MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK2

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010466	TGA	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016237
2	NC_010466	GCT	2	6	182	187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016237
3	NC_010466	CAC	2	6	213	218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016237
4	NC_010466	CTT	2	6	236	241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016237
5	NC_010466	TCA	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016237
6	NC_010466	TTC	2	6	993	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016238
7	NC_010466	TGT	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016238
8	NC_010466	TGA	2	6	1067	1072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016238
9	NC_010466	AAC	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016239
10	NC_010466	ATA	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016239
11	NC_010466	CTA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016239
12	NC_010466	TCA	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016239
13	NC_010466	TCA	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016239
14	NC_010466	AGT	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016239
15	NC_010466	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016239
16	NC_010466	ATC	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016239
17	NC_010466	TCT	2	6	1688	1693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016239
18	NC_010466	GAT	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016239
19	NC_010466	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016239
20	NC_010466	CTT	2	6	1771	1776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016239
21	NC_010466	ATT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016239
22	NC_010466	TCT	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016239
23	NC_010466	AGC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016239
24	NC_010466	TTA	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016239
25	NC_010466	CAA	2	6	2663	2668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016240
26	NC_010466	GAA	2	6	2821	2826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016240
27	NC_010466	CTC	2	6	2945	2950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016241
28	NC_010466	GTT	2	6	2974	2979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016241
29	NC_010466	TGA	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016241
30	NC_010466	AAG	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
31	NC_010466	TGC	2	6	3083	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016241
32	NC_010466	GAA	2	6	3202	3207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
33	NC_010466	TGA	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016241
34	NC_010466	GAA	2	6	3381	3386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
35	NC_010466	AGA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
36	NC_010466	GAA	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
37	NC_010466	GAC	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016241
38	NC_010466	TAG	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016241
39	NC_010466	AAC	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016242
40	NC_010466	GGA	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016242
41	NC_010466	TAT	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016243
42	NC_010466	AGC	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016243
43	NC_010466	ATT	2	6	6304	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016244
44	NC_010466	ATG	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016244
45	NC_010466	AAT	2	6	6409	6414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016244
46	NC_010466	ACC	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016244
47	NC_010466	TCA	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016244
48	NC_010466	ACA	2	6	6655	6660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016244
49	NC_010466	GAA	2	6	6824	6829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016244
50	NC_010466	TCA	2	6	6843	6848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016244
51	NC_010466	AAC	2	6	6897	6902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016244
52	NC_010466	ACA	2	6	7135	7140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016245
53	NC_010466	GAT	2	6	7258	7263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016245
54	NC_010466	ATC	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016245
55	NC_010466	TCA	2	6	7681	7686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016246
56	NC_010466	AGA	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016246
57	NC_010466	GAA	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016246
58	NC_010466	AAT	2	6	8041	8046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016247
59	NC_010466	GTT	2	6	8055	8060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016247
60	NC_010466	TCA	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016247
61	NC_010466	ATA	2	6	8282	8287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016247
62	NC_010466	AAC	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016247
63	NC_010466	TGG	2	6	8430	8435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016247
64	NC_010466	CCA	3	9	8780	8788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016247
65	NC_010466	AAT	2	6	8797	8802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016247
66	NC_010466	ATC	2	6	8803	8808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016247
67	NC_010466	ACA	2	6	8828	8833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016247
68	NC_010466	TCA	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016247
69	NC_010466	AAT	2	6	8860	8865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016247
70	NC_010466	GTT	2	6	9237	9242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016248
71	NC_010466	TGA	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016248
72	NC_010466	AAC	2	6	9345	9350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016248
73	NC_010466	ATA	2	6	9408	9413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016248
74	NC_010466	AAC	2	6	9434	9439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016248
75	NC_010466	AAT	2	6	9455	9460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016248
76	NC_010466	GAT	3	9	9469	9477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016248
77	NC_010466	CGA	2	6	9783	9788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016248
78	NC_010466	AAT	2	6	9872	9877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016248
79	NC_010466	TTG	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016248
80	NC_010466	CTT	2	6	10017	10022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016248
81	NC_010466	GCA	2	6	10071	10076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016248
82	NC_010466	TTC	2	6	10498	10503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016249
83	NC_010466	GAG	2	6	10623	10628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016249
84	NC_010466	AAT	2	6	10678	10683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016249
85	NC_010466	TAG	2	6	10800	10805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016249
86	NC_010466	CCA	2	6	10806	10811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016249
