MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 36814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010609	AGAA	2	8	134273	134280	75 %	0 %	25 %	0 %	184152756
2502	NC_010609	CGG	2	6	134284	134289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152756
2503	NC_010609	ATT	2	6	134442	134447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152756
2504	NC_010609	AGG	2	6	134466	134471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152756
2505	NC_010609	GCA	2	6	134483	134488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152757
2506	NC_010609	ATG	2	6	134510	134515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152757
2507	NC_010609	ATG	2	6	134609	134614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152757
2508	NC_010609	A	6	6	134641	134646	100 %	0 %	0 %	0 %	184152757
2509	NC_010609	CAA	2	6	134864	134869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152758
2510	NC_010609	AATT	2	8	134927	134934	50 %	50 %	0 %	0 %	184152758
2511	NC_010609	GAA	2	6	134940	134945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152758
2512	NC_010609	TGT	2	6	135066	135071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152758
2513	NC_010609	TGA	2	6	135081	135086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152758
2514	NC_010609	TAA	2	6	135180	135185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152758
2515	NC_010609	GCT	2	6	135208	135213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152758
2516	NC_010609	TGA	3	9	135312	135320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152758
2517	NC_010609	TTA	2	6	135346	135351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152758
2518	NC_010609	GAA	2	6	135388	135393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152758
2519	NC_010609	CAA	2	6	135414	135419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152758
2520	NC_010609	GCA	2	6	135475	135480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152758
2521	NC_010609	GCT	2	6	135481	135486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152758
2522	NC_010609	GAA	2	6	135487	135492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152758
2523	NC_010609	CTG	2	6	135617	135622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152758
2524	NC_010609	AAG	2	6	135652	135657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152758
2525	NC_010609	AGC	2	6	135675	135680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152758
2526	NC_010609	ATT	2	6	135685	135690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152758
2527	NC_010609	TGA	2	6	135747	135752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152758
2528	NC_010609	CAG	2	6	135767	135772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152758
2529	NC_010609	TTG	2	6	135833	135838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152758
2530	NC_010609	AGTG	2	8	135890	135897	25 %	25 %	50 %	0 %	184152759
2531	NC_010609	AAC	2	6	135901	135906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152759
2532	NC_010609	CGG	2	6	135954	135959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152759
2533	NC_010609	A	6	6	136001	136006	100 %	0 %	0 %	0 %	184152759
2534	NC_010609	TAAA	2	8	136027	136034	75 %	25 %	0 %	0 %	184152759
2535	NC_010609	AAGA	2	8	136065	136072	75 %	0 %	25 %	0 %	184152759
2536	NC_010609	AAG	2	6	136116	136121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152759
2537	NC_010609	ATT	2	6	136139	136144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152759
2538	NC_010609	GAA	2	6	136175	136180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152759
2539	NC_010609	CTG	2	6	136195	136200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152759
2540	NC_010609	CAAT	2	8	136212	136219	50 %	25 %	0 %	25 %	184152759
2541	NC_010609	GTT	2	6	136223	136228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152759
2542	NC_010609	ATA	2	6	136237	136242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152759
2543	NC_010609	TGCAA	2	10	136304	136313	40 %	20 %	20 %	20 %	184152759
2544	NC_010609	GGA	2	6	136368	136373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152759
2545	NC_010609	GTAA	2	8	136434	136441	50 %	25 %	25 %	0 %	184152759
2546	NC_010609	AGC	2	6	136484	136489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152759
2547	NC_010609	ATT	2	6	136497	136502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152759
2548	NC_010609	CATTGG	2	12	136562	136573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152759
2549	NC_010609	TTA	2	6	136576	136581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152759
2550	NC_010609	ACG	2	6	136652	136657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152759
2551	NC_010609	CA	3	6	136913	136918	50 %	0 %	0 %	50 %	184152760
2552	NC_010609	GAT	2	6	136945	136950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152760
2553	NC_010609	GAA	2	6	136964	136969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152760
2554	NC_010609	ACA	2	6	136980	136985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152760
2555	NC_010609	AAGC	2	8	137120	137127	50 %	0 %	25 %	25 %	184152760
2556	NC_010609	TTA	2	6	137160	137165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152760
2557	NC_010609	ATG	3	9	137190	137198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152760
2558	NC_010609	GTT	2	6	137201	137206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152760
2559	NC_010609	CTT	2	6	137252	137257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152760
2560	NC_010609	TTA	2	6	137262	137267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152760
2561	NC_010609	CTT	2	6	137279	137284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152760
2562	NC_010609	TGA	2	6	137287	137292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152760
