MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010524	CAG	2	6	50937	50942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1502	NC_010524	CGT	2	6	50972	50977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1503	NC_010524	ACC	2	6	50980	50985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056736
1504	NC_010524	CGGC	2	8	51023	51030	0 %	0 %	50 %	50 %	171056736
1505	NC_010524	GCC	2	6	51043	51048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056737
1506	NC_010524	CGA	2	6	51130	51135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056737
1507	NC_010524	TCT	2	6	51136	51141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056737
1508	NC_010524	GCT	2	6	51142	51147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056737
1509	NC_010524	GCACCG	2	12	51178	51189	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056737
1510	NC_010524	ATCAGG	2	12	51261	51272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171056737
1511	NC_010524	GCGCCA	2	12	51283	51294	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056737
1512	NC_010524	GGC	2	6	51317	51322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056737
1513	NC_010524	GTG	2	6	51341	51346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056737
1514	NC_010524	GC	3	6	51377	51382	0 %	0 %	50 %	50 %	171056737
1515	NC_010524	CGA	2	6	51391	51396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056737
1516	NC_010524	GC	3	6	51468	51473	0 %	0 %	50 %	50 %	171056738
1517	NC_010524	GCC	2	6	51490	51495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056738
1518	NC_010524	CGA	2	6	51504	51509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1519	NC_010524	GCG	2	6	51511	51516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056738
1520	NC_010524	CGCCAG	2	12	51517	51528	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056738
1521	NC_010524	CTC	2	6	51583	51588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056738
1522	NC_010524	CTC	2	6	51604	51609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056738
1523	NC_010524	GCC	2	6	51691	51696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056738
1524	NC_010524	CAG	2	6	51724	51729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1525	NC_010524	ACC	3	9	51734	51742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056738
1526	NC_010524	GGC	2	6	51820	51825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056738
1527	NC_010524	GC	3	6	51824	51829	0 %	0 %	50 %	50 %	171056738
1528	NC_010524	CAG	2	6	51856	51861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1529	NC_010524	CGGCT	2	10	51878	51887	0 %	20 %	40 %	40 %	171056738
1530	NC_010524	CGGC	2	8	51899	51906	0 %	0 %	50 %	50 %	171056738
1531	NC_010524	CGT	2	6	51930	51935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1532	NC_010524	GGT	2	6	51951	51956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056738
1533	NC_010524	GCT	2	6	51990	51995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1534	NC_010524	GAT	2	6	52045	52050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056738
1535	NC_010524	GCG	2	6	52059	52064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056738
1536	NC_010524	TTG	2	6	52103	52108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056738
1537	NC_010524	GCC	2	6	52115	52120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056738
1538	NC_010524	GC	3	6	52179	52184	0 %	0 %	50 %	50 %	171056738
1539	NC_010524	TCG	2	6	52190	52195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1540	NC_010524	CGG	2	6	52230	52235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056738
1541	NC_010524	CATC	2	8	52254	52261	25 %	25 %	0 %	50 %	171056738
1542	NC_010524	AGC	2	6	52304	52309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1543	NC_010524	CAC	2	6	52318	52323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056738
1544	NC_010524	GC	4	8	52350	52357	0 %	0 %	50 %	50 %	171056738
1545	NC_010524	CGG	2	6	52371	52376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056738
1546	NC_010524	CGG	2	6	52469	52474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056738
1547	NC_010524	GCCG	2	8	52500	52507	0 %	0 %	50 %	50 %	171056738
1548	NC_010524	CGT	2	6	52551	52556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1549	NC_010524	TCG	2	6	52589	52594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1550	NC_010524	TCG	2	6	52670	52675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1551	NC_010524	CTG	2	6	52723	52728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1552	NC_010524	GCC	2	6	52742	52747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056738
1553	NC_010524	GC	3	6	52780	52785	0 %	0 %	50 %	50 %	171056738
1554	NC_010524	CAG	2	6	52831	52836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1555	NC_010524	CGA	2	6	52839	52844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1556	NC_010524	CAG	2	6	52849	52854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1557	NC_010524	TGC	2	6	52869	52874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1558	NC_010524	CG	3	6	52892	52897	0 %	0 %	50 %	50 %	171056738
1559	NC_010524	GCA	2	6	52917	52922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
1560	NC_010524	GCG	2	6	52923	52928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056738
1561	NC_010524	CAG	2	6	52941	52946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056739
