MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010524	GAA	2	6	521339	521344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057174
14002	NC_010524	TGG	2	6	521370	521375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057174
14003	NC_010524	CCG	2	6	521434	521439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057174
14004	NC_010524	CGG	2	6	521473	521478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
14005	NC_010524	GAA	2	6	521492	521497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057174
14006	NC_010524	GGCCA	2	10	521537	521546	20 %	0 %	40 %	40 %	171057174
14007	NC_010524	ACC	2	6	521573	521578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057174
14008	NC_010524	ATC	2	6	521579	521584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057174
14009	NC_010524	GAA	2	6	521645	521650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057174
14010	NC_010524	CCA	2	6	521652	521657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057174
14011	NC_010524	CGG	2	6	521704	521709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
14012	NC_010524	AAG	2	6	521759	521764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057174
14013	NC_010524	GAA	2	6	521807	521812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057174
14014	NC_010524	TGGC	2	8	521820	521827	0 %	25 %	50 %	25 %	171057174
14015	NC_010524	GGC	3	9	521825	521833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
14016	NC_010524	CTG	2	6	521840	521845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057174
14017	NC_010524	GCT	2	6	521858	521863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057174
14018	NC_010524	CGG	2	6	521959	521964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
14019	NC_010524	CGT	3	9	521974	521982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057174
14020	NC_010524	CGC	2	6	522022	522027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057174
14021	NC_010524	CGC	2	6	522103	522108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057174
14022	NC_010524	GTCG	2	8	522109	522116	0 %	25 %	50 %	25 %	171057174
14023	NC_010524	ACC	2	6	522131	522136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057174
14024	NC_010524	GCC	2	6	522170	522175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057174
14025	NC_010524	GGC	3	9	522176	522184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
14026	NC_010524	CGG	2	6	522190	522195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
14027	NC_010524	GGC	2	6	522209	522214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
14028	NC_010524	GGC	2	6	522218	522223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
14029	NC_010524	TGT	2	6	522336	522341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057175
14030	NC_010524	CAG	2	6	522346	522351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14031	NC_010524	CGAT	2	8	522371	522378	25 %	25 %	25 %	25 %	171057175
14032	NC_010524	AGC	2	6	522422	522427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14033	NC_010524	GCC	2	6	522487	522492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057175
14034	NC_010524	CAG	2	6	522494	522499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14035	NC_010524	AGA	2	6	522570	522575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057175
14036	NC_010524	CAG	2	6	522643	522648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14037	NC_010524	CACG	2	8	522657	522664	25 %	0 %	25 %	50 %	171057175
14038	NC_010524	CGG	2	6	522690	522695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057175
14039	NC_010524	TGG	2	6	522716	522721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057175
14040	NC_010524	GC	3	6	522787	522792	0 %	0 %	50 %	50 %	171057175
14041	NC_010524	TTC	2	6	522823	522828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057175
14042	NC_010524	GCA	2	6	522921	522926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14043	NC_010524	GTA	2	6	522934	522939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057175
14044	NC_010524	CGGG	2	8	522942	522949	0 %	0 %	75 %	25 %	171057175
14045	NC_010524	CGT	2	6	522954	522959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14046	NC_010524	GTG	2	6	523021	523026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057175
14047	NC_010524	GTG	2	6	523067	523072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057175
14048	NC_010524	CTT	2	6	523090	523095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057175
14049	NC_010524	CTG	2	6	523168	523173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14050	NC_010524	GGT	2	6	523282	523287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057175
14051	NC_010524	CGTCGA	2	12	523320	523331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14052	NC_010524	CG	3	6	523419	523424	0 %	0 %	50 %	50 %	171057175
14053	NC_010524	GCC	2	6	523468	523473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057175
14054	NC_010524	CCA	2	6	523539	523544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057175
14055	NC_010524	CGC	2	6	523629	523634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057175
14056	NC_010524	CGC	2	6	523695	523700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057175
14057	NC_010524	GTC	2	6	523804	523809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14058	NC_010524	GGC	2	6	523831	523836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057175
14059	NC_010524	CTT	3	9	523956	523964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057175
