MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010524	GC	3	6	162051	162056	0 %	0 %	50 %	50 %	171056846
4502	NC_010524	GGC	2	6	162083	162088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056846
4503	NC_010524	CAC	2	6	162102	162107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056846
4504	NC_010524	GAA	2	6	162135	162140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056846
4505	NC_010524	GGTCG	2	10	162195	162204	0 %	20 %	60 %	20 %	171056846
4506	NC_010524	CGG	2	6	162235	162240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056846
4507	NC_010524	CGA	2	6	162248	162253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056846
4508	NC_010524	GCC	2	6	162266	162271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056846
4509	NC_010524	GC	3	6	162321	162326	0 %	0 %	50 %	50 %	171056846
4510	NC_010524	TCG	2	6	162349	162354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056846
4511	NC_010524	ACC	2	6	162355	162360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056846
4512	NC_010524	GTGGC	2	10	162403	162412	0 %	20 %	60 %	20 %	171056846
4513	NC_010524	ACC	3	9	162484	162492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056846
4514	NC_010524	CGT	2	6	162497	162502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056846
4515	NC_010524	GGCC	2	8	162527	162534	0 %	0 %	50 %	50 %	171056846
4516	NC_010524	CGGC	2	8	162542	162549	0 %	0 %	50 %	50 %	171056846
4517	NC_010524	GCA	2	6	162641	162646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056846
4518	NC_010524	GATC	2	8	162755	162762	25 %	25 %	25 %	25 %	171056846
4519	NC_010524	GCC	3	9	162804	162812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056846
4520	NC_010524	GCGT	2	8	162839	162846	0 %	25 %	50 %	25 %	171056846
4521	NC_010524	CACGCG	2	12	162863	162874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056846
4522	NC_010524	TGCGGA	2	12	162952	162963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056847
4523	NC_010524	CTT	2	6	162967	162972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056847
4524	NC_010524	GC	3	6	163016	163021	0 %	0 %	50 %	50 %	171056847
4525	NC_010524	GGC	2	6	163147	163152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056847
4526	NC_010524	CGGTGA	2	12	163168	163179	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056847
4527	NC_010524	TCG	2	6	163218	163223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056847
4528	NC_010524	TGA	2	6	163237	163242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056847
4529	NC_010524	TCT	2	6	163357	163362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056848
4530	NC_010524	GCT	2	6	163422	163427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056848
4531	NC_010524	GAC	2	6	163440	163445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056848
4532	NC_010524	GCC	2	6	163554	163559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4533	NC_010524	GCC	2	6	163566	163571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4534	NC_010524	ATC	2	6	163615	163620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056848
4535	NC_010524	GC	3	6	163679	163684	0 %	0 %	50 %	50 %	171056848
4536	NC_010524	CCA	2	6	163721	163726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056848
4537	NC_010524	GGC	2	6	163766	163771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056848
4538	NC_010524	CCA	2	6	163787	163792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056848
4539	NC_010524	GCG	3	9	163816	163824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056848
4540	NC_010524	ACC	3	9	163837	163845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056848
4541	NC_010524	GCC	2	6	163864	163869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4542	NC_010524	GC	3	6	163871	163876	0 %	0 %	50 %	50 %	171056848
4543	NC_010524	CCG	2	6	163879	163884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4544	NC_010524	GCCA	2	8	163891	163898	25 %	0 %	25 %	50 %	171056848
4545	NC_010524	GCC	2	6	163917	163922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4546	NC_010524	GGTCAT	3	18	163923	163940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171056848
4547	NC_010524	GCG	2	6	163946	163951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056848
4548	NC_010524	GC	4	8	163977	163984	0 %	0 %	50 %	50 %	171056848
4549	NC_010524	CCA	2	6	163985	163990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056848
4550	NC_010524	GCG	2	6	164008	164013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056848
4551	NC_010524	CAC	2	6	164031	164036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056848
4552	NC_010524	GCC	2	6	164040	164045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4553	NC_010524	GCC	2	6	164079	164084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4554	NC_010524	GAT	2	6	164187	164192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056848
4555	NC_010524	CAG	2	6	164214	164219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056848
4556	NC_010524	GAA	3	9	164223	164231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056848
4557	NC_010524	AGC	2	6	164236	164241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056848
4558	NC_010524	CCG	2	6	164302	164307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4559	NC_010524	GCC	2	6	164325	164330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4560	NC_010524	ACA	2	6	164414	164419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056848
4561	NC_010524	GC	3	6	164430	164435	0 %	0 %	50 %	50 %	171056848
4562	NC_010524	GCC	2	6	164439	164444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056848
4563	NC_010524	TCA	2	6	164471	164476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056848
4564	NC_010524	GCA	2	6	164490	164495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056848
4565	NC_010524	CTT	2	6	164573	164578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056848
