MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009513	TTGCCG	2	12	763	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543244
2	NC_009513	ATATTG	2	12	1240	1251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543244
3	NC_009513	AGACTA	2	12	5667	5678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148543248
4	NC_009513	TGATGG	2	12	6952	6963	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148543249
5	NC_009513	TGAAGA	2	12	8098	8109	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543249
6	NC_009513	CTTCTG	2	12	8787	8798	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148543249
7	NC_009513	AACGTC	2	12	12562	12573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148543253
8	NC_009513	TGAAGT	2	12	14483	14494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543255
9	NC_009513	CCATTT	2	12	18614	18625	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148543260
10	NC_009513	TGGTGT	2	12	25963	25974	0 %	50 %	50 %	0 %	148543266
11	NC_009513	ACTTGA	2	12	28380	28391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543268
12	NC_009513	ATGCGG	2	12	29683	29694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148543269
13	NC_009513	ACCAAG	2	12	34291	34302	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148543274
14	NC_009513	TAATTG	2	12	34337	34348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543274
15	NC_009513	ACGTCG	2	12	37988	37999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148543278
16	NC_009513	TAAAGG	2	12	38650	38661	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543278
17	NC_009513	GTGGAT	2	12	43160	43171	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148543283
18	NC_009513	CAAGGA	2	12	48145	48156	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148543288
19	NC_009513	CTGTTA	2	12	48459	48470	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148543288
20	NC_009513	AGAACA	2	12	51136	51147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148543289
21	NC_009513	GCACAA	2	12	51161	51172	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148543289
22	NC_009513	TGCTAA	2	12	51532	51543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543289
23	NC_009513	GCACAA	2	12	52700	52711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148543289
24	NC_009513	TCCTTA	2	12	57186	57197	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148543292
25	NC_009513	AGCCCA	2	12	58966	58977	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148543292
26	NC_009513	TGCTAA	2	12	61056	61067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543293
27	NC_009513	GTTTCG	2	12	66856	66867	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148543296
28	NC_009513	AACAAG	2	12	69376	69387	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148543297
29	NC_009513	AAGGTT	2	12	70120	70131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543297
30	NC_009513	GCTTCT	2	12	70585	70596	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148543298
31	NC_009513	TTGGAA	2	12	74628	74639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543302
32	NC_009513	TGAAAA	2	12	79516	79527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148543307
33	NC_009513	CTAAGA	2	12	82377	82388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148543309
34	NC_009513	CCAACC	2	12	84005	84016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543310
35	NC_009513	GTTGGC	2	12	85456	85467	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148543311
36	NC_009513	GATATT	2	12	87336	87347	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543313
37	NC_009513	TCATGT	2	12	89884	89895	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148543316
38	NC_009513	TAATCC	2	12	100148	100159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543325
39	NC_009513	TTCGAA	2	12	100993	101004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543326
40	NC_009513	CAAGGA	2	12	103941	103952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148543327
41	NC_009513	TTTCAT	2	12	103977	103988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148543327
42	NC_009513	TCTTGG	2	12	108408	108419	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148543329
43	NC_009513	AAGGTA	2	12	114768	114779	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543335
44	NC_009513	ATTGAA	2	12	123497	123508	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148543337
45	NC_009513	TATCAT	2	12	124708	124719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148543337
46	NC_009513	TTATGG	2	12	127133	127144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148543339
47	NC_009513	ATTAAG	2	12	131300	131311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148543342
48	NC_009513	TTAGAT	2	12	132765	132776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543344
49	NC_009513	TTGATC	2	12	133315	133326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148543345
50	NC_009513	CATTGG	2	12	136943	136954	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148543349
51	NC_009513	GATTAA	2	12	139170	139181	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148543351
52	NC_009513	ACTGGT	2	12	139807	139818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148543352
53	NC_009513	ATGTTC	2	12	140812	140823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148543353
54	NC_009513	CCAAGC	2	12	142598	142609	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148543355
55	NC_009513	TTATTG	2	12	144463	144474	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148543357
56	NC_009513	GTGATT	2	12	146850	146861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148543359
57	NC_009513	GCTGAT	2	12	149991	150002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148543363
58	NC_009513	TCCGCG	2	12	150661	150672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148543364
59	NC_009513	CACCAA	2	12	152947	152958	50 %	0 %	0 %	50 %	148543367
60	NC_009513	CAATTA	2	12	156903	156914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148543370
61	NC_009513	GGTAAG	2	12	163956	163967	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148543376
62	NC_009513	ATGAGG	2	12	164698	164709	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148543377
63	NC_009513	TTATGA	2	12	169075	169086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543380
64	NC_009513	AATGGA	2	12	175416	175427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543386
65	NC_009513	TTAACA	2	12	176349	176360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148543387
66	NC_009513	GATAAA	2	12	190960	190971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148543396
67	NC_009513	CGATAC	2	12	191796	191807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148543396
68	NC_009513	ATTGCC	2	12	196728	196739	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148543401
69	NC_009513	GCCAAG	2	12	199345	199356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543405
70	NC_009513	GGTTAA	2	12	205566	205577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543410
71	NC_009513	CTTTTG	2	12	209296	209307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148543413
72	NC_009513	AAAAGT	2	12	211689	211700	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148543415
73	NC_009513	CATTTA	2	12	212308	212319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148543416
74	NC_009513	AATTTT	2	12	213466	213477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543417
75	NC_009513	GGCTTA	2	12	219107	219118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148543422
