MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010524	CGGC	2	8	124106	124113	0 %	0 %	50 %	50 %	171056811
3502	NC_010524	GGT	2	6	124127	124132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056811
3503	NC_010524	ACC	3	9	124165	124173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056811
3504	NC_010524	CGG	2	6	124181	124186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056811
3505	NC_010524	CGC	2	6	124288	124293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056811
3506	NC_010524	GCT	2	6	124328	124333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056811
3507	NC_010524	ACC	2	6	124335	124340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056811
3508	NC_010524	GGC	2	6	124387	124392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056811
3509	NC_010524	CG	3	6	124405	124410	0 %	0 %	50 %	50 %	171056811
3510	NC_010524	TCG	3	9	124474	124482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056811
3511	NC_010524	CGAA	2	8	124589	124596	50 %	0 %	25 %	25 %	171056812
3512	NC_010524	CGC	3	9	124602	124610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3513	NC_010524	CGG	2	6	124625	124630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056812
3514	NC_010524	GTC	2	6	124702	124707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056812
3515	NC_010524	GCC	2	6	124741	124746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3516	NC_010524	GGT	2	6	124761	124766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056812
3517	NC_010524	GC	3	6	124772	124777	0 %	0 %	50 %	50 %	171056812
3518	NC_010524	CGG	2	6	124805	124810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056812
3519	NC_010524	GC	3	6	124814	124819	0 %	0 %	50 %	50 %	171056812
3520	NC_010524	AGC	2	6	124820	124825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056812
3521	NC_010524	GCC	2	6	124949	124954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3522	NC_010524	CAC	2	6	124962	124967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056812
3523	NC_010524	CCG	2	6	125024	125029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3524	NC_010524	CGA	2	6	125040	125045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056812
3525	NC_010524	GCC	2	6	125056	125061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3526	NC_010524	CGC	2	6	125080	125085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3527	NC_010524	ACG	2	6	125093	125098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056812
3528	NC_010524	CGC	2	6	125101	125106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3529	NC_010524	GCC	2	6	125107	125112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3530	NC_010524	CG	3	6	125125	125130	0 %	0 %	50 %	50 %	171056812
3531	NC_010524	CAG	3	9	125137	125145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056812
3532	NC_010524	GCT	2	6	125163	125168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056812
3533	NC_010524	CAC	2	6	125184	125189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056812
3534	NC_010524	CGCC	2	8	125259	125266	0 %	0 %	25 %	75 %	171056812
3535	NC_010524	GCC	2	6	125284	125289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
3536	NC_010524	CCGC	2	8	125292	125299	0 %	0 %	25 %	75 %	171056812
3537	NC_010524	ACGC	2	8	125333	125340	25 %	0 %	25 %	50 %	171056812
3538	NC_010524	CGA	2	6	125352	125357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056812
3539	NC_010524	CAA	2	6	125367	125372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056812
3540	NC_010524	CGGC	2	8	125381	125388	0 %	0 %	50 %	50 %	171056812
3541	NC_010524	CCGCC	2	10	125391	125400	0 %	0 %	20 %	80 %	171056812
3542	NC_010524	GGC	2	6	125401	125406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056812
3543	NC_010524	CGCC	2	8	125407	125414	0 %	0 %	25 %	75 %	171056812
3544	NC_010524	GCG	2	6	125415	125420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056812
3545	NC_010524	C	6	6	125512	125517	0 %	0 %	0 %	100 %	171056813
3546	NC_010524	TC	3	6	125518	125523	0 %	50 %	0 %	50 %	171056813
3547	NC_010524	TGC	2	6	125542	125547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056813
3548	NC_010524	GCG	2	6	125554	125559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056813
3549	NC_010524	CAG	2	6	125643	125648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056813
3550	NC_010524	GCC	2	6	125688	125693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056813
3551	NC_010524	TGG	2	6	125728	125733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056813
3552	NC_010524	CGT	2	6	125789	125794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056813
3553	NC_010524	CCGC	2	8	125809	125816	0 %	0 %	25 %	75 %	171056813
3554	NC_010524	CCG	2	6	125849	125854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056813
3555	NC_010524	CGC	2	6	125858	125863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056813
3556	NC_010524	TGA	2	6	125986	125991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056813
3557	NC_010524	CGGCC	2	10	126023	126032	0 %	0 %	40 %	60 %	171056813
3558	NC_010524	GGC	2	6	126041	126046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056813
3559	NC_010524	GGCG	2	8	126066	126073	0 %	0 %	75 %	25 %	171056813
3560	NC_010524	TCG	2	6	126094	126099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056813
3561	NC_010524	TCGACT	2	12	126109	126120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171056813
3562	NC_010524	GC	4	8	126143	126150	0 %	0 %	50 %	50 %	171056813
3563	NC_010524	GCG	2	6	126211	126216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056813
3564	NC_010524	GCCG	2	8	126251	126258	0 %	0 %	50 %	50 %	171056813
3565	NC_010524	CGG	2	6	126305	126310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056813
3566	NC_010524	GCCCGC	2	12	126373	126384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056813
3567	NC_010524	GAT	2	6	126404	126409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056813
3568	NC_010524	CGG	2	6	126509	126514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056813
3569	NC_010524	ACG	2	6	126538	126543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056813
3570	NC_010524	GCC	2	6	126613	126618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056813
3571	NC_010524	ACG	2	6	126640	126645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056813
