MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010524	GTC	2	6	224614	224619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056904
6002	NC_010524	GCG	2	6	224623	224628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056904
6003	NC_010524	CGGC	2	8	224631	224638	0 %	0 %	50 %	50 %	171056904
6004	NC_010524	GCA	2	6	224679	224684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056904
6005	NC_010524	CAG	2	6	224702	224707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056904
6006	NC_010524	GCG	2	6	224736	224741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056904
6007	NC_010524	GGGTGC	2	12	224802	224813	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171056904
6008	NC_010524	ATC	2	6	224828	224833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056904
6009	NC_010524	GCC	2	6	224839	224844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056904
6010	NC_010524	ACC	2	6	224870	224875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056904
6011	NC_010524	GAA	2	6	224944	224949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056904
6012	NC_010524	AGC	2	6	224960	224965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056904
6013	NC_010524	ATG	2	6	224999	225004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056904
6014	NC_010524	CGG	2	6	225057	225062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056904
6015	NC_010524	CGC	2	6	225117	225122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056904
6016	NC_010524	GC	3	6	225130	225135	0 %	0 %	50 %	50 %	171056904
6017	NC_010524	CAGC	2	8	225154	225161	25 %	0 %	25 %	50 %	171056904
6018	NC_010524	GCG	2	6	225180	225185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056904
6019	NC_010524	CCA	2	6	225207	225212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056904
6020	NC_010524	CGA	2	6	225216	225221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056904
6021	NC_010524	CAG	2	6	225253	225258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056904
6022	NC_010524	AGGA	2	8	225263	225270	50 %	0 %	50 %	0 %	171056904
6023	NC_010524	ATC	2	6	225281	225286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056904
6024	NC_010524	GCG	2	6	225288	225293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056905
6025	NC_010524	GCG	2	6	225309	225314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056905
6026	NC_010524	CGG	2	6	225317	225322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056905
6027	NC_010524	GGC	2	6	225342	225347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056905
6028	NC_010524	CGA	2	6	225374	225379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056905
6029	NC_010524	GC	3	6	225390	225395	0 %	0 %	50 %	50 %	171056905
6030	NC_010524	GGCC	2	8	225398	225405	0 %	0 %	50 %	50 %	171056905
6031	NC_010524	TCG	2	6	225406	225411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056905
6032	NC_010524	GCGG	2	8	225462	225469	0 %	0 %	75 %	25 %	171056905
6033	NC_010524	AGA	2	6	225602	225607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056905
6034	NC_010524	GCCC	2	8	225623	225630	0 %	0 %	25 %	75 %	171056905
6035	NC_010524	GC	3	6	225633	225638	0 %	0 %	50 %	50 %	171056905
6036	NC_010524	CTC	2	6	225642	225647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056905
6037	NC_010524	TCT	2	6	225653	225658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056905
6038	NC_010524	TGGT	2	8	225712	225719	0 %	50 %	50 %	0 %	171056905
6039	NC_010524	ACC	2	6	225724	225729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056905
6040	NC_010524	CG	3	6	225754	225759	0 %	0 %	50 %	50 %	171056905
6041	NC_010524	GC	3	6	225770	225775	0 %	0 %	50 %	50 %	171056905
6042	NC_010524	GTC	2	6	225813	225818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056905
6043	NC_010524	CGA	2	6	225848	225853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056905
6044	NC_010524	GGC	2	6	225898	225903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056906
6045	NC_010524	CAG	2	6	225952	225957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6046	NC_010524	GC	3	6	225971	225976	0 %	0 %	50 %	50 %	171056906
6047	NC_010524	CGT	2	6	226005	226010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6048	NC_010524	GAA	2	6	226012	226017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056906
6049	NC_010524	GGC	2	6	226060	226065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056906
6050	NC_010524	GCG	3	9	226118	226126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056906
6051	NC_010524	GCT	3	9	226128	226136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6052	NC_010524	CGGC	2	8	226137	226144	0 %	0 %	50 %	50 %	171056906
6053	NC_010524	CAG	2	6	226150	226155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6054	NC_010524	CTT	2	6	226192	226197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056906
6055	NC_010524	TTG	2	6	226217	226222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056906
6056	NC_010524	GCG	2	6	226223	226228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056906
6057	NC_010524	GCC	2	6	226238	226243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056906
6058	NC_010524	GGC	2	6	226252	226257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056906
6059	NC_010524	GC	3	6	226262	226267	0 %	0 %	50 %	50 %	171056906
6060	NC_010524	GCC	2	6	226271	226276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056906
6061	NC_010524	GC	3	6	226300	226305	0 %	0 %	50 %	50 %	171056906
6062	NC_010524	CAG	2	6	226450	226455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6063	NC_010524	TTC	2	6	226478	226483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056906
6064	NC_010524	GGC	2	6	226515	226520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056906
6065	NC_010524	GCCAGC	2	12	226598	226609	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056906
6066	NC_010524	CGATCG	2	12	226671	226682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6067	NC_010524	GC	3	6	226708	226713	0 %	0 %	50 %	50 %	171056906
6068	NC_010524	GTA	2	6	226714	226719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056906
6069	NC_010524	GCC	2	6	226720	226725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056906
6070	NC_010524	CAG	2	6	226768	226773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6071	NC_010524	CTG	2	6	226798	226803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6072	NC_010524	TCG	2	6	226857	226862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6073	NC_010524	CG	3	6	226897	226902	0 %	0 %	50 %	50 %	171056906
6074	NC_010524	TCT	2	6	226986	226991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056906
6075	NC_010524	GAA	3	9	227005	227013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056906
