MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 chromosome

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008531	TTGTAT	2	12	3864	3875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617178
2	NC_008531	CTGATA	2	12	5231	5242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617179
3	NC_008531	TATATT	2	12	6298	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116617179
4	NC_008531	ACTGTA	2	12	7428	7439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617180
5	NC_008531	ACAAGC	2	12	7967	7978	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116617180
6	NC_008531	TGAAGA	2	12	8195	8206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116617180
7	NC_008531	ATTAAT	2	12	20897	20908	50 %	50 %	0 %	0 %	116617191
8	NC_008531	TTATTG	2	12	30068	30079	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617193
9	NC_008531	AATTAA	2	12	30154	30165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116617193
10	NC_008531	AAAATA	2	12	33071	33082	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116617196
11	NC_008531	ATATGT	2	12	33158	33169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617197
12	NC_008531	TGATTT	2	12	36376	36387	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617199
13	NC_008531	CAAATG	2	12	38875	38886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617202
14	NC_008531	TACCAT	2	12	40662	40673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116617203
15	NC_008531	AAAAGT	2	12	41206	41217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617203
16	NC_008531	TATTGC	2	12	44620	44631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617208
17	NC_008531	GGTAAA	2	12	46065	46076	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116617210
18	NC_008531	ACAGCA	2	12	49541	49552	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116617213
19	NC_008531	TAGCAA	2	12	49581	49592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617213
20	NC_008531	AGCATT	2	12	50140	50151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617213
21	NC_008531	GCAAGA	2	12	51007	51018	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116617214
22	NC_008531	TGGCTG	2	12	56476	56487	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116617220
23	NC_008531	AATCTT	2	12	67090	67101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116617233
24	NC_008531	TAATTG	2	12	67275	67286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617233
25	NC_008531	TTGCCA	2	12	68463	68474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116617235
26	NC_008531	TGGATC	2	12	73397	73408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617238
27	NC_008531	GTAAAT	2	12	74209	74220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617240
28	NC_008531	TAAGAT	2	12	78211	78222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617248
29	NC_008531	GGTGCT	2	12	81270	81281	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116617252
30	NC_008531	TGAAAC	2	12	86915	86926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617256
31	NC_008531	ATGATA	2	12	89336	89347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617259
32	NC_008531	TTAGAT	2	12	92609	92620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617261
33	NC_008531	TTGCTA	2	12	101379	101390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617271
34	NC_008531	AATATT	2	12	101669	101680	50 %	50 %	0 %	0 %	116617271
35	NC_008531	AGAATA	2	12	101697	101708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617271
36	NC_008531	TGGTGA	2	12	110510	110521	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116617282
37	NC_008531	CATGAA	2	12	120838	120849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617291
38	NC_008531	TTAATG	2	12	126717	126728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617297
39	NC_008531	TATGAA	2	12	145222	145233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617313
40	NC_008531	TGTTAA	2	12	147246	147257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617314
41	NC_008531	TTAGAA	2	12	147412	147423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617314
42	NC_008531	TGAGGA	2	12	159440	159451	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116617317
43	NC_008531	TTGAGG	2	12	159859	159870	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116617317
44	NC_008531	GCTATT	2	12	161491	161502	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617318
45	NC_008531	TAAAAT	2	12	163148	163159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116617319
46	NC_008531	ATGTTG	2	12	173412	173423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617329
47	NC_008531	TGCATC	2	12	173536	173547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116617329
48	NC_008531	ATTGAA	2	12	176199	176210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617335
49	NC_008531	CTGTTG	2	12	177438	177449	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116617338
50	NC_008531	TATCGA	2	12	178239	178250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617340
51	NC_008531	ATTGTT	2	12	178866	178877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617341
52	NC_008531	TAAAGG	2	12	179973	179984	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116617343
53	NC_008531	CTTGGA	2	12	181086	181097	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617346
54	NC_008531	TTTATT	2	12	191088	191099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116617360
55	NC_008531	AAAATG	2	12	197695	197706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617368
56	NC_008531	TCGATG	2	12	198348	198359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617369
57	NC_008531	TCACAG	2	12	208500	208511	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116617378