76	NC_009513	TGGGGA	2	12	220319	220330	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	148543424
77	NC_009513	CAATGG	2	12	220418	220429	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148543424
78	NC_009513	TTTATC	2	12	222027	222038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148543426
79	NC_009513	ACTTCA	2	12	223937	223948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543427
80	NC_009513	AACTTG	2	12	224362	224373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543428
81	NC_009513	ACCATC	2	12	240990	241001	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148543442
82	NC_009513	TGATGT	2	12	254358	254369	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148543456
83	NC_009513	ATCGAT	2	12	259033	259044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543460
84	NC_009513	GATCAA	2	12	259820	259831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148543461
85	NC_009513	CGATGA	2	12	264065	264076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148543466
86	NC_009513	CGTCAC	2	12	265822	265833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148543467
87	NC_009513	AAGGTA	2	12	266662	266673	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543468
88	NC_009513	GCGATT	2	12	271088	271099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148543471
89	NC_009513	CGCAAT	2	12	277382	277393	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148543479
90	NC_009513	ATGAAA	2	12	277938	277949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148543480
91	NC_009513	AAAGAT	2	12	282814	282825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148543483
92	NC_009513	TGGTAT	2	12	283107	283118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148543483
93	NC_009513	AATTAG	2	12	283190	283201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148543483
94	NC_009513	AAGGTA	2	12	284569	284580	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543485
95	NC_009513	GGTTGC	2	12	286032	286043	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148543486
96	NC_009513	TGAATT	2	12	291550	291561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543492
97	NC_009513	CTTATA	2	12	294900	294911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148543495
98	NC_009513	AAAGCC	2	12	300017	300028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148543499
99	NC_009513	CACAAT	2	12	302215	302226	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148543501
100	NC_009513	TTCAGC	2	12	305387	305398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148543505
101	NC_009513	TTGATA	2	12	310110	310121	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543508
102	NC_009513	AAAGAA	2	12	310954	310965	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148543508
103	NC_009513	TATTGC	2	12	322647	322658	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148543514
104	NC_009513	CCCATG	2	12	330770	330781	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148543521
105	NC_009513	TGAAGA	2	12	331176	331187	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543521
106	NC_009513	CGTAAG	2	12	338761	338772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148543527
107	NC_009513	CAATTA	2	12	343838	343849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148543531
108	NC_009513	ATCTGG	2	12	344123	344134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148543532
109	NC_009513	GCCACC	2	12	347433	347444	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148543535
110	NC_009513	CTAATT	2	12	349022	349033	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148543538
111	NC_009513	TTGAAG	2	12	351153	351164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543539
112	NC_009513	TAGCTG	2	12	353714	353725	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148543542
113	NC_009513	GGATGC	2	12	358946	358957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148543548
114	NC_009513	TCATTT	2	12	360587	360598	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148543549
115	NC_009513	AGTTTT	2	12	360707	360718	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148543549
116	NC_009513	CAGTTG	2	12	361811	361822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148543551
117	NC_009513	TAAGGT	2	12	361893	361904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543551
118	NC_009513	TGGTCT	2	12	361929	361940	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148543551
119	NC_009513	CTTTAA	2	12	364848	364859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148543557
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123	NC_009513	TGGAAG	2	12	371387	371398	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148543560
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125	NC_009513	TGTCTT	2	12	377015	377026	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148543568
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212	NC_009513	TTCTCT	2	12	659894	659905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543824
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217	NC_009513	AAGAAA	2	12	664160	664171	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148543827
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219	NC_009513	CAAGAT	2	12	670621	670632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148543834
220	NC_009513	AAATTA	2	12	678677	678688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543843
221	NC_009513	ATGTTG	2	12	682688	682699	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148543846
222	NC_009513	CTGGAA	2	12	685916	685927	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148543849
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224	NC_009513	GGTGCA	2	12	691860	691871	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148543853
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226	NC_009513	ACCTTC	2	12	698644	698655	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148543862
227	NC_009513	TATCAG	2	12	702426	702437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543865
228	NC_009513	GATAAT	2	12	703105	703116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148543866
229	NC_009513	TGAAGC	2	12	706250	706261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148543869
230	NC_009513	TATGAC	2	12	706817	706828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543869
231	NC_009513	AAAACT	2	12	710517	710528	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148543874
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339	NC_009513	TTGCTT	2	12	1067274	1067285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148544243
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452	NC_009513	ATTGCC	2	12	1433927	1433938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148544589
453	NC_009513	CTTGCC	2	12	1440400	1440411	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148544597
454	NC_009513	CCAAAA	2	12	1442181	1442192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544598
455	NC_009513	TTAGTA	2	12	1443977	1443988	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148544599
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459	NC_009513	GCATAT	2	12	1469242	1469253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148544630
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462	NC_009513	ACCATC	2	12	1473189	1473200	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148544633
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