MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1

Total Repeats: 660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010470	GAT	2	6	29458	29463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
502	NC_010470	A	6	6	29493	29498	100 %	0 %	0 %	0 %	170016345
503	NC_010470	A	6	6	29517	29522	100 %	0 %	0 %	0 %	170016345
504	NC_010470	GTT	2	6	29572	29577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016345
505	NC_010470	GTTT	2	8	29658	29665	0 %	75 %	25 %	0 %	170016345
506	NC_010470	TTGG	2	8	29770	29777	0 %	50 %	50 %	0 %	170016345
507	NC_010470	TCT	2	6	29855	29860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016345
508	NC_010470	GTTA	2	8	29911	29918	25 %	50 %	25 %	0 %	170016345
509	NC_010470	ATCTA	2	10	29958	29967	40 %	40 %	0 %	20 %	170016345
510	NC_010470	A	6	6	30008	30013	100 %	0 %	0 %	0 %	170016345
511	NC_010470	TGA	2	6	30063	30068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
512	NC_010470	AAAC	2	8	30075	30082	75 %	0 %	0 %	25 %	170016345
513	NC_010470	ACA	2	6	30099	30104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016345
514	NC_010470	GTT	2	6	30129	30134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016345
515	NC_010470	TGA	2	6	30195	30200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
516	NC_010470	TGA	2	6	30231	30236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
517	NC_010470	AAAC	2	8	30298	30305	75 %	0 %	0 %	25 %	170016345
518	NC_010470	AAT	2	6	30319	30324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016345
519	NC_010470	TAA	2	6	30438	30443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016345
520	NC_010470	ATA	2	6	30458	30463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016345
521	NC_010470	A	7	7	30514	30520	100 %	0 %	0 %	0 %	170016345
522	NC_010470	ATT	2	6	30549	30554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016345
523	NC_010470	AACAAA	2	12	30578	30589	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	170016345
524	NC_010470	A	6	6	30618	30623	100 %	0 %	0 %	0 %	170016345
525	NC_010470	A	7	7	30648	30654	100 %	0 %	0 %	0 %	170016345
526	NC_010470	TAA	2	6	30661	30666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016346
527	NC_010470	AGT	2	6	30686	30691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016346
528	NC_010470	TAA	3	9	30713	30721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016346
529	NC_010470	TAA	2	6	30845	30850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016346
530	NC_010470	A	6	6	30856	30861	100 %	0 %	0 %	0 %	170016346
531	NC_010470	AAT	2	6	30873	30878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016346
532	NC_010470	TAG	2	6	30964	30969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016346
533	NC_010470	TCA	2	6	30985	30990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016346
534	NC_010470	GA	3	6	31034	31039	50 %	0 %	50 %	0 %	170016346
535	NC_010470	ATTG	2	8	31048	31055	25 %	50 %	25 %	0 %	170016348
536	NC_010470	A	6	6	31069	31074	100 %	0 %	0 %	0 %	170016348
537	NC_010470	ATC	2	6	31123	31128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016348
538	NC_010470	ACA	2	6	31149	31154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016348
539	NC_010470	ATCA	2	8	31195	31202	50 %	25 %	0 %	25 %	170016348
540	NC_010470	TGA	2	6	31211	31216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016348
541	NC_010470	AAT	2	6	31246	31251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016348
542	NC_010470	TTC	2	6	31396	31401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016348
543	NC_010470	TTG	2	6	31457	31462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016348
544	NC_010470	TGT	2	6	31476	31481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016348
545	NC_010470	T	8	8	31634	31641	0 %	100 %	0 %	0 %	170016349
546	NC_010470	CAA	2	6	31718	31723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016349
547	NC_010470	CAA	2	6	31779	31784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016349
548	NC_010470	GAT	2	6	31854	31859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016349
549	NC_010470	AGTT	2	8	31870	31877	25 %	50 %	25 %	0 %	170016349
550	NC_010470	CAA	2	6	31959	31964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016349
551	NC_010470	ATT	2	6	31976	31981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016349
552	NC_010470	T	6	6	31980	31985	0 %	100 %	0 %	0 %	170016349
553	NC_010470	ATT	2	6	32030	32035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016349
554	NC_010470	AAT	2	6	32104	32109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016349
555	NC_010470	CAA	4	12	32192	32203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016350
556	NC_010470	AGCC	2	8	32267	32274	25 %	0 %	25 %	50 %	170016350
557	NC_010470	GGT	2	6	32287	32292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016350
558	NC_010470	TTC	2	6	32336	32341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016350
559	NC_010470	A	6	6	32378	32383	100 %	0 %	0 %	0 %	170016350
560	NC_010470	ATT	2	6	32439	32444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016350
561	NC_010470	TGG	2	6	32458	32463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016350
562	NC_010470	ATA	2	6	32481	32486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016350
563	NC_010470	GTG	2	6	32504	32509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016350
564	NC_010470	ATG	2	6	32538	32543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016350
565	NC_010470	TAC	2	6	32618	32623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016350
566	NC_010470	TGA	2	6	32811	32816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016351
