MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus DPC 4571

Total Repeats: 32487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010080	TGAA	2	8	309487	309494	50 %	25 %	25 %	0 %	161506865
5002	NC_010080	CTA	2	6	309496	309501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506865
5003	NC_010080	CCA	2	6	309554	309559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161506865
5004	NC_010080	GATT	2	8	309644	309651	25 %	50 %	25 %	0 %	161506865
5005	NC_010080	GCA	2	6	309669	309674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506865
5006	NC_010080	CAAA	2	8	309700	309707	75 %	0 %	0 %	25 %	161506865
5007	NC_010080	ATT	2	6	309741	309746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161506865
5008	NC_010080	AGC	2	6	309761	309766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506865
5009	NC_010080	AGC	2	6	309788	309793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506865
5010	NC_010080	AAG	2	6	309802	309807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506865
5011	NC_010080	GAA	2	6	309834	309839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506865
5012	NC_010080	TGT	2	6	309878	309883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506865
5013	NC_010080	GTA	2	6	309906	309911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506865
5014	NC_010080	AG	3	6	309977	309982	50 %	0 %	50 %	0 %	161506865
5015	NC_010080	GCA	3	9	310146	310154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506865
5016	NC_010080	AGA	2	6	310166	310171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506865
5017	NC_010080	CAAG	2	8	310219	310226	50 %	0 %	25 %	25 %	161506865
5018	NC_010080	TCG	2	6	310289	310294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506865
5019	NC_010080	GTT	2	6	310308	310313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506865
5020	NC_010080	TGA	2	6	310319	310324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506865
5021	NC_010080	ATC	2	6	310428	310433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506865
5022	NC_010080	ACGT	2	8	310457	310464	25 %	25 %	25 %	25 %	161506865
5023	NC_010080	TTC	2	6	310554	310559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161506865
5024	NC_010080	TGA	2	6	310583	310588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506865
5025	NC_010080	TGA	2	6	310601	310606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506865
5026	NC_010080	AAG	2	6	310614	310619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506865
5027	NC_010080	TACT	2	8	310642	310649	25 %	50 %	0 %	25 %	161506865
5028	NC_010080	AAG	2	6	310674	310679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506865
5029	NC_010080	AGA	2	6	310764	310769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506865
5030	NC_010080	TGT	2	6	310880	310885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506865
5031	NC_010080	A	6	6	310893	310898	100 %	0 %	0 %	0 %	161506865
5032	NC_010080	TC	3	6	311191	311196	0 %	50 %	0 %	50 %	161506866
5033	NC_010080	AAG	2	6	311203	311208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506866
5034	NC_010080	AAG	2	6	311278	311283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506866
5035	NC_010080	TGA	2	6	311288	311293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506866
5036	NC_010080	TGA	2	6	311375	311380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506866
5037	NC_010080	TGC	2	6	311405	311410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506866
5038	NC_010080	TGA	2	6	311494	311499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506866
5039	NC_010080	TTCA	2	8	311510	311517	25 %	50 %	0 %	25 %	161506866
5040	NC_010080	GT	3	6	311569	311574	0 %	50 %	50 %	0 %	161506866
5041	NC_010080	GTC	2	6	311602	311607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506866
5042	NC_010080	TAC	2	6	311618	311623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506866
5043	NC_010080	GTG	2	6	311638	311643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506866
5044	NC_010080	CAT	2	6	311759	311764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506866
5045	NC_010080	CAG	2	6	311827	311832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506866
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5047	NC_010080	CGT	2	6	311943	311948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506866
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5050	NC_010080	TGT	2	6	312080	312085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506866
5051	NC_010080	TGA	2	6	312128	312133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506866
5052	NC_010080	AAGG	2	8	312162	312169	50 %	0 %	50 %	0 %	161506866
5053	NC_010080	CAG	2	6	312289	312294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506866
5054	NC_010080	ACT	2	6	312313	312318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506866
5055	NC_010080	ACAAG	2	10	312329	312338	60 %	0 %	20 %	20 %	161506866
5056	NC_010080	TGA	2	6	312350	312355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506866
5057	NC_010080	CGT	2	6	312375	312380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506866
5058	NC_010080	TCG	2	6	312383	312388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506866
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5060	NC_010080	GTT	2	6	312444	312449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506866
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5064	NC_010080	TCA	2	6	312546	312551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506866
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5068	NC_010080	CGT	2	6	312798	312803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506866
5069	NC_010080	ACT	2	6	312841	312846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506866
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5087	NC_010080	ACTTC	2	10	313755	313764	20 %	40 %	0 %	40 %	161506866
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5107	NC_010080	AAGA	2	8	314718	314725	75 %	0 %	25 %	0 %	161506866
