MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 58349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008555	ATT	2	6	24056	24061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871444
502	NC_008555	AGTGAT	2	12	24074	24085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871444
503	NC_008555	T	6	6	24137	24142	0 %	100 %	0 %	0 %	116871444
504	NC_008555	GCA	2	6	24355	24360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871444
505	NC_008555	CATT	2	8	24424	24431	25 %	50 %	0 %	25 %	116871444
506	NC_008555	AAT	2	6	24434	24439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871444
507	NC_008555	GCT	2	6	24480	24485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871444
508	NC_008555	T	7	7	24512	24518	0 %	100 %	0 %	0 %	116871444
509	NC_008555	GTT	2	6	24542	24547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871444
510	NC_008555	TGT	2	6	24620	24625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871444
511	NC_008555	GGCT	2	8	24637	24644	0 %	25 %	50 %	25 %	116871444
512	NC_008555	TTA	2	6	24660	24665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871444
513	NC_008555	GCC	3	9	24681	24689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116871444
514	NC_008555	A	7	7	24761	24767	100 %	0 %	0 %	0 %	116871444
515	NC_008555	AAT	2	6	25068	25073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871445
516	NC_008555	A	6	6	25093	25098	100 %	0 %	0 %	0 %	116871445
517	NC_008555	ACA	2	6	25143	25148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871445
518	NC_008555	GTT	2	6	25149	25154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871445
519	NC_008555	ACA	2	6	25263	25268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871445
520	NC_008555	AAC	2	6	25446	25451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871445
521	NC_008555	TTAA	2	8	25470	25477	50 %	50 %	0 %	0 %	116871445
522	NC_008555	AAT	2	6	25605	25610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871445
523	NC_008555	AT	3	6	25694	25699	50 %	50 %	0 %	0 %	116871445
524	NC_008555	ATTGAA	2	12	25731	25742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116871445
525	NC_008555	A	6	6	25746	25751	100 %	0 %	0 %	0 %	116871445
526	NC_008555	ATTAT	2	10	25777	25786	40 %	60 %	0 %	0 %	116871446
527	NC_008555	GCA	2	6	25788	25793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871446
528	NC_008555	A	6	6	25817	25822	100 %	0 %	0 %	0 %	116871446
529	NC_008555	GAT	2	6	25832	25837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871446
530	NC_008555	AAC	2	6	25847	25852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871446
531	NC_008555	GCA	2	6	25860	25865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871446
532	NC_008555	AG	3	6	25904	25909	50 %	0 %	50 %	0 %	116871446
533	NC_008555	TAG	2	6	25951	25956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871446
534	NC_008555	TGGG	2	8	25963	25970	0 %	25 %	75 %	0 %	116871446
535	NC_008555	ATTA	2	8	26045	26052	50 %	50 %	0 %	0 %	116871446
536	NC_008555	ATT	2	6	26088	26093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871446
537	NC_008555	AAT	2	6	26133	26138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871446
538	NC_008555	GAT	2	6	26151	26156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871446
539	NC_008555	TGA	2	6	26206	26211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871447
540	NC_008555	CAA	2	6	26235	26240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871447
541	NC_008555	TTG	2	6	26277	26282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871447
542	NC_008555	A	6	6	26296	26301	100 %	0 %	0 %	0 %	116871447
543	NC_008555	A	6	6	26310	26315	100 %	0 %	0 %	0 %	116871447
544	NC_008555	AAT	2	6	26390	26395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871447
545	NC_008555	CAA	2	6	26411	26416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871447
546	NC_008555	CAA	2	6	26505	26510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871447
547	NC_008555	GCC	2	6	26520	26525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116871447
548	NC_008555	A	6	6	26531	26536	100 %	0 %	0 %	0 %	116871447
549	NC_008555	ATT	2	6	26574	26579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871447
550	NC_008555	A	6	6	26585	26590	100 %	0 %	0 %	0 %	116871447
551	NC_008555	A	6	6	26653	26658	100 %	0 %	0 %	0 %	116871447
552	NC_008555	TAA	2	6	26663	26668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871447
553	NC_008555	TTG	2	6	26711	26716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871448
554	NC_008555	TAA	2	6	26781	26786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871448
555	NC_008555	AGT	2	6	27175	27180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871448
556	NC_008555	AGT	2	6	27250	27255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871448
557	NC_008555	TTC	3	9	27267	27275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871448
558	NC_008555	CAA	2	6	27285	27290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871448
559	NC_008555	TCG	2	6	27297	27302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871448
560	NC_008555	ATT	2	6	27311	27316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871448
561	NC_008555	AGC	3	9	27325	27333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871448
562	NC_008555	CAAA	2	8	27397	27404	75 %	0 %	0 %	25 %	116871448
