MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_008526	CG	3	6	2844641	2844646	0 %	0 %	50 %	50 %	116496281
44502	NC_008526	ATC	2	6	2844647	2844652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496281
44503	NC_008526	CAA	2	6	2844679	2844684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496281
44504	NC_008526	TGC	2	6	2844701	2844706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496281
44505	NC_008526	TGCTG	2	10	2844711	2844720	0 %	40 %	40 %	20 %	116496281
44506	NC_008526	AATC	2	8	2844721	2844728	50 %	25 %	0 %	25 %	116496281
44507	NC_008526	CAGCC	2	10	2844823	2844832	20 %	0 %	20 %	60 %	116496281
44508	NC_008526	CAA	2	6	2844886	2844891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496281
44509	NC_008526	AAT	2	6	2844901	2844906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496281
44510	NC_008526	CCA	2	6	2845170	2845175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496281
44511	NC_008526	ATCA	2	8	2845231	2845238	50 %	25 %	0 %	25 %	116496281
44512	NC_008526	AAT	2	6	2845255	2845260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496281
44513	NC_008526	TAA	2	6	2845271	2845276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496281
44514	NC_008526	TGT	2	6	2845408	2845413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496281
44515	NC_008526	TGCG	2	8	2845433	2845440	0 %	25 %	50 %	25 %	116496281
44516	NC_008526	AAC	2	6	2845450	2845455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496281
44517	NC_008526	TGC	2	6	2845537	2845542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496281
44518	NC_008526	CAT	3	9	2845593	2845601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496281
44519	NC_008526	CGA	2	6	2845647	2845652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496281
44520	NC_008526	GCA	2	6	2845751	2845756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496281
44521	NC_008526	GCT	2	6	2845814	2845819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496281
44522	NC_008526	T	7	7	2845819	2845825	0 %	100 %	0 %	0 %	116496281
44523	NC_008526	ATG	2	6	2845826	2845831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496281
44524	NC_008526	TCA	2	6	2845925	2845930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496281
44525	NC_008526	CCG	2	6	2846142	2846147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496282
44526	NC_008526	TTTGC	2	10	2846167	2846176	0 %	60 %	20 %	20 %	116496282
44527	NC_008526	AAT	2	6	2846214	2846219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496282
44528	NC_008526	TTTGA	2	10	2846234	2846243	20 %	60 %	20 %	0 %	116496282
44529	NC_008526	GAC	2	6	2846308	2846313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496282
44530	NC_008526	AAT	2	6	2846327	2846332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496282
44531	NC_008526	GCG	2	6	2846417	2846422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496282
44532	NC_008526	CTT	2	6	2846856	2846861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496283
44533	NC_008526	TTGC	2	8	2846895	2846902	0 %	50 %	25 %	25 %	116496283
44534	NC_008526	TG	3	6	2846933	2846938	0 %	50 %	50 %	0 %	116496283
44535	NC_008526	A	6	6	2846947	2846952	100 %	0 %	0 %	0 %	116496283
44536	NC_008526	GTT	2	6	2846953	2846958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496283
44537	NC_008526	CTT	2	6	2846984	2846989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496283
44538	NC_008526	GAC	2	6	2846999	2847004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496283
44539	NC_008526	TTG	2	6	2847020	2847025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496283
44540	NC_008526	GTT	2	6	2847086	2847091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496283
44541	NC_008526	AAC	2	6	2847103	2847108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496283
44542	NC_008526	TTGT	2	8	2847170	2847177	0 %	75 %	25 %	0 %	116496283
44543	NC_008526	CTG	2	6	2847907	2847912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496284
44544	NC_008526	ATG	2	6	2847981	2847986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496284
44545	NC_008526	TGG	2	6	2847988	2847993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496284
44546	NC_008526	CGC	2	6	2848034	2848039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496284
44547	NC_008526	TGCG	2	8	2848066	2848073	0 %	25 %	50 %	25 %	116496284
44548	NC_008526	AGCA	2	8	2848109	2848116	50 %	0 %	25 %	25 %	116496284
44549	NC_008526	ATT	2	6	2848118	2848123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116496284
44550	NC_008526	CTG	2	6	2848171	2848176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496284
44551	NC_008526	GGC	2	6	2848367	2848372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496284
44552	NC_008526	ACC	2	6	2848428	2848433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496284
