MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010610	CTT	2	6	215561	215566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154648
3502	NC_010610	CGG	2	6	215584	215589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154648
3503	NC_010610	GTC	2	6	215622	215627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154648
3504	NC_010610	ACC	2	6	215751	215756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154648
3505	NC_010610	CGG	2	6	215764	215769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154648
3506	NC_010610	GCCA	2	8	215792	215799	25 %	0 %	25 %	50 %	184154648
3507	NC_010610	ACC	2	6	215931	215936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154648
3508	NC_010610	CAC	2	6	215939	215944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154648
3509	NC_010610	ATT	2	6	216011	216016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154649
3510	NC_010610	CGG	2	6	216039	216044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154649
3511	NC_010610	GTG	2	6	216059	216064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154649
3512	NC_010610	GGT	2	6	216082	216087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154649
3513	NC_010610	GAA	2	6	216125	216130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154649
3514	NC_010610	GC	3	6	216157	216162	0 %	0 %	50 %	50 %	184154649
3515	NC_010610	TGG	2	6	216183	216188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154649
3516	NC_010610	TGG	2	6	216207	216212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154649
3517	NC_010610	TTG	2	6	216257	216262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154649
3518	NC_010610	ACC	2	6	216365	216370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154649
3519	NC_010610	ACC	2	6	216386	216391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154649
3520	NC_010610	GCGACC	2	12	216420	216431	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	184154649
3521	NC_010610	GGC	2	6	216517	216522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154649
3522	NC_010610	GTT	2	6	216627	216632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154650
3523	NC_010610	ACCA	2	8	216642	216649	50 %	0 %	0 %	50 %	184154650
3524	NC_010610	AGC	2	6	216691	216696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154650
3525	NC_010610	CGC	3	9	216710	216718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154650
3526	NC_010610	CGA	2	6	216773	216778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154650
3527	NC_010610	CAG	2	6	216885	216890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154650
3528	NC_010610	GCC	2	6	216907	216912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154650
3529	NC_010610	CGAC	2	8	216919	216926	25 %	0 %	25 %	50 %	184154650
3530	NC_010610	TCT	2	6	216928	216933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154650
3531	NC_010610	CCG	3	9	216979	216987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154650
3532	NC_010610	CTGGGG	2	12	216993	217004	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	184154650
3533	NC_010610	G	6	6	217001	217006	0 %	0 %	100 %	0 %	184154650
3534	NC_010610	CGT	2	6	217007	217012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154650
3535	NC_010610	TCAA	2	8	217020	217027	50 %	25 %	0 %	25 %	184154650
3536	NC_010610	GTT	2	6	217082	217087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154650
3537	NC_010610	ACG	2	6	217207	217212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154650
3538	NC_010610	TAC	2	6	217227	217232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154650
3539	NC_010610	CGG	2	6	217251	217256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154650
3540	NC_010610	CACGA	2	10	217302	217311	40 %	0 %	20 %	40 %	184154650
3541	NC_010610	GCC	2	6	217326	217331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154650
3542	NC_010610	T	7	7	217763	217769	0 %	100 %	0 %	0 %	184154651
3543	NC_010610	ATT	2	6	217787	217792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154651
3544	NC_010610	AT	3	6	217794	217799	50 %	50 %	0 %	0 %	184154651
3545	NC_010610	CCT	2	6	217810	217815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154651
3546	NC_010610	T	7	7	218059	218065	0 %	100 %	0 %	0 %	184154651
3547	NC_010610	TTCA	2	8	218069	218076	25 %	50 %	0 %	25 %	184154651
3548	NC_010610	CAAAT	2	10	218121	218130	60 %	20 %	0 %	20 %	184154651
3549	NC_010610	AAAT	2	8	218267	218274	75 %	25 %	0 %	0 %	184154652
3550	NC_010610	GGC	2	6	218418	218423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154652
3551	NC_010610	AGA	2	6	218524	218529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154652
3552	NC_010610	AACT	2	8	218659	218666	50 %	25 %	0 %	25 %	184154652
3553	NC_010610	GCA	2	6	218687	218692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154652
3554	NC_010610	TAAC	2	8	218697	218704	50 %	25 %	0 %	25 %	184154652
3555	NC_010610	TTTC	2	8	218851	218858	0 %	75 %	0 %	25 %	184154652
3556	NC_010610	TC	3	6	218857	218862	0 %	50 %	0 %	50 %	184154652
3557	NC_010610	CTT	2	6	218947	218952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154652
3558	NC_010610	ACT	2	6	218954	218959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154652
3559	NC_010610	TCG	2	6	219049	219054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154652
3560	NC_010610	TTG	2	6	219110	219115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154652
3561	NC_010610	GAA	2	6	219238	219243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154652
3562	NC_010610	CAG	2	6	219396	219401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154652
3563	NC_010610	CAC	2	6	219458	219463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154652
3564	NC_010610	CTAA	2	8	219494	219501	50 %	25 %	0 %	25 %	184154652
3565	NC_010610	ATT	2	6	219506	219511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154652
3566	NC_010610	GGT	2	6	219725	219730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154653
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3568	NC_010610	ATT	3	9	219748	219756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154653
3569	NC_010610	TAG	2	6	219786	219791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154653
3570	NC_010610	GTCA	2	8	219796	219803	25 %	25 %	25 %	25 %	184154653
3571	NC_010610	AC	3	6	219804	219809	50 %	0 %	0 %	50 %	184154653
