MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 36814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010609	TTC	2	6	26623	26628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152678
502	NC_010609	ATA	2	6	26634	26639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
503	NC_010609	TTAT	2	8	26670	26677	25 %	75 %	0 %	0 %	184152678
504	NC_010609	AAG	2	6	26678	26683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152678
505	NC_010609	TGT	2	6	26701	26706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152678
506	NC_010609	TAA	2	6	26710	26715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
507	NC_010609	A	6	6	26765	26770	100 %	0 %	0 %	0 %	184152678
508	NC_010609	ATT	2	6	26951	26956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152678
509	NC_010609	GGT	2	6	27047	27052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152678
510	NC_010609	ATTA	2	8	27055	27062	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
511	NC_010609	AATT	2	8	27085	27092	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
512	NC_010609	ATT	2	6	27173	27178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152678
513	NC_010609	TTAA	2	8	27185	27192	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
514	NC_010609	TGG	2	6	27231	27236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152678
515	NC_010609	CAA	2	6	27285	27290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152678
516	NC_010609	CTG	2	6	27345	27350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152678
517	NC_010609	A	6	6	27356	27361	100 %	0 %	0 %	0 %	184152678
518	NC_010609	ATG	2	6	27363	27368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152678
519	NC_010609	TA	3	6	27426	27431	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
520	NC_010609	TTA	2	6	27463	27468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152678
521	NC_010609	ACA	2	6	27521	27526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152678
522	NC_010609	TGA	2	6	27532	27537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152678
523	NC_010609	CAA	2	6	27542	27547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152678
524	NC_010609	ATA	2	6	27549	27554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
525	NC_010609	AAT	2	6	27791	27796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152679
526	NC_010609	GTA	2	6	27836	27841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152679
527	NC_010609	AGA	2	6	27850	27855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152679
528	NC_010609	AGA	2	6	27871	27876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152679
529	NC_010609	ATT	2	6	27976	27981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152679
530	NC_010609	ACTTGA	2	12	28000	28011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152679
531	NC_010609	GAA	2	6	28022	28027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152679
532	NC_010609	TAT	2	6	28054	28059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152679
533	NC_010609	ATG	2	6	28065	28070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152679
534	NC_010609	GAC	2	6	28135	28140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152679
535	NC_010609	ATT	2	6	28175	28180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152679
536	NC_010609	GCG	2	6	28235	28240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152679
537	NC_010609	GGC	2	6	28246	28251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152679
538	NC_010609	CCA	2	6	28270	28275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152679
539	NC_010609	TTAA	2	8	28282	28289	50 %	50 %	0 %	0 %	184152679
540	NC_010609	TAT	3	9	28614	28622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152680
541	NC_010609	TTG	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152680
542	NC_010609	TCA	2	6	28665	28670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152680
543	NC_010609	ATG	2	6	28705	28710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152680
544	NC_010609	CAT	2	6	28711	28716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152680
545	NC_010609	AGA	2	6	28761	28766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152680
546	NC_010609	ACC	2	6	28888	28893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152680
547	NC_010609	ATG	2	6	29021	29026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152680
548	NC_010609	CAG	2	6	29041	29046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152680
549	NC_010609	AGC	2	6	29148	29153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152680
550	NC_010609	ACAAT	2	10	29264	29273	60 %	20 %	0 %	20 %	184152680
551	NC_010609	ATGCGG	2	12	29303	29314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184152680
552	NC_010609	TGG	2	6	29358	29363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152680
553	NC_010609	AGC	2	6	29403	29408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152680
554	NC_010609	TAA	2	6	29463	29468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152680
555	NC_010609	CAT	2	6	29473	29478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152680
556	NC_010609	AGCA	2	8	29501	29508	50 %	0 %	25 %	25 %	184152680
557	NC_010609	CAG	2	6	29531	29536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152680
558	NC_010609	AAC	2	6	29555	29560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152680
559	NC_010609	TAAG	2	8	29574	29581	50 %	25 %	25 %	0 %	184152680
560	NC_010609	ATT	2	6	30061	30066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152681