1562	NC_010524	GCA	2	6	52961	52966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056739
1563	NC_010524	TCG	3	9	52969	52977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056739
1564	NC_010524	GGC	2	6	53009	53014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056739
1565	NC_010524	CGG	2	6	53017	53022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056739
1566	NC_010524	GGT	2	6	53045	53050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056739
1567	NC_010524	CGT	2	6	53071	53076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056739
1568	NC_010524	CGG	2	6	53099	53104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056739
1569	NC_010524	CCGGC	2	10	53116	53125	0 %	0 %	40 %	60 %	171056739
1570	NC_010524	TGCG	2	8	53161	53168	0 %	25 %	50 %	25 %	171056739
1571	NC_010524	GCA	2	6	53180	53185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056739
1572	NC_010524	GGC	2	6	53247	53252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056739
1573	NC_010524	GCG	2	6	53258	53263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056739
1574	NC_010524	GGT	2	6	53313	53318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056739
1575	NC_010524	CAC	3	9	53334	53342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056739
1576	NC_010524	TCG	2	6	53440	53445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056739
1577	NC_010524	TGC	2	6	53462	53467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056739
1578	NC_010524	GCCA	2	8	53509	53516	25 %	0 %	25 %	50 %	171056739
1579	NC_010524	GC	3	6	53545	53550	0 %	0 %	50 %	50 %	171056739
1580	NC_010524	CGC	3	9	53548	53556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056739
1581	NC_010524	TGA	2	6	53647	53652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056740
1582	NC_010524	CGCAGC	2	12	53664	53675	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056740
1583	NC_010524	CGG	2	6	53704	53709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056740
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1585	NC_010524	GC	3	6	53841	53846	0 %	0 %	50 %	50 %	171056740
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1587	NC_010524	GC	3	6	53873	53878	0 %	0 %	50 %	50 %	171056740
1588	NC_010524	GCA	2	6	53906	53911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056740
1589	NC_010524	GTA	2	6	53912	53917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056740
1590	NC_010524	AGC	2	6	53949	53954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056740
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1592	NC_010524	CGGG	2	8	53992	53999	0 %	0 %	75 %	25 %	171056740
1593	NC_010524	CGG	2	6	54053	54058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056740
1594	NC_010524	GCCA	2	8	54063	54070	25 %	0 %	25 %	50 %	171056740
1595	NC_010524	CGGC	2	8	54079	54086	0 %	0 %	50 %	50 %	171056740
1596	NC_010524	CAG	2	6	54116	54121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056740
1597	NC_010524	CGC	2	6	54130	54135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056740
1598	NC_010524	TCT	2	6	54142	54147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056740
1599	NC_010524	CAC	2	6	54152	54157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056740
1600	NC_010524	CAG	2	6	54236	54241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056740
1601	NC_010524	CAC	2	6	54242	54247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056740
1602	NC_010524	GCG	2	6	54333	54338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056740
1603	NC_010524	CG	3	6	54337	54342	0 %	0 %	50 %	50 %	171056740
1604	NC_010524	CGT	2	6	54364	54369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056740
1605	NC_010524	GCA	2	6	54385	54390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056740
1606	NC_010524	GCG	2	6	54409	54414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056740
1607	NC_010524	GCC	2	6	54477	54482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056740
1608	NC_010524	CGC	2	6	54512	54517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056740
1609	NC_010524	GCG	2	6	54522	54527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056740
1610	NC_010524	GCA	2	6	54535	54540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056740
1611	NC_010524	CGG	2	6	54546	54551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056740
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1614	NC_010524	TCGAG	2	10	54734	54743	20 %	20 %	40 %	20 %	171056741
1615	NC_010524	GC	3	6	54749	54754	0 %	0 %	50 %	50 %	171056741
1616	NC_010524	CGG	2	6	54779	54784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056741
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1619	NC_010524	GC	3	6	54833	54838	0 %	0 %	50 %	50 %	171056741
1620	NC_010524	GCC	2	6	54859	54864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056741
1621	NC_010524	CGC	2	6	54872	54877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056741
1622	NC_010524	CCA	2	6	55023	55028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056741
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1999	NC_010524	ACGA	2	8	68816	68823	50 %	0 %	25 %	25 %	171056758
2000	NC_010524	CTG	2	6	68845	68850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056758

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