44553	NC_008526	AAG	2	6	2848458	2848463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496284
44554	NC_008526	CAG	2	6	2848483	2848488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496284
44555	NC_008526	CTC	2	6	2848619	2848624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116496284
44556	NC_008526	CTG	2	6	2848711	2848716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496284
44557	NC_008526	AAT	2	6	2848718	2848723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496284
44558	NC_008526	GCCTT	2	10	2848794	2848803	0 %	40 %	20 %	40 %	116496284
44559	NC_008526	AGC	2	6	2848817	2848822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496284
44560	NC_008526	CTG	2	6	2848852	2848857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496284
44561	NC_008526	TAA	2	6	2848867	2848872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496284
44562	NC_008526	GTC	2	6	2848893	2848898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496284
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44564	NC_008526	ACA	2	6	2849007	2849012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496284
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44566	NC_008526	TCTT	2	8	2849064	2849071	0 %	75 %	0 %	25 %	116496284
44567	NC_008526	CAC	2	6	2849317	2849322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496285
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44571	NC_008526	ACG	2	6	2849511	2849516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496285
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44573	NC_008526	AAAT	2	8	2849611	2849618	75 %	25 %	0 %	0 %	116496285
44574	NC_008526	GCA	2	6	2849685	2849690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496285
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44576	NC_008526	CAT	2	6	2849783	2849788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496285
44577	NC_008526	ATC	2	6	2849834	2849839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496285
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44582	NC_008526	TTCCA	2	10	2850087	2850096	20 %	40 %	0 %	40 %	116496285
44583	NC_008526	CAT	2	6	2850152	2850157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496285
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44585	NC_008526	AGACA	2	10	2850223	2850232	60 %	0 %	20 %	20 %	116496285
44586	NC_008526	AAAG	2	8	2850247	2850254	75 %	0 %	25 %	0 %	116496285
44587	NC_008526	TAA	2	6	2850401	2850406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496285
44588	NC_008526	CCAAC	2	10	2850407	2850416	40 %	0 %	0 %	60 %	116496285
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44599	NC_008526	CAT	2	6	2851017	2851022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496286
44600	NC_008526	CAAA	2	8	2851059	2851066	75 %	0 %	0 %	25 %	116496286
44601	NC_008526	GGT	2	6	2851084	2851089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496286
44602	NC_008526	TTCGG	2	10	2851125	2851134	0 %	40 %	40 %	20 %	116496286
44603	NC_008526	TCA	2	6	2851241	2851246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496286
44604	NC_008526	CTG	2	6	2851300	2851305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496286
44605	NC_008526	CTA	2	6	2851323	2851328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496286
44606	NC_008526	GCT	2	6	2851374	2851379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496286
44607	NC_008526	GAA	2	6	2851381	2851386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496286
44608	NC_008526	GCAAT	2	10	2851388	2851397	40 %	20 %	20 %	20 %	116496286
44609	NC_008526	GAA	2	6	2851402	2851407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496286
44610	NC_008526	TGAT	2	8	2851427	2851434	25 %	50 %	25 %	0 %	116496286
44611	NC_008526	TCA	2	6	2851445	2851450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496286
44612	NC_008526	TCA	2	6	2851454	2851459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496286
44613	NC_008526	GCCA	2	8	2851514	2851521	25 %	0 %	25 %	50 %	116496286
44614	NC_008526	GAC	2	6	2851524	2851529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496286
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44616	NC_008526	A	6	6	2851633	2851638	100 %	0 %	0 %	0 %	116496286
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44840	NC_008526	TCG	2	6	2868197	2868202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496303
44841	NC_008526	AGCCA	2	10	2868403	2868412	40 %	0 %	20 %	40 %	116496303
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44845	NC_008526	GCA	2	6	2868660	2868665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496303
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44964	NC_008526	CGA	2	6	2876108	2876113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496310
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