MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 36903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009513	TAG	2	6	224304	224309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543428
4002	NC_009513	AACTTG	2	12	224362	224373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543428
4003	NC_009513	GCG	2	6	224417	224422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543428
4004	NC_009513	GTT	2	6	224423	224428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543428
4005	NC_009513	CAA	2	6	224442	224447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543428
4006	NC_009513	CAA	2	6	224476	224481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543428
4007	NC_009513	CCG	2	6	224609	224614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543428
4008	NC_009513	CAC	2	6	224676	224681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543428
4009	NC_009513	CCAA	2	8	224683	224690	50 %	0 %	0 %	50 %	148543428
4010	NC_009513	ATT	2	6	224713	224718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543428
4011	NC_009513	TCC	2	6	224728	224733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543429
4012	NC_009513	ATC	2	6	224735	224740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543429
4013	NC_009513	AAG	2	6	224772	224777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543429
4014	NC_009513	TTG	2	6	224786	224791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543429
4015	NC_009513	CTT	2	6	224894	224899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543429
4016	NC_009513	TGAT	2	8	224914	224921	25 %	50 %	25 %	0 %	148543429
4017	NC_009513	GCA	2	6	224953	224958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543429
4018	NC_009513	TTC	2	6	224960	224965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543429
4019	NC_009513	ATC	2	6	224966	224971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543429
4020	NC_009513	TGT	2	6	225051	225056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543429
4021	NC_009513	GGA	2	6	225061	225066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543429
4022	NC_009513	TTA	2	6	225123	225128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543429
4023	NC_009513	AAG	2	6	225203	225208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543429
4024	NC_009513	TCA	2	6	225255	225260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543429
4025	NC_009513	GTT	3	9	225310	225318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543429
4026	NC_009513	CAC	2	6	225319	225324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543429
4027	NC_009513	CTT	2	6	225392	225397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543429
4028	NC_009513	TCA	2	6	225408	225413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543429
4029	NC_009513	TAA	2	6	225470	225475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543429
4030	NC_009513	TTA	2	6	225528	225533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543429
4031	NC_009513	A	7	7	225558	225564	100 %	0 %	0 %	0 %	148543429
4032	NC_009513	AGG	2	6	225606	225611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543429
4033	NC_009513	CAA	2	6	225655	225660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543429
4034	NC_009513	AAC	2	6	225713	225718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543429
4035	NC_009513	TGT	2	6	225748	225753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543429
4036	NC_009513	TTTA	2	8	225790	225797	25 %	75 %	0 %	0 %	148543430
4037	NC_009513	CTG	2	6	225826	225831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543430
4038	NC_009513	GTTTT	2	10	225856	225865	0 %	80 %	20 %	0 %	148543430
4039	NC_009513	T	6	6	225862	225867	0 %	100 %	0 %	0 %	148543430
4040	NC_009513	ACA	2	6	225885	225890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543430
4041	NC_009513	TTG	2	6	225903	225908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543430
4042	NC_009513	AAT	2	6	225932	225937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543430
4043	NC_009513	CAG	2	6	226003	226008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543430
4044	NC_009513	TAGT	2	8	226017	226024	25 %	50 %	25 %	0 %	148543430
4045	NC_009513	ACT	2	6	226029	226034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543430
4046	NC_009513	CTT	2	6	226145	226150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543430
4047	NC_009513	TCAA	2	8	226155	226162	50 %	25 %	0 %	25 %	148543430
4048	NC_009513	AAT	2	6	226182	226187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543430
4049	NC_009513	CAT	2	6	226207	226212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543430
4050	NC_009513	CCA	2	6	226230	226235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543430
4051	NC_009513	TGGT	2	8	226406	226413	0 %	50 %	50 %	0 %	148543430
4052	NC_009513	TTG	3	9	226544	226552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543430
4053	NC_009513	CGGA	2	8	226553	226560	25 %	0 %	50 %	25 %	148543430
4054	NC_009513	AAC	2	6	226583	226588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543430
