MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 37401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_008530	AGC	2	6	202607	202612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628846
4003	NC_008530	T	7	7	202628	202634	0 %	100 %	0 %	0 %	116628846
4004	NC_008530	AT	3	6	202638	202643	50 %	50 %	0 %	0 %	116628846
4005	NC_008530	ATT	2	6	202863	202868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628847
4006	NC_008530	GT	3	6	202882	202887	0 %	50 %	50 %	0 %	116628847
4007	NC_008530	TCA	2	6	202965	202970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628847
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4009	NC_008530	ATT	2	6	203287	203292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628848
4010	NC_008530	T	6	6	203327	203332	0 %	100 %	0 %	0 %	116628848
4011	NC_008530	ATG	2	6	203396	203401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628848
4012	NC_008530	ATA	2	6	203411	203416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628848
4013	NC_008530	A	6	6	203443	203448	100 %	0 %	0 %	0 %	116628848
4014	NC_008530	TCG	2	6	203637	203642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628848
4015	NC_008530	GTT	2	6	203701	203706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628848
4016	NC_008530	ATG	2	6	203755	203760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628848
4017	NC_008530	TCT	2	6	203822	203827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628848
4018	NC_008530	ATT	2	6	203910	203915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628848
4019	NC_008530	ACTTA	2	10	203958	203967	40 %	40 %	0 %	20 %	116628848
4020	NC_008530	TAT	2	6	203996	204001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628848
4021	NC_008530	ATT	2	6	204004	204009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628848
4022	NC_008530	ATT	2	6	204025	204030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628848
4023	NC_008530	ATT	2	6	204085	204090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628848
4024	NC_008530	GGT	2	6	204100	204105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628848
4025	NC_008530	ACT	2	6	204111	204116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628848
4026	NC_008530	TA	3	6	204152	204157	50 %	50 %	0 %	0 %	116628848
4027	NC_008530	TAT	2	6	204183	204188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628848
4028	NC_008530	A	6	6	204196	204201	100 %	0 %	0 %	0 %	116628848
4029	NC_008530	T	7	7	204247	204253	0 %	100 %	0 %	0 %	116628849
4030	NC_008530	A	7	7	204310	204316	100 %	0 %	0 %	0 %	116628849
4031	NC_008530	GCA	2	6	204397	204402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628849
4032	NC_008530	TAT	2	6	204441	204446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628849
4033	NC_008530	TAT	2	6	204508	204513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628849
4034	NC_008530	TTAATT	2	12	204523	204534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628849
4035	NC_008530	TGA	2	6	204545	204550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628849
4036	NC_008530	TAT	2	6	204599	204604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628849
4037	NC_008530	AAT	2	6	204634	204639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628849
4038	NC_008530	ATT	2	6	204673	204678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628849
4039	NC_008530	TGA	2	6	204686	204691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628849
4040	NC_008530	CTA	2	6	204807	204812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628849
4041	NC_008530	CTT	2	6	204860	204865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628849
4042	NC_008530	AAT	2	6	204942	204947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628849
4043	NC_008530	AAT	2	6	204954	204959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628849
4044	NC_008530	ATTT	2	8	205208	205215	25 %	75 %	0 %	0 %	116628850
4045	NC_008530	GGT	2	6	205284	205289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628850
4046	NC_008530	AT	3	6	205319	205324	50 %	50 %	0 %	0 %	116628850
4047	NC_008530	A	6	6	205333	205338	100 %	0 %	0 %	0 %	116628850
4048	NC_008530	TGCT	2	8	205405	205412	0 %	50 %	25 %	25 %	116628850
4049	NC_008530	AAGCT	2	10	205435	205444	40 %	20 %	20 %	20 %	116628850
4050	NC_008530	ATTA	2	8	205469	205476	50 %	50 %	0 %	0 %	116628850
4051	NC_008530	GTT	2	6	205482	205487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628850
4052	NC_008530	CAA	2	6	205523	205528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628850
4053	NC_008530	ATT	2	6	205548	205553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628850
4054	NC_008530	AGT	2	6	205617	205622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628850
4055	NC_008530	TCT	2	6	205630	205635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628850
4056	NC_008530	GAAA	2	8	205706	205713	75 %	0 %	25 %	0 %	116628850
4057	NC_008530	GTG	2	6	205729	205734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628850
4058	NC_008530	TGC	2	6	205757	205762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628850