2563	NC_010609	T	6	6	137359	137364	0 %	100 %	0 %	0 %	184152760
2564	NC_010609	AGA	2	6	137383	137388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152760
2565	NC_010609	TGG	2	6	137440	137445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152760
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2568	NC_010609	CGC	2	6	137663	137668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152761
2569	NC_010609	TGA	2	6	137675	137680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152761
2570	NC_010609	GAA	2	6	137835	137840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152761
2571	NC_010609	ATGG	2	8	137862	137869	25 %	25 %	50 %	0 %	184152761
2572	NC_010609	ATG	2	6	137880	137885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152761
2573	NC_010609	TTG	2	6	137941	137946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152761
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2575	NC_010609	TGC	2	6	138089	138094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152761
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2579	NC_010609	TGA	2	6	138407	138412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152761
2580	NC_010609	CGT	2	6	138483	138488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152761
2581	NC_010609	TGA	2	6	138548	138553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152761
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2583	NC_010609	TGA	2	6	138574	138579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152761
2584	NC_010609	CTG	2	6	138583	138588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152761
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2586	NC_010609	AATC	2	8	138678	138685	50 %	25 %	0 %	25 %	184152761
2587	NC_010609	GATTAA	2	12	138789	138800	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	184152761
2588	NC_010609	GGC	2	6	138859	138864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152762
2589	NC_010609	TGA	2	6	138873	138878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152762
2590	NC_010609	TTG	2	6	138893	138898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152762
2591	NC_010609	CGT	2	6	138903	138908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152762
2592	NC_010609	AGA	2	6	138978	138983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152762
2593	NC_010609	GAT	2	6	139005	139010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152762
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2599	NC_010609	AAG	2	6	139381	139386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152762
2600	NC_010609	ACTGGT	2	12	139426	139437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184152762
2601	NC_010609	ATCA	2	8	139457	139464	50 %	25 %	0 %	25 %	184152762
2602	NC_010609	ACT	2	6	139467	139472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152762
2603	NC_010609	GAA	2	6	139582	139587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152762
2604	NC_010609	AAAGG	2	10	139603	139612	60 %	0 %	40 %	0 %	184152762
2605	NC_010609	ACT	2	6	139687	139692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152762
2606	NC_010609	GGAT	2	8	139725	139732	25 %	25 %	50 %	0 %	184152762
2607	NC_010609	GCA	2	6	139750	139755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152762
2608	NC_010609	TGT	2	6	139785	139790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152762
2609	NC_010609	TTA	2	6	139900	139905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152762
2610	NC_010609	GAT	2	6	139927	139932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152762
2611	NC_010609	GAATT	2	10	139952	139961	40 %	40 %	20 %	0 %	184152762
2612	NC_010609	GAT	2	6	140077	140082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152762
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2614	NC_010609	AT	3	6	140219	140224	50 %	50 %	0 %	0 %	184152763
2615	NC_010609	CTT	2	6	140234	140239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152763
2616	NC_010609	TGGGA	2	10	140327	140336	20 %	20 %	60 %	0 %	184152763
2617	NC_010609	GGTT	2	8	140402	140409	0 %	50 %	50 %	0 %	184152763
2618	NC_010609	ATGTTC	2	12	140431	140442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184152763
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2620	NC_010609	TTC	2	6	140465	140470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152763
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2985	NC_010609	ATG	2	6	159073	159078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152781
2986	NC_010609	AGC	2	6	159128	159133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152781
2987	NC_010609	TAA	3	9	159290	159298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152781
2988	NC_010609	TTGA	2	8	159315	159322	25 %	50 %	25 %	0 %	184152781
2989	NC_010609	ACA	2	6	159358	159363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152782
2990	NC_010609	GCT	2	6	159385	159390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152782
2991	NC_010609	GTT	2	6	159487	159492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152782
2992	NC_010609	GGTCA	2	10	159529	159538	20 %	20 %	40 %	20 %	184152782
2993	NC_010609	AAC	2	6	159596	159601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152782
2994	NC_010609	TAA	2	6	159639	159644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152782
2995	NC_010609	TTA	2	6	159825	159830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152782
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2997	NC_010609	CCT	2	6	159912	159917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152782
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2999	NC_010609	AAATG	2	10	160381	160390	60 %	20 %	20 %	0 %	184152783
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