MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010609	TTGCCG	2	12	383	394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152656
2	NC_010609	ATATTG	2	12	860	871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184152656
3	NC_010609	AGACTA	2	12	5287	5298	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	184152660
4	NC_010609	TGATGG	2	12	6572	6583	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	184152661
5	NC_010609	TGAAGA	2	12	7718	7729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152661
6	NC_010609	CTTCTG	2	12	8407	8418	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	184152661
7	NC_010609	AACGTC	2	12	12182	12193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	184152665
8	NC_010609	TGAAGT	2	12	14103	14114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152667
9	NC_010609	CCATTT	2	12	18234	18245	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	184152671
10	NC_010609	TGGTGT	2	12	25583	25594	0 %	50 %	50 %	0 %	184152677
11	NC_010609	ACTTGA	2	12	28000	28011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152679
12	NC_010609	ATGCGG	2	12	29303	29314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184152680
13	NC_010609	ACCAAG	2	12	33911	33922	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	184152685
14	NC_010609	TAATTG	2	12	33957	33968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184152685
15	NC_010609	ACGTCG	2	12	37608	37619	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	184152689
16	NC_010609	TAAAGG	2	12	38270	38281	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152689
17	NC_010609	GTGGAT	2	12	42780	42791	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	184152693
18	NC_010609	CAAGGA	2	12	47765	47776	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	184152698
19	NC_010609	CTGTTA	2	12	48079	48090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184152698
20	NC_010609	AGAACA	2	12	50756	50767	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	184152699
21	NC_010609	GCACAA	2	12	50781	50792	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	184152699
22	NC_010609	TGCTAA	2	12	51152	51163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152699
23	NC_010609	GCACAA	2	12	52320	52331	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	184152699
24	NC_010609	TCCTTA	2	12	56806	56817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	184152702
25	NC_010609	AGCCCA	2	12	58586	58597	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	184152702
26	NC_010609	TGCTAA	2	12	60676	60687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152703
27	NC_010609	GTTTCG	2	12	66476	66487	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	184152706
28	NC_010609	AACAAG	2	12	68996	69007	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	184152707
29	NC_010609	AAGGTT	2	12	69740	69751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152707
30	NC_010609	GCTTCT	2	12	70205	70216	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	184152708
31	NC_010609	TTGGAA	2	12	74247	74258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152712
32	NC_010609	TGAAAA	2	12	79135	79146	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	184152717
33	NC_010609	CTAAGA	2	12	81996	82007	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	184152719
34	NC_010609	CCAACC	2	12	83624	83635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152720
35	NC_010609	GTTGGC	2	12	85075	85086	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	184152721
36	NC_010609	GATATT	2	12	86955	86966	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184152723
37	NC_010609	TCATGT	2	12	89503	89514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184152725
38	NC_010609	TAATCC	2	12	99767	99778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152733
39	NC_010609	TTCGAA	2	12	100612	100623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152734
40	NC_010609	CAAGGA	2	12	103560	103571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	184152735
41	NC_010609	TTTCAT	2	12	103596	103607	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	184152735
42	NC_010609	AAGGTA	2	12	114387	114398	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152743
43	NC_010609	TGTAAC	2	12	119813	119824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152745
44	NC_010609	GGTGCT	2	12	120069	120080	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	184152745
45	NC_010609	AACATT	2	12	120282	120293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	184152745
46	NC_010609	ATTGAA	2	12	123116	123127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	184152747
47	NC_010609	TATCAT	2	12	124327	124338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	184152747
48	NC_010609	TTATGG	2	12	126752	126763	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	184152749
49	NC_010609	ATTAAG	2	12	130919	130930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	184152752
50	NC_010609	TTAGAT	2	12	132384	132395	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184152754
51	NC_010609	TTGATC	2	12	132934	132945	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184152755
52	NC_010609	CATTGG	2	12	136562	136573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152759
53	NC_010609	GATTAA	2	12	138789	138800	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	184152761
54	NC_010609	ACTGGT	2	12	139426	139437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152762
