MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 36903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009513	CAG	2	6	52111	52116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1002	NC_009513	TAG	2	6	52141	52146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543289
1003	NC_009513	ATT	2	6	52148	52153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543289
1004	NC_009513	AAT	2	6	52154	52159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543289
1005	NC_009513	ACT	2	6	52238	52243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543289
1006	NC_009513	AC	3	6	52334	52339	50 %	0 %	0 %	50 %	148543289
1007	NC_009513	TCT	2	6	52360	52365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543289
1008	NC_009513	TGA	2	6	52411	52416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543289
1009	NC_009513	CAT	2	6	52461	52466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543289
1010	NC_009513	TTAAC	2	10	52512	52521	40 %	40 %	0 %	20 %	148543289
1011	NC_009513	AAG	2	6	52524	52529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543289
1012	NC_009513	TAA	2	6	52606	52611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543289
1013	NC_009513	AAC	2	6	52674	52679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543289
1014	NC_009513	GCACAA	2	12	52700	52711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148543289
1015	NC_009513	CCA	2	6	52738	52743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543289
1016	NC_009513	AAC	2	6	52764	52769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543289
1017	NC_009513	ATG	2	6	52776	52781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543289
1018	NC_009513	TGC	2	6	52843	52848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1019	NC_009513	TGC	2	6	52951	52956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1020	NC_009513	TTA	2	6	53082	53087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543289
1021	NC_009513	GCT	2	6	53132	53137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1022	NC_009513	AGC	2	6	53173	53178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1023	NC_009513	CAA	2	6	53183	53188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543289
1024	NC_009513	AG	3	6	53202	53207	50 %	0 %	50 %	0 %	148543289
1025	NC_009513	ATA	2	6	53229	53234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543289
1026	NC_009513	TGT	2	6	53236	53241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543289
1027	NC_009513	CAG	2	6	53250	53255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1028	NC_009513	AGC	2	6	53260	53265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1029	NC_009513	ATG	2	6	53268	53273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543289
1030	NC_009513	ACT	2	6	53327	53332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543289
1031	NC_009513	TGC	2	6	53428	53433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1032	NC_009513	TAC	2	6	53434	53439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543289
1033	NC_009513	AAT	2	6	53441	53446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543289
1034	NC_009513	CTG	2	6	53472	53477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543289
1035	NC_009513	ATA	2	6	53478	53483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543289
1036	NC_009513	ACA	2	6	53499	53504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543289
1037	NC_009513	AAG	2	6	53540	53545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543289
1038	NC_009513	AAG	2	6	53558	53563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543289
1039	NC_009513	ATC	2	6	53569	53574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543289
1040	NC_009513	TCT	2	6	53591	53596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543289
1041	NC_009513	TTG	2	6	53604	53609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543289
1042	NC_009513	AAG	2	6	53660	53665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543289
1043	NC_009513	ATCA	2	8	53768	53775	50 %	25 %	0 %	25 %	148543290
1044	NC_009513	ATT	3	9	53789	53797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543290
1045	NC_009513	ATG	2	6	53813	53818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543290
1046	NC_009513	TTG	2	6	53931	53936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543290
1047	NC_009513	CTG	2	6	54036	54041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543290
1048	NC_009513	GTT	2	6	54079	54084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543290
1049	NC_009513	ATTA	2	8	54164	54171	50 %	50 %	0 %	0 %	148543290
1050	NC_009513	GTTT	2	8	54179	54186	0 %	75 %	25 %	0 %	148543290
1051	NC_009513	CAT	2	6	54274	54279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543290
1052	NC_009513	GCG	2	6	54320	54325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543290
1053	NC_009513	AT	3	6	54329	54334	50 %	50 %	0 %	0 %	148543290
1054	NC_009513	ATT	2	6	54501	54506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543291
1055	NC_009513	TGG	2	6	54507	54512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543291
1056	NC_009513	CTTT	2	8	54649	54656	0 %	75 %	0 %	25 %	148543291
1057	NC_009513	AGC	2	6	54739	54744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543291
1058	NC_009513	TCA	2	6	54748	54753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543291
1059	NC_009513	CAT	2	6	54800	54805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543291
1060	NC_009513	TGA	2	6	54821	54826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543291
1061	NC_009513	TGA	2	6	54896	54901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543291
1062	NC_009513	GGC	2	6	54995	55000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543291
