MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 plasmid pBsph

Total Repeats: 3204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010381	T	6	6	168511	168516	0 %	100 %	0 %	0 %	169825593
3002	NC_010381	GAA	2	6	168523	168528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825593
3003	NC_010381	TGG	2	6	168547	168552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825593
3004	NC_010381	TAC	2	6	168652	168657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825593
3005	NC_010381	TAAT	2	8	168660	168667	50 %	50 %	0 %	0 %	169825593
3006	NC_010381	TTTA	2	8	168757	168764	25 %	75 %	0 %	0 %	169825593
3007	NC_010381	TCA	3	9	168782	168790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825593
3008	NC_010381	CAC	2	6	168825	168830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825593
3009	NC_010381	TA	3	6	168985	168990	50 %	50 %	0 %	0 %	169825593
3010	NC_010381	T	6	6	169052	169057	0 %	100 %	0 %	0 %	169825593
3011	NC_010381	TCT	2	6	169066	169071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825593
3012	NC_010381	ATTGT	2	10	169165	169174	20 %	60 %	20 %	0 %	169825593
3013	NC_010381	AT	3	6	169193	169198	50 %	50 %	0 %	0 %	169825593
3014	NC_010381	GAA	2	6	169217	169222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825593
3015	NC_010381	ATC	2	6	169291	169296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825593
3016	NC_010381	TTA	2	6	169313	169318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825593
3017	NC_010381	CAAA	2	8	169362	169369	75 %	0 %	0 %	25 %	169825593
3018	NC_010381	CTT	2	6	169386	169391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825593
3019	NC_010381	CTT	2	6	169401	169406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825593
3020	NC_010381	TTC	2	6	169408	169413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825593
3021	NC_010381	TAC	2	6	169456	169461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825593
3022	NC_010381	CTGTCA	2	12	169503	169514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169825593
3023	NC_010381	ATC	2	6	169551	169556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825594
3024	NC_010381	AAT	2	6	169557	169562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825594
3025	NC_010381	TAT	2	6	169589	169594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825594
3026	NC_010381	TAA	2	6	169623	169628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825594
3027	NC_010381	TAT	3	9	169643	169651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825594
3028	NC_010381	GAA	2	6	169672	169677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825594
3029	NC_010381	TTC	2	6	169726	169731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825594
3030	NC_010381	ATT	2	6	169746	169751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825594
3031	NC_010381	AAT	2	6	169764	169769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825594
3032	NC_010381	TGTTT	2	10	169776	169785	0 %	80 %	20 %	0 %	169825594
3033	NC_010381	ACTAAA	2	12	169855	169866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169825594
3034	NC_010381	CATA	2	8	169924	169931	50 %	25 %	0 %	25 %	169825594
3035	NC_010381	TAA	2	6	170058	170063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825594
3036	NC_010381	TAA	2	6	170073	170078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825594
3037	NC_010381	TTA	2	6	170105	170110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825594
3038	NC_010381	TAT	2	6	170126	170131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825594
3039	NC_010381	ATT	2	6	170160	170165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825594
3040	NC_010381	TTAA	2	8	170173	170180	50 %	50 %	0 %	0 %	169825594
3041	NC_010381	GCT	2	6	170206	170211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825594
3042	NC_010381	AAG	2	6	170270	170275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825594
3043	NC_010381	TTA	2	6	170354	170359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825595
3044	NC_010381	GA	3	6	170397	170402	50 %	0 %	50 %	0 %	169825595
3045	NC_010381	AAT	2	6	170452	170457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825595
3046	NC_010381	CTT	2	6	170487	170492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825595
3047	NC_010381	TCA	2	6	170498	170503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825595
3048	NC_010381	CAAA	2	8	170508	170515	75 %	0 %	0 %	25 %	169825595
3049	NC_010381	A	6	6	170513	170518	100 %	0 %	0 %	0 %	169825595
3050	NC_010381	AATC	2	8	170637	170644	50 %	25 %	0 %	25 %	169825595
3051	NC_010381	AAGTCA	2	12	170672	170683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169825595
3052	NC_010381	TAC	2	6	170758	170763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825595
3053	NC_010381	TTC	2	6	170782	170787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825595
3054	NC_010381	ACT	2	6	170788	170793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825595
3055	NC_010381	AAT	2	6	170795	170800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825595
3056	NC_010381	TAA	2	6	170860	170865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825595
3057	NC_010381	A	6	6	171001	171006	100 %	0 %	0 %	0 %	169825595
3058	NC_010381	ATTTGA	2	12	171011	171022	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169825595
3059	NC_010381	TTC	2	6	171051	171056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825596
3060	NC_010381	TCT	2	6	171127	171132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825596