3572	NC_010610	GGC	2	6	219870	219875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154653
3573	NC_010610	CCGAT	2	10	219914	219923	20 %	20 %	20 %	40 %	184154653
3574	NC_010610	TAA	2	6	219930	219935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154653
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3576	NC_010610	ACA	2	6	219998	220003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154653
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3580	NC_010610	AAT	2	6	220126	220131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154653
3581	NC_010610	A	6	6	220188	220193	100 %	0 %	0 %	0 %	184154653
3582	NC_010610	TGA	2	6	220263	220268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154653
3583	NC_010610	CGATT	2	10	220356	220365	20 %	40 %	20 %	20 %	184154653
3584	NC_010610	A	6	6	220373	220378	100 %	0 %	0 %	0 %	184154653
3585	NC_010610	ACG	2	6	220387	220392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154653
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3588	NC_010610	AAG	2	6	220501	220506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154653
3589	NC_010610	AGT	2	6	220556	220561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154653
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3591	NC_010610	GCCG	2	8	220822	220829	0 %	0 %	50 %	50 %	184154654
3592	NC_010610	GAG	2	6	220862	220867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154654
3593	NC_010610	CTG	2	6	220928	220933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154654
3594	NC_010610	A	6	6	220934	220939	100 %	0 %	0 %	0 %	184154654
3595	NC_010610	G	7	7	220969	220975	0 %	0 %	100 %	0 %	184154654
3596	NC_010610	AGG	2	6	221124	221129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154654
3597	NC_010610	TGA	2	6	221202	221207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154654
3598	NC_010610	GTG	2	6	221217	221222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154654
3599	NC_010610	ATG	2	6	221252	221257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154654
3600	NC_010610	TCT	2	6	221265	221270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154654
3601	NC_010610	ACCT	2	8	221279	221286	25 %	25 %	0 %	50 %	184154654
3602	NC_010610	GAC	2	6	221338	221343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154654
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3604	NC_010610	CCG	2	6	221352	221357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154654
3605	NC_010610	T	6	6	221432	221437	0 %	100 %	0 %	0 %	184154654
3606	NC_010610	TTC	2	6	221525	221530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154654
3607	NC_010610	CTT	2	6	221563	221568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154654
3608	NC_010610	GCCT	2	8	221606	221613	0 %	25 %	25 %	50 %	184154654
3609	NC_010610	GGT	2	6	221633	221638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154654
3610	NC_010610	GAT	2	6	221692	221697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154654
3611	NC_010610	CCT	2	6	221749	221754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154654
3612	NC_010610	GTC	2	6	221755	221760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154654
3613	NC_010610	GGT	2	6	221785	221790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154654
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3617	NC_010610	G	6	6	221927	221932	0 %	0 %	100 %	0 %	184154655
3618	NC_010610	CTGG	2	8	221948	221955	0 %	25 %	50 %	25 %	184154655
3619	NC_010610	GGC	2	6	222065	222070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154655
3620	NC_010610	CAC	2	6	222086	222091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154655
3621	NC_010610	GCTG	2	8	222151	222158	0 %	25 %	50 %	25 %	184154655
3622	NC_010610	TCT	2	6	222159	222164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154655
3623	NC_010610	GGT	3	9	222202	222210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154655
3624	NC_010610	CTGG	2	8	222215	222222	0 %	25 %	50 %	25 %	184154655
3625	NC_010610	CTT	2	6	222226	222231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154655
3626	NC_010610	TGC	2	6	222267	222272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154655
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3628	NC_010610	GGT	2	6	222404	222409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154655
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3665	NC_010610	TCAT	2	8	223851	223858	25 %	50 %	0 %	25 %	184154655
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3735	NC_010610	GGGA	2	8	227592	227599	25 %	0 %	75 %	0 %	184154658
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3740	NC_010610	CTT	2	6	227742	227747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154659
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3853	NC_010610	G	6	6	233620	233625	0 %	0 %	100 %	0 %	184154664
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3864	NC_010610	AGTGG	2	10	234468	234477	20 %	20 %	60 %	0 %	184154665
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3987	NC_010610	GTG	2	6	241504	241509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154672
3988	NC_010610	CGC	2	6	241524	241529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154672
3989	NC_010610	ACT	2	6	241592	241597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154672
3990	NC_010610	GTT	3	9	241627	241635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154672
3991	NC_010610	CCCGGG	2	12	241658	241669	0 %	0 %	50 %	50 %	184154672
3992	NC_010610	CAT	2	6	241701	241706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154672
3993	NC_010610	GCG	2	6	241713	241718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154672
3994	NC_010610	CAT	2	6	241749	241754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154672
3995	NC_010610	AAG	2	6	241771	241776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154672
3996	NC_010610	GAC	2	6	241789	241794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154672
3997	NC_010610	CTT	2	6	241868	241873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154672
3998	NC_010610	GTG	3	9	241936	241944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154672
3999	NC_010610	AGA	2	6	241965	241970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154672
4000	NC_010610	TAA	2	6	242067	242072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154672

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