MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009004	TTGCTG	2	12	419	430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	125622883
2	NC_009004	TTGAAG	2	12	1628	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622884
3	NC_009004	TGAAAG	2	12	1931	1942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	125622884
4	NC_009004	ATGTTG	2	12	4415	4426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	125622885
5	NC_009004	TCAAAA	2	12	7004	7015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	125622886
6	NC_009004	AAAATG	2	12	7155	7166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	125622886
7	NC_009004	AAGCCA	2	12	10232	10243	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	125622888
8	NC_009004	AAAGAT	2	12	11231	11242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	125622889
9	NC_009004	TAAAAA	2	12	12749	12760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	125622891
10	NC_009004	AATTGG	2	12	14831	14842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622894
11	NC_009004	TTGACA	2	12	17334	17345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	125622895
12	NC_009004	AAATCA	2	12	20707	20718	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	125622899
13	NC_009004	GTCGGA	2	12	24138	24149	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	125622902
14	NC_009004	GCGTGA	2	12	24680	24691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	125622902
15	NC_009004	ATGCAA	2	12	25312	25323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125622902
16	NC_009004	TTTCTT	2	12	36702	36713	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	125622911
17	NC_009004	AAAAGG	2	12	50879	50890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622936
18	NC_009004	GGAAAG	2	12	51351	51362	50 %	0 %	50 %	0 %	125622936
19	NC_009004	TGTTTG	2	12	57100	57111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622943
20	NC_009004	GATAAT	2	12	60019	60030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	125622945
21	NC_009004	TCAGAG	2	12	60238	60249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	125622945
22	NC_009004	AAGGAA	2	12	60297	60308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622945
23	NC_009004	TTCACC	2	12	67045	67056	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	125622951
24	NC_009004	GCAGGA	2	12	68231	68242	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	125622951
25	NC_009004	CTTCAA	2	12	71311	71322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622954
26	NC_009004	TATAAA	2	12	72211	72222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622955
27	NC_009004	GGTCAG	2	12	74266	74277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	125622958
28	NC_009004	TTGCTT	2	12	76220	76231	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125622960
29	NC_009004	TTGTTT	2	12	76529	76540	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	125622960
30	NC_009004	TTATTT	2	12	77668	77679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	125622961
31	NC_009004	TCCAAG	2	12	80337	80348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125622964
32	NC_009004	ACAAGA	2	12	82505	82516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	125622965
33	NC_009004	TAGGCT	2	12	82635	82646	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	125622966
34	NC_009004	CTTTAT	2	12	85553	85564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	125622968
35	NC_009004	AAGTTC	2	12	92443	92454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	125622976
36	NC_009004	CATTTG	2	12	94649	94660	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125622979
37	NC_009004	AAGCAA	2	12	94754	94765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	125622979
38	NC_009004	GGGAAT	2	12	95790	95801	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	125622980
39	NC_009004	ATCAAA	2	12	97891	97902	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	125622982
40	NC_009004	TTTTCG	2	12	98880	98891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125622983
41	NC_009004	AAAACC	2	12	100528	100539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622985
42	NC_009004	TGGACG	2	12	101019	101030	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	125622985
43	NC_009004	TGGGAC	2	12	103234	103245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	125622989
44	NC_009004	CAGTTG	2	12	104096	104107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	125622990
45	NC_009004	AGCTGA	2	12	107491	107502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	125622992
46	NC_009004	TTTATC	2	12	110282	110293	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	125622995
47	NC_009004	TATAAA	2	12	114991	115002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623001
48	NC_009004	TATGGG	2	12	122260	122271	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	125623006
49	NC_009004	TTCATA	2	12	140112	140123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	125623023
50	NC_009004	ATTGCT	2	12	142138	142149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125623025
51	NC_009004	TGCAGC	2	12	142221	142232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	125623025
52	NC_009004	TCATAA	2	12	145607	145618	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	125623032
53	NC_009004	CAAAAG	2	12	146143	146154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	125623033
54	NC_009004	GTTTAA	2	12	146834	146845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	125623034
55	NC_009004	CAAACC	2	12	149710	149721	50 %	0 %	0 %	50 %	125623037
56	NC_009004	ATTAAT	2	12	153863	153874	50 %	50 %	0 %	0 %	125623041
57	NC_009004	ATAATT	2	12	159082	159093	50 %	50 %	0 %	0 %	125623046
58	NC_009004	TTGCTT	2	12	165432	165443	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125623053
59	NC_009004	GTAAAG	2	12	170716	170727	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	125623056
