MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010524	CCT	2	6	16672	16677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056708
502	NC_010524	GGCC	2	8	16714	16721	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
503	NC_010524	TCG	2	6	16726	16731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
504	NC_010524	CTT	2	6	16772	16777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056708
505	NC_010524	CCG	2	6	16816	16821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
506	NC_010524	CG	3	6	16827	16832	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
507	NC_010524	GCA	2	6	16835	16840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
508	NC_010524	GGCC	2	8	16841	16848	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
509	NC_010524	GCGG	2	8	16871	16878	0 %	0 %	75 %	25 %	171056708
510	NC_010524	GCT	2	6	16919	16924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
511	NC_010524	TGG	2	6	16951	16956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056708
512	NC_010524	GC	3	6	16995	17000	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
513	NC_010524	CGA	2	6	17018	17023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
514	NC_010524	GCT	2	6	17033	17038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
515	NC_010524	AGC	2	6	17062	17067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
516	NC_010524	GCT	2	6	17078	17083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
517	NC_010524	GC	3	6	17121	17126	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
518	NC_010524	GCT	2	6	17133	17138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
519	NC_010524	CGC	2	6	17144	17149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
520	NC_010524	GTC	2	6	17169	17174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
521	NC_010524	GCTCGG	2	12	17192	17203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056708
522	NC_010524	TGC	2	6	17215	17220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
523	NC_010524	TGC	2	6	17236	17241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
524	NC_010524	ACG	2	6	17242	17247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
525	NC_010524	GC	3	6	17258	17263	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
526	NC_010524	CCA	2	6	17288	17293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056708
527	NC_010524	GCA	2	6	17333	17338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
528	NC_010524	CGCC	2	8	17423	17430	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
529	NC_010524	GGC	2	6	17438	17443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
530	NC_010524	GC	3	6	17453	17458	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
531	NC_010524	GTC	2	6	17478	17483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
532	NC_010524	CCCG	2	8	17545	17552	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
533	NC_010524	GCCGCT	2	12	17558	17569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056708
534	NC_010524	CAG	2	6	17589	17594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
535	NC_010524	CCGC	2	8	17645	17652	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
536	NC_010524	CGC	2	6	17654	17659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
537	NC_010524	C	7	7	17659	17665	0 %	0 %	0 %	100 %	171056708
538	NC_010524	GC	3	6	17668	17673	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
539	NC_010524	GCT	2	6	17678	17683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
540	NC_010524	GGC	2	6	17739	17744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
541	NC_010524	GC	3	6	17769	17774	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
542	NC_010524	CGA	2	6	17789	17794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
543	NC_010524	CGATC	2	10	17810	17819	20 %	20 %	20 %	40 %	171056708
544	NC_010524	GCC	2	6	17846	17851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
545	NC_010524	GCC	3	9	17884	17892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
546	NC_010524	TGC	2	6	17893	17898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
547	NC_010524	CGACGG	2	12	17909	17920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056708
548	NC_010524	TGC	3	9	17968	17976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
549	NC_010524	CGC	2	6	18037	18042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
550	NC_010524	GCA	2	6	18056	18061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
551	NC_010524	CG	3	6	18083	18088	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
552	NC_010524	GCC	4	12	18159	18170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
553	NC_010524	GAC	2	6	18174	18179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
554	NC_010524	GAG	2	6	18255	18260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056708
555	NC_010524	GCCG	2	8	18269	18276	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
556	NC_010524	AAG	2	6	18279	18284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056708
557	NC_010524	GGC	2	6	18335	18340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
558	NC_010524	GC	3	6	18347	18352	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
559	NC_010524	CGG	2	6	18371	18376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
560	NC_010524	CCG	2	6	18423	18428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
561	NC_010524	GC	3	6	18442	18447	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
