MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11

Total Repeats: 1426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008527	AAAGT	2	10	4081	4090	60 %	20 %	20 %	0 %	116510846
2	NC_008527	GTCTT	2	10	4776	4785	0 %	60 %	20 %	20 %	116510846
3	NC_008527	GAAAA	2	10	7694	7703	80 %	0 %	20 %	0 %	116510847
4	NC_008527	ATGGT	2	10	12877	12886	20 %	40 %	40 %	0 %	116510852
5	NC_008527	ATTTT	2	10	15279	15288	20 %	80 %	0 %	0 %	116510854
6	NC_008527	TGCGA	2	10	16534	16543	20 %	20 %	40 %	20 %	116510854
7	NC_008527	TACTT	2	10	17179	17188	20 %	60 %	0 %	20 %	116510854
8	NC_008527	TGATT	2	10	19246	19255	20 %	60 %	20 %	0 %	116510857
9	NC_008527	TTTGG	2	10	22600	22609	0 %	60 %	40 %	0 %	116510860
10	NC_008527	TGGTA	2	10	24541	24550	20 %	40 %	40 %	0 %	116510861
11	NC_008527	TGGCT	2	10	26538	26547	0 %	40 %	40 %	20 %	116510862
12	NC_008527	ATTTT	2	10	26633	26642	20 %	80 %	0 %	0 %	116510862
13	NC_008527	AGAGA	2	10	27551	27560	60 %	0 %	40 %	0 %	116510862
14	NC_008527	TATAA	2	10	35425	35434	60 %	40 %	0 %	0 %	116510871
15	NC_008527	TAGAG	2	10	36745	36754	40 %	20 %	40 %	0 %	116510874
16	NC_008527	TAAGC	2	10	37491	37500	40 %	20 %	20 %	20 %	116510875
17	NC_008527	TGGAT	2	10	38054	38063	20 %	40 %	40 %	0 %	116510876
18	NC_008527	AAAAG	2	10	38520	38529	80 %	0 %	20 %	0 %	116510877
19	NC_008527	TCAAA	2	10	38688	38697	60 %	20 %	0 %	20 %	116510877
20	NC_008527	GTGAG	2	10	40260	40269	20 %	20 %	60 %	0 %	116510879
21	NC_008527	TTTAT	2	10	41301	41310	20 %	80 %	0 %	0 %	116510880
22	NC_008527	AATTA	2	10	41675	41684	60 %	40 %	0 %	0 %	116510880
23	NC_008527	ATTAT	2	10	41948	41957	40 %	60 %	0 %	0 %	116510880
24	NC_008527	AATCA	2	10	43788	43797	60 %	20 %	0 %	20 %	116510882
25	NC_008527	TTTAA	2	10	44383	44392	40 %	60 %	0 %	0 %	116510882
26	NC_008527	GCTTG	2	10	47469	47478	0 %	40 %	40 %	20 %	116510885
27	NC_008527	TCCAT	2	10	47820	47829	20 %	40 %	0 %	40 %	116510885
28	NC_008527	AAAAT	2	10	51732	51741	80 %	20 %	0 %	0 %	116510889
29	NC_008527	ATTAA	2	10	54714	54723	60 %	40 %	0 %	0 %	116510892
30	NC_008527	CAAGC	2	10	59822	59831	40 %	0 %	20 %	40 %	116510896
31	NC_008527	CCATT	2	10	62062	62071	20 %	40 %	0 %	40 %	116510898
32	NC_008527	ACAAG	2	10	63285	63294	60 %	0 %	20 %	20 %	116510900
33	NC_008527	TCCAA	2	10	63441	63450	40 %	20 %	0 %	40 %	116510900
34	NC_008527	TGAGT	2	10	65806	65815	20 %	40 %	40 %	0 %	116510902
35	NC_008527	AATTT	2	10	68748	68757	40 %	60 %	0 %	0 %	116510906
36	NC_008527	ACTGG	2	10	69579	69588	20 %	20 %	40 %	20 %	116510907
37	NC_008527	TTATT	2	10	72366	72375	20 %	80 %	0 %	0 %	116510911
38	NC_008527	TTGCT	2	10	73853	73862	0 %	60 %	20 %	20 %	116510912
39	NC_008527	ACGAG	2	10	75184	75193	40 %	0 %	40 %	20 %	116510914
40	NC_008527	TGAGT	2	10	75227	75236	20 %	40 %	40 %	0 %	116510914
41	NC_008527	GCAGA	2	10	75842	75851	40 %	0 %	40 %	20 %	116510915
42	NC_008527	TTTTA	2	10	78396	78405	20 %	80 %	0 %	0 %	116510918
43	NC_008527	AAGCT	2	10	78569	78578	40 %	20 %	20 %	20 %	116510918
44	NC_008527	TGGAT	2	10	79564	79573	20 %	40 %	40 %	0 %	116510919
45	NC_008527	CAAGA	2	10	82950	82959	60 %	0 %	20 %	20 %	116510924
