MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_010610	GGT	2	6	1534656	1534661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155831
25503	NC_010610	T	6	6	1534689	1534694	0 %	100 %	0 %	0 %	184155831
25504	NC_010610	CTT	2	6	1534712	1534717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155831
25505	NC_010610	CGC	2	6	1534755	1534760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155831
25506	NC_010610	CGG	2	6	1534791	1534796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155831
25507	NC_010610	TCG	2	6	1535102	1535107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155832
25508	NC_010610	CGTG	2	8	1535134	1535141	0 %	25 %	50 %	25 %	184155832
25509	NC_010610	GGCCC	2	10	1535253	1535262	0 %	0 %	40 %	60 %	184155832
25510	NC_010610	TGA	2	6	1535279	1535284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155832
25511	NC_010610	GTG	2	6	1535295	1535300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155832
25512	NC_010610	GTC	2	6	1535340	1535345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155832
25513	NC_010610	ACC	2	6	1535347	1535352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155832
25514	NC_010610	TCA	2	6	1535440	1535445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155832
25515	NC_010610	CCA	2	6	1535480	1535485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155832
25516	NC_010610	CGG	2	6	1535534	1535539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155832
25517	NC_010610	ACGG	2	8	1535548	1535555	25 %	0 %	50 %	25 %	184155832
25518	NC_010610	CGGCCA	2	12	1535588	1535599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	184155832
25519	NC_010610	CAT	2	6	1535739	1535744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155832
25520	NC_010610	TCC	2	6	1535770	1535775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155832
25521	NC_010610	GGC	2	6	1535856	1535861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155832
25522	NC_010610	CGG	2	6	1535921	1535926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155832
25523	NC_010610	GAT	2	6	1535949	1535954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155832
25524	NC_010610	CAC	2	6	1535958	1535963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155832
25525	NC_010610	CCG	2	6	1535976	1535981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155832
25526	NC_010610	GAT	2	6	1535985	1535990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155832
25527	NC_010610	GTC	2	6	1536039	1536044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155832
25528	NC_010610	GTC	2	6	1536078	1536083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155832
25529	NC_010610	TAAGCG	2	12	1536099	1536110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	184155832
25530	NC_010610	GCC	2	6	1536163	1536168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155832
25531	NC_010610	CGT	2	6	1536218	1536223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155832
25532	NC_010610	T	7	7	1536223	1536229	0 %	100 %	0 %	0 %	184155832
25533	NC_010610	TGG	2	6	1536233	1536238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155832
25534	NC_010610	CTA	2	6	1536248	1536253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155832
25535	NC_010610	CAT	2	6	1536291	1536296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155832
25536	NC_010610	ATC	2	6	1536390	1536395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155833
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25539	NC_010610	GCCACT	2	12	1536461	1536472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	184155833
25540	NC_010610	CGG	2	6	1536478	1536483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155833
25541	NC_010610	TGG	2	6	1536543	1536548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155833
25542	NC_010610	CGT	2	6	1536556	1536561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155833
25543	NC_010610	AGACA	2	10	1536578	1536587	60 %	0 %	20 %	20 %	184155833
25544	NC_010610	GCTT	2	8	1536592	1536599	0 %	50 %	25 %	25 %	184155833
25545	NC_010610	TCG	2	6	1536633	1536638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155833
25546	NC_010610	TGGTG	2	10	1536652	1536661	0 %	40 %	60 %	0 %	184155833
25547	NC_010610	AAG	2	6	1536822	1536827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155833
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25550	NC_010610	ACCCC	2	10	1536928	1536937	20 %	0 %	0 %	80 %	184155833
25551	NC_010610	GAA	2	6	1536948	1536953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155833
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25554	NC_010610	CGG	2	6	1537546	1537551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155834
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25557	NC_010610	GCGG	2	8	1537694	1537701	0 %	0 %	75 %	25 %	184155834
25558	NC_010610	C	7	7	1537750	1537756	0 %	0 %	0 %	100 %	184155834
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25560	NC_010610	CGA	2	6	1537786	1537791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155834
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25583	NC_010610	CCG	2	6	1539614	1539619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155836
25584	NC_010610	CAC	3	9	1539633	1539641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155836