5108	NC_010080	GAC	2	6	314760	314765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506866
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5118	NC_010080	A	6	6	315333	315338	100 %	0 %	0 %	0 %	161506867
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5120	NC_010080	GAA	2	6	315368	315373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506867
5121	NC_010080	TAA	2	6	315455	315460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161506867
5122	NC_010080	ATGG	2	8	315467	315474	25 %	25 %	50 %	0 %	161506867
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5125	NC_010080	TAA	2	6	315587	315592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161506867
5126	NC_010080	CAT	2	6	315629	315634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506867
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5129	NC_010080	GTC	2	6	315700	315705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506867
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5135	NC_010080	CAC	2	6	316224	316229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161506867
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5142	NC_010080	GAT	2	6	316512	316517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506867
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5158	NC_010080	TCAG	2	8	317189	317196	25 %	25 %	25 %	25 %	161506867
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5230	NC_010080	ACT	4	12	321860	321871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506871
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5233	NC_010080	GAA	2	6	321953	321958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506871
5234	NC_010080	ACT	2	6	321992	321997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506871
5235	NC_010080	AACGCT	2	12	322256	322267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161506871
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5237	NC_010080	ACG	2	6	322347	322352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506871
5238	NC_010080	GAA	2	6	322406	322411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506871
5239	NC_010080	CGT	2	6	322421	322426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506871
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5241	NC_010080	GAC	2	6	322457	322462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506871
5242	NC_010080	CAT	2	6	322465	322470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506871
5243	NC_010080	GAA	2	6	322490	322495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506871
5244	NC_010080	ACG	2	6	322503	322508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506871
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5246	NC_010080	ATG	2	6	322598	322603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506871
5247	NC_010080	ACT	2	6	322620	322625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506871
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5264	NC_010080	TGC	2	6	323563	323568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506871
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5270	NC_010080	ACT	2	6	323811	323816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506871
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5361	NC_010080	AAG	2	6	329186	329191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506882
5362	NC_010080	TTA	2	6	329323	329328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161506883
5363	NC_010080	TGTA	2	8	329378	329385	25 %	50 %	25 %	0 %	161506883
5364	NC_010080	AAGC	2	8	329391	329398	50 %	0 %	25 %	25 %	161506883
5365	NC_010080	A	6	6	329418	329423	100 %	0 %	0 %	0 %	161506883
5366	NC_010080	CGT	2	6	329469	329474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506883
5367	NC_010080	ATT	2	6	329517	329522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161506883
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5370	NC_010080	TTCT	2	8	329717	329724	0 %	75 %	0 %	25 %	161506884
5371	NC_010080	AAG	2	6	329734	329739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506884
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5482	NC_010080	TAAT	2	8	335083	335090	50 %	50 %	0 %	0 %	161506894
5483	NC_010080	TAA	2	6	335141	335146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161506894
5484	NC_010080	GAT	2	6	335234	335239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506895
5485	NC_010080	TACCT	2	10	335269	335278	20 %	40 %	0 %	40 %	161506895
5486	NC_010080	CTA	2	6	335313	335318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506895
5487	NC_010080	GTT	2	6	335652	335657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506896
5488	NC_010080	ACAT	2	8	335664	335671	50 %	25 %	0 %	25 %	161506896
5489	NC_010080	AAG	2	6	335697	335702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506896
5490	NC_010080	CGTT	2	8	335732	335739	0 %	50 %	25 %	25 %	161506896
5491	NC_010080	AGA	2	6	335756	335761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506896
5492	NC_010080	CCG	2	6	335879	335884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506896
5493	NC_010080	AAT	2	6	335916	335921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161506896
5494	NC_010080	CTCGTA	2	12	335923	335934	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506896
5495	NC_010080	CGT	2	6	336009	336014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506897
5496	NC_010080	GAA	2	6	336017	336022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506897
5497	NC_010080	GCG	2	6	336034	336039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506897
5498	NC_010080	CA	3	6	336043	336048	50 %	0 %	0 %	50 %	161506897
5499	NC_010080	TAA	2	6	336062	336067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161506897
5500	NC_010080	GCA	2	6	336177	336182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506897

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