MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 4306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010524	GCCGC	3	15	496	510	0 %	0 %	40 %	60 %	171056693
2	NC_010524	GGCCG	2	10	7433	7442	0 %	0 %	60 %	40 %	171056698
3	NC_010524	AGGCG	2	10	8742	8751	20 %	0 %	60 %	20 %	171056699
4	NC_010524	GTGCC	2	10	10610	10619	0 %	20 %	40 %	40 %	171056701
5	NC_010524	CGGCG	2	10	10860	10869	0 %	0 %	60 %	40 %	171056701
6	NC_010524	GCCAG	2	10	11275	11284	20 %	0 %	40 %	40 %	171056702
7	NC_010524	TGCGC	2	10	11438	11447	0 %	20 %	40 %	40 %	171056702
8	NC_010524	ACCGC	2	10	12314	12323	20 %	0 %	20 %	60 %	171056703
9	NC_010524	GCAGC	2	10	13353	13362	20 %	0 %	40 %	40 %	171056704
10	NC_010524	AGCCC	2	10	14084	14093	20 %	0 %	20 %	60 %	171056705
11	NC_010524	CGGTG	2	10	14738	14747	0 %	20 %	60 %	20 %	171056705
12	NC_010524	CTGGC	2	10	14847	14856	0 %	20 %	40 %	40 %	171056706
13	NC_010524	AGCGC	2	10	15522	15531	20 %	0 %	40 %	40 %	171056707
14	NC_010524	CGATC	2	10	17810	17819	20 %	20 %	20 %	40 %	171056708
15	NC_010524	GCGCG	2	10	18755	18764	0 %	0 %	60 %	40 %	171056708
16	NC_010524	CCGGC	2	10	19471	19480	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
17	NC_010524	GCGCC	2	10	19482	19491	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
18	NC_010524	CCACG	2	10	20412	20421	20 %	0 %	20 %	60 %	171056709
19	NC_010524	TGCGC	2	10	20676	20685	0 %	20 %	40 %	40 %	171056709
20	NC_010524	GAGCT	2	10	20797	20806	20 %	20 %	40 %	20 %	171056709
21	NC_010524	GCCGC	2	10	21336	21345	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
22	NC_010524	GTGCT	2	10	24379	24388	0 %	40 %	40 %	20 %	171056711
23	NC_010524	GCGCC	2	10	24585	24594	0 %	0 %	40 %	60 %	171056711
24	NC_010524	TCGGC	2	10	24868	24877	0 %	20 %	40 %	40 %	171056712
25	NC_010524	CGGCG	2	10	24893	24902	0 %	0 %	60 %	40 %	171056712
26	NC_010524	CGACC	2	10	26653	26662	20 %	0 %	20 %	60 %	171056713
27	NC_010524	GGCCG	2	10	28567	28576	0 %	0 %	60 %	40 %	171056714
28	NC_010524	TCGCG	2	10	28976	28985	0 %	20 %	40 %	40 %	171056715
29	NC_010524	CTGGC	2	10	33704	33713	0 %	20 %	40 %	40 %	171056721
30	NC_010524	CCAGC	2	10	34419	34428	20 %	0 %	20 %	60 %	171056722
31	NC_010524	GCGCC	2	10	39200	39209	0 %	0 %	40 %	60 %	171056727
32	NC_010524	GCCCG	2	10	40997	41006	0 %	0 %	40 %	60 %	171056729
33	NC_010524	TGCGC	2	10	45090	45099	0 %	20 %	40 %	40 %	171056731
34	NC_010524	CGCGC	2	10	46446	46455	0 %	0 %	40 %	60 %	171056732
35	NC_010524	GCAGC	2	10	46520	46529	20 %	0 %	40 %	40 %	171056732
36	NC_010524	CGAGC	2	10	46679	46688	20 %	0 %	40 %	40 %	171056732
37	NC_010524	TGGTG	2	10	46909	46918	0 %	40 %	60 %	0 %	171056732
38	NC_010524	GCGCC	2	10	48354	48363	0 %	0 %	40 %	60 %	171056734
39	NC_010524	CGCTG	2	10	49037	49046	0 %	20 %	40 %	40 %	171056734
40	NC_010524	CGCGG	2	10	49200	49209	0 %	0 %	60 %	40 %	171056734
41	NC_010524	GCCGG	2	10	49344	49353	0 %	0 %	60 %	40 %	171056734
42	NC_010524	CGGCT	2	10	51878	51887	0 %	20 %	40 %	40 %	171056738
43	NC_010524	CCGGC	2	10	53116	53125	0 %	0 %	40 %	60 %	171056739
44	NC_010524	TCGAG	2	10	54734	54743	20 %	20 %	40 %	20 %	171056741
45	NC_010524	GGCCC	2	10	56629	56638	0 %	0 %	40 %	60 %	171056742
46	NC_010524	CCCGA	2	10	58226	58235	20 %	0 %	20 %	60 %	171056744