567	NC_010470	ACT	2	6	32839	32844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016351
568	NC_010470	TGTC	2	8	32902	32909	0 %	50 %	25 %	25 %	170016351
569	NC_010470	ACC	2	6	32921	32926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016351
570	NC_010470	ACG	2	6	32927	32932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016351
571	NC_010470	TAT	2	6	33007	33012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016351
572	NC_010470	A	6	6	33023	33028	100 %	0 %	0 %	0 %	170016351
573	NC_010470	TTGG	2	8	33069	33076	0 %	50 %	50 %	0 %	170016351
574	NC_010470	CTG	2	6	33111	33116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016351
575	NC_010470	TGG	2	6	33148	33153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016351
576	NC_010470	A	7	7	33377	33383	100 %	0 %	0 %	0 %	170016351
577	NC_010470	AAT	2	6	33422	33427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016351
578	NC_010470	AAT	2	6	33479	33484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016351
579	NC_010470	TGA	2	6	33505	33510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016351
580	NC_010470	AG	3	6	33544	33549	50 %	0 %	50 %	0 %	170016351
581	NC_010470	ATA	2	6	33606	33611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016351
582	NC_010470	A	7	7	33619	33625	100 %	0 %	0 %	0 %	170016351
583	NC_010470	CAG	2	6	33741	33746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016351
584	NC_010470	TCT	2	6	33809	33814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016351
585	NC_010470	GTG	2	6	33836	33841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016351
586	NC_010470	ATT	2	6	33869	33874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016351
587	NC_010470	AAAG	2	8	34041	34048	75 %	0 %	25 %	0 %	170016351
588	NC_010470	GAAA	2	8	34121	34128	75 %	0 %	25 %	0 %	170016352
589	NC_010470	TA	3	6	34162	34167	50 %	50 %	0 %	0 %	170016352
590	NC_010470	GTA	2	6	34314	34319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016352
591	NC_010470	AAC	2	6	34328	34333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016352
592	NC_010470	ATGAAG	2	12	34390	34401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170016352
593	NC_010470	TCA	2	6	34405	34410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016352
594	NC_010470	T	6	6	34557	34562	0 %	100 %	0 %	0 %	170016352
595	NC_010470	GATT	2	8	34640	34647	25 %	50 %	25 %	0 %	170016352
596	NC_010470	AAG	2	6	35344	35349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016353
597	NC_010470	CGA	3	9	35351	35359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016353
598	NC_010470	AC	3	6	35366	35371	50 %	0 %	0 %	50 %	170016353
599	NC_010470	GAA	2	6	35391	35396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016353
600	NC_010470	GAT	2	6	35401	35406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016353
601	NC_010470	TGA	2	6	35447	35452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016353
602	NC_010470	TGT	2	6	35553	35558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016353
603	NC_010470	GAT	2	6	35592	35597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016353
604	NC_010470	TCA	2	6	35729	35734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016353
605	NC_010470	GAA	2	6	35755	35760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016353
606	NC_010470	TGA	2	6	35772	35777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016353
607	NC_010470	ACA	2	6	35813	35818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016353
608	NC_010470	CCT	2	6	35855	35860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016353
609	NC_010470	ATG	2	6	36274	36279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016354
610	NC_010470	GCT	2	6	36317	36322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016354
611	NC_010470	TGA	2	6	36332	36337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016354
612	NC_010470	ATT	2	6	36399	36404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016354
613	NC_010470	AGT	2	6	36405	36410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016354
614	NC_010470	TGAT	2	8	36496	36503	25 %	50 %	25 %	0 %	170016354
615	NC_010470	T	6	6	36552	36557	0 %	100 %	0 %	0 %	170016354
616	NC_010470	TTG	2	6	36622	36627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016354
617	NC_010470	TGA	2	6	36650	36655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016354
618	NC_010470	ATA	2	6	36685	36690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016354
619	NC_010470	TAA	2	6	36701	36706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016354
620	NC_010470	ATAA	2	8	36712	36719	75 %	25 %	0 %	0 %	170016354
621	NC_010470	ATT	2	6	36783	36788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016355
622	NC_010470	TGA	2	6	36797	36802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016355
623	NC_010470	TTTG	2	8	36857	36864	0 %	75 %	25 %	0 %	170016355
624	NC_010470	AGTG	2	8	36893	36900	25 %	25 %	50 %	0 %	170016355
625	NC_010470	ATCAAA	2	12	37054	37065	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170016355
626	NC_010470	AAAG	2	8	37071	37078	75 %	0 %	25 %	0 %	170016355
627	NC_010470	GAA	2	6	37103	37108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016356
628	NC_010470	TAT	2	6	37145	37150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016356
629	NC_010470	ATG	2	6	37206	37211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016356
630	NC_010470	ATT	2	6	37234	37239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016356
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634	NC_010470	A	6	6	37432	37437	100 %	0 %	0 %	0 %	170016356
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