740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154685
4237	NC_010610	GCG	2	6	256813	256818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154685
4238	NC_010610	AACCGG	2	12	256829	256840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154685
4239	NC_010610	CGC	2	6	256841	256846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154685
4240	NC_010610	CGGGAT	2	12	256867	256878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184154686
4241	NC_010610	GCGG	2	8	256906	256913	0 %	0 %	75 %	25 %	184154686
4242	NC_010610	CAA	2	6	256936	256941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154686
4243	NC_010610	CTA	2	6	256993	256998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154686
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4249	NC_010610	AGTT	2	8	257462	257469	25 %	50 %	25 %	0 %	184154687
4250	NC_010610	C	6	6	257501	257506	0 %	0 %	0 %	100 %	184154687
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4282	NC_010610	TTGG	2	8	259448	259455	0 %	50 %	50 %	0 %	184154689
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4348	NC_010610	A	7	7	263565	263571	100 %	0 %	0 %	0 %	184154691
4349	NC_010610	CCA	2	6	263620	263625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154691
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4357	NC_010610	CGCC	2	8	264185	264192	0 %	0 %	25 %	75 %	184154693
4358	NC_010610	CCG	2	6	264206	264211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154693
4359	NC_010610	TCG	2	6	264233	264238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154693
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4361	NC_010610	GTG	2	6	264267	264272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154693
4362	NC_010610	AGCA	2	8	264303	264310	50 %	0 %	25 %	25 %	184154693
4363	NC_010610	AACG	2	8	264346	264353	50 %	0 %	25 %	25 %	184154693
4364	NC_010610	AAG	2	6	264381	264386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154693
4365	NC_010610	GTT	2	6	264404	264409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154693
4366	NC_010610	ACT	2	6	264454	264459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154693
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4368	NC_010610	GAA	2	6	264635	264640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154694
4369	NC_010610	ATA	2	6	264705	264710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154694
4370	NC_010610	TCA	2	6	264750	264755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154694
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4372	NC_010610	GCCACG	2	12	264912	264923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	184154694
4373	NC_010610	TCA	2	6	264940	264945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154694
4374	NC_010610	TCCCG	2	10	264962	264971	0 %	20 %	20 %	60 %	184154694
4375	NC_010610	TCC	2	6	265040	265045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154694
4376	NC_010610	GGC	2	6	265106	265111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154694
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4378	NC_010610	T	7	7	265180	265186	0 %	100 %	0 %	0 %	184154695
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4382	NC_010610	GCG	2	6	265429	265434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154695
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4384	NC_010610	T	6	6	265456	265461	0 %	100 %	0 %	0 %	184154695
4385	NC_010610	CAC	2	6	265507	265512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154695
4386	NC_010610	GAC	2	6	265516	265521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154695
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4389	NC_010610	AACA	2	8	265639	265646	75 %	0 %	0 %	25 %	184154695
4390	NC_010610	CCG	2	6	265653	265658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154695
4391	NC_010610	AAAC	2	8	265697	265704	75 %	0 %	0 %	25 %	184154695
4392	NC_010610	AACG	2	8	265834	265841	50 %	0 %	25 %	25 %	184154695
4393	NC_010610	GCC	2	6	265891	265896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154695
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4401	NC_010610	CGGG	2	8	266167	266174	0 %	0 %	75 %	25 %	184154695
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4403	NC_010610	GCCA	2	8	266195	266202	25 %	0 %	25 %	50 %	184154695
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4422	NC_010610	TAC	2	6	266981	266986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154696
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4442	NC_010610	TTC	2	6	267889	267894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154697
4443	NC_010610	GTTGGG	2	12	267928	267939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154697
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4452	NC_010610	TTGG	2	8	268204	268211	0 %	50 %	50 %	0 %	184154697
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4479	NC_010610	GAA	2	6	269247	269252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154697
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4482	NC_010610	GAA	2	6	269458	269463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154698
4483	NC_010610	CCA	2	6	269466	269471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154698
4484	NC_010610	TCG	2	6	269609	269614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154698
4485	NC_010610	TGA	2	6	269808	269813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154698
4486	NC_010610	TTA	2	6	269820	269825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154698
4487	NC_010610	CGA	2	6	269940	269945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154698
4488	NC_010610	ACG	2	6	269965	269970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154698
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4490	NC_010610	TGAT	2	8	270161	270168	25 %	50 %	25 %	0 %	184154698
4491	NC_010610	GAA	3	9	270226	270234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154698
4492	NC_010610	GAATG	2	10	270348	270357	40 %	20 %	40 %	0 %	184154699
4493	NC_010610	AAG	2	6	270443	270448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154699
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4495	NC_010610	ATG	2	6	270524	270529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154699
4496	NC_010610	TGG	2	6	270571	270576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154699
4497	NC_010610	TGG	2	6	270591	270596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154699
4498	NC_010610	CGA	2	6	270613	270618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154699
4499	NC_010610	CCGATG	2	12	270624	270635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	184154699
4500	NC_010610	TAA	2	6	270664	270669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154699

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