MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 1511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008526	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	116493575
2	NC_008526	CAACG	2	10	1773	1782	40 %	0 %	20 %	40 %	116493576
3	NC_008526	GAAGA	2	10	4921	4930	60 %	0 %	40 %	0 %	116493579
4	NC_008526	GGCAC	2	10	5407	5416	20 %	0 %	40 %	40 %	116493579
5	NC_008526	GACAA	2	10	5681	5690	60 %	0 %	20 %	20 %	116493579
6	NC_008526	GAAAA	2	10	7766	7775	80 %	0 %	20 %	0 %	116493580
7	NC_008526	GACAA	2	10	8892	8901	60 %	0 %	20 %	20 %	116493580
8	NC_008526	CATTT	2	10	10006	10015	20 %	60 %	0 %	20 %	116493581
9	NC_008526	AGCCA	2	10	18403	18412	40 %	0 %	20 %	40 %	116493592
10	NC_008526	TGGCT	2	10	20913	20922	0 %	40 %	40 %	20 %	116493594
11	NC_008526	GCTTT	2	10	22465	22474	0 %	60 %	20 %	20 %	116493595
12	NC_008526	CAGCG	2	10	23112	23121	20 %	0 %	40 %	40 %	116493595
13	NC_008526	TCCTG	2	10	26054	26063	0 %	40 %	20 %	40 %	116493598
14	NC_008526	TTGTT	2	10	26843	26852	0 %	80 %	20 %	0 %	116493599
15	NC_008526	AAGCC	2	10	27629	27638	40 %	0 %	20 %	40 %	116493600
16	NC_008526	CAAAG	2	10	28473	28482	60 %	0 %	20 %	20 %	116493601
17	NC_008526	AGCGA	2	10	35297	35306	40 %	0 %	40 %	20 %	116493608
18	NC_008526	AGCCA	2	10	37310	37319	40 %	0 %	20 %	40 %	116493611
19	NC_008526	GTCTT	2	10	42326	42335	0 %	60 %	20 %	20 %	116493617
20	NC_008526	TTGGC	2	10	42365	42374	0 %	40 %	40 %	20 %	116493617
21	NC_008526	GAAAA	2	10	45836	45845	80 %	0 %	20 %	0 %	116493622
22	NC_008526	TTGAA	2	10	46261	46270	40 %	40 %	20 %	0 %	116493622
23	NC_008526	ATAAA	2	10	46407	46416	80 %	20 %	0 %	0 %	116493622
24	NC_008526	AGCCA	2	10	47150	47159	40 %	0 %	20 %	40 %	116493623
25	NC_008526	TCAAT	2	10	48326	48335	40 %	40 %	0 %	20 %	116493624
26	NC_008526	ATGAA	2	10	49077	49086	60 %	20 %	20 %	0 %	116493625
27	NC_008526	TGTTT	2	10	55338	55347	0 %	80 %	20 %	0 %	116493631
28	NC_008526	GCGCC	2	10	56842	56851	0 %	0 %	40 %	60 %	116493632
29	NC_008526	CAGTT	2	10	59314	59323	20 %	40 %	20 %	20 %	116493633
30	NC_008526	TTGAT	2	10	66349	66358	20 %	60 %	20 %	0 %	116493642
31	NC_008526	TTGCT	2	10	66442	66451	0 %	60 %	20 %	20 %	116493642
32	NC_008526	CGTTT	2	10	68342	68351	0 %	60 %	20 %	20 %	116493644
33	NC_008526	TAAGT	2	10	72100	72109	40 %	40 %	20 %	0 %	116493648
34	NC_008526	TCATC	2	10	73649	73658	20 %	40 %	0 %	40 %	116493650
35	NC_008526	GAAGC	2	10	77069	77078	40 %	0 %	40 %	20 %	116493652
36	NC_008526	TGGCA	2	10	77236	77245	20 %	20 %	40 %	20 %	116493652
37	NC_008526	GTTTC	2	10	80018	80027	0 %	60 %	20 %	20 %	116493655
38	NC_008526	AAGAA	2	10	80588	80597	80 %	0 %	20 %	0 %	116493656
39	NC_008526	TACTC	2	10	81196	81205	20 %	40 %	0 %	40 %	116493658
40	NC_008526	TGAGA	2	10	84401	84410	40 %	20 %	40 %	0 %	116493662
41	NC_008526	ATTGC	2	10	84795	84804	20 %	40 %	20 %	20 %	116493662
42	NC_008526	TTATT	2	10	85025	85034	20 %	80 %	0 %	0 %	116493663
43	NC_008526	TCAAG	2	10	85435	85444	40 %	20 %	20 %	20 %	116493663
44	NC_008526	TCGAG	2	10	86318	86327	20 %	20 %	40 %	20 %	116493664
45	NC_008526	TCTCT	2	10	86839	86848	0 %	60 %	0 %	40 %	116493665
46	NC_008526	TTTTC	2	10	87026	87035	0 %	80 %	0 %	20 %	116493665
47	NC_008526	AATTA	2	10	87134	87143	60 %	40 %	0 %	0 %	116493665
