MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_010524	CTT	2	6	183380	183385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056867
5003	NC_010524	AGG	2	6	183421	183426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056867
5004	NC_010524	GCT	2	6	183428	183433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5005	NC_010524	GCT	2	6	183452	183457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5006	NC_010524	GC	3	6	183644	183649	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5007	NC_010524	CGCCAG	2	12	183651	183662	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056867
5008	NC_010524	TGC	2	6	183670	183675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5009	NC_010524	TGG	2	6	183682	183687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056867
5010	NC_010524	CGAGGC	2	12	183704	183715	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056867
5011	NC_010524	CGC	2	6	183751	183756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056867
5012	NC_010524	GC	3	6	183795	183800	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5013	NC_010524	TCG	3	9	183805	183813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5014	NC_010524	CCT	2	6	183859	183864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056867
5015	NC_010524	GC	3	6	183866	183871	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5016	NC_010524	AGC	2	6	183877	183882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5017	NC_010524	GGC	2	6	183884	183889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5018	NC_010524	CGC	2	6	183927	183932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056867
5019	NC_010524	CGA	2	6	183971	183976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5020	NC_010524	GCC	2	6	183978	183983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056867
5021	NC_010524	GAGGCC	2	12	183984	183995	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056867
5022	NC_010524	AGG	2	6	184072	184077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056867
5023	NC_010524	GCG	2	6	184096	184101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5024	NC_010524	CTGG	2	8	184113	184120	0 %	25 %	50 %	25 %	171056867
5025	NC_010524	GGC	2	6	184142	184147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5026	NC_010524	CCG	2	6	184181	184186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056867
5027	NC_010524	GC	3	6	184228	184233	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5028	NC_010524	CGAGGC	2	12	184259	184270	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056867
5029	NC_010524	TCG	2	6	184276	184281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5030	NC_010524	CCGG	2	8	184297	184304	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5031	NC_010524	GTGC	2	8	184305	184312	0 %	25 %	50 %	25 %	171056867
5032	NC_010524	CGG	2	6	184319	184324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5033	NC_010524	ACG	2	6	184519	184524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5034	NC_010524	GAA	2	6	184559	184564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056867
5035	NC_010524	TGC	2	6	184582	184587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5036	NC_010524	CGTCGG	2	12	184592	184603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056867
5037	NC_010524	GC	3	6	184608	184613	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5038	NC_010524	CG	3	6	184622	184627	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5039	NC_010524	GCA	2	6	184684	184689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5040	NC_010524	CGG	2	6	184733	184738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5041	NC_010524	CGG	2	6	184813	184818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5042	NC_010524	ACG	2	6	184832	184837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5043	NC_010524	GC	3	6	184848	184853	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5044	NC_010524	CAG	2	6	184868	184873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5045	NC_010524	CTG	2	6	184875	184880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056867
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5047	NC_010524	CAG	3	9	184917	184925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
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5050	NC_010524	CGC	2	6	185038	185043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056867
5051	NC_010524	CGG	3	9	185066	185074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5052	NC_010524	GC	3	6	185143	185148	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5053	NC_010524	CGA	2	6	185171	185176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
5054	NC_010524	CGG	2	6	185201	185206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5055	NC_010524	CG	3	6	185288	185293	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
5056	NC_010524	CGC	2	6	185423	185428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056868
5057	NC_010524	GTG	2	6	185442	185447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056868
5058	NC_010524	GGCGA	2	10	185458	185467	20 %	0 %	60 %	20 %	171056868
5059	NC_010524	CGA	3	9	185465	185473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056868
5060	NC_010524	GCCC	2	8	185477	185484	0 %	0 %	25 %	75 %	171056868
5061	NC_010524	CCA	2	6	185492	185497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056868
5062	NC_010524	TCG	3	9	185560	185568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056868
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5074	NC_010524	CAG	2	6	186110	186115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056869
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5089	NC_010524	TCG	2	6	186741	186746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056869
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5102	NC_010524	ACC	2	6	187188	187193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056869
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5104	NC_010524	TCG	2	6	187218	187223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056869
5105	NC_010524	AGCTTG	2	12	187296	187307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171056869
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5113	NC_010524	CGGA	2	8	187538	187545	25 %	0 %	50 %	25 %	171056869
5114	NC_010524	GCCG	2	8	187547	187554	0 %	0 %	50 %	50 %	171056869