1063	NC_009513	GGT	2	6	55086	55091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543291
1064	NC_009513	ACC	2	6	55153	55158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543291
1065	NC_009513	TTG	2	6	55165	55170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543291
1066	NC_009513	TGG	2	6	55196	55201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543291
1067	NC_009513	CGG	2	6	55277	55282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543291
1068	NC_009513	GAA	2	6	55334	55339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543291
1069	NC_009513	AAGAT	2	10	55345	55354	60 %	20 %	20 %	0 %	148543291
1070	NC_009513	TTGCA	2	10	55402	55411	20 %	40 %	20 %	20 %	148543291
1071	NC_009513	A	6	6	55444	55449	100 %	0 %	0 %	0 %	148543291
1072	NC_009513	TAAT	2	8	55471	55478	50 %	50 %	0 %	0 %	148543291
1073	NC_009513	CGA	2	6	55523	55528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543291
1074	NC_009513	TAT	2	6	55632	55637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543291
1075	NC_009513	TTA	2	6	55670	55675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543291
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1077	NC_009513	TTAAA	2	10	55765	55774	60 %	40 %	0 %	0 %	148543291
1078	NC_009513	TTTA	2	8	55791	55798	25 %	75 %	0 %	0 %	148543291
1079	NC_009513	CTG	2	6	55926	55931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543291
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1081	NC_009513	ATC	2	6	56115	56120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543292
1082	NC_009513	ATTG	2	8	56128	56135	25 %	50 %	25 %	0 %	148543292
1083	NC_009513	CTG	2	6	56166	56171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543292
1084	NC_009513	TAT	2	6	56183	56188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543292
1085	NC_009513	GCTT	2	8	56314	56321	0 %	50 %	25 %	25 %	148543292
1086	NC_009513	ACA	2	6	56356	56361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543292
1087	NC_009513	GTT	2	6	56399	56404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543292
1088	NC_009513	GCGA	2	8	56435	56442	25 %	0 %	50 %	25 %	148543292
1089	NC_009513	AAC	2	6	56448	56453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543292
1090	NC_009513	CAGCT	2	10	56475	56484	20 %	20 %	20 %	40 %	148543292
1091	NC_009513	GAA	2	6	56486	56491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543292
1092	NC_009513	A	6	6	56494	56499	100 %	0 %	0 %	0 %	148543292
1093	NC_009513	CCG	2	6	56511	56516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543292
1094	NC_009513	ATT	2	6	56531	56536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543292
1095	NC_009513	CAG	2	6	56562	56567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543292
1096	NC_009513	ATG	2	6	56595	56600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543292
1097	NC_009513	TA	3	6	56608	56613	50 %	50 %	0 %	0 %	148543292
1098	NC_009513	CTT	2	6	56719	56724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543292
1099	NC_009513	AAC	2	6	56757	56762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543292
1100	NC_009513	AGT	2	6	56764	56769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543292
1101	NC_009513	ATTA	2	8	56776	56783	50 %	50 %	0 %	0 %	148543292
1102	NC_009513	ATC	2	6	56841	56846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543292
1103	NC_009513	TCC	2	6	56863	56868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543292
1104	NC_009513	TATTC	2	10	56880	56889	20 %	60 %	0 %	20 %	148543292
1105	NC_009513	AAG	2	6	56940	56945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543292
1106	NC_009513	CTC	2	6	56979	56984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543292
1107	NC_009513	ACA	2	6	57001	57006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543292
1108	NC_009513	GCGA	2	8	57054	57061	25 %	0 %	50 %	25 %	148543292
1109	NC_009513	CTT	2	6	57068	57073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543292
1110	NC_009513	AAT	2	6	57125	57130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543292
1111	NC_009513	TCCTTA	2	12	57186	57197	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148543292
1112	NC_009513	ATA	2	6	57249	57254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543292
1113	NC_009513	ATC	2	6	57291	57296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543292
1114	NC_009513	CTC	2	6	57308	57313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543292
1115	NC_009513	ACA	2	6	57314	57319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543292
1116	NC_009513	TTA	2	6	57320	57325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543292
1117	NC_009513	CAG	2	6	57351	57356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543292
1118	NC_009513	ATC	2	6	57359	57364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543292
1119	NC_009513	AGC	2	6	57436	57441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543292
1120	NC_009513	TAC	2	6	57448	57453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543292
1121	NC_009513	A	6	6	57487	57492	100 %	0 %	0 %	0 %	148543292
1122	NC_009513	GAAC	2	8	57546	57553	50 %	0 %	25 %	25 %	148543292
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1124	NC_009513	GCA	2	6	57748	57753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543292
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1498	NC_009513	CCA	2	6	76374	76379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543303
1499	NC_009513	AGA	2	6	76397	76402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543303
1500	NC_009513	ATGA	2	8	76425	76432	50 %	25 %	25 %	0 %	148543303

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