60	NC_009004	GAATAC	2	12	173531	173542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125623062
61	NC_009004	TTTGAA	2	12	173982	173993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	125623062
62	NC_009004	TTCAGC	2	12	178304	178315	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	125623067
63	NC_009004	ATTGGG	2	12	179305	179316	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	125623067
64	NC_009004	AAATAG	2	12	181639	181650	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	125623069
65	NC_009004	AATCGA	2	12	182094	182105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125623070
66	NC_009004	TACCAT	2	12	185992	186003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623074
67	NC_009004	ATGTTT	2	12	186043	186054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	125623074
68	NC_009004	AAAAGA	2	12	187009	187020	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	125623075
69	NC_009004	AAGTAA	2	12	187794	187805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	125623075
70	NC_009004	CGAAGT	2	12	190689	190700	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	125623077
71	NC_009004	AGAAGT	2	12	192630	192641	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	125623079
72	NC_009004	GACTTT	2	12	192705	192716	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125623079
73	NC_009004	TCCAGA	2	12	195871	195882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125623083
74	NC_009004	GAAGGT	2	12	197646	197657	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	125623086
75	NC_009004	GAAAAC	2	12	198189	198200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	125623086
76	NC_009004	CTGAAT	2	12	198824	198835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	125623087
77	NC_009004	AAAAGC	2	12	199236	199247	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	125623087
78	NC_009004	AAAAAC	2	12	201581	201592	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	125623089
79	NC_009004	TTGCTT	2	12	204245	204256	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125623092
80	NC_009004	TAAAAA	2	12	209375	209386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	125623097
81	NC_009004	TGCAAC	2	12	211326	211337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125623099
82	NC_009004	AAAAAT	2	12	211745	211756	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	125623099
83	NC_009004	AAATAA	2	12	216620	216631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	125623103
84	NC_009004	ATTATG	2	12	216832	216843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	125623103
85	NC_009004	ACGTAA	2	12	238506	238517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125623127
86	NC_009004	CGTAAA	2	12	238531	238542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125623127
87	NC_009004	CCAGCC	2	12	241377	241388	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	125623130
88	NC_009004	AAGCTC	2	12	249698	249709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125623136
89	NC_009004	TGATTG	2	12	252550	252561	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	125623137
90	NC_009004	GTCATT	2	12	254656	254667	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125623139
91	NC_009004	AAGGCC	2	12	259857	259868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623143
92	NC_009004	TAACGA	2	12	261214	261225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125623144
93	NC_009004	TGGCAT	2	12	262124	262135	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	125623146
94	NC_009004	TTTGAT	2	12	263765	263776	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	125623149
95	NC_009004	TTTAAC	2	12	266892	266903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	125623153
96	NC_009004	TTGGTT	2	12	268181	268192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623154
97	NC_009004	CAAAAT	2	12	269477	269488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	125623154
98	NC_009004	ATTTCC	2	12	273964	273975	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	125623158
99	NC_009004	ATCTGC	2	12	274738	274749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	125623158
100	NC_009004	GGCTCA	2	12	280214	280225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	125623163
101	NC_009004	AAAAAC	2	12	285575	285586	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	125623168
102	NC_009004	GTCTTG	2	12	285719	285730	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	125623168
103	NC_009004	CTTGGT	2	12	287939	287950	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	125623169
104	NC_009004	CTTTTT	2	12	290702	290713	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	125623173
105	NC_009004	ATTTTT	2	12	300419	300430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	125623185
106	NC_009004	CCAACA	2	12	307498	307509	50 %	0 %	0 %	50 %	125623191
107	NC_009004	AACATC	2	12	309312	309323	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	125623193
108	NC_009004	AGGGAT	2	12	311289	311300	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	125623195
109	NC_009004	TTTAAA	2	12	317197	317208	50 %	50 %	0 %	0 %	125623199
110	NC_009004	TTGCTG	2	12	325325	325336	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	125623208
111	NC_009004	TAATTA	2	12	325926	325937	50 %	50 %	0 %	0 %	125623208
112	NC_009004	GATTTT	3	18	329725	329742	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	125623212
113	NC_009004	TTGCTT	2	12	330826	330837	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125623214
114	NC_009004	ATGATT	2	12	331959	331970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	125623214
115	NC_009004	GAAAAT	2	12	332067	332078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	125623214
116	NC_009004	GAAAAA	2	12	332877	332888	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	125623215