562	NC_010524	AGAACG	2	12	18472	18483	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	171056708
563	NC_010524	ACCA	2	8	18489	18496	50 %	0 %	0 %	50 %	171056708
564	NC_010524	CGC	2	6	18505	18510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
565	NC_010524	CTCG	2	8	18617	18624	0 %	25 %	25 %	50 %	171056708
566	NC_010524	GCGCG	2	10	18755	18764	0 %	0 %	60 %	40 %	171056708
567	NC_010524	GC	3	6	18782	18787	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
568	NC_010524	GCC	2	6	18909	18914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
569	NC_010524	GC	3	6	18952	18957	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
570	NC_010524	CGG	2	6	19004	19009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
571	NC_010524	CGCCTG	2	12	19017	19028	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056708
572	NC_010524	CGC	2	6	19082	19087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
573	NC_010524	CCG	2	6	19111	19116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
574	NC_010524	CGA	2	6	19162	19167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
575	NC_010524	CAT	2	6	19206	19211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056709
576	NC_010524	CGG	2	6	19218	19223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
577	NC_010524	GGC	2	6	19236	19241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
578	NC_010524	TGG	2	6	19244	19249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056709
579	NC_010524	GCTGGT	2	12	19251	19262	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171056709
580	NC_010524	GCT	2	6	19263	19268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
581	NC_010524	CG	3	6	19274	19279	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
582	NC_010524	CG	3	6	19290	19295	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
583	NC_010524	CTG	2	6	19348	19353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
584	NC_010524	CTG	3	9	19384	19392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
585	NC_010524	GC	3	6	19425	19430	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
586	NC_010524	GCT	2	6	19449	19454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
587	NC_010524	CCGGC	2	10	19471	19480	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
588	NC_010524	GCGCC	2	10	19482	19491	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
589	NC_010524	GCGCCA	2	12	19512	19523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056709
590	NC_010524	GGC	2	6	19527	19532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
591	NC_010524	GC	3	6	19547	19552	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
592	NC_010524	CGA	2	6	19569	19574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
593	NC_010524	AGC	2	6	19622	19627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
594	NC_010524	CGCC	2	8	19638	19645	0 %	0 %	25 %	75 %	171056709
595	NC_010524	GC	3	6	19675	19680	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
596	NC_010524	CGG	2	6	19695	19700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
597	NC_010524	CGA	2	6	19821	19826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
598	NC_010524	GGC	2	6	19845	19850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
599	NC_010524	GC	3	6	19900	19905	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
600	NC_010524	ACG	2	6	19910	19915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
601	NC_010524	CGA	2	6	19929	19934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
602	NC_010524	GCT	2	6	19938	19943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
603	NC_010524	GGC	2	6	19968	19973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
604	NC_010524	CCGG	2	8	19977	19984	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
605	NC_010524	CGG	2	6	19989	19994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
606	NC_010524	CG	3	6	20001	20006	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
607	NC_010524	GC	3	6	20069	20074	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
608	NC_010524	TGC	2	6	20075	20080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
609	NC_010524	CGC	2	6	20091	20096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056709
610	NC_010524	GCCG	2	8	20100	20107	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
611	NC_010524	GCC	2	6	20110	20115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056709
612	NC_010524	CGC	2	6	20121	20126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056709
613	NC_010524	CGA	2	6	20148	20153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
614	NC_010524	ACCT	2	8	20158	20165	25 %	25 %	0 %	50 %	171056709
615	NC_010524	GC	4	8	20221	20228	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
616	NC_010524	GCC	2	6	20297	20302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056709
617	NC_010524	GCTG	2	8	20327	20334	0 %	25 %	50 %	25 %	171056709
618	NC_010524	TGC	2	6	20384	20389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
619	NC_010524	CCACG	2	10	20412	20421	20 %	0 %	20 %	60 %	171056709
620	NC_010524	GCA	2	6	20436	20441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
621	NC_010524	CGCC	2	8	20445	20452	0 %	0 %	25 %	75 %	171056709
622	NC_010524	AGC	2	6	20501	20506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
623	NC_010524	GCT	2	6	20532	20537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
624	NC_010524	GCC	2	6	20551	20556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056709
625	NC_010524	TGG	2	6	20645	20650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056709