47	NC_010524	CGGCG	2	10	59417	59426	0 %	0 %	60 %	40 %	171056746
48	NC_010524	CATCG	2	10	59865	59874	20 %	20 %	20 %	40 %	171056746
49	NC_010524	CCAGC	2	10	60599	60608	20 %	0 %	20 %	60 %	171056746
50	NC_010524	CGGCC	2	10	60936	60945	0 %	0 %	40 %	60 %	171056746
51	NC_010524	CGGCG	2	10	60946	60955	0 %	0 %	60 %	40 %	171056746
52	NC_010524	GCCAC	2	10	61126	61135	20 %	0 %	20 %	60 %	171056746
53	NC_010524	GCGCC	2	10	61624	61633	0 %	0 %	40 %	60 %	171056747
54	NC_010524	GCGCG	2	10	63347	63356	0 %	0 %	60 %	40 %	171056750
55	NC_010524	GCCGC	2	10	64069	64078	0 %	0 %	40 %	60 %	171056751
56	NC_010524	CGAGC	2	10	64511	64520	20 %	0 %	40 %	40 %	171056751
57	NC_010524	CAGGC	2	10	64869	64878	20 %	0 %	40 %	40 %	171056751
58	NC_010524	GGCCG	2	10	65559	65568	0 %	0 %	60 %	40 %	171056752
59	NC_010524	CAGCT	2	10	65787	65796	20 %	20 %	20 %	40 %	171056752
60	NC_010524	TGCGC	2	10	66926	66935	0 %	20 %	40 %	40 %	171056754
61	NC_010524	CGCGG	2	10	68037	68046	0 %	0 %	60 %	40 %	171056756
62	NC_010524	TGCTC	2	10	68751	68760	0 %	40 %	20 %	40 %	171056758
63	NC_010524	CCGGG	2	10	69252	69261	0 %	0 %	60 %	40 %	171056758
64	NC_010524	GCGCC	2	10	69527	69536	0 %	0 %	40 %	60 %	171056758
65	NC_010524	GCGCG	2	10	69834	69843	0 %	0 %	60 %	40 %	171056758
66	NC_010524	GCGCC	2	10	71114	71123	0 %	0 %	40 %	60 %	171056759
67	NC_010524	CGAGG	2	10	72430	72439	20 %	0 %	60 %	20 %	171056760
68	NC_010524	CGGTG	2	10	72492	72501	0 %	20 %	60 %	20 %	171056760
69	NC_010524	CCCAG	2	10	74667	74676	20 %	0 %	20 %	60 %	171056762
70	NC_010524	CACGG	2	10	76187	76196	20 %	0 %	40 %	40 %	171056764
71	NC_010524	GCCGC	2	10	76299	76308	0 %	0 %	40 %	60 %	171056764
72	NC_010524	GCCGC	2	10	76526	76535	0 %	0 %	40 %	60 %	171056764
73	NC_010524	GCCGC	2	10	77110	77119	0 %	0 %	40 %	60 %	171056765
74	NC_010524	CCGCG	2	10	77524	77533	0 %	0 %	40 %	60 %	171056765
75	NC_010524	GGCCG	2	10	78482	78491	0 %	0 %	60 %	40 %	171056766
76	NC_010524	GCGCC	2	10	79021	79030	0 %	0 %	40 %	60 %	171056767
77	NC_010524	GCCGT	2	10	79256	79265	0 %	20 %	40 %	40 %	171056767
78	NC_010524	CGCGG	2	10	79572	79581	0 %	0 %	60 %	40 %	171056768
79	NC_010524	GGCTG	2	10	81072	81081	0 %	20 %	60 %	20 %	171056770
80	NC_010524	TCGAC	2	10	81341	81350	20 %	20 %	20 %	40 %	171056770
81	NC_010524	GGCCG	2	10	82371	82380	0 %	0 %	60 %	40 %	171056771
82	NC_010524	GCCGG	2	10	82699	82708	0 %	0 %	60 %	40 %	171056771
83	NC_010524	GCCGC	2	10	83653	83662	0 %	0 %	40 %	60 %	171056772
84	NC_010524	GCGCC	2	10	84512	84521	0 %	0 %	40 %	60 %	171056773
85	NC_010524	CCCGA	2	10	84657	84666	20 %	0 %	20 %	60 %	171056773
86	NC_010524	CGGTG	2	10	84686	84695	0 %	20 %	60 %	20 %	171056773
87	NC_010524	GCCCG	2	10	86697	86706	0 %	0 %	40 %	60 %	171056775
88	NC_010524	GCCGC	2	10	91034	91043	0 %	0 %	40 %	60 %	171056778
89	NC_010524	CCGGG	2	10	91076	91085	0 %	0 %	60 %	40 %	171056778
90	NC_010524	GCGCC	2	10	92429	92438	0 %	0 %	40 %	60 %	171056779
91	NC_010524	CTGAT	2	10	94076	94085	20 %	40 %	20 %	20 %	171056780
92	NC_010524	ACGGC	2	10	95019	95028	20 %	0 %	40 %	40 %	171056781
93	NC_010524	GCCCG	2	10	95809	95818	0 %	0 %	40 %	60 %	171056782
94	NC_010524	GCGCG	2	10	96467	96476	0 %	0 %	60 %	40 %	171056783
95	NC_010524	GGGCC	2	10	97638	97647	0 %	0 %	60 %	40 %	171056784
96	NC_010524	GGCGT	2	10	97833	97842	0 %	20 %	60 %	20 %	171056784