14060	NC_010524	CGA	2	6	523974	523979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14061	NC_010524	CCA	2	6	524008	524013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057175
14062	NC_010524	GTC	2	6	524122	524127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14063	NC_010524	CGT	2	6	524133	524138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057175
14064	NC_010524	ACC	2	6	524180	524185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057175
14065	NC_010524	GCC	2	6	524252	524257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057175
14066	NC_010524	GCG	2	6	524330	524335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057175
14067	NC_010524	ACC	2	6	524336	524341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057175
14068	NC_010524	GGC	2	6	524545	524550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057176
14069	NC_010524	GAC	2	6	524553	524558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057176
14070	NC_010524	CGA	2	6	524674	524679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057176
14071	NC_010524	CGG	2	6	524722	524727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057176
14072	NC_010524	GCTG	2	8	524804	524811	0 %	25 %	50 %	25 %	171057176
14073	NC_010524	AGC	2	6	524814	524819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057176
14074	NC_010524	GC	3	6	524835	524840	0 %	0 %	50 %	50 %	171057176
14075	NC_010524	GAT	2	6	524888	524893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057176
14076	NC_010524	CGA	3	9	524896	524904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057176
14077	NC_010524	TCA	2	6	524905	524910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057176
14078	NC_010524	CGG	2	6	525229	525234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057177
14079	NC_010524	GTG	2	6	525256	525261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057177
14080	NC_010524	TCG	2	6	525360	525365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057177
14081	NC_010524	AGT	2	6	525439	525444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057177
14082	NC_010524	GTGC	2	8	525516	525523	0 %	25 %	50 %	25 %	171057177
14083	NC_010524	GCC	2	6	525545	525550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057177
14084	NC_010524	TCG	2	6	525666	525671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057177
14085	NC_010524	A	7	7	525680	525686	100 %	0 %	0 %	0 %	171057177
14086	NC_010524	GCG	2	6	525718	525723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057177
14087	NC_010524	AACG	2	8	525789	525796	50 %	0 %	25 %	25 %	171057177
14088	NC_010524	AGG	2	6	525871	525876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057177
14089	NC_010524	TCG	2	6	525903	525908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057177
14090	NC_010524	CCAGCA	2	12	525910	525921	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171057177
14091	NC_010524	TCGG	2	8	525967	525974	0 %	25 %	50 %	25 %	171057177
14092	NC_010524	CTG	2	6	525988	525993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057177
14093	NC_010524	AAT	2	6	526006	526011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171057177
14094	NC_010524	GC	3	6	526067	526072	0 %	0 %	50 %	50 %	171057177
14095	NC_010524	TGG	2	6	526074	526079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057177
14096	NC_010524	CGAG	2	8	526192	526199	25 %	0 %	50 %	25 %	171057177
14097	NC_010524	CAG	2	6	526421	526426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057177
14098	NC_010524	CTT	2	6	526438	526443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057177
14099	NC_010524	GCA	2	6	526459	526464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057177
14100	NC_010524	TGGC	2	8	526892	526899	0 %	25 %	50 %	25 %	171057178
14101	NC_010524	TGAG	2	8	526931	526938	25 %	25 %	50 %	0 %	171057178
14102	NC_010524	GCT	3	9	526959	526967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057178
14103	NC_010524	CGATC	2	10	527109	527118	20 %	20 %	20 %	40 %	171057178
14104	NC_010524	TGC	2	6	527134	527139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057178
14105	NC_010524	GTC	2	6	527143	527148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057178
14106	NC_010524	GGC	2	6	527320	527325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057178
14107	NC_010524	GCC	2	6	527329	527334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057178
14108	NC_010524	GCCT	2	8	527358	527365	0 %	25 %	25 %	50 %	171057178
14109	NC_010524	CG	4	8	527397	527404	0 %	0 %	50 %	50 %	171057178
14110	NC_010524	CCA	2	6	527412	527417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057178
14111	NC_010524	TGG	2	6	527426	527431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057178
14112	NC_010524	CTG	2	6	527511	527516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057178
14113	NC_010524	GCAG	2	8	527646	527653	25 %	0 %	50 %	25 %	171057178
14114	NC_010524	GAT	2	6	527665	527670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057178
14115	NC_010524	TGC	2	6	527711	527716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057178
14116	NC_010524	CGG	2	6	527774	527779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057178
14117	NC_010524	CAG	2	6	527818	527823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057178
14118	NC_010524	C	6	6	527842	527847	0 %	0 %	0 %	100 %	171057178
14119	NC_010524	GGC	2	6	527923	527928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057178
14120	NC_010524	CG	3	6	527983	527988	0 %	0 %	50 %	50 %	171057178
14121	NC_010524	CGG	2	6	528003	528008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057178