48	NC_008526	TCCCA	2	10	88382	88391	20 %	20 %	0 %	60 %	116493667
49	NC_008526	GCTTT	2	10	92023	92032	0 %	60 %	20 %	20 %	116493670
50	NC_008526	ATTGA	2	10	95276	95285	40 %	40 %	20 %	0 %	116493672
51	NC_008526	CAAAA	2	10	97950	97959	80 %	0 %	0 %	20 %	116493677
52	NC_008526	ATTTC	2	10	98476	98485	20 %	60 %	0 %	20 %	116493677
53	NC_008526	ATTTA	2	10	101689	101698	40 %	60 %	0 %	0 %	116493679
54	NC_008526	AACCA	2	10	104470	104479	60 %	0 %	0 %	40 %	116493682
55	NC_008526	GCCAT	2	10	104824	104833	20 %	20 %	20 %	40 %	116493683
56	NC_008526	AAGGC	2	10	104871	104880	40 %	0 %	40 %	20 %	116493683
57	NC_008526	TAATT	2	10	107054	107063	40 %	60 %	0 %	0 %	116493686
58	NC_008526	GAAGA	2	10	109993	110002	60 %	0 %	40 %	0 %	116493688
59	NC_008526	GAAAA	2	10	110011	110020	80 %	0 %	20 %	0 %	116493688
60	NC_008526	CAAAG	2	10	110077	110086	60 %	0 %	20 %	20 %	116493688
61	NC_008526	CGGCC	2	10	118490	118499	0 %	0 %	40 %	60 %	116493694
62	NC_008526	CTCAA	2	10	119073	119082	40 %	20 %	0 %	40 %	116493694
63	NC_008526	ACCAA	2	10	119344	119353	60 %	0 %	0 %	40 %	116493694
64	NC_008526	CAAGT	2	10	120304	120313	40 %	20 %	20 %	20 %	116493695
65	NC_008526	GACCC	2	10	121752	121761	20 %	0 %	20 %	60 %	116493696
66	NC_008526	ACCAA	2	10	122340	122349	60 %	0 %	0 %	40 %	116493697
67	NC_008526	TTGGC	2	10	123856	123865	0 %	40 %	40 %	20 %	116493697
68	NC_008526	TGTGT	2	10	125393	125402	0 %	60 %	40 %	0 %	116493698
69	NC_008526	ATTGC	2	10	133685	133694	20 %	40 %	20 %	20 %	116493705
70	NC_008526	TCGAG	2	10	135312	135321	20 %	20 %	40 %	20 %	116493706
71	NC_008526	TGATC	2	10	135707	135716	20 %	40 %	20 %	20 %	116493707
72	NC_008526	CATGC	2	10	136837	136846	20 %	20 %	20 %	40 %	116493708
73	NC_008526	GGAAC	2	10	139663	139672	40 %	0 %	40 %	20 %	116493709
74	NC_008526	CGATC	2	10	143590	143599	20 %	20 %	20 %	40 %	116493714
75	NC_008526	AAAGC	2	10	149556	149565	60 %	0 %	20 %	20 %	116493722
76	NC_008526	CATAA	2	10	149625	149634	60 %	20 %	0 %	20 %	116493722
77	NC_008526	GGGAT	2	10	150718	150727	20 %	20 %	60 %	0 %	116493723
78	NC_008526	GCTCA	2	10	151053	151062	20 %	20 %	20 %	40 %	116493723
79	NC_008526	TTTTC	2	10	153914	153923	0 %	80 %	0 %	20 %	116493727
80	NC_008526	CAAGC	2	10	155306	155315	40 %	0 %	20 %	40 %	116493728
81	NC_008526	AATGA	2	10	156606	156615	60 %	20 %	20 %	0 %	116493729
82	NC_008526	CCAAC	2	10	157174	157183	40 %	0 %	0 %	60 %	116493730
83	NC_008526	GCCTT	2	10	159066	159075	0 %	40 %	20 %	40 %	116493732
84	NC_008526	ATTTA	2	10	160631	160640	40 %	60 %	0 %	0 %	116493734
85	NC_008526	GTAAG	2	10	163202	163211	40 %	20 %	40 %	0 %	116493736
86	NC_008526	CACAA	2	10	164636	164645	60 %	0 %	0 %	40 %	116493737
87	NC_008526	TGAAT	2	10	166625	166634	40 %	40 %	20 %	0 %	116493739
88	NC_008526	ATCAA	2	10	168078	168087	60 %	20 %	0 %	20 %	116493741
89	NC_008526	CCGTT	2	10	172297	172306	0 %	40 %	20 %	40 %	116493743
90	NC_008526	CCAAC	2	10	174706	174715	40 %	0 %	0 %	60 %	116493745
91	NC_008526	GAACC	2	10	175957	175966	40 %	0 %	20 %	40 %	116493745
92	NC_008526	TGAAG	2	10	177356	177365	40 %	20 %	40 %	0 %	116493746
93	NC_008526	CAGCC	2	10	178268	178277	20 %	0 %	20 %	60 %	116493746
94	NC_008526	TTTGG	2	10	180430	180439	0 %	60 %	40 %	0 %	116493749