97	NC_010524	TCGGG	2	10	99671	99680	0 %	20 %	60 %	20 %	171056786
98	NC_010524	GCCGC	2	10	99952	99961	0 %	0 %	40 %	60 %	171056786
99	NC_010524	GCCGG	2	10	101534	101543	0 %	0 %	60 %	40 %	171056788
100	NC_010524	GGCCA	2	10	101617	101626	20 %	0 %	40 %	40 %	171056788
101	NC_010524	CGGTG	2	10	102059	102068	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
102	NC_010524	CGCAG	2	10	102452	102461	20 %	0 %	40 %	40 %	171056789
103	NC_010524	GGCGT	2	10	102778	102787	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
104	NC_010524	GGTCG	2	10	102855	102864	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
105	NC_010524	GCGCG	2	10	103070	103079	0 %	0 %	60 %	40 %	171056789
106	NC_010524	CGCTG	2	10	103409	103418	0 %	20 %	40 %	40 %	171056790
107	NC_010524	CGGCG	2	10	106754	106763	0 %	0 %	60 %	40 %	171056794
108	NC_010524	GTCGC	2	10	109650	109659	0 %	20 %	40 %	40 %	171056797
109	NC_010524	GCATC	2	10	109917	109926	20 %	20 %	20 %	40 %	171056797
110	NC_010524	CCGTG	2	10	111382	111391	0 %	20 %	40 %	40 %	171056799
111	NC_010524	AGGGC	2	10	111484	111493	20 %	0 %	60 %	20 %	171056799
112	NC_010524	CGGCC	2	10	112015	112024	0 %	0 %	40 %	60 %	171056799
113	NC_010524	GCGCG	2	10	114200	114209	0 %	0 %	60 %	40 %	171056801
114	NC_010524	GGTCG	2	10	115664	115673	0 %	20 %	60 %	20 %	171056802
115	NC_010524	AGCGC	2	10	117407	117416	20 %	0 %	40 %	40 %	171056803
116	NC_010524	CGACC	2	10	118214	118223	20 %	0 %	20 %	60 %	171056804
117	NC_010524	TGCCC	2	10	118955	118964	0 %	20 %	20 %	60 %	171056806
118	NC_010524	AGGCC	2	10	119599	119608	20 %	0 %	40 %	40 %	171056807
119	NC_010524	CGGCG	2	10	124043	124052	0 %	0 %	60 %	40 %	171056811
120	NC_010524	CCGCC	2	10	125391	125400	0 %	0 %	20 %	80 %	171056812
121	NC_010524	CGGCC	2	10	126023	126032	0 %	0 %	40 %	60 %	171056813
122	NC_010524	GCTGG	2	10	127158	127167	0 %	20 %	60 %	20 %	171056815
123	NC_010524	GCCGC	2	10	127594	127603	0 %	0 %	40 %	60 %	171056815
124	NC_010524	CCGTG	2	10	128484	128493	0 %	20 %	40 %	40 %	171056816
125	NC_010524	CGCGG	2	10	128628	128637	0 %	0 %	60 %	40 %	171056816
126	NC_010524	GCTGG	2	10	130362	130371	0 %	20 %	60 %	20 %	171056818
127	NC_010524	CTGGC	2	10	130435	130444	0 %	20 %	40 %	40 %	171056818
128	NC_010524	GGCTG	2	10	132895	132904	0 %	20 %	60 %	20 %	171056820
129	NC_010524	CCCGA	2	10	133735	133744	20 %	0 %	20 %	60 %	171056821
130	NC_010524	CGCGC	2	10	133910	133919	0 %	0 %	40 %	60 %	171056822
131	NC_010524	TGCCG	2	10	136865	136874	0 %	20 %	40 %	40 %	171056824
132	NC_010524	CGGCA	2	10	141945	141954	20 %	0 %	40 %	40 %	171056829
133	NC_010524	ACGGC	2	10	142049	142058	20 %	0 %	40 %	40 %	171056829
134	NC_010524	CGGCG	2	10	142572	142581	0 %	0 %	60 %	40 %	171056829
135	NC_010524	CCTGG	2	10	143311	143320	0 %	20 %	40 %	40 %	171056830
136	NC_010524	CCGGC	2	10	143931	143940	0 %	0 %	40 %	60 %	171056830
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263	NC_010524	AGCCC	2	10	291670	291679	20 %	0 %	20 %	60 %	171056968
264	NC_010524	GCGCG	2	10	292285	292294	0 %	0 %	60 %	40 %	171056968
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280	NC_010524	GGGCG	2	10	311248	311257	0 %	0 %	80 %	20 %	171056985
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