58	NC_008531	GATACA	2	12	209744	209755	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617379
59	NC_008531	CTTTAT	2	12	212117	212128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116617381
60	NC_008531	TTAATT	2	12	218988	218999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116617387
61	NC_008531	AGGAGC	2	12	221286	221297	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116617389
62	NC_008531	CGAAGC	2	12	221495	221506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116617390
63	NC_008531	GTATGG	2	12	226561	226572	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116617397
64	NC_008531	TAAGGT	2	12	229017	229028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116617401
65	NC_008531	GGCTTG	2	12	229054	229065	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116617401
66	NC_008531	ATTTTG	2	12	229358	229369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617402
67	NC_008531	GTGAAG	2	12	229983	229994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116617403
68	NC_008531	AAGATA	2	12	234578	234589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617409
69	NC_008531	AATTGA	2	12	234816	234827	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617409
70	NC_008531	GCATTT	2	12	235476	235487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617410
71	NC_008531	TTTTAT	2	12	236203	236214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116617411
72	NC_008531	CAATTT	2	12	240682	240693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116617415
73	NC_008531	ATTTTG	2	12	249094	249105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617421
74	NC_008531	ATTTGG	2	12	251166	251177	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617423
75	NC_008531	ATGAAA	2	12	256813	256824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617428
76	NC_008531	CTAACG	2	12	259158	259169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116617430
77	NC_008531	GTTCCT	2	12	261370	261381	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116617432
78	NC_008531	GCATTT	2	12	262532	262543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617433
79	NC_008531	ATTTTG	2	12	263032	263043	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617434
80	NC_008531	GCATTC	2	12	264034	264045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116617436
81	NC_008531	TTGCAA	2	12	267086	267097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617440
82	NC_008531	CAAACA	2	12	274098	274109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116617447
83	NC_008531	TGATAT	2	12	274518	274529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617448
84	NC_008531	GAAAAA	2	12	277117	277128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116617448
85	NC_008531	CTTCAA	2	12	281182	281193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116617452
86	NC_008531	ACAGAA	2	12	283661	283672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116617454
87	NC_008531	CATGGC	2	12	284983	284994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116617454
88	NC_008531	GATTAT	2	12	287951	287962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617457
89	NC_008531	AATATG	2	12	289156	289167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617458
90	NC_008531	TTAACA	2	12	296057	296068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116617465
91	NC_008531	TTAAAC	2	12	296812	296823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116617466
92	NC_008531	ATTGGT	2	12	309676	309687	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617480
93	NC_008531	TTTCAG	2	12	314038	314049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617483
94	NC_008531	TCATAT	2	12	317218	317229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116617486
95	NC_008531	AGATAT	2	12	317360	317371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617487
96	NC_008531	GTATCG	2	12	323307	323318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617495
97	NC_008531	TGGATT	2	12	327623	327634	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617499
98	NC_008531	ATGGTA	2	12	329846	329857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116617502
99	NC_008531	TGGGCA	2	12	330396	330407	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116617502
100	NC_008531	TTGTTC	2	12	335585	335596	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116617507
101	NC_008531	ATTGGT	2	12	335689	335700	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617507
102	NC_008531	TCATTT	2	12	338224	338235	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116617509
103	NC_008531	CAGTTT	2	12	345074	345085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617514
104	NC_008531	AATTAT	2	12	347180	347191	50 %	50 %	0 %	0 %	116617515
105	NC_008531	ATATGA	2	12	347964	347975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617516
106	NC_008531	GGTGCT	2	12	351206	351217	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116617517
107	NC_008531	GTTGAA	3	18	353616	353633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116617519
108	NC_008531	TAGTTC	2	12	360899	360910	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617526
109	NC_008531	GTTGGT	2	12	363454	363465	0 %	50 %	50 %	0 %	116617528
110	NC_008531	TGCTAT	2	12	364443	364454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617528
111	NC_008531	TGGACA	2	12	367937	367948	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116617531
112	NC_008531	AATGTT	2	12	369689	369700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617533
113	NC_008531	GTTTGC	2	12	373387	373398	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116617536
114	NC_008531	CAAAAA	2	12	377091	377102	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116617539