46	NC_008527	AAAGA	2	10	87439	87448	80 %	0 %	20 %	0 %	116510926
47	NC_008527	AGAGT	2	10	87849	87858	40 %	20 %	40 %	0 %	116510927
48	NC_008527	TGGTT	2	10	88522	88531	0 %	60 %	40 %	0 %	116510927
49	NC_008527	ATTTG	2	10	88857	88866	20 %	60 %	20 %	0 %	116510928
50	NC_008527	TCGTA	2	10	91589	91598	20 %	40 %	20 %	20 %	116510930
51	NC_008527	GATTT	2	10	95442	95451	20 %	60 %	20 %	0 %	116510932
52	NC_008527	TCAAA	2	10	97872	97881	60 %	20 %	0 %	20 %	116510935
53	NC_008527	TCGCA	2	10	101501	101510	20 %	20 %	20 %	40 %	116510939
54	NC_008527	TATTC	2	10	102335	102344	20 %	60 %	0 %	20 %	116510940
55	NC_008527	TTTTA	2	10	104509	104518	20 %	80 %	0 %	0 %	116510943
56	NC_008527	CTCTA	2	10	105666	105675	20 %	40 %	0 %	40 %	116510944
57	NC_008527	ATTTT	2	10	109152	109161	20 %	80 %	0 %	0 %	116510947
58	NC_008527	TTGTC	2	10	109532	109541	0 %	60 %	20 %	20 %	116510947
59	NC_008527	TAGAG	2	10	111744	111753	40 %	20 %	40 %	0 %	116510951
60	NC_008527	TGGAT	2	10	114059	114068	20 %	40 %	40 %	0 %	116510952
61	NC_008527	GAAGG	2	10	114138	114147	40 %	0 %	60 %	0 %	116510952
62	NC_008527	AATTA	2	10	115040	115049	60 %	40 %	0 %	0 %	116510952
63	NC_008527	ATTTT	2	10	115946	115955	20 %	80 %	0 %	0 %	116510953
64	NC_008527	TTTTC	2	10	117250	117259	0 %	80 %	0 %	20 %	116510954
65	NC_008527	CCAAA	2	10	117795	117804	60 %	0 %	0 %	40 %	116510954
66	NC_008527	TGGCT	2	10	118760	118769	0 %	40 %	40 %	20 %	116510956
67	NC_008527	CAAAT	2	10	119339	119348	60 %	20 %	0 %	20 %	116510957
68	NC_008527	TTTTA	2	10	119611	119620	20 %	80 %	0 %	0 %	116510957
69	NC_008527	CAGGT	2	10	121814	121823	20 %	20 %	40 %	20 %	116510960
70	NC_008527	GTTTG	2	10	121875	121884	0 %	60 %	40 %	0 %	116510960
71	NC_008527	TTATT	2	10	123329	123338	20 %	80 %	0 %	0 %	116510963
72	NC_008527	TAAAA	2	10	125176	125185	80 %	20 %	0 %	0 %	116510966
73	NC_008527	TTAAC	2	10	132709	132718	40 %	40 %	0 %	20 %	116510975
74	NC_008527	AAACA	2	10	133465	133474	80 %	0 %	0 %	20 %	116510975
75	NC_008527	GAAAT	2	10	134221	134230	60 %	20 %	20 %	0 %	116510975
76	NC_008527	TTCAC	2	10	136591	136600	20 %	40 %	0 %	40 %	116510975
77	NC_008527	TTCAC	2	10	136876	136885	20 %	40 %	0 %	40 %	116510975
78	NC_008527	AAGAA	2	10	137944	137953	80 %	0 %	20 %	0 %	116510975
79	NC_008527	AATAT	2	10	139657	139666	60 %	40 %	0 %	0 %	116510977
80	NC_008527	AAAGA	2	10	139794	139803	80 %	0 %	20 %	0 %	116510977
81	NC_008527	AAATA	2	10	140044	140053	80 %	20 %	0 %	0 %	116510977
82	NC_008527	CTTCC	2	10	140621	140630	0 %	40 %	0 %	60 %	116510978
83	NC_008527	ATGGA	2	10	142341	142350	40 %	20 %	40 %	0 %	116510981
84	NC_008527	TACAG	2	10	142676	142685	40 %	20 %	20 %	20 %	116510981
85	NC_008527	TAATT	2	10	153078	153087	40 %	60 %	0 %	0 %	116510992
86	NC_008527	TACAA	2	10	154020	154029	60 %	20 %	0 %	20 %	116510993
87	NC_008527	TGATT	2	10	156398	156407	20 %	60 %	20 %	0 %	116510995
88	NC_008527	GATTG	2	10	157790	157799	20 %	40 %	40 %	0 %	116510996
89	NC_008527	AGCCA	2	10	159895	159904	40 %	0 %	20 %	40 %	116510998
90	NC_008527	TTGGC	2	10	160790	160799	0 %	40 %	40 %	20 %	116510998