561	NC_010609	AAAAG	2	10	30081	30090	80 %	0 %	20 %	0 %	184152681
562	NC_010609	TTG	2	6	30152	30157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152681
563	NC_010609	TGA	2	6	30165	30170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152681
564	NC_010609	AAGG	2	8	30220	30227	50 %	0 %	50 %	0 %	184152681
565	NC_010609	TTC	2	6	30297	30302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152681
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568	NC_010609	CAG	2	6	30392	30397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152681
569	NC_010609	TACCT	2	10	30438	30447	20 %	40 %	0 %	40 %	184152681
570	NC_010609	CAT	2	6	30498	30503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152681
571	NC_010609	ATAA	2	8	30521	30528	75 %	25 %	0 %	0 %	184152681
572	NC_010609	A	6	6	30753	30758	100 %	0 %	0 %	0 %	184152682
573	NC_010609	ATG	2	6	30768	30773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152682
574	NC_010609	TGG	2	6	30815	30820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152682
575	NC_010609	ATTG	2	8	30845	30852	25 %	50 %	25 %	0 %	184152682
576	NC_010609	A	6	6	30966	30971	100 %	0 %	0 %	0 %	184152683
577	NC_010609	CGG	2	6	31005	31010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152683
578	NC_010609	CAT	2	6	31073	31078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152683
579	NC_010609	AAG	2	6	31087	31092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152683
580	NC_010609	GAT	2	6	31103	31108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152683
581	NC_010609	A	6	6	31150	31155	100 %	0 %	0 %	0 %	184152683
582	NC_010609	GAGT	2	8	31166	31173	25 %	25 %	50 %	0 %	184152683
583	NC_010609	ATG	2	6	31186	31191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152683
584	NC_010609	CAG	2	6	31231	31236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152683
585	NC_010609	GATT	2	8	31250	31257	25 %	50 %	25 %	0 %	184152683
586	NC_010609	TTAGT	2	10	31288	31297	20 %	60 %	20 %	0 %	184152683
587	NC_010609	GGC	2	6	31314	31319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152683
588	NC_010609	GGC	2	6	31367	31372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152683
589	NC_010609	TGC	2	6	31399	31404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152683
590	NC_010609	GAT	2	6	31407	31412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152683
591	NC_010609	AGC	2	6	31457	31462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152683
592	NC_010609	TTA	2	6	31464	31469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152683
593	NC_010609	CTT	2	6	31756	31761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152684
594	NC_010609	ATTG	2	8	31822	31829	25 %	50 %	25 %	0 %	184152684
595	NC_010609	TAC	2	6	31831	31836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152684
596	NC_010609	ATT	2	6	32000	32005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152684
597	NC_010609	TGG	2	6	32011	32016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152684
598	NC_010609	TAAC	2	8	32058	32065	50 %	25 %	0 %	25 %	184152684
599	NC_010609	TGA	2	6	32068	32073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152684
600	NC_010609	GAA	2	6	32104	32109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152684
601	NC_010609	CCA	2	6	32117	32122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152684
602	NC_010609	ACT	2	6	32138	32143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152684
603	NC_010609	TTA	2	6	32178	32183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152684
604	NC_010609	TGT	3	9	32209	32217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152684
605	NC_010609	GCT	2	6	32291	32296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152684
606	NC_010609	AAG	2	6	32376	32381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152684
607	NC_010609	AATT	2	8	32388	32395	50 %	50 %	0 %	0 %	184152684
608	NC_010609	AGT	2	6	32413	32418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152684
609	NC_010609	AAT	2	6	32489	32494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152684
610	NC_010609	GGT	2	6	32534	32539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152684
611	NC_010609	ATG	2	6	32544	32549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152684
612	NC_010609	CTC	2	6	32550	32555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152684
613	NC_010609	GAA	2	6	32591	32596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152684
614	NC_010609	ACT	2	6	32657	32662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152684
615	NC_010609	AGC	2	6	32680	32685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152684
616	NC_010609	TTG	2	6	32724	32729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152684
617	NC_010609	CAT	2	6	32736	32741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152684
618	NC_010609	AGA	2	6	32767	32772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152684
619	NC_010609	ATG	2	6	32780	32785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152684
620	NC_010609	CTA	2	6	32884	32889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152684
621	NC_010609	ATT	2	6	33260	33265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152685
622	NC_010609	AACC	2	8	33282	33289	50 %	0 %	0 %	50 %	184152685
623	NC_010609	GTT	2	6	33327	33332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152685
624	NC_010609	TTC	2	6	33403	33408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152685
625	NC_010609	GTTA	2	8	33418	33425	25 %	50 %	25 %	0 %	184152685
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