55	NC_010609	ATGTTC	2	12	140431	140442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184152763
56	NC_010609	CCAAGC	2	12	142217	142228	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	184152765
57	NC_010609	TTATTG	2	12	144082	144093	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	184152767
58	NC_010609	GTGATT	2	12	146469	146480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	184152769
59	NC_010609	GCTGAT	2	12	149610	149621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152773
60	NC_010609	TCCGCG	2	12	150280	150291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	184152774
61	NC_010609	CACCAA	2	12	152566	152577	50 %	0 %	0 %	50 %	184152777
62	NC_010609	CAATTA	2	12	156522	156533	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	184152780
63	NC_010609	GGTAAG	2	12	163575	163586	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	184152786
64	NC_010609	ATGAGG	2	12	164317	164328	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	184152787
65	NC_010609	TTATGA	2	12	168694	168705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184152790
66	NC_010609	AATGGA	2	12	175035	175046	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152796
67	NC_010609	TTAACA	2	12	175968	175979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	184152797
68	NC_010609	GATAAA	2	12	190779	190790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	184152805
69	NC_010609	CGATAC	2	12	191615	191626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	184152805
70	NC_010609	ATTGCC	2	12	196547	196558	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	184152810
71	NC_010609	GCCAAG	2	12	199164	199175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152814
72	NC_010609	GGTTAA	2	12	205385	205396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152819
73	NC_010609	CTTTTG	2	12	209115	209126	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	184152822
74	NC_010609	AAAAGT	2	12	211508	211519	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	184152824
75	NC_010609	CATTTA	2	12	212127	212138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	184152825
76	NC_010609	AATTTT	2	12	213285	213296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152826
77	NC_010609	GGCTTA	2	12	218926	218937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152831
78	NC_010609	TGGGGA	2	12	220138	220149	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	184152833
79	NC_010609	CAATGG	2	12	220237	220248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	184152833
80	NC_010609	TTTATC	2	12	221846	221857	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	184152835
81	NC_010609	ACTTCA	2	12	223756	223767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152836
82	NC_010609	AACTTG	2	12	224181	224192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152837
83	NC_010609	ACCATC	2	12	240809	240820	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	184152850
84	NC_010609	TGATGT	2	12	254177	254188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	184152865
85	NC_010609	ATCGAT	2	12	258852	258863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152869
86	NC_010609	GATCAA	2	12	259639	259650	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	184152870
87	NC_010609	CGATGA	2	12	263884	263895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	184152875
88	NC_010609	CGTCAC	2	12	265642	265653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	184152876
89	NC_010609	AAGGTA	2	12	266482	266493	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152877
90	NC_010609	GCGATT	2	12	270908	270919	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152880
91	NC_010609	CGCAAT	2	12	277202	277213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	184152888
92	NC_010609	ATGAAA	2	12	277758	277769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	184152889
93	NC_010609	AAAGAT	2	12	282634	282645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	184152892
94	NC_010609	TGGTAT	2	12	282927	282938	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	184152892
95	NC_010609	AATTAG	2	12	283010	283021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	184152892
96	NC_010609	AAGGTA	2	12	284389	284400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152894
97	NC_010609	GGTTGC	2	12	285852	285863	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	184152895
98	NC_010609	TGAATT	2	12	291370	291381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184152900
99	NC_010609	CTTATA	2	12	294720	294731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	184152903
100	NC_010609	AAAGCC	2	12	299837	299848	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	184152907
101	NC_010609	TTCAGC	2	12	305206	305217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	184152912
102	NC_010609	TTGATA	2	12	309929	309940	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184152915
103	NC_010609	AAAGAA	2	12	310773	310784	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	184152915
104	NC_010609	TATTGC	2	12	322470	322481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184152920
105	NC_010609	CCCATG	2	12	330593	330604	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	184152927
106	NC_010609	TGAAGA	2	12	330999	331010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152927
107	NC_010609	CGTAAG	2	12	338584	338595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	184152933