25585	NC_010610	CTT	2	6	1539896	1539901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155836
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25588	NC_010610	GGCG	2	8	1540083	1540090	0 %	0 %	75 %	25 %	184155836
25589	NC_010610	T	6	6	1540156	1540161	0 %	100 %	0 %	0 %	184155837
25590	NC_010610	CTT	2	6	1540169	1540174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155837
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25599	NC_010610	C	6	6	1540528	1540533	0 %	0 %	0 %	100 %	184155837
25600	NC_010610	GAT	3	9	1540538	1540546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155837
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25610	NC_010610	CCAAT	2	10	1540961	1540970	40 %	20 %	0 %	40 %	184155837
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25615	NC_010610	CAT	2	6	1541252	1541257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155837
25616	NC_010610	AGCC	2	8	1541266	1541273	25 %	0 %	25 %	50 %	184155837
25617	NC_010610	C	6	6	1541275	1541280	0 %	0 %	0 %	100 %	184155837
25618	NC_010610	GTT	2	6	1541363	1541368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155837
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25621	NC_010610	C	6	6	1541776	1541781	0 %	0 %	0 %	100 %	184155838
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25625	NC_010610	GAT	2	6	1541837	1541842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155838
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25720	NC_010610	ATC	2	6	1549071	1549076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155848
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25724	NC_010610	GGC	2	6	1549132	1549137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155848
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25728	NC_010610	ATG	2	6	1549386	1549391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155848
25729	NC_010610	AACC	2	8	1549438	1549445	50 %	0 %	0 %	50 %	184155848
25730	NC_010610	CCG	2	6	1549603	1549608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155848
25731	NC_010610	CGT	2	6	1549648	1549653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155848
25732	NC_010610	GTAGC	2	10	1549731	1549740	20 %	20 %	40 %	20 %	184155848
25733	NC_010610	TTG	2	6	1550251	1550256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155849
25734	NC_010610	CGC	2	6	1550298	1550303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155849
25735	NC_010610	AGTA	2	8	1550323	1550330	50 %	25 %	25 %	0 %	184155849
25736	NC_010610	CTTG	2	8	1550361	1550368	0 %	50 %	25 %	25 %	184155849
25737	NC_010610	GAT	2	6	1550409	1550414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155849
25738	NC_010610	TTG	2	6	1550436	1550441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155849
25739	NC_010610	TGA	2	6	1550483	1550488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155849
25740	NC_010610	C	7	7	1550498	1550504	0 %	0 %	0 %	100 %	184155849
25741	NC_010610	GCC	2	6	1550524	1550529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155849
25742	NC_010610	AAG	2	6	1550530	1550535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155849
25743	NC_010610	GAA	2	6	1550550	1550555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155849
25744	NC_010610	CGG	2	6	1550579	1550584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155849
25745	NC_010610	CGT	2	6	1550658	1550663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155849
25746	NC_010610	CTA	2	6	1550678	1550683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155849
25747	NC_010610	GAT	2	6	1550703	1550708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155849
25748	NC_010610	TGGT	2	8	1550740	1550747	0 %	50 %	50 %	0 %	184155849
25749	NC_010610	GAT	3	9	1550802	1550810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155849
25750	NC_010610	AGG	2	6	1550947	1550952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184155849
25751	NC_010610	TGT	2	6	1551092	1551097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155849
25752	NC_010610	TGA	2	6	1551137	1551142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155849
25753	NC_010610	CCG	2	6	1551148	1551153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155849
25754	NC_010610	ACC	2	6	1551154	1551159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155849
25755	NC_010610	TGA	2	6	1551176	1551181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155849
25756	NC_010610	CAG	2	6	1551246	1551251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155849
25757	NC_010610	GAC	2	6	1551291	1551296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155849
25758	NC_010610	GCG	2	6	1551301	1551306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155849
25759	NC_010610	AAG	2	6	1551355	1551360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155849
25760	NC_010610	GCC	2	6	1551388	1551393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155849
25761	NC_010610	CGG	2	6	1551425	1551430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155849
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25764	NC_010610	CATC	2	8	1551476	1551483	25 %	25 %	0 %	50 %	184155849
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25767	NC_010610	CTGA	2	8	1551741	1551748	25 %	25 %	25 %	25 %	184155850
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25770	NC_010610	CCT	2	6	1551929	1551934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155850