4566	NC_010524	GGC	2	6	164610	164615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056848
4567	NC_010524	CGC	3	9	164829	164837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056849
4568	NC_010524	GCTC	2	8	164928	164935	0 %	25 %	25 %	50 %	171056849
4569	NC_010524	CGT	2	6	164949	164954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056849
4570	NC_010524	CCGG	2	8	164978	164985	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4571	NC_010524	TGGT	2	8	165083	165090	0 %	50 %	50 %	0 %	171056849
4572	NC_010524	GCT	2	6	165106	165111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056849
4573	NC_010524	CGG	2	6	165157	165162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056849
4574	NC_010524	CGGC	2	8	165171	165178	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4575	NC_010524	CGG	2	6	165220	165225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056849
4576	NC_010524	TCA	2	6	165270	165275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056849
4577	NC_010524	CTT	2	6	165295	165300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056849
4578	NC_010524	CTG	2	6	165325	165330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056849
4579	NC_010524	TTC	2	6	165334	165339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056849
4580	NC_010524	CAGC	2	8	165343	165350	25 %	0 %	25 %	50 %	171056849
4581	NC_010524	GC	3	6	165472	165477	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4582	NC_010524	GC	3	6	165510	165515	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4583	NC_010524	GTT	2	6	165556	165561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056849
4584	NC_010524	CG	3	6	165569	165574	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4585	NC_010524	GCC	2	6	165592	165597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056849
4586	NC_010524	TTG	2	6	165707	165712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056849
4587	NC_010524	GGT	2	6	165720	165725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056849
4588	NC_010524	GCC	3	9	165733	165741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056849
4589	NC_010524	GTC	2	6	165748	165753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056849
4590	NC_010524	CGG	2	6	165768	165773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056849
4591	NC_010524	CAC	2	6	165778	165783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056849
4592	NC_010524	GGGCT	2	10	165790	165799	0 %	20 %	60 %	20 %	171056849
4593	NC_010524	GATC	2	8	165807	165814	25 %	25 %	25 %	25 %	171056849
4594	NC_010524	CGGC	2	8	165857	165864	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4595	NC_010524	GC	3	6	165877	165882	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4596	NC_010524	GCT	2	6	165888	165893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056849
4597	NC_010524	CG	4	8	165906	165913	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4598	NC_010524	GTCG	2	8	165967	165974	0 %	25 %	50 %	25 %	171056849
4599	NC_010524	CGT	3	9	166029	166037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056849
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4601	NC_010524	CAC	2	6	166132	166137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056849
4602	NC_010524	GCG	2	6	166186	166191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056849
4603	NC_010524	CG	3	6	166190	166195	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4604	NC_010524	CAG	2	6	166213	166218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056849
4605	NC_010524	GTC	2	6	166219	166224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056849
4606	NC_010524	CG	3	6	166254	166259	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4607	NC_010524	CACCG	2	10	166303	166312	20 %	0 %	20 %	60 %	171056849
4608	NC_010524	CGG	2	6	166380	166385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056849
4609	NC_010524	GGCC	2	8	166416	166423	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4610	NC_010524	CAC	4	12	166435	166446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056849
4611	NC_010524	CG	3	6	166464	166469	0 %	0 %	50 %	50 %	171056849
4612	NC_010524	GCC	2	6	166569	166574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056850
4613	NC_010524	AGC	2	6	166575	166580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056850
4614	NC_010524	TCT	2	6	166582	166587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056850
4615	NC_010524	GCA	2	6	166588	166593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056850
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4617	NC_010524	AGGT	2	8	166623	166630	25 %	25 %	50 %	0 %	171056850
4618	NC_010524	CGG	2	6	166634	166639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056850
4619	NC_010524	CGT	2	6	166693	166698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056850
4620	NC_010524	GCC	2	6	166727	166732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056850
4621	NC_010524	CGA	2	6	166783	166788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056850
4622	NC_010524	GAT	2	6	166796	166801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056850
4623	NC_010524	GGCG	2	8	166802	166809	0 %	0 %	75 %	25 %	171056850
4624	NC_010524	GCT	2	6	166814	166819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056850
4625	NC_010524	GCA	2	6	166873	166878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056850
4626	NC_010524	CAG	2	6	166904	166909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056850
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4628	NC_010524	CGT	2	6	166957	166962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056850
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4642	NC_010524	CGG	2	6	167379	167384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056851
4643	NC_010524	GGCC	2	8	167469	167476	0 %	0 %	50 %	50 %	171056851
4644	NC_010524	CG	3	6	167487	167492	0 %	0 %	50 %	50 %	171056851
4645	NC_010524	CAG	2	6	167494	167499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056851