108	NC_010609	CAATTA	2	12	343661	343672	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	184152937
109	NC_010609	ATCTGG	2	12	343946	343957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152938
110	NC_010609	GCCACC	2	12	347256	347267	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	184152941
111	NC_010609	CTAATT	2	12	348845	348856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	184152944
112	NC_010609	TTGAAG	2	12	350976	350987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152945
113	NC_010609	TAGCTG	2	12	353537	353548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152948
114	NC_010609	GGATGC	2	12	358769	358780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184152955
115	NC_010609	TCATTT	2	12	360410	360421	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	184152956
116	NC_010609	AGTTTT	2	12	360530	360541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	184152956
117	NC_010609	CAGTTG	2	12	361634	361645	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152958
118	NC_010609	TAAGGT	2	12	361716	361727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152958
119	NC_010609	TGGTCT	2	12	361752	361763	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	184152958
120	NC_010609	CTTTAA	2	12	364671	364682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	184152964
121	NC_010609	TAGAAG	2	12	368313	368324	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152966
122	NC_010609	CATATC	2	12	369586	369597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152967
123	NC_010609	GTACTT	2	12	370320	370331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184152967
124	NC_010609	TGGAAG	2	12	371210	371221	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	184152967
125	NC_010609	TTTATC	2	12	371395	371406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	184152967
126	NC_010609	TGTCTT	2	12	376838	376849	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	184152975
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147	NC_010609	CAATTG	2	12	439194	439205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184153030
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216	NC_010609	TTGGTG	2	12	672619	672630	0 %	50 %	50 %	0 %	184153229
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219	NC_010609	CAAGAT	2	12	679979	679990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	184153235
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221	NC_010609	ATGTTG	2	12	692046	692057	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	184153247
222	NC_010609	CTGGAA	2	12	695274	695285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	184153250
223	NC_010609	CATCAC	2	12	695790	695801	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	184153250
224	NC_010609	TTAAAT	2	12	699332	699343	50 %	50 %	0 %	0 %	184153254
225	NC_010609	GCAATT	2	12	699631	699642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184153254
226	NC_010609	GGTGCA	2	12	701218	701229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184153255
227	NC_010609	GGTTCA	2	12	704508	704519	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184153258
228	NC_010609	ACCTTC	2	12	708002	708013	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	184153262
229	NC_010609	TATCAG	2	12	711784	711795	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184153265
230	NC_010609	GATAAT	2	12	712463	712474	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	184153266
231	NC_010609	TGAAGC	2	12	715608	715619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	184153269
232	NC_010609	TATGAC	2	12	716175	716186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184153269
233	NC_010609	AAAACT	2	12	719875	719886	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	184153274
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235	NC_010609	TCAAGT	2	12	725592	725603	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184153280
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342	NC_010609	ATCAAA	2	12	1081347	1081358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	184153606
343	NC_010609	TACCTT	2	12	1089416	1089427	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	184153612
344	NC_010609	TTAAAG	2	12	1092367	1092378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	184153613
345	NC_010609	ACACTC	2	12	1092442	1092453	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	184153613
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347	NC_010609	TTGCTT	2	12	1106887	1106898	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	184153626
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450	NC_010609	GTTTGT	2	12	1452971	1452982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184153931
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452	NC_010609	TTACAT	2	12	1466711	1466722	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	184153941
453	NC_010609	TAGGAT	2	12	1467833	1467844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184153942
454	NC_010609	TTCATG	2	12	1470650	1470661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184153945
455	NC_010609	AAATAG	2	12	1473228	1473239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	184153947
456	NC_010609	ATTGCC	2	12	1473342	1473353	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	184153947
457	NC_010609	CTTGCC	2	12	1479815	1479826	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	184153955
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