91	NC_008527	CCAAA	2	10	166928	166937	60 %	0 %	0 %	40 %	116511005
92	NC_008527	GTAAA	2	10	169125	169134	60 %	20 %	20 %	0 %	116511008
93	NC_008527	AAATT	2	10	170279	170288	60 %	40 %	0 %	0 %	116511009
94	NC_008527	TAAAT	2	10	172072	172081	60 %	40 %	0 %	0 %	116511011
95	NC_008527	TCCTT	2	10	177466	177475	0 %	60 %	0 %	40 %	116511017
96	NC_008527	AAAAT	2	10	177481	177490	80 %	20 %	0 %	0 %	116511017
97	NC_008527	ACTAA	2	10	177520	177529	60 %	20 %	0 %	20 %	116511017
98	NC_008527	AAAAG	2	10	178020	178029	80 %	0 %	20 %	0 %	116511017
99	NC_008527	TGATT	2	10	187120	187129	20 %	60 %	20 %	0 %	116511028
100	NC_008527	CTTAT	2	10	187362	187371	20 %	60 %	0 %	20 %	116511028
101	NC_008527	TGGAA	2	10	189182	189191	40 %	20 %	40 %	0 %	116511030
102	NC_008527	TGATT	2	10	189261	189270	20 %	60 %	20 %	0 %	116511030
103	NC_008527	AATTA	2	10	190153	190162	60 %	40 %	0 %	0 %	116511031
104	NC_008527	TTAAT	2	10	191261	191270	40 %	60 %	0 %	0 %	116511032
105	NC_008527	CATGA	2	10	192362	192371	40 %	20 %	20 %	20 %	116511033
106	NC_008527	AAAGA	2	10	192936	192945	80 %	0 %	20 %	0 %	116511033
107	NC_008527	AGTAA	2	10	193233	193242	60 %	20 %	20 %	0 %	116511034
108	NC_008527	ATCCA	2	10	193909	193918	40 %	20 %	0 %	40 %	116511034
109	NC_008527	TCTTA	2	10	193942	193951	20 %	60 %	0 %	20 %	116511034
110	NC_008527	CCTTG	2	10	194207	194216	0 %	40 %	20 %	40 %	116511034
111	NC_008527	TTAAT	2	10	194853	194862	40 %	60 %	0 %	0 %	116511035
112	NC_008527	TTCCT	2	10	195958	195967	0 %	60 %	0 %	40 %	116511036
113	NC_008527	GATTG	2	10	196440	196449	20 %	40 %	40 %	0 %	116511036
114	NC_008527	AGAAA	2	10	200448	200457	80 %	0 %	20 %	0 %	116511040
115	NC_008527	TTTTA	2	10	202036	202045	20 %	80 %	0 %	0 %	116511042
116	NC_008527	TGATT	2	10	203332	203341	20 %	60 %	20 %	0 %	116511043
117	NC_008527	AAAGA	2	10	204043	204052	80 %	0 %	20 %	0 %	116511044
118	NC_008527	CAACA	2	10	206431	206440	60 %	0 %	0 %	40 %	116511045
119	NC_008527	ATATT	2	10	207807	207816	40 %	60 %	0 %	0 %	116511046
120	NC_008527	GGGAT	2	10	211686	211695	20 %	20 %	60 %	0 %	116511049
121	NC_008527	TGAGT	2	10	215095	215104	20 %	40 %	40 %	0 %	116511052
122	NC_008527	TGAGA	2	10	217381	217390	40 %	20 %	40 %	0 %	116511057
123	NC_008527	AGTAA	2	10	219154	219163	60 %	20 %	20 %	0 %	116511059
124	NC_008527	GCGAG	2	10	219324	219333	20 %	0 %	60 %	20 %	116511060
125	NC_008527	CTTGT	2	10	219372	219381	0 %	60 %	20 %	20 %	116511060
126	NC_008527	TTGTA	2	10	223533	223542	20 %	60 %	20 %	0 %	116511064
127	NC_008527	GATTT	2	10	223651	223660	20 %	60 %	20 %	0 %	116511065
128	NC_008527	ATTTT	2	10	223856	223865	20 %	80 %	0 %	0 %	116511065
129	NC_008527	TCAAG	2	10	225530	225539	40 %	20 %	20 %	20 %	116511067
130	NC_008527	AAAAT	2	10	226917	226926	80 %	20 %	0 %	0 %	116511068
131	NC_008527	CTAGT	2	10	228185	228194	20 %	40 %	20 %	20 %	116511069
132	NC_008527	GGAGT	2	10	231673	231682	20 %	20 %	60 %	0 %	116511074
133	NC_008527	TCATG	2	10	238159	238168	20 %	40 %	20 %	20 %	116511077
134	NC_008527	TGAGA	2	10	238329	238338	40 %	20 %	40 %	0 %	116511077
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