3061	NC_010381	CTTT	2	8	171157	171164	0 %	75 %	0 %	25 %	169825596
3062	NC_010381	TGCTTT	2	12	171180	171191	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169825596
3063	NC_010381	TTCT	2	8	171284	171291	0 %	75 %	0 %	25 %	169825596
3064	NC_010381	TGA	2	6	171402	171407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825596
3065	NC_010381	ATTG	2	8	171409	171416	25 %	50 %	25 %	0 %	169825596
3066	NC_010381	TCA	2	6	171427	171432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825596
3067	NC_010381	CAA	2	6	171464	171469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825596
3068	NC_010381	CTTT	2	8	171470	171477	0 %	75 %	0 %	25 %	169825596
3069	NC_010381	T	6	6	171475	171480	0 %	100 %	0 %	0 %	169825596
3070	NC_010381	TCT	2	6	171496	171501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825596
3071	NC_010381	ATA	2	6	171666	171671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825596
3072	NC_010381	GTCA	2	8	171693	171700	25 %	25 %	25 %	25 %	169825596
3073	NC_010381	TTC	2	6	171864	171869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825596
3074	NC_010381	TA	3	6	171890	171895	50 %	50 %	0 %	0 %	169825596
3075	NC_010381	TAT	2	6	171954	171959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825596
3076	NC_010381	T	6	6	171963	171968	0 %	100 %	0 %	0 %	169825596
3077	NC_010381	GTA	2	6	172021	172026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825597
3078	NC_010381	ATT	2	6	172034	172039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825597
3079	NC_010381	CTA	2	6	172056	172061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
3080	NC_010381	T	6	6	172088	172093	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
3081	NC_010381	CTT	2	6	172096	172101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
3082	NC_010381	CACT	2	8	172115	172122	25 %	25 %	0 %	50 %	169825597
3083	NC_010381	TTG	2	6	172128	172133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825597
3084	NC_010381	ATC	2	6	172147	172152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
3085	NC_010381	ATC	2	6	172198	172203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
3086	NC_010381	T	6	6	172205	172210	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
3087	NC_010381	TAAT	2	8	172262	172269	50 %	50 %	0 %	0 %	169825597
3088	NC_010381	TCA	2	6	172325	172330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
3089	NC_010381	AAGT	2	8	172428	172435	50 %	25 %	25 %	0 %	169825597
3090	NC_010381	TCT	2	6	172499	172504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
3091	NC_010381	GCT	2	6	172514	172519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825597
3092	NC_010381	AAT	2	6	172563	172568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825597
3093	NC_010381	CAA	2	6	172575	172580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825597
3094	NC_010381	AGT	2	6	172633	172638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825597
3095	NC_010381	TTC	2	6	172651	172656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
3096	NC_010381	T	6	6	172718	172723	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
3097	NC_010381	TCT	2	6	172784	172789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
3098	NC_010381	TTC	2	6	172795	172800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
3099	NC_010381	TCTTGT	2	12	172817	172828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169825597
3100	NC_010381	GTATCT	2	12	172838	172849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169825597
3101	NC_010381	TAC	2	6	172948	172953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
3102	NC_010381	TTC	2	6	173007	173012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
3103	NC_010381	T	7	7	173108	173114	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
3104	NC_010381	TGT	2	6	173130	173135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825597
3105	NC_010381	CAA	2	6	173148	173153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825597
3106	NC_010381	ATGG	2	8	173166	173173	25 %	25 %	50 %	0 %	169825597
3107	NC_010381	T	6	6	173218	173223	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
3108	NC_010381	TAATC	2	10	173258	173267	40 %	40 %	0 %	20 %	169825597
3109	NC_010381	T	6	6	173281	173286	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
3110	NC_010381	TCA	2	6	173331	173336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
3111	NC_010381	TTA	2	6	173343	173348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825597
3112	NC_010381	CAC	2	6	173382	173387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825597
3113	NC_010381	T	6	6	173457	173462	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
3114	NC_010381	CAC	2	6	173463	173468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825597
3115	NC_010381	AAAT	2	8	173478	173485	75 %	25 %	0 %	0 %	169825597
3116	NC_010381	ACA	2	6	173490	173495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825597
3117	NC_010381	A	6	6	173495	173500	100 %	0 %	0 %	0 %	169825597
3118	NC_010381	CA	3	6	173502	173507	50 %	0 %	0 %	50 %	169825597
3119	NC_010381	AT	3	6	173580	173585	50 %	50 %	0 %	0 %	169825598
3120	NC_010381	AATTT	2	10	173614	173623	40 %	60 %	0 %	0 %	169825598
3121	NC_010381	TTC	2	6	173630	173635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825598
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3123	NC_010381	AAT	2	6	173720	173725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825598
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.