117	NC_009004	AAAAAG	2	12	337235	337246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	125623219
118	NC_009004	TTTTTG	2	12	338274	338285	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	125623221
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346	NC_009004	ACAGCA	2	12	977252	977263	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	125623848
347	NC_009004	ACACTT	2	12	977575	977586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623849
348	NC_009004	GGGAGA	2	12	979736	979747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125623851
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353	NC_009004	TGCCAT	2	12	996035	996046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	125623865
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442	NC_009004	GTATCC	2	12	1318152	1318163	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	125624162
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450	NC_009004	ATATTT	2	12	1348833	1348844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125624191
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453	NC_009004	AAGTCA	2	12	1354843	1354854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125624196
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456	NC_009004	ATCTTT	2	12	1360128	1360139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	125624202
457	NC_009004	TGGAGC	2	12	1360317	1360328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	125624202
458	NC_009004	CAACTT	2	12	1362140	1362151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125624206
459	NC_009004	CCTGAA	2	12	1365634	1365645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125624207
460	NC_009004	TTGTTC	2	12	1366803	1366814	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125624207
461	NC_009004	TTTATC	2	12	1368700	1368711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	125624210
462	NC_009004	TTAAGA	2	12	1369767	1369778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	125624213
463	NC_009004	ATCAAC	2	12	1370804	1370815	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	125624213
464	NC_009004	TGCTAT	2	12	1377941	1377952	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125624221
465	NC_009004	TTGCTT	2	12	1391287	1391298	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125624235
466	NC_009004	CAATGG	2	12	1393349	1393360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	125624237
467	NC_009004	ACCAGC	2	12	1393572	1393583	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	125624237
468	NC_009004	GTACTT	2	12	1400295	1400306	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125624243
469	NC_009004	ATATTT	2	12	1402470	1402481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125624244
470	NC_009004	TCAGCA	2	12	1406588	1406599	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125624249
471	NC_009004	GCTTGT	2	12	1412722	1412733	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	125624253
472	NC_009004	TCTGGA	2	12	1414387	1414398	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	125624256
473	NC_009004	TTTTTA	2	12	1416100	1416111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	125624256
474	NC_009004	ATTACT	2	12	1416556	1416567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	125624256
475	NC_009004	GCTTTT	2	12	1417491	1417502	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125624257
476	NC_009004	TTTTAT	2	12	1417948	1417959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	125624257
477	NC_009004	ATCTTC	2	12	1420270	1420281	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	125624259
478	NC_009004	ACCTGA	2	12	1424056	1424067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125624261
479	NC_009004	ATTTTC	2	12	1424270	1424281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	125624261
480	NC_009004	ACCATA	2	12	1424938	1424949	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	125624262
481	NC_009004	ACTTTT	2	12	1425178	1425189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	125624262
482	NC_009004	TCATTT	2	12	1427768	1427779	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	125624264
483	NC_009004	TCAATT	2	12	1428008	1428019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	125624264
484	NC_009004	TTCTTT	2	12	1428898	1428909	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	125624264
485	NC_009004	TAAAAG	2	12	1434501	1434512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	125624269
486	NC_009004	TCTGTT	2	12	1435842	1435853	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	125624270
487	NC_009004	CAATCC	2	12	1437324	1437335	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	125624271
488	NC_009004	CACGTT	2	12	1437681	1437692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	125624271
489	NC_009004	CAGTTT	2	12	1437741	1437752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125624271
490	NC_009004	TACCGA	2	12	1438702	1438713	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125624272
491	NC_009004	AAACCA	2	12	1441318	1441329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125624275
492	NC_009004	GCAATG	2	12	1442407	1442418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	125624275
493	NC_009004	CAAAAG	2	12	1443701	1443712	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	125624275
494	NC_009004	TTTCAA	2	12	1444418	1444429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	125624276
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498	NC_009004	TCAATC	2	12	1472414	1472425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125624308
499	NC_009004	CCAAAT	2	12	1473598	1473609	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	125624309
500	NC_009004	CAGTAC	2	12	1478999	1479010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125624312

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