626	NC_010524	TGCGC	2	10	20676	20685	0 %	20 %	40 %	40 %	171056709
627	NC_010524	CGC	2	6	20741	20746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056709
628	NC_010524	GAC	3	9	20767	20775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
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631	NC_010524	CGA	2	6	20862	20867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
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756	NC_010524	GC	3	6	24328	24333	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
757	NC_010524	ACG	2	6	24353	24358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056711
758	NC_010524	GAT	2	6	24369	24374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056711
759	NC_010524	GTGCT	2	10	24379	24388	0 %	40 %	40 %	20 %	171056711
760	NC_010524	TCG	2	6	24397	24402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
761	NC_010524	GCG	2	6	24403	24408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056711
762	NC_010524	GGC	2	6	24426	24431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056711
763	NC_010524	GAG	2	6	24472	24477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056711
764	NC_010524	CGGC	2	8	24480	24487	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
765	NC_010524	CAGC	2	8	24519	24526	25 %	0 %	25 %	50 %	171056711
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767	NC_010524	CGA	2	6	24543	24548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056711
768	NC_010524	GAG	2	6	24562	24567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056711
769	NC_010524	GCGCC	2	10	24585	24594	0 %	0 %	40 %	60 %	171056711
770	NC_010524	CG	3	6	24595	24600	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
771	NC_010524	CGA	2	6	24624	24629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056711
772	NC_010524	GGCC	2	8	24630	24637	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
773	NC_010524	GCT	2	6	24645	24650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
774	NC_010524	GCG	3	9	24673	24681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056711
775	NC_010524	TGG	2	6	24713	24718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056711
776	NC_010524	CGC	2	6	24741	24746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056711
777	NC_010524	GGCC	2	8	24756	24763	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
778	NC_010524	CGG	2	6	24792	24797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056711
779	NC_010524	GCT	2	6	24825	24830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
780	NC_010524	CGA	2	6	24837	24842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056711
781	NC_010524	GAC	2	6	24846	24851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056711
782	NC_010524	TCGGC	2	10	24868	24877	0 %	20 %	40 %	40 %	171056712
783	NC_010524	CGGCG	2	10	24893	24902	0 %	0 %	60 %	40 %	171056712
784	NC_010524	CTA	2	6	24938	24943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056712
785	NC_010524	CGT	2	6	24965	24970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056712
786	NC_010524	TGC	3	9	24985	24993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056712
787	NC_010524	CTG	3	9	24999	25007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056712
788	NC_010524	CG	3	6	25027	25032	0 %	0 %	50 %	50 %	171056712
789	NC_010524	TGC	3	9	25039	25047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056712
790	NC_010524	CTT	2	6	25064	25069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056712
791	NC_010524	TTC	2	6	25077	25082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056712
792	NC_010524	CTG	2	6	25086	25091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056712
793	NC_010524	GCTG	2	8	25120	25127	0 %	25 %	50 %	25 %	171056712
794	NC_010524	GC	4	8	25188	25195	0 %	0 %	50 %	50 %	171056712
795	NC_010524	GCG	2	6	25202	25207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056712
796	NC_010524	CG	3	6	25244	25249	0 %	0 %	50 %	50 %	171056712
797	NC_010524	GGT	2	6	25307	25312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056712
798	NC_010524	CTG	2	6	25320	25325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056712
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823	NC_010524	GC	4	8	26236	26243	0 %	0 %	50 %	50 %	171056713
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871	NC_010524	CTGG	2	8	27724	27731	0 %	25 %	50 %	25 %	171056714
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874	NC_010524	GTG	2	6	27854	27859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056714
875	NC_010524	GC	3	6	27942	27947	0 %	0 %	50 %	50 %	171056714
876	NC_010524	TGG	2	6	27948	27953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056714
877	NC_010524	CGA	2	6	27975	27980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056714
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879	NC_010524	GGT	2	6	28048	28053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056714
880	NC_010524	GGC	2	6	28054	28059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056714
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882	NC_010524	GTGC	2	8	28117	28124	0 %	25 %	50 %	25 %	171056714
883	NC_010524	GGC	2	6	28130	28135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056714
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1000	NC_010524	GCG	2	6	31554	31559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056717

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