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25772	NC_010610	CGT	2	6	1551990	1551995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155850
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25784	NC_010610	C	7	7	1552420	1552426	0 %	0 %	0 %	100 %	184155850
25785	NC_010610	GCCG	2	8	1552491	1552498	0 %	0 %	50 %	50 %	184155850
25786	NC_010610	AAGC	2	8	1552520	1552527	50 %	0 %	25 %	25 %	184155850
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25791	NC_010610	TGG	2	6	1552839	1552844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155851
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25801	NC_010610	GTC	2	6	1553658	1553663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155852
25802	NC_010610	CTC	2	6	1553724	1553729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155852
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25810	NC_010610	CGT	2	6	1554518	1554523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155852
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25818	NC_010610	GGCGGT	2	12	1554711	1554722	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	184155852
25819	NC_010610	ATCA	2	8	1554792	1554799	50 %	25 %	0 %	25 %	184155852
25820	NC_010610	GCA	2	6	1554801	1554806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155852
25821	NC_010610	AGT	2	6	1554830	1554835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155852
25822	NC_010610	CAT	2	6	1554891	1554896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155852
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25824	NC_010610	GAC	2	6	1554984	1554989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155852
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25827	NC_010610	CGT	2	6	1555055	1555060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155852
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25832	NC_010610	CCAG	2	8	1555754	1555761	25 %	0 %	25 %	50 %	184155853
25833	NC_010610	CGG	2	6	1555805	1555810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155853
25834	NC_010610	C	6	6	1555846	1555851	0 %	0 %	0 %	100 %	184155853
25835	NC_010610	AGA	2	6	1555892	1555897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155853
25836	NC_010610	GAT	2	6	1555903	1555908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155853
25837	NC_010610	TGA	2	6	1555922	1555927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155853
25838	NC_010610	GCA	2	6	1555970	1555975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155853
25839	NC_010610	GGCC	2	8	1556033	1556040	0 %	0 %	50 %	50 %	184155853
25840	NC_010610	GAT	2	6	1556049	1556054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155853
25841	NC_010610	CCGGA	2	10	1556056	1556065	20 %	0 %	40 %	40 %	184155853
25842	NC_010610	GAT	2	6	1556118	1556123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155853
25843	NC_010610	GTA	2	6	1556184	1556189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155853
25844	NC_010610	ATC	2	6	1556206	1556211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155853
25845	NC_010610	AAG	2	6	1556308	1556313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155853
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25847	NC_010610	GAT	2	6	1556328	1556333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155853
25848	NC_010610	GAT	2	6	1556337	1556342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155853
25849	NC_010610	TAAC	2	8	1556418	1556425	50 %	25 %	0 %	25 %	184155854
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25964	NC_010610	TTC	2	6	1570012	1570017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155861
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25966	NC_010610	GACC	2	8	1570065	1570072	25 %	0 %	25 %	50 %	184155861
25967	NC_010610	TGG	2	6	1570086	1570091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155861
25968	NC_010610	TCG	2	6	1570097	1570102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155861
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25975	NC_010610	TCA	2	6	1570365	1570370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155861
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25980	NC_010610	TGG	2	6	1570460	1570465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155861
25981	NC_010610	CGA	2	6	1570467	1570472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155861
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25983	NC_010610	CGTG	2	8	1570568	1570575	0 %	25 %	50 %	25 %	184155861
25984	NC_010610	GTA	2	6	1570576	1570581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155861
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25990	NC_010610	CCG	2	6	1570919	1570924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155861
25991	NC_010610	CCTT	2	8	1570968	1570975	0 %	50 %	0 %	50 %	184155862
25992	NC_010610	CTTCG	2	10	1571006	1571015	0 %	40 %	20 %	40 %	184155862
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25995	NC_010610	CGA	2	6	1571467	1571472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155863
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25999	NC_010610	A	6	6	1571831	1571836	100 %	0 %	0 %	0 %	184155864
26000	NC_010610	A	6	6	1571867	1571872	100 %	0 %	0 %	0 %	184155864

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