115	NC_008531	CAGTTG	2	12	380825	380836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617542
116	NC_008531	AAAAAG	2	12	380972	380983	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116617542
117	NC_008531	TTGTCT	2	12	386993	387004	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116617549
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228	NC_008531	ATTCGT	2	12	696236	696247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617835
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452	NC_008531	TTTGCA	2	12	1376625	1376636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116618485
453	NC_008531	GCCATT	2	12	1378232	1378243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116618487
454	NC_008531	TCATTA	2	12	1379807	1379818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116618490
455	NC_008531	TTTCAA	2	12	1387445	1387456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116618495
456	NC_008531	CGTAAA	2	12	1387856	1387867	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116618495
457	NC_008531	ATCTGT	2	12	1389489	1389500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116618497
458	NC_008531	TATTTG	2	12	1390189	1390200	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116618498
459	NC_008531	ATAATC	2	12	1391054	1391065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116618499
460	NC_008531	CCATTA	2	12	1404869	1404880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116618506
461	NC_008531	CAGACC	2	12	1405560	1405571	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116618506
462	NC_008531	CCCCAT	2	12	1405594	1405605	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	116618506
463	NC_008531	ATGATT	2	12	1410875	1410886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116618511
464	NC_008531	TAGCTG	2	12	1411032	1411043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116618511
465	NC_008531	ACCATT	2	12	1412135	1412146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116618512
466	NC_008531	AGTATG	2	12	1417109	1417120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116618517
467	NC_008531	ATTTCA	2	12	1417825	1417836	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116618518
468	NC_008531	TATAAC	2	12	1423350	1423361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116618522
469	NC_008531	TGTAAA	2	12	1426260	1426271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116618525
470	NC_008531	TAAAAT	2	12	1429087	1429098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116618527
471	NC_008531	TAACCA	2	12	1429814	1429825	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116618529
472	NC_008531	AAGCTG	2	12	1437433	1437444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116618537
473	NC_008531	ATAAAA	2	12	1441673	1441684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116618543
474	NC_008531	GGTGCT	2	12	1449793	1449804	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116618551
475	NC_008531	ACGCGT	2	12	1452628	1452639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116618552
476	NC_008531	CAGCTG	2	12	1454643	1454654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116618554
477	NC_008531	AATGCA	2	12	1454867	1454878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116618554
478	NC_008531	TTTCCT	2	12	1456895	1456906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116618555
479	NC_008531	AATTGC	2	12	1458285	1458296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618557
480	NC_008531	CCAGCA	2	12	1459607	1459618	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116618558
481	NC_008531	TCAATG	2	12	1461692	1461703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618560
482	NC_008531	TTCAAG	2	12	1463153	1463164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618562
483	NC_008531	ATTGCA	2	12	1463458	1463469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618562
484	NC_008531	ATGGGC	2	12	1469824	1469835	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116618569
485	NC_008531	TGCTAT	2	12	1472214	1472225	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116618571
486	NC_008531	CTAATA	2	12	1473689	1473700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116618574
487	NC_008531	GACCAT	2	12	1487174	1487185	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116618581
488	NC_008531	TTCAGC	2	12	1487241	1487252	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116618581
489	NC_008531	CAGCAT	2	12	1488455	1488466	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116618582
490	NC_008531	CACTAT	2	12	1497685	1497696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116618592
491	NC_008531	TTTCTT	2	12	1499062	1499073	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116618592
492	NC_008531	ACTTTA	2	12	1502886	1502897	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116618598
493	NC_008531	CATCCA	2	12	1504852	1504863	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116618601
494	NC_008531	CAATAT	2	12	1507001	1507012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116618604
495	NC_008531	CTAGAA	2	12	1507372	1507383	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116618605
496	NC_008531	TGAATA	2	12	1508035	1508046	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116618605
497	NC_008531	TGCGTC	2	12	1508704	1508715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116618605
498	NC_008531	TAATTT	2	12	1510030	1510041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116618607
499	NC_008531	AACCAA	2	12	1518989	1519000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116618615
500	NC_008531	CATCAG	2	12	1520818	1520829	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116618616

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