563	NC_008555	GAG	2	6	27455	27460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116871448
564	NC_008555	AGC	2	6	27527	27532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871449
565	NC_008555	GTTG	2	8	27541	27548	0 %	50 %	50 %	0 %	116871449
566	NC_008555	GCCA	2	8	27552	27559	25 %	0 %	25 %	50 %	116871449
567	NC_008555	ATG	2	6	27582	27587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871449
568	NC_008555	GAT	2	6	27642	27647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871449
569	NC_008555	ATG	2	6	27660	27665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871449
570	NC_008555	CAAT	2	8	27674	27681	50 %	25 %	0 %	25 %	116871449
571	NC_008555	T	6	6	27681	27686	0 %	100 %	0 %	0 %	116871449
572	NC_008555	GGT	2	6	27705	27710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871449
573	NC_008555	GAA	2	6	27738	27743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871449
574	NC_008555	AAAG	2	8	27749	27756	75 %	0 %	25 %	0 %	116871449
575	NC_008555	AAG	2	6	27763	27768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871449
576	NC_008555	CGA	2	6	27844	27849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871449
577	NC_008555	GCA	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871449
578	NC_008555	GTT	2	6	27900	27905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871449
579	NC_008555	CAGA	2	8	28000	28007	50 %	0 %	25 %	25 %	116871449
580	NC_008555	TC	3	6	28158	28163	0 %	50 %	0 %	50 %	116871449
581	NC_008555	A	7	7	28209	28215	100 %	0 %	0 %	0 %	116871449
582	NC_008555	TTA	2	6	28236	28241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871449
583	NC_008555	ATT	2	6	28257	28262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871449
584	NC_008555	T	6	6	28329	28334	0 %	100 %	0 %	0 %	116871450
585	NC_008555	AGC	2	6	28394	28399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871450
586	NC_008555	TAG	2	6	28405	28410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871450
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588	NC_008555	ACG	2	6	28426	28431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871450
589	NC_008555	GCA	3	9	28467	28475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871450
590	NC_008555	TTA	2	6	28519	28524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871450
591	NC_008555	GGA	2	6	28536	28541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116871450
592	NC_008555	ATG	2	6	28603	28608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871450
593	NC_008555	TTCT	2	8	28611	28618	0 %	75 %	0 %	25 %	116871450
594	NC_008555	ATTG	2	8	28688	28695	25 %	50 %	25 %	0 %	116871450
595	NC_008555	CAG	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871450
596	NC_008555	TTC	2	6	28739	28744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871450
597	NC_008555	CTTC	2	8	28852	28859	0 %	50 %	0 %	50 %	116871450
598	NC_008555	ACA	2	6	28877	28882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871450
599	NC_008555	AC	3	6	28924	28929	50 %	0 %	0 %	50 %	116871450
600	NC_008555	GGC	2	6	28959	28964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871450
601	NC_008555	TAA	2	6	29019	29024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871450
602	NC_008555	GAT	2	6	29071	29076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871451
603	NC_008555	AAG	2	6	29085	29090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871451
604	NC_008555	ACT	2	6	29105	29110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871451
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606	NC_008555	TCA	2	6	29224	29229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871451
607	NC_008555	A	7	7	29229	29235	100 %	0 %	0 %	0 %	116871451
608	NC_008555	TTAC	2	8	29277	29284	25 %	50 %	0 %	25 %	116871451
609	NC_008555	ATG	2	6	29303	29308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871451
610	NC_008555	TG	3	6	29307	29312	0 %	50 %	50 %	0 %	116871451
611	NC_008555	GTT	2	6	29351	29356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871451
612	NC_008555	AGC	2	6	29379	29384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871451
613	NC_008555	CAAT	2	8	29405	29412	50 %	25 %	0 %	25 %	116871451
614	NC_008555	TGA	2	6	29455	29460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871451
615	NC_008555	TGG	2	6	29533	29538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871451
616	NC_008555	AT	3	6	29584	29589	50 %	50 %	0 %	0 %	116871451
617	NC_008555	ATT	2	6	29612	29617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871451
618	NC_008555	CGG	2	6	29962	29967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871452
619	NC_008555	GT	3	6	29985	29990	0 %	50 %	50 %	0 %	116871452
620	NC_008555	AGT	2	6	30106	30111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871452
621	NC_008555	CAG	2	6	30168	30173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871452
622	NC_008555	GAAG	2	8	30182	30189	50 %	0 %	50 %	0 %	116871452
623	NC_008555	AGC	2	6	30271	30276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871452
624	NC_008555	GCA	2	6	30299	30304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871452
625	NC_008555	TGGC	2	8	30319	30326	0 %	25 %	50 %	25 %	116871452
626	NC_008555	TA	3	6	30347	30352	50 %	50 %	0 %	0 %	116871452
627	NC_008555	CTT	2	6	30385	30390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871452
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