14122	NC_010524	CAC	2	6	528046	528051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057178
14123	NC_010524	CG	3	6	528059	528064	0 %	0 %	50 %	50 %	171057178
14124	NC_010524	GCG	2	6	528127	528132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057178
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14225	NC_010524	GACGGC	2	12	532285	532296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057181
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14227	NC_010524	ACG	2	6	532313	532318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057181
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14238	NC_010524	GGC	2	6	532935	532940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057182
14239	NC_010524	CTT	2	6	532968	532973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057182
14240	NC_010524	GCA	2	6	533009	533014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057182
14241	NC_010524	CGGTGG	2	12	533027	533038	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171057182
14242	NC_010524	GCC	2	6	533062	533067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057182
14243	NC_010524	TG	3	6	533078	533083	0 %	50 %	50 %	0 %	171057182
14244	NC_010524	C	7	7	533260	533266	0 %	0 %	0 %	100 %	171057183
14245	NC_010524	GCGCC	2	10	533274	533283	0 %	0 %	40 %	60 %	171057183
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14247	NC_010524	GCT	2	6	533304	533309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057183
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14252	NC_010524	GCC	2	6	533408	533413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057183
14253	NC_010524	CAT	2	6	533424	533429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057183
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14262	NC_010524	CTG	2	6	533644	533649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057183
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14341	NC_010524	TGA	2	6	536278	536283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057185
14342	NC_010524	TCGCGG	2	12	536331	536342	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057186
14343	NC_010524	GAT	2	6	536365	536370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057186
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14345	NC_010524	CAC	2	6	536431	536436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057186
14346	NC_010524	ATG	2	6	536504	536509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057186
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14349	NC_010524	CCG	2	6	536600	536605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057186
14350	NC_010524	CGC	2	6	536628	536633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057186
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14352	NC_010524	TCT	2	6	536756	536761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057186
14353	NC_010524	TCG	2	6	536762	536767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057186
14354	NC_010524	CGA	2	6	536781	536786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057186
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14475	NC_010524	GGT	3	9	541320	541328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057190
14476	NC_010524	CG	3	6	541399	541404	0 %	0 %	50 %	50 %	171057190
14477	NC_010524	GGGCCT	2	12	541428	541439	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057190
14478	NC_010524	CAC	2	6	541473	541478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057190
14479	NC_010524	CGA	2	6	541488	541493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057190
14480	NC_010524	CCG	2	6	541516	541521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057190
14481	NC_010524	GC	4	8	541535	541542	0 %	0 %	50 %	50 %	171057190
14482	NC_010524	GCCCA	2	10	541564	541573	20 %	0 %	20 %	60 %	171057190
14483	NC_010524	CGA	2	6	541584	541589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057190
14484	NC_010524	GCAGAC	4	24	541602	541625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057190
14485	NC_010524	CGCGGG	2	12	541668	541679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057191
14486	NC_010524	GCC	2	6	541729	541734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057191
14487	NC_010524	TGA	2	6	541740	541745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057191
14488	NC_010524	ACC	2	6	541763	541768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057191
14489	NC_010524	GAA	2	6	541813	541818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057191
14490	NC_010524	GCC	2	6	541834	541839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057191
14491	NC_010524	GC	3	6	541846	541851	0 %	0 %	50 %	50 %	171057191
14492	NC_010524	CAG	4	12	541915	541926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14493	NC_010524	TTC	2	6	541945	541950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057191
14494	NC_010524	GGC	2	6	541957	541962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057191
14495	NC_010524	GGT	2	6	541975	541980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057191
14496	NC_010524	CCCG	2	8	542041	542048	0 %	0 %	25 %	75 %	171057191
14497	NC_010524	GAT	2	6	542071	542076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057191
14498	NC_010524	GGTCG	2	10	542104	542113	0 %	20 %	60 %	20 %	171057191
14499	NC_010524	TTC	2	6	542132	542137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057191
14500	NC_010524	GCA	2	6	542148	542153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191

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