95	NC_008526	GCGGT	2	10	182274	182283	0 %	20 %	60 %	20 %	116493751
96	NC_008526	TAATA	2	10	185210	185219	60 %	40 %	0 %	0 %	116493754
97	NC_008526	GTTGA	2	10	189775	189784	20 %	40 %	40 %	0 %	116493757
98	NC_008526	CGTTG	2	10	192000	192009	0 %	40 %	40 %	20 %	116493759
99	NC_008526	AGATG	2	10	192976	192985	40 %	20 %	40 %	0 %	116493760
100	NC_008526	TTCAT	2	10	195463	195472	20 %	60 %	0 %	20 %	116493764
101	NC_008526	GGCAT	2	10	198369	198378	20 %	20 %	40 %	20 %	116493769
102	NC_008526	CGGCA	2	10	198973	198982	20 %	0 %	40 %	40 %	116493770
103	NC_008526	GCCAA	2	10	203836	203845	40 %	0 %	20 %	40 %	116493778
104	NC_008526	CTGGG	2	10	206603	206612	0 %	20 %	60 %	20 %	116493782
105	NC_008526	ACTTC	2	10	208765	208774	20 %	40 %	0 %	40 %	116493784
106	NC_008526	GTAGA	2	10	209212	209221	40 %	20 %	40 %	0 %	116493785
107	NC_008526	GCTTG	2	10	211017	211026	0 %	40 %	40 %	20 %	116493787
108	NC_008526	TCAAT	2	10	215106	215115	40 %	40 %	0 %	20 %	116493791
109	NC_008526	ACTCA	2	10	221999	222008	40 %	20 %	0 %	40 %	116493797
110	NC_008526	ATTTG	2	10	222645	222654	20 %	60 %	20 %	0 %	116493798
111	NC_008526	TTGAC	2	10	226540	226549	20 %	40 %	20 %	20 %	116493800
112	NC_008526	CGTTT	2	10	231428	231437	0 %	60 %	20 %	20 %	116493804
113	NC_008526	ATTTG	2	10	232843	232852	20 %	60 %	20 %	0 %	116493806
114	NC_008526	CTTTT	2	10	232930	232939	0 %	80 %	0 %	20 %	116493806
115	NC_008526	CCAGT	2	10	234080	234089	20 %	20 %	20 %	40 %	116493807
116	NC_008526	GAAGC	2	10	234918	234927	40 %	0 %	40 %	20 %	116493807
117	NC_008526	GGTTG	2	10	237330	237339	0 %	40 %	60 %	0 %	116493808
118	NC_008526	CTGGA	2	10	239488	239497	20 %	20 %	40 %	20 %	116493810
119	NC_008526	AGTTG	2	10	243877	243886	20 %	40 %	40 %	0 %	116493815
120	NC_008526	TGATT	2	10	244656	244665	20 %	60 %	20 %	0 %	116493816
121	NC_008526	TGTCA	2	10	244900	244909	20 %	40 %	20 %	20 %	116493816
122	NC_008526	TGATC	2	10	248704	248713	20 %	40 %	20 %	20 %	116493819
123	NC_008526	AACTT	2	10	250723	250732	40 %	40 %	0 %	20 %	116493820
124	NC_008526	CAAAC	2	10	254390	254399	60 %	0 %	0 %	40 %	116493824
125	NC_008526	GATCG	2	10	255649	255658	20 %	20 %	40 %	20 %	116493826
126	NC_008526	AGATC	2	10	257755	257764	40 %	20 %	20 %	20 %	116493827
127	NC_008526	GCACT	2	10	257988	257997	20 %	20 %	20 %	40 %	116493827
128	NC_008526	ATTCG	2	10	265604	265613	20 %	40 %	20 %	20 %	116493830
129	NC_008526	ATGCT	2	10	267559	267568	20 %	40 %	20 %	20 %	116493833
130	NC_008526	ATGGC	2	10	267688	267697	20 %	20 %	40 %	20 %	116493833
131	NC_008526	GATCG	2	10	268807	268816	20 %	20 %	40 %	20 %	116493834
132	NC_008526	TTGCT	2	10	269704	269713	0 %	60 %	20 %	20 %	116493835
133	NC_008526	ACATG	2	10	270577	270586	40 %	20 %	20 %	20 %	116493836
134	NC_008526	ATGGC	2	10	270910	270919	20 %	20 %	40 %	20 %	116493837
135	NC_008526	ATCAA	2	10	272864	272873	60 %	20 %	0 %	20 %	116493839
136	NC_008526	AATCG	2	10	276498	276507	40 %	20 %	20 %	20 %	116493844
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153	NC_008526	GTCTT	2	10	312064	312073	0 %	60 %	20 %	20 %	116493879
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199	NC_008526	TTGGC	2	10	391711	391720	0 %	40 %	40 %	20 %	116493953
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