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4650	NC_010524	CAG	2	6	167629	167634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056851
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4652	NC_010524	CTG	2	6	167704	167709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056851
4653	NC_010524	GCTG	2	8	167724	167731	0 %	25 %	50 %	25 %	171056851
4654	NC_010524	AGCG	2	8	167786	167793	25 %	0 %	50 %	25 %	171056851
4655	NC_010524	GC	4	8	167802	167809	0 %	0 %	50 %	50 %	171056851
4656	NC_010524	CCAC	2	8	167820	167827	25 %	0 %	0 %	75 %	171056851
4657	NC_010524	CAG	2	6	167839	167844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056851
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4660	NC_010524	CTG	2	6	167959	167964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056851
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4663	NC_010524	GC	3	6	168055	168060	0 %	0 %	50 %	50 %	171056851
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4682	NC_010524	CGA	2	6	168758	168763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056852
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4734	NC_010524	GGC	2	6	170819	170824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056854
4735	NC_010524	CCGA	2	8	170870	170877	25 %	0 %	25 %	50 %	171056854
4736	NC_010524	TCGA	2	8	170907	170914	25 %	25 %	25 %	25 %	171056854
4737	NC_010524	CGC	2	6	171011	171016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056854
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4740	NC_010524	GGC	2	6	171095	171100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056854
4741	NC_010524	GCGTG	2	10	171104	171113	0 %	20 %	60 %	20 %	171056854
4742	NC_010524	GC	3	6	171115	171120	0 %	0 %	50 %	50 %	171056854
4743	NC_010524	AGC	2	6	171142	171147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056854
4744	NC_010524	GCG	2	6	171163	171168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056854
4745	NC_010524	CGGT	2	8	171169	171176	0 %	25 %	50 %	25 %	171056854
4746	NC_010524	CG	4	8	171181	171188	0 %	0 %	50 %	50 %	171056854
4747	NC_010524	CAA	2	6	171335	171340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056854
4748	NC_010524	TCT	2	6	171358	171363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056854
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4753	NC_010524	GCC	2	6	171552	171557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056855
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4755	NC_010524	ATCG	2	8	171635	171642	25 %	25 %	25 %	25 %	171056855
4756	NC_010524	CGC	2	6	171684	171689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056855
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4761	NC_010524	CTG	2	6	172028	172033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056855
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4765	NC_010524	AGGT	2	8	172182	172189	25 %	25 %	50 %	0 %	171056856
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4773	NC_010524	CG	3	6	172473	172478	0 %	0 %	50 %	50 %	171056856
4774	NC_010524	GC	3	6	172481	172486	0 %	0 %	50 %	50 %	171056856
4775	NC_010524	CGG	2	6	172501	172506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056856
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4786	NC_010524	GC	3	6	173159	173164	0 %	0 %	50 %	50 %	171056857
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4851	NC_010524	CGA	2	6	176298	176303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056860
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4864	NC_010524	GCC	2	6	177139	177144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056860
4865	NC_010524	GAG	2	6	177203	177208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056860
4866	NC_010524	GCCG	2	8	177244	177251	0 %	0 %	50 %	50 %	171056861
4867	NC_010524	CTG	2	6	177276	177281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056861
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4869	NC_010524	CTGG	2	8	177293	177300	0 %	25 %	50 %	25 %	171056861
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4874	NC_010524	GCCG	2	8	177455	177462	0 %	0 %	50 %	50 %	171056861
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4881	NC_010524	CTG	2	6	177702	177707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056861
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4984	NC_010524	GCA	2	6	182553	182558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056866
4985	NC_010524	GGC	2	6	182586	182591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056866
4986	NC_010524	GCGCG	2	10	182628	182637	0 %	0 %	60 %	40 %	171056866
4987	NC_010524	CGA	2	6	182667	182672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056866
4988	NC_010524	TCG	2	6	182681	182686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056866
4989	NC_010524	CCT	2	6	182720	182725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056866
4990	NC_010524	CGG	2	6	182742	182747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056866
4991	NC_010524	CGA	2	6	182826	182831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056866
4992	NC_010524	ACCG	2	8	182850	182857	25 %	0 %	25 %	50 %	171056866
4993	NC_010524	ACG	2	6	183157	183162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867
4994	NC_010524	GCG	2	6	183191	183196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
4995	NC_010524	CG	3	6	183224	183229	0 %	0 %	50 %	50 %	171056867
4996	NC_010524	AGG	2	6	183235	183240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056867
4997	NC_010524	CGG	2	6	183278	183283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
4998	NC_010524	GCGG	2	8	183305	183312	0 %	0 %	75 %	25 %	171056867
4999	NC_010524	GCG	2	6	183328	183333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056867
5000	NC_010524	CAG	2	6	183363	183368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056867

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