MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 36814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010609	TATT	2	8	276804	276811	25 %	75 %	0 %	0 %	184152888
5002	NC_010609	GGC	2	6	276828	276833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152888
5003	NC_010609	GCG	2	6	276843	276848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152888
5004	NC_010609	ATT	2	6	276849	276854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152888
5005	NC_010609	TTG	2	6	276964	276969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152888
5006	NC_010609	ATC	2	6	277014	277019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152888
5007	NC_010609	TGC	2	6	277067	277072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152888
5008	NC_010609	CTA	2	6	277081	277086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152888
5009	NC_010609	A	6	6	277099	277104	100 %	0 %	0 %	0 %	184152888
5010	NC_010609	CGCAAT	2	12	277202	277213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	184152888
5011	NC_010609	TGG	2	6	277239	277244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152888
5012	NC_010609	TGG	2	6	277247	277252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152888
5013	NC_010609	AGT	2	6	277260	277265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152888
5014	NC_010609	GCA	2	6	277338	277343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152888
5015	NC_010609	GAT	2	6	277427	277432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152888
5016	NC_010609	CTG	2	6	277456	277461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152888
5017	NC_010609	TA	3	6	277498	277503	50 %	50 %	0 %	0 %	184152888
5018	NC_010609	C	6	6	277562	277567	0 %	0 %	0 %	100 %	184152888
5019	NC_010609	TAA	2	6	277602	277607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152888
5020	NC_010609	ATGAAA	2	12	277758	277769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	184152889
5021	NC_010609	GT	3	6	277840	277845	0 %	50 %	50 %	0 %	184152889
5022	NC_010609	CCA	2	6	277910	277915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152889
5023	NC_010609	CAA	2	6	278031	278036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152889
5024	NC_010609	TAC	2	6	278046	278051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152889
5025	NC_010609	TTG	3	9	278071	278079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152889
5026	NC_010609	GAC	3	9	278102	278110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152889
5027	NC_010609	TAA	2	6	278174	278179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152889
5028	NC_010609	CTT	2	6	278202	278207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152889
5029	NC_010609	CTT	2	6	278273	278278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152889
5030	NC_010609	TTA	2	6	278308	278313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152889
5031	NC_010609	TTC	2	6	278340	278345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152889
5032	NC_010609	ATT	2	6	278435	278440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152889
5033	NC_010609	AAT	2	6	278499	278504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152889
5034	NC_010609	CAA	2	6	278512	278517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152889
5035	NC_010609	GAA	2	6	278571	278576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152889
5036	NC_010609	TGGT	2	8	278590	278597	0 %	50 %	50 %	0 %	184152889
5037	NC_010609	TAA	2	6	278609	278614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152889
5038	NC_010609	AAGC	2	8	278670	278677	50 %	0 %	25 %	25 %	184152889
5039	NC_010609	TGC	2	6	278864	278869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152889
5040	NC_010609	AGA	2	6	278894	278899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152889
5041	NC_010609	ACC	2	6	278905	278910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152889
5042	NC_010609	AAG	2	6	278974	278979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152889
5043	NC_010609	CAT	2	6	279000	279005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152889
5044	NC_010609	TGC	2	6	279008	279013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152889
5045	NC_010609	CAA	2	6	279024	279029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152889
5046	NC_010609	AGA	2	6	279104	279109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152889
5047	NC_010609	GAA	2	6	279272	279277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152890
5048	NC_010609	GCT	2	6	279365	279370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152890
5049	NC_010609	ATT	2	6	279383	279388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152890
5050	NC_010609	AAG	2	6	279465	279470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152890
5051	NC_010609	AGT	2	6	279511	279516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152890
5052	NC_010609	TGG	2	6	279520	279525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152890
5053	NC_010609	ACA	2	6	279559	279564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152890
5054	NC_010609	AATC	2	8	279702	279709	50 %	25 %	0 %	25 %	184152890
5055	NC_010609	GAT	2	6	279725	279730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152890
5056	NC_010609	CCA	2	6	279761	279766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152890
5057	NC_010609	ACT	2	6	279836	279841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152890
5058	NC_010609	CG	4	8	279866	279873	0 %	0 %	50 %	50 %	184152890
5059	NC_010609	CAT	2	6	279892	279897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152890
5060	NC_010609	GCG	2	6	279955	279960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152890
5061	NC_010609	GCT	2	6	280103	280108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152890
5062	NC_010609	TGC	2	6	280293	280298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152890
5063	NC_010609	CCA	2	6	280307	280312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152890
5064	NC_010609	GAA	2	6	280319	280324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152890
5065	NC_010609	GAA	2	6	280400	280405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152890
5066	NC_010609	CTA	2	6	280418	280423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152890
5067	NC_010609	AGC	2	6	280450	280455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152890
5068	NC_010609	GAAG	2	8	280474	280481	50 %	0 %	50 %	0 %	184152890
5069	NC_010609	AAT	2	6	280565	280570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152890
5070	NC_010609	TGG	2	6	280576	280581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152890
5071	NC_010609	CCG	2	6	280606	280611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152890
5072	NC_010609	TGG	3	9	280621	280629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152890
5073	NC_010609	AGA	2	6	280696	280701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152890
5074	NC_010609	CGT	2	6	280841	280846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152891
5075	NC_010609	TCT	2	6	280991	280996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152891
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5079	NC_010609	TTC	2	6	281380	281385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152891
5080	NC_010609	TG	3	6	281470	281475	0 %	50 %	50 %	0 %	184152891
5081	NC_010609	TCA	2	6	281480	281485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152891
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5085	NC_010609	TTG	2	6	282200	282205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152892
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5088	NC_010609	TCC	2	6	282457	282462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152892
5089	NC_010609	ATGA	2	8	282595	282602	50 %	25 %	25 %	0 %	184152892
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5091	NC_010609	ATG	2	6	282697	282702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152892
5092	NC_010609	ATG	2	6	282746	282751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152892
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5094	NC_010609	AAC	2	6	282819	282824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152892
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5099	NC_010609	TGT	2	6	282999	283004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152892
5100	NC_010609	AATTAG	2	12	283010	283021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	184152892
5101	NC_010609	CTT	2	6	283259	283264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152893
5102	NC_010609	TAG	2	6	283299	283304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152893
5103	NC_010609	CAT	2	6	283364	283369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152893
5104	NC_010609	CGG	2	6	283421	283426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152893
5105	NC_010609	TACT	2	8	283429	283436	25 %	50 %	0 %	25 %	184152893
5106	NC_010609	CAT	2	6	283457	283462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152893
5107	NC_010609	ATT	2	6	283473	283478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152893
5108	NC_010609	CAA	2	6	283499	283504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152893
5109	NC_010609	TC	3	6	283515	283520	0 %	50 %	0 %	50 %	184152893
5110	NC_010609	ATTG	2	8	283534	283541	25 %	50 %	25 %	0 %	184152893
5111	NC_010609	ATTTA	2	10	283616	283625	40 %	60 %	0 %	0 %	184152893
5112	NC_010609	AAC	2	6	284311	284316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152894
5113	NC_010609	GTA	2	6	284371	284376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152894
5114	NC_010609	AAGGTA	2	12	284389	284400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152894
5115	NC_010609	GCA	2	6	284481	284486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152894
5116	NC_010609	TCT	2	6	284513	284518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152894
5117	NC_010609	TGG	2	6	284618	284623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152894
5118	NC_010609	GTG	2	6	284649	284654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152894
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5120	NC_010609	T	6	6	284710	284715	0 %	100 %	0 %	0 %	184152894
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