87	NC_010466	AAT	2	6	10879	10884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016249
88	NC_010466	TTC	2	6	11053	11058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016249
89	NC_010466	TCG	2	6	11075	11080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016249
90	NC_010466	ATG	2	6	11083	11088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016249
91	NC_010466	TGT	2	6	11107	11112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016249
92	NC_010466	ACG	2	6	11143	11148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016249
93	NC_010466	CAT	2	6	11298	11303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016249
94	NC_010466	CTT	2	6	11535	11540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016250
95	NC_010466	AAT	2	6	11701	11706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016251
96	NC_010466	AAG	2	6	11752	11757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016251
97	NC_010466	ATG	2	6	11792	11797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016251
98	NC_010466	ACT	2	6	12013	12018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016252
99	NC_010466	GAG	2	6	12055	12060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016252
100	NC_010466	CAC	3	9	12228	12236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016252
101	NC_010466	TAA	2	6	12245	12250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016252
102	NC_010466	AAG	2	6	12294	12299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016252
103	NC_010466	TAA	2	6	12355	12360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016252
104	NC_010466	ACA	2	6	12405	12410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016252
105	NC_010466	GTT	2	6	12800	12805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016253
106	NC_010466	ACT	2	6	12923	12928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016253
107	NC_010466	TTG	2	6	12957	12962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016253
108	NC_010466	ATA	2	6	13037	13042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016253
109	NC_010466	ACC	2	6	13141	13146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016253
110	NC_010466	ACT	2	6	13190	13195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016253
111	NC_010466	ATC	2	6	13210	13215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016253
112	NC_010466	ACC	2	6	13477	13482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016254
113	NC_010466	TTC	2	6	13668	13673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016255
114	NC_010466	CAA	2	6	13703	13708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016255
115	NC_010466	GAC	2	6	13724	13729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016255
116	NC_010466	CTT	2	6	13829	13834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016255
117	NC_010466	CAG	2	6	13911	13916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016255
118	NC_010466	TAA	2	6	13930	13935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016255
119	NC_010466	TCA	2	6	13996	14001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016255
120	NC_010466	ATT	2	6	14002	14007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016255
121	NC_010466	CAA	2	6	14019	14024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016255
122	NC_010466	CAA	2	6	14223	14228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016256
123	NC_010466	AAT	2	6	14262	14267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016256
124	NC_010466	CAC	2	6	14291	14296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016256
125	NC_010466	TCC	2	6	14364	14369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016256
126	NC_010466	CCA	2	6	14928	14933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016257
127	NC_010466	CCA	2	6	15075	15080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016257
128	NC_010466	AGC	2	6	15182	15187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016257
129	NC_010466	GTT	2	6	15246	15251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016257
130	NC_010466	CTG	2	6	15258	15263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016257
131	NC_010466	GCT	2	6	15371	15376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016258
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142	NC_010466	TGA	2	6	16794	16799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016259
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252	NC_010466	GAT	2	6	27715	27720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016270
253	NC_010466	TCC	3	9	27756	27764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016270
254	NC_010466	ATT	2	6	27767	27772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016270
255	NC_010466	AAT	2	6	27782	27787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016270
256	NC_010466	CTT	2	6	28105	28110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016270
257	NC_010466	AAT	2	6	28121	28126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016270
258	NC_010466	ATA	2	6	28188	28193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016270
259	NC_010466	AGT	2	6	28280	28285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016270
260	NC_010466	CTT	2	6	28339	28344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016270
261	NC_010466	TCA	2	6	28350	28355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016270
262	NC_010466	GTT	2	6	28459	28464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016270
263	NC_010466	TTC	2	6	28508	28513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016270
264	NC_010466	TAA	2	6	28639	28644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016270
265	NC_010466	TTG	2	6	28660	28665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016270
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269	NC_010466	TTA	2	6	29392	29397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016271
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271	NC_010466	ATA	2	6	29463	29468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016271
272	NC_010466	AAC	2	6	29655	29660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016271
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274	NC_010466	GAC	2	6	29750	29755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016271
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276	NC_010466	CAC	2	6	29932	29937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016271
277	NC_010466	TGA	2	6	30001	30006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016271
278	NC_010466	CGA	2	6	30133	30138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016271
279	NC_010466	GAT	2	6	30155	30160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016271
280	NC_010466	GTT	2	6	30223	30228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016271
281	NC_010466	ATG	2	6	30393	30398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016271
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284	NC_010466	ATG	2	6	30605	30610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016271
285	NC_010466	ATG	2	6	30680	30685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016271
286	NC_010466	GCT	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016272
287	NC_010466	TCT	2	6	31234	31239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016272
288	NC_010466	TAA	2	6	31339	31344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016272

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.