MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK3

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010467	ATA	2	6	358	363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016274
2	NC_010467	CAA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016274
3	NC_010467	AAG	2	6	535	540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016274
4	NC_010467	TTA	2	6	607	612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016274
5	NC_010467	AAT	2	6	711	716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016274
6	NC_010467	ACA	2	6	722	727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016274
7	NC_010467	TGA	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016274
8	NC_010467	GAT	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016274
9	NC_010467	GAT	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016274
10	NC_010467	AAG	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016274
11	NC_010467	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016274
12	NC_010467	TGA	2	6	1464	1469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016275
13	NC_010467	GAC	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016275
14	NC_010467	CAA	2	6	1762	1767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016275
15	NC_010467	AGA	2	6	1797	1802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016275
16	NC_010467	TAA	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016275
17	NC_010467	AGA	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016275
18	NC_010467	ATC	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016275
19	NC_010467	GTG	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016275
20	NC_010467	TGA	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016276
21	NC_010467	TAT	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
22	NC_010467	AAT	2	6	2258	2263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016276
23	NC_010467	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016276
24	NC_010467	CTG	2	6	2343	2348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016276
25	NC_010467	CTT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016276
26	NC_010467	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
27	NC_010467	TAT	2	6	2520	2525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
28	NC_010467	GAT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016276
29	NC_010467	TTC	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016276
30	NC_010467	ATT	2	6	2728	2733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
31	NC_010467	TTG	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016276
32	NC_010467	AGA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016276
33	NC_010467	TAT	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
34	NC_010467	AAT	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016277
35	NC_010467	GTT	2	6	4147	4152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016277
36	NC_010467	TAA	2	6	4175	4180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016277
37	NC_010467	TGT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016277
38	NC_010467	TGG	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016277
39	NC_010467	TCA	2	6	4368	4373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016277
40	NC_010467	GTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016277
41	NC_010467	CTA	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016278
42	NC_010467	AAC	2	6	5408	5413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016278
43	NC_010467	TAT	2	6	5539	5544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016278
44	NC_010467	ATC	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016278
45	NC_010467	TGA	2	6	5582	5587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016278
46	NC_010467	TAA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016278
47	NC_010467	AGT	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016278
48	NC_010467	GTT	2	6	5800	5805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016278
49	NC_010467	TCC	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016278
50	NC_010467	ACA	2	6	5885	5890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016278
51	NC_010467	ATA	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016278
52	NC_010467	ACT	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016279
53	NC_010467	TCA	2	6	6252	6257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016279
54	NC_010467	ATT	2	6	6260	6265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016279
55	NC_010467	CTC	2	6	6274	6279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016279
56	NC_010467	GTT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016279
57	NC_010467	TCC	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016279
58	NC_010467	TTG	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016279
59	NC_010467	TTA	2	6	7213	7218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016280
60	NC_010467	GTG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016280
61	NC_010467	GTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016280
62	NC_010467	ATA	2	6	7474	7479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
63	NC_010467	AAT	2	6	7505	7510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
64	NC_010467	AAT	3	9	7553	7561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
65	NC_010467	GTC	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016280
66	NC_010467	ATA	2	6	7635	7640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
67	NC_010467	ATG	2	6	7678	7683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016280
68	NC_010467	AAT	2	6	7684	7689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
69	NC_010467	TAT	2	6	8623	8628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016282
70	NC_010467	GAT	2	6	8639	8644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016282
71	NC_010467	AAT	2	6	8687	8692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016282
72	NC_010467	CAA	2	6	8693	8698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016282
73	NC_010467	TAG	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016282
74	NC_010467	TTG	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016282
75	NC_010467	TAT	2	6	8816	8821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016282
76	NC_010467	CTG	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016283
77	NC_010467	TTA	2	6	9006	9011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016283
78	NC_010467	GAT	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016283
79	NC_010467	GTA	2	6	9181	9186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
80	NC_010467	ATG	2	6	9196	9201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
81	NC_010467	TGC	2	6	9248	9253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016284
82	NC_010467	GAT	2	6	9275	9280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
83	NC_010467	GTG	2	6	9286	9291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016284
84	NC_010467	AAT	2	6	9309	9314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016284
85	NC_010467	TGA	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
86	NC_010467	AAG	2	6	9430	9435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016284
87	NC_010467	TGA	2	6	9443	9448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
88	NC_010467	TTA	2	6	9502	9507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016284
89	NC_010467	TAA	2	6	9521	9526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016284
90	NC_010467	TGT	2	6	9626	9631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016284
91	NC_010467	TCA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016284
92	NC_010467	TTC	2	6	9733	9738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016284
93	NC_010467	ATA	2	6	9757	9762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016284
94	NC_010467	GAT	2	6	9807	9812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
95	NC_010467	TAC	2	6	9860	9865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016284
96	NC_010467	TAC	2	6	9872	9877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016284
97	NC_010467	TGA	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
98	NC_010467	TGG	2	6	10058	10063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016284
99	NC_010467	CAA	2	6	10258	10263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016285
100	NC_010467	ACT	2	6	10275	10280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016285
101	NC_010467	TAA	2	6	10310	10315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016285
102	NC_010467	GGA	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016285
103	NC_010467	ACA	2	6	10337	10342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016285
104	NC_010467	ATG	3	9	10369	10377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016285
105	NC_010467	ATG	2	6	10513	10518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016285
106	NC_010467	GCA	2	6	10554	10559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016285
107	NC_010467	AAG	2	6	10621	10626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016285
108	NC_010467	TTA	2	6	10684	10689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016285
109	NC_010467	GAA	2	6	10761	10766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016285
110	NC_010467	ATT	2	6	10982	10987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016286
111	NC_010467	CAA	2	6	11238	11243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016286
112	NC_010467	GAA	2	6	11261	11266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016286
113	NC_010467	TGA	2	6	11326	11331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016286
114	NC_010467	TGA	2	6	11422	11427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016286
115	NC_010467	TAT	2	6	11464	11469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016286
116	NC_010467	TAT	2	6	11505	11510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016286
117	NC_010467	GCT	2	6	11513	11518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016286
118	NC_010467	TTA	2	6	11592	11597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016286
119	NC_010467	TAC	2	6	11683	11688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016286
120	NC_010467	TTA	2	6	11721	11726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016286
121	NC_010467	TTG	2	6	11805	11810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016286
122	NC_010467	AAC	2	6	11824	11829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016286
123	NC_010467	TTA	2	6	11859	11864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016286
124	NC_010467	GAA	3	9	11935	11943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016286
125	NC_010467	AGC	2	6	12151	12156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016286
126	NC_010467	TGA	2	6	12181	12186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016286
127	NC_010467	CAT	2	6	12264	12269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016286
128	NC_010467	ATT	2	6	12457	12462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016287
129	NC_010467	TTA	3	9	12544	12552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016287
130	NC_010467	CTT	2	6	12653	12658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016287
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.