4055	NC_009513	ACT	2	6	226599	226604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543430
4056	NC_009513	ATG	2	6	226614	226619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543430
4057	NC_009513	TCT	2	6	226622	226627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543430
4058	NC_009513	TTTC	2	8	226628	226635	0 %	75 %	0 %	25 %	148543430
4059	NC_009513	CCG	2	6	227456	227461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543431
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4061	NC_009513	A	6	6	227560	227565	100 %	0 %	0 %	0 %	148543431
4062	NC_009513	GAA	2	6	227579	227584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543431
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4064	NC_009513	GAA	2	6	227934	227939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543431
4065	NC_009513	GTT	2	6	227967	227972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543431
4066	NC_009513	ACTTG	2	10	228002	228011	20 %	40 %	20 %	20 %	148543431
4067	NC_009513	AGA	3	9	228014	228022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543431
4068	NC_009513	GCAA	2	8	228080	228087	50 %	0 %	25 %	25 %	148543431
4069	NC_009513	AAG	2	6	228249	228254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543432
4070	NC_009513	T	6	6	228279	228284	0 %	100 %	0 %	0 %	148543432
4071	NC_009513	TTG	2	6	228423	228428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543432
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4074	NC_009513	CAG	2	6	228651	228656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543432
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4077	NC_009513	GTT	2	6	228764	228769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543432
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4083	NC_009513	TTAGT	2	10	229110	229119	20 %	60 %	20 %	0 %	148543432
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4092	NC_009513	TATT	2	8	229322	229329	25 %	75 %	0 %	0 %	148543432
4093	NC_009513	ATT	2	6	229376	229381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543432
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4102	NC_009513	ATC	2	6	229709	229714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543433
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4104	NC_009513	AT	3	6	229770	229775	50 %	50 %	0 %	0 %	148543433
4105	NC_009513	TC	3	6	229791	229796	0 %	50 %	0 %	50 %	148543433
4106	NC_009513	TAT	3	9	229801	229809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543433
4107	NC_009513	ATT	2	6	229834	229839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543434
4108	NC_009513	A	6	6	229917	229922	100 %	0 %	0 %	0 %	148543434
4109	NC_009513	ATG	2	6	229930	229935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543434
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4119	NC_009513	GTT	2	6	230396	230401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543434
4120	NC_009513	TTGA	2	8	230432	230439	25 %	50 %	25 %	0 %	148543434
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4239	NC_009513	A	6	6	236234	236239	100 %	0 %	0 %	0 %	148543438
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4241	NC_009513	AAG	2	6	236300	236305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543438
4242	NC_009513	TGA	2	6	236311	236316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543438
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4244	NC_009513	TAA	2	6	236401	236406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543438
4245	NC_009513	ATA	2	6	236433	236438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543438
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4247	NC_009513	ATGC	2	8	236543	236550	25 %	25 %	25 %	25 %	148543438
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4249	NC_009513	GGACA	2	10	236586	236595	40 %	0 %	40 %	20 %	148543438
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4251	NC_009513	ATT	2	6	236637	236642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543438
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4259	NC_009513	GAAA	2	8	236898	236905	75 %	0 %	25 %	0 %	148543438
4260	NC_009513	AG	3	6	236935	236940	50 %	0 %	50 %	0 %	148543438
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4345	NC_009513	TGT	2	6	241472	241477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543443
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4353	NC_009513	TTA	2	6	241855	241860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543443
4354	NC_009513	GATG	2	8	241943	241950	25 %	25 %	50 %	0 %	148543443
4355	NC_009513	AGC	2	6	242012	242017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543443
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4361	NC_009513	TAAA	2	8	242227	242234	75 %	25 %	0 %	0 %	148543443
4362	NC_009513	GGC	2	6	242285	242290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543443
4363	NC_009513	GCT	2	6	242325	242330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543443
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