3572	NC_010524	GC	3	6	126660	126665	0 %	0 %	50 %	50 %	171056813
3573	NC_010524	GGC	2	6	126680	126685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056813
3574	NC_010524	CGGC	2	8	126702	126709	0 %	0 %	50 %	50 %	171056813
3575	NC_010524	AGC	2	6	126824	126829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056814
3576	NC_010524	GGCA	2	8	126861	126868	25 %	0 %	50 %	25 %	171056814
3577	NC_010524	GC	3	6	126878	126883	0 %	0 %	50 %	50 %	171056814
3578	NC_010524	GCG	2	6	126908	126913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056814
3579	NC_010524	GGT	2	6	126936	126941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056814
3580	NC_010524	CTG	4	12	126997	127008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3581	NC_010524	CTG	2	6	127014	127019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3582	NC_010524	CGG	2	6	127048	127053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056815
3583	NC_010524	CGG	2	6	127056	127061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056815
3584	NC_010524	GCT	2	6	127107	127112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3585	NC_010524	GCC	2	6	127117	127122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056815
3586	NC_010524	CGG	2	6	127143	127148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056815
3587	NC_010524	GCTGG	2	10	127158	127167	0 %	20 %	60 %	20 %	171056815
3588	NC_010524	GCT	2	6	127170	127175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3589	NC_010524	CGG	2	6	127178	127183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056815
3590	NC_010524	GCT	2	6	127188	127193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3591	NC_010524	GCT	2	6	127197	127202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3592	NC_010524	CGC	2	6	127275	127280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056815
3593	NC_010524	GCT	2	6	127374	127379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3594	NC_010524	CGGC	2	8	127381	127388	0 %	0 %	50 %	50 %	171056815
3595	NC_010524	GCG	2	6	127415	127420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056815
3596	NC_010524	CCG	2	6	127430	127435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056815
3597	NC_010524	CAC	2	6	127461	127466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056815
3598	NC_010524	CGA	2	6	127512	127517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3599	NC_010524	TCG	2	6	127523	127528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3600	NC_010524	GCA	2	6	127560	127565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3601	NC_010524	GGT	2	6	127566	127571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056815
3602	NC_010524	GCCG	2	8	127574	127581	0 %	0 %	50 %	50 %	171056815
3603	NC_010524	GCCGC	2	10	127594	127603	0 %	0 %	40 %	60 %	171056815
3604	NC_010524	GTG	2	6	127648	127653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056815
3605	NC_010524	CAC	2	6	127657	127662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056815
3606	NC_010524	CAC	2	6	127707	127712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056815
3607	NC_010524	GCC	2	6	127719	127724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056815
3608	NC_010524	CGA	2	6	127740	127745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056815
3609	NC_010524	GCCCAG	2	12	127801	127812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056816
3610	NC_010524	CTC	2	6	127834	127839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056816
3611	NC_010524	GCCG	2	8	127905	127912	0 %	0 %	50 %	50 %	171056816
3612	NC_010524	CAG	2	6	127957	127962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056816
3613	NC_010524	GCG	2	6	127994	127999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056816
3614	NC_010524	AGA	2	6	128034	128039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056816
3615	NC_010524	GCG	3	9	128047	128055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056816
3616	NC_010524	ACC	2	6	128063	128068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056816
3617	NC_010524	CAG	2	6	128083	128088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056816
3618	NC_010524	GGC	3	9	128109	128117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056816
3619	NC_010524	GC	3	6	128182	128187	0 %	0 %	50 %	50 %	171056816
3620	NC_010524	GGC	2	6	128206	128211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056816
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3622	NC_010524	CGC	2	6	128238	128243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056816
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3983	NC_010524	CAG	4	12	141314	141325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056828
3984	NC_010524	TCA	2	6	141331	141336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056828
3985	NC_010524	CCG	2	6	141337	141342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056828
3986	NC_010524	TCA	2	6	141448	141453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056828
3987	NC_010524	ATC	2	6	141465	141470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056828
3988	NC_010524	CAG	2	6	141503	141508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056828
3989	NC_010524	GCA	2	6	141528	141533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056828
3990	NC_010524	GTA	2	6	141660	141665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056829
3991	NC_010524	CTT	2	6	141672	141677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056829
3992	NC_010524	CTGG	2	8	141699	141706	0 %	25 %	50 %	25 %	171056829
3993	NC_010524	CTG	2	6	141756	141761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056829
3994	NC_010524	TCT	2	6	141872	141877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056829
3995	NC_010524	CGG	3	9	141878	141886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056829
3996	NC_010524	GGC	2	6	141894	141899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056829
3997	NC_010524	CGGCA	2	10	141945	141954	20 %	0 %	40 %	40 %	171056829
3998	NC_010524	CTT	2	6	142035	142040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056829
3999	NC_010524	ACGGC	2	10	142049	142058	20 %	0 %	40 %	40 %	171056829
4000	NC_010524	GGCCCA	2	12	142062	142073	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056829

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