4059	NC_008530	TTCT	2	8	205774	205781	0 %	75 %	0 %	25 %	116628850
4060	NC_008530	GAAAA	2	10	205869	205878	80 %	0 %	20 %	0 %	116628850
4061	NC_008530	ATTA	2	8	205916	205923	50 %	50 %	0 %	0 %	116628850
4062	NC_008530	ATT	2	6	205946	205951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628850
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4068	NC_008530	ATGAA	2	10	206431	206440	60 %	20 %	20 %	0 %	116628851
4069	NC_008530	ACA	2	6	206441	206446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628851
4070	NC_008530	GAC	2	6	206490	206495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628851
4071	NC_008530	ATG	2	6	206521	206526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628851
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4073	NC_008530	TGA	2	6	206840	206845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628851
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4081	NC_008530	ATA	2	6	207254	207259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628852
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4088	NC_008530	AG	3	6	207633	207638	50 %	0 %	50 %	0 %	116628852
4089	NC_008530	TGG	2	6	207675	207680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628852
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4095	NC_008530	TTACCT	2	12	207809	207820	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116628852
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4104	NC_008530	GTG	2	6	208283	208288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628852
4105	NC_008530	TAC	2	6	208303	208308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628852
4106	NC_008530	TTA	2	6	208353	208358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628852
4107	NC_008530	ATGA	2	8	208359	208366	50 %	25 %	25 %	0 %	116628852
4108	NC_008530	GTT	2	6	208559	208564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628853
4109	NC_008530	CT	3	6	208574	208579	0 %	50 %	0 %	50 %	116628853
4110	NC_008530	CATT	2	8	208635	208642	25 %	50 %	0 %	25 %	116628853
4111	NC_008530	GGT	2	6	208665	208670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628853
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4113	NC_008530	TTGG	2	8	208831	208838	0 %	50 %	50 %	0 %	116628853
4114	NC_008530	TTG	2	6	208900	208905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628853
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4118	NC_008530	TTTA	2	8	209320	209327	25 %	75 %	0 %	0 %	116628854
4119	NC_008530	ATT	2	6	209333	209338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628854
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4121	NC_008530	TGT	2	6	209403	209408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628854
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4244	NC_008530	GAA	2	6	215655	215660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628857
4245	NC_008530	AT	3	6	215665	215670	50 %	50 %	0 %	0 %	116628857
4246	NC_008530	GAATG	2	10	215699	215708	40 %	20 %	40 %	0 %	116628857
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4251	NC_008530	TCG	2	6	216079	216084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628858
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4365	NC_008530	CAT	2	6	221145	221150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628864
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4394	NC_008530	GAA	2	6	222556	222561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628865
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4485	NC_008530	TGC	2	6	226940	226945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628871
4486	NC_008530	TAA	2	6	227006	227011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628871
4487	NC_008530	CTG	2	6	227026	227031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628871
4488	NC_008530	CAAG	2	8	227034	227041	50 %	0 %	25 %	25 %	116628871
4489	NC_008530	ATA	2	6	227043	227048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628871
4490	NC_008530	ATA	2	6	227061	227066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628871
4491	NC_008530	TCTT	2	8	227228	227235	0 %	75 %	0 %	25 %	116628872
4492	NC_008530	AGC	2	6	227242	227247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628872
4493	NC_008530	TGT	2	6	227265	227270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628872
4494	NC_008530	GCC	2	6	227347	227352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628872
4495	NC_008530	CTG	2	6	227373	227378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628872
4496	NC_008530	AGG	2	6	227410	227415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628872
4497	NC_008530	AAGT	2	8	227438	227445	50 %	25 %	25 %	0 %	116628872
4498	NC_008530	AAG	2	6	227471	227476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628872
4499	NC_008530	AGC	2	6	227596	227601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628872
4500	NC_008530	AAGATA	2	12	227606	227617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116628872

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