MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
129001	NC_010524	CGGCG	2	10	4892315	4892324	0 %	0 %	60 %	40 %	171061040
129002	NC_010524	GCT	2	6	4892335	4892340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061040
129003	NC_010524	CGA	2	6	4892378	4892383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061040
129004	NC_010524	CTCG	2	8	4892384	4892391	0 %	25 %	25 %	50 %	171061040
129005	NC_010524	GC	3	6	4892428	4892433	0 %	0 %	50 %	50 %	171061040
129006	NC_010524	CGG	2	6	4892465	4892470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061040
129007	NC_010524	GCAGGC	2	12	4892486	4892497	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171061040
129008	NC_010524	GCT	2	6	4892516	4892521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061040
129009	NC_010524	GCG	2	6	4892527	4892532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061040
129010	NC_010524	CGG	2	6	4892539	4892544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061040
129011	NC_010524	CAGC	2	8	4892618	4892625	25 %	0 %	25 %	50 %	171061040
129012	NC_010524	CGC	2	6	4892702	4892707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061041
129013	NC_010524	ATC	2	6	4892793	4892798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061041
129014	NC_010524	CCGAGC	2	12	4892812	4892823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171061041
129015	NC_010524	CGC	2	6	4892875	4892880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061041
129016	NC_010524	CGC	2	6	4892890	4892895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061041
129017	NC_010524	GCC	2	6	4892901	4892906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061041
129018	NC_010524	GCC	2	6	4892909	4892914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061041
129019	NC_010524	GCT	2	6	4892962	4892967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061042
129020	NC_010524	TGA	2	6	4892997	4893002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061042
129021	NC_010524	CAT	2	6	4893016	4893021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061042
129022	NC_010524	GGCCG	2	10	4893046	4893055	0 %	0 %	60 %	40 %	171061042
129023	NC_010524	CGGC	2	8	4893064	4893071	0 %	0 %	50 %	50 %	171061042
129024	NC_010524	CGA	2	6	4893085	4893090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061042
129025	NC_010524	CGG	2	6	4893112	4893117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061042
129026	NC_010524	TGG	2	6	4893161	4893166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061042
129027	NC_010524	GCG	2	6	4893175	4893180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061042
129028	NC_010524	CGA	2	6	4893202	4893207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061042
129029	NC_010524	GCCG	2	8	4893214	4893221	0 %	0 %	50 %	50 %	171061042
129030	NC_010524	CAG	2	6	4893263	4893268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061042
129031	NC_010524	GTGG	2	8	4893271	4893278	0 %	25 %	75 %	0 %	171061042
129032	NC_010524	CGA	2	6	4893280	4893285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061042
129033	NC_010524	TGC	2	6	4893306	4893311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061042
129034	NC_010524	CG	3	6	4893324	4893329	0 %	0 %	50 %	50 %	171061042
129035	NC_010524	GCC	2	6	4893371	4893376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061042
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129037	NC_010524	GC	3	6	4893463	4893468	0 %	0 %	50 %	50 %	171061042
129038	NC_010524	CGA	2	6	4893605	4893610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061043
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129040	NC_010524	CGC	2	6	4893722	4893727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061043
129041	NC_010524	CGA	2	6	4893740	4893745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061043
129042	NC_010524	TGG	2	6	4893768	4893773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061043
129043	NC_010524	GGC	2	6	4893774	4893779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061043
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129045	NC_010524	ATC	2	6	4893831	4893836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061043
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129047	NC_010524	CGC	3	9	4893853	4893861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061043
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129050	NC_010524	CGA	3	9	4893929	4893937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061043
129051	NC_010524	GCC	2	6	4894014	4894019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061043
129052	NC_010524	GGCT	2	8	4894023	4894030	0 %	25 %	50 %	25 %	171061043
129053	NC_010524	AGC	2	6	4894074	4894079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061043
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129055	NC_010524	TGC	2	6	4894126	4894131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061043
129056	NC_010524	GC	4	8	4894159	4894166	0 %	0 %	50 %	50 %	171061043
129057	NC_010524	TGC	3	9	4894168	4894176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061043
129058	NC_010524	ACC	2	6	4894182	4894187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061043
129059	NC_010524	GCA	2	6	4894232	4894237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061043
129060	NC_010524	CTG	2	6	4894320	4894325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061043
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129064	NC_010524	GC	3	6	4894448	4894453	0 %	0 %	50 %	50 %	171061043
129065	NC_010524	TGC	2	6	4894468	4894473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061043
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129098	NC_010524	GGC	2	6	4895537	4895542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061043
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129109	NC_010524	CAG	2	6	4895840	4895845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061044
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129114	NC_010524	GCC	2	6	4896023	4896028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061044
129115	NC_010524	TGACCG	2	12	4896031	4896042	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171061044
129116	NC_010524	GCA	2	6	4896148	4896153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061044
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129120	NC_010524	CGG	2	6	4896389	4896394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061045
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129127	NC_010524	CG	3	6	4896607	4896612	0 %	0 %	50 %	50 %	171061045
129128	NC_010524	GCG	2	6	4896644	4896649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061045
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.