MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010610	GAA	2	6	25463	25468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154499
502	NC_010610	T	6	6	25484	25489	0 %	100 %	0 %	0 %	184154499
503	NC_010610	CGA	2	6	25525	25530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154499
504	NC_010610	CGC	2	6	25678	25683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154499
505	NC_010610	ACC	2	6	25713	25718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154499
506	NC_010610	ATTT	2	8	25720	25727	25 %	75 %	0 %	0 %	184154499
507	NC_010610	GTA	2	6	25738	25743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154499
508	NC_010610	ACA	2	6	26136	26141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154500
509	NC_010610	GAT	2	6	26177	26182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154500
510	NC_010610	T	6	6	26192	26197	0 %	100 %	0 %	0 %	184154500
511	NC_010610	TTC	2	6	26286	26291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154500
512	NC_010610	CCA	2	6	26298	26303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154500
513	NC_010610	TCG	2	6	26329	26334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154500
514	NC_010610	CGGAC	2	10	26344	26353	20 %	0 %	40 %	40 %	184154500
515	NC_010610	G	6	6	26369	26374	0 %	0 %	100 %	0 %	184154500
516	NC_010610	GCCT	2	8	26380	26387	0 %	25 %	25 %	50 %	184154500
517	NC_010610	CGTGAT	2	12	26414	26425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184154500
518	NC_010610	GCC	2	6	26475	26480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154500
519	NC_010610	GAT	2	6	26549	26554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154500
520	NC_010610	ACG	2	6	26572	26577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154500
521	NC_010610	GCC	2	6	26637	26642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154500
522	NC_010610	CTT	2	6	26663	26668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154500
523	NC_010610	AAG	2	6	26688	26693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154500
524	NC_010610	CGT	2	6	26711	26716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154500
525	NC_010610	GCC	2	6	26736	26741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154500
526	NC_010610	TTTA	2	8	26759	26766	25 %	75 %	0 %	0 %	184154500
527	NC_010610	TTC	2	6	26910	26915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154500
528	NC_010610	CGG	2	6	26950	26955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154500
529	NC_010610	CAC	2	6	26981	26986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154500
530	NC_010610	CCG	2	6	26998	27003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154500
531	NC_010610	GCC	2	6	27039	27044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154500
532	NC_010610	CAAT	2	8	27048	27055	50 %	25 %	0 %	25 %	184154500
533	NC_010610	CGC	2	6	27056	27061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154500
534	NC_010610	AGC	2	6	27123	27128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154500
535	NC_010610	GCC	2	6	27141	27146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154500
536	NC_010610	TTC	2	6	27162	27167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154500
537	NC_010610	CTGC	2	8	27314	27321	0 %	25 %	25 %	50 %	184154500
538	NC_010610	CCT	2	6	27343	27348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154500
539	NC_010610	GGC	2	6	27369	27374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154500
540	NC_010610	CAC	2	6	27434	27439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154500
541	NC_010610	GAC	2	6	27515	27520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154501
542	NC_010610	AGA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154501
543	NC_010610	T	6	6	27597	27602	0 %	100 %	0 %	0 %	184154501
544	NC_010610	GAA	2	6	27603	27608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154501
545	NC_010610	TGG	2	6	27681	27686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154501
546	NC_010610	GAT	2	6	27716	27721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154501
547	NC_010610	GCG	2	6	27821	27826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154501
548	NC_010610	GGC	2	6	27861	27866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154501
549	NC_010610	CGG	2	6	27901	27906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154501
550	NC_010610	TGG	2	6	27919	27924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154501
551	NC_010610	CTG	2	6	27949	27954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154501
552	NC_010610	ACG	2	6	28015	28020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154501
553	NC_010610	AAGC	2	8	28048	28055	50 %	0 %	25 %	25 %	184154501
554	NC_010610	CTG	2	6	28068	28073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154501
555	NC_010610	GACC	2	8	28142	28149	25 %	0 %	25 %	50 %	184154501
556	NC_010610	ACC	2	6	28254	28259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154501
557	NC_010610	TGG	2	6	28288	28293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154501
558	NC_010610	CGG	2	6	28294	28299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154501
559	NC_010610	ACG	2	6	28336	28341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154501
560	NC_010610	TGG	2	6	28345	28350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154501
561	NC_010610	GTCA	2	8	28359	28366	25 %	25 %	25 %	25 %	184154501
562	NC_010610	GTG	2	6	28395	28400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154501
563	NC_010610	CTA	2	6	28463	28468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154501
564	NC_010610	CGG	2	6	28523	28528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154501
565	NC_010610	CTGC	2	8	28556	28563	0 %	25 %	25 %	50 %	184154501
566	NC_010610	TAC	2	6	28611	28616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154501
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568	NC_010610	GAA	2	6	28737	28742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154501
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570	NC_010610	GC	3	6	28848	28853	0 %	0 %	50 %	50 %	184154501
571	NC_010610	ACT	2	6	28873	28878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154501
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573	NC_010610	AAC	2	6	28944	28949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154501
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576	NC_010610	ACG	2	6	29131	29136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154501
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578	NC_010610	CAAC	2	8	29195	29202	50 %	0 %	0 %	50 %	184154501
579	NC_010610	CAAG	2	8	29240	29247	50 %	0 %	25 %	25 %	184154501
580	NC_010610	CGA	2	6	29279	29284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154501
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592	NC_010610	GAA	2	6	30083	30088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154502
593	NC_010610	CCA	2	6	30102	30107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154502
594	NC_010610	CTT	2	6	30178	30183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154502
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599	NC_010610	GCC	2	6	30410	30415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154502
600	NC_010610	CGGC	2	8	30423	30430	0 %	0 %	50 %	50 %	184154502
601	NC_010610	GCG	2	6	30473	30478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154502
602	NC_010610	GCG	2	6	30627	30632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154503
603	NC_010610	GTTA	2	8	30642	30649	25 %	50 %	25 %	0 %	184154503
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610	NC_010610	GC	3	6	30946	30951	0 %	0 %	50 %	50 %	184154503
611	NC_010610	TAGG	2	8	30966	30973	25 %	25 %	50 %	0 %	184154503
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617	NC_010610	CGG	2	6	31366	31371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154504
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623	NC_010610	GGC	2	6	31616	31621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154504
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625	NC_010610	GGT	2	6	31685	31690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154504
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627	NC_010610	GACAA	2	10	31875	31884	60 %	0 %	20 %	20 %	184154504
628	NC_010610	GGC	2	6	32012	32017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154504
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759	NC_010610	AAGT	2	8	38682	38689	50 %	25 %	25 %	0 %	184154510
760	NC_010610	ACCA	2	8	38694	38701	50 %	0 %	0 %	50 %	184154510
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762	NC_010610	AGTGA	2	10	38791	38800	40 %	20 %	40 %	0 %	184154510
763	NC_010610	TTC	2	6	38810	38815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154510
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879	NC_010610	AGA	2	6	44219	44224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154512
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999	NC_010610	GT	5	10	49894	49903	0 %	50 %	50 %	0 %	184154515
1000	NC_010610	GGCT	2	8	49984	49991	0 %	25 %	50 %	25 %	184154515

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