5115	NC_010524	GCTG	2	8	187579	187586	0 %	25 %	50 %	25 %	171056869
5116	NC_010524	GGCG	2	8	187609	187616	0 %	0 %	75 %	25 %	171056869
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5121	NC_010524	TCG	2	6	187710	187715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056869
5122	NC_010524	GCG	2	6	187735	187740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056869
5123	NC_010524	CAG	2	6	187802	187807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056869
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5125	NC_010524	GAC	2	6	187820	187825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056869
5126	NC_010524	GCG	2	6	187918	187923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056869
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5135	NC_010524	CGA	2	6	188947	188952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056870
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5145	NC_010524	GCC	2	6	189323	189328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056870
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5147	NC_010524	ACC	2	6	189348	189353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056870
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5152	NC_010524	CCG	2	6	189625	189630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056871
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5190	NC_010524	CAG	2	6	190976	190981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
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5202	NC_010524	GTC	2	6	191390	191395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056872
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5221	NC_010524	CG	3	6	192281	192286	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5222	NC_010524	CGA	2	6	192324	192329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056873
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5226	NC_010524	AGG	2	6	192449	192454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056873
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5230	NC_010524	GGC	2	6	192580	192585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056873
5231	NC_010524	GCT	2	6	192600	192605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5232	NC_010524	CAT	2	6	192621	192626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056873
5233	NC_010524	GCG	2	6	192632	192637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056873
5234	NC_010524	ACG	2	6	192712	192717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5235	NC_010524	CGA	2	6	192726	192731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056873
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5237	NC_010524	GCGCC	2	10	192771	192780	0 %	0 %	40 %	60 %	171056873
5238	NC_010524	GCGCGA	2	12	192801	192812	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056873
5239	NC_010524	ATGC	2	8	192826	192833	25 %	25 %	25 %	25 %	171056873
5240	NC_010524	GC	4	8	192836	192843	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5241	NC_010524	GGC	2	6	192873	192878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056873
5242	NC_010524	CTG	2	6	192934	192939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5243	NC_010524	GC	3	6	192969	192974	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5244	NC_010524	ACCGA	2	10	192993	193002	40 %	0 %	20 %	40 %	171056874
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5246	NC_010524	CTG	3	9	193065	193073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056874
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5260	NC_010524	CTG	3	9	193524	193532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056874
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5362	NC_010524	GCC	2	6	197440	197445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056879
5363	NC_010524	TGC	2	6	197446	197451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056879
5364	NC_010524	GTC	2	6	197470	197475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056879
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5366	NC_010524	TGC	2	6	197542	197547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056879
5367	NC_010524	GCA	2	6	197557	197562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056879
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5479	NC_010524	ATC	2	6	202757	202762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056884
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5481	NC_010524	CCA	2	6	202845	202850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056884
5482	NC_010524	GCCG	2	8	202986	202993	0 %	0 %	50 %	50 %	171056884
5483	NC_010524	GCT	2	6	203303	203308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056885
5484	NC_010524	CGCT	2	8	203317	203324	0 %	25 %	25 %	50 %	171056885
5485	NC_010524	GCCA	2	8	203334	203341	25 %	0 %	25 %	50 %	171056885
5486	NC_010524	GAG	2	6	203360	203365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056885
5487	NC_010524	CTG	2	6	203419	203424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056885
5488	NC_010524	CCAGC	2	10	203495	203504	20 %	0 %	20 %	60 %	171056885
5489	NC_010524	GCC	2	6	203510	203515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056885
5490	NC_010524	TGA	2	6	203521	203526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056885
5491	NC_010524	GAT	2	6	203576	203581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056885
5492	NC_010524	CAG	2	6	203594	203599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056885
5493	NC_010524	GGCGAT	2	12	203654	203665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056885
5494	NC_010524	TCA	2	6	203680	203685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056885
5495	NC_010524	CCG	2	6	203713	203718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056885
5496	NC_010524	TCG	2	6	203757	203762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056885
5497	NC_010524	CAG	2	6	203774	203779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056885
5498	NC_010524	CAG	2	6	203795	203800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056885
5499	NC_010524	CGA	2	6	203812	203817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056885
5500	NC_010524	GAA	2	6	203852	203857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056885

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