6076	NC_010524	CAC	2	6	227038	227043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056906
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6078	NC_010524	CGT	2	6	227073	227078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6079	NC_010524	CGC	2	6	227125	227130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056906
6080	NC_010524	CAG	2	6	227134	227139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6081	NC_010524	AGC	2	6	227264	227269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6082	NC_010524	TCG	3	9	227273	227281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
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6084	NC_010524	CGGCG	2	10	227334	227343	0 %	0 %	60 %	40 %	171056906
6085	NC_010524	CGG	2	6	227427	227432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056906
6086	NC_010524	TGC	2	6	227454	227459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6087	NC_010524	CGA	2	6	227466	227471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6088	NC_010524	ACG	2	6	227492	227497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6089	NC_010524	TCG	2	6	227498	227503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
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6091	NC_010524	CGT	2	6	227610	227615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6092	NC_010524	CGAC	2	8	227718	227725	25 %	0 %	25 %	50 %	171056906
6093	NC_010524	CTT	2	6	227749	227754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056906
6094	NC_010524	AGC	2	6	227756	227761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
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6099	NC_010524	GCC	2	6	227843	227848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056906
6100	NC_010524	CGGCG	2	10	227873	227882	0 %	0 %	60 %	40 %	171056906
6101	NC_010524	GCC	2	6	227920	227925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056906
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6103	NC_010524	CAG	2	6	228016	228021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6104	NC_010524	CTTCG	2	10	228054	228063	0 %	40 %	20 %	40 %	171056907
6105	NC_010524	GCT	2	6	228073	228078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6106	NC_010524	CGG	2	6	228089	228094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056907
6107	NC_010524	TCG	2	6	228112	228117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6108	NC_010524	GGC	3	9	228171	228179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056907
6109	NC_010524	GC	4	8	228184	228191	0 %	0 %	50 %	50 %	171056907
6110	NC_010524	GGC	2	6	228216	228221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056907
6111	NC_010524	CGC	2	6	228242	228247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056907
6112	NC_010524	GCT	2	6	228311	228316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6113	NC_010524	CAG	2	6	228363	228368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6114	NC_010524	TGG	2	6	228421	228426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056907
6115	NC_010524	GCC	2	6	228552	228557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056907
6116	NC_010524	CTG	2	6	228561	228566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6117	NC_010524	GTC	2	6	228651	228656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6118	NC_010524	CGA	2	6	228659	228664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056907
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6120	NC_010524	CGAG	2	8	228704	228711	25 %	0 %	50 %	25 %	171056907
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6241	NC_010524	TGG	2	6	233357	233362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056911
6242	NC_010524	CGGCGC	2	12	233409	233420	0 %	0 %	50 %	50 %	171056911
6243	NC_010524	TTG	2	6	233460	233465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056911
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6246	NC_010524	GGT	2	6	233917	233922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056912
6247	NC_010524	GAC	2	6	233942	233947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056912
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6273	NC_010524	CTGG	2	8	235063	235070	0 %	25 %	50 %	25 %	171056913
6274	NC_010524	GAGC	2	8	235078	235085	25 %	0 %	50 %	25 %	171056913
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6341	NC_010524	AAGGC	2	10	236804	236813	40 %	0 %	40 %	20 %	171056914
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6349	NC_010524	GC	3	6	237080	237085	0 %	0 %	50 %	50 %	171056915
6350	NC_010524	ACGC	2	8	237088	237095	25 %	0 %	25 %	50 %	171056915
6351	NC_010524	CG	3	6	237127	237132	0 %	0 %	50 %	50 %	171056915
6352	NC_010524	CGG	2	6	237142	237147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056915
6353	NC_010524	GCCG	2	8	237153	237160	0 %	0 %	50 %	50 %	171056915
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6359	NC_010524	GC	3	6	237417	237422	0 %	0 %	50 %	50 %	171056915
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6474	NC_010524	GC	4	8	241192	241199	0 %	0 %	50 %	50 %	171056916
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6482	NC_010524	CAC	2	6	241564	241569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056917
6483	NC_010524	GGC	2	6	241599	241604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056917
6484	NC_010524	TTC	2	6	241714	241719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056917
6485	NC_010524	CG	3	6	241788	241793	0 %	0 %	50 %	50 %	171056917
6486	NC_010524	CAG	2	6	241795	241800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056917
6487	NC_010524	GCC	2	6	241807	241812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056917
6488	NC_010524	GCG	2	6	241825	241830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056917
6489	NC_010524	CGGC	2	8	241857	241864	0 %	0 %	50 %	50 %	171056917
6490	NC_010524	GGCC	2	8	241872	241879	0 %	0 %	50 %	50 %	171056917
6491	NC_010524	CGG	3	9	241891	241899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056917
6492	NC_010524	CG	3	6	241900	241905	0 %	0 %	50 %	50 %	171056917
6493	NC_010524	GGCG	2	8	241918	241925	0 %	0 %	75 %	25 %	171056917
6494	NC_010524	GCG	2	6	241989	241994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056917
6495	NC_010524	CGT	2	6	242007	242012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056917
6496	NC_010524	AGCC	2	8	242015	242022	25 %	0 %	25 %	50 %	171056917
6497	NC_010524	GAA	2	6	242035	242040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056917
6498	NC_010524	AGC	2	6	242057	242062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056917
6499	NC_010524	GCC	2	6	242063	242068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056917
6500	NC_010524	GC	4	8	242088	242095	0 %	0 %	50 %	50 %	171056918

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