MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008526	AGCT	2	8	222191	222198	25 %	25 %	25 %	25 %	116493797
3502	NC_008526	TGGT	2	8	222575	222582	0 %	50 %	50 %	0 %	116493798
3503	NC_008526	ATTTG	2	10	222645	222654	20 %	60 %	20 %	0 %	116493798
3504	NC_008526	ATC	2	6	222745	222750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493798
3505	NC_008526	CTG	2	6	222764	222769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493798
3506	NC_008526	AGCT	2	8	222797	222804	25 %	25 %	25 %	25 %	116493798
3507	NC_008526	GAT	2	6	222820	222825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493798
3508	NC_008526	TGAT	2	8	222830	222837	25 %	50 %	25 %	0 %	116493798
3509	NC_008526	GGC	2	6	222838	222843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493798
3510	NC_008526	TAT	2	6	222850	222855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493798
3511	NC_008526	GCT	2	6	222879	222884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493798
3512	NC_008526	GCT	2	6	222886	222891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493798
3513	NC_008526	GGC	2	6	222925	222930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493798
3514	NC_008526	TGG	2	6	222966	222971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493798
3515	NC_008526	GAT	2	6	223101	223106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493798
3516	NC_008526	GCG	2	6	223165	223170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493798
3517	NC_008526	GCTG	2	8	223208	223215	0 %	25 %	50 %	25 %	116493798
3518	NC_008526	GCC	2	6	223225	223230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493798
3519	NC_008526	GAA	2	6	223309	223314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493798
3520	NC_008526	TGA	2	6	223358	223363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493798
3521	NC_008526	GAA	2	6	223378	223383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493798
3522	NC_008526	GGC	2	6	223432	223437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493798
3523	NC_008526	AT	3	6	223549	223554	50 %	50 %	0 %	0 %	116493799
3524	NC_008526	ACT	2	6	223574	223579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493799
3525	NC_008526	TTTG	2	8	223594	223601	0 %	75 %	25 %	0 %	116493799
3526	NC_008526	AAT	2	6	223631	223636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493799
3527	NC_008526	CG	3	6	223827	223832	0 %	0 %	50 %	50 %	116493799
3528	NC_008526	TCA	2	6	223833	223838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493799
3529	NC_008526	AGC	3	9	223855	223863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493799
3530	NC_008526	CTT	2	6	224038	224043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493799
3531	NC_008526	GCG	2	6	224210	224215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493799
3532	NC_008526	TTGGCG	2	12	224280	224291	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116493799
3533	NC_008526	TGAC	2	8	224349	224356	25 %	25 %	25 %	25 %	116493799
3534	NC_008526	TAC	2	6	224393	224398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493799
3535	NC_008526	GTT	2	6	224417	224422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493799
3536	NC_008526	AAC	2	6	224435	224440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493799
3537	NC_008526	GGT	2	6	224441	224446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493799
3538	NC_008526	AAC	2	6	224502	224507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493799
3539	NC_008526	TCCA	2	8	224580	224587	25 %	25 %	0 %	50 %	116493799
3540	NC_008526	GCA	2	6	224656	224661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493799
3541	NC_008526	AGC	2	6	224683	224688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493799
3542	NC_008526	TA	3	6	224712	224717	50 %	50 %	0 %	0 %	116493799
3543	NC_008526	TGA	2	6	224727	224732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493799
3544	NC_008526	GC	3	6	224783	224788	0 %	0 %	50 %	50 %	116493799
3545	NC_008526	GTT	2	6	224876	224881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493799
3546	NC_008526	GTT	2	6	224992	224997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493799
3547	NC_008526	ATC	2	6	225339	225344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493800
3548	NC_008526	ATC	2	6	225375	225380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493800
3549	NC_008526	GTC	3	9	225387	225395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493800
3550	NC_008526	GCCA	2	8	225416	225423	25 %	0 %	25 %	50 %	116493800
3551	NC_008526	GC	3	6	225454	225459	0 %	0 %	50 %	50 %	116493800
3552	NC_008526	CTTCGG	2	12	225482	225493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493800
3553	NC_008526	TGG	2	6	225524	225529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493800
3554	NC_008526	TCA	2	6	225553	225558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493800
3555	NC_008526	CGC	2	6	225570	225575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493800
3556	NC_008526	GTT	2	6	225591	225596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493800
3557	NC_008526	GCC	2	6	225752	225757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493800
3558	NC_008526	CTG	2	6	225799	225804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493800
3559	NC_008526	ATC	2	6	225828	225833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493800
3560	NC_008526	GTT	2	6	225863	225868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493800
3561	NC_008526	A	6	6	225940	225945	100 %	0 %	0 %	0 %	116493800
3562	NC_008526	GGA	2	6	225956	225961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493800
3563	NC_008526	TGG	2	6	226049	226054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493800
3564	NC_008526	CATT	2	8	226096	226103	25 %	50 %	0 %	25 %	116493800
3565	NC_008526	TTG	2	6	226134	226139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493800
3566	NC_008526	GC	3	6	226164	226169	0 %	0 %	50 %	50 %	116493800
3567	NC_008526	GCCA	2	8	226175	226182	25 %	0 %	25 %	50 %	116493800
3568	NC_008526	TAC	2	6	226231	226236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493800
3569	NC_008526	TGG	2	6	226244	226249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493800
3570	NC_008526	CGG	2	6	226250	226255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493800
3571	NC_008526	TGAT	2	8	226273	226280	25 %	50 %	25 %	0 %	116493800
3572	NC_008526	A	6	6	226301	226306	100 %	0 %	0 %	0 %	116493800
3573	NC_008526	CAC	2	6	226330	226335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493800
3574	NC_008526	TTGAC	2	10	226540	226549	20 %	40 %	20 %	20 %	116493800
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3579	NC_008526	TGT	2	6	226621	226626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493800
3580	NC_008526	TGG	2	6	226633	226638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493800
3581	NC_008526	GTA	2	6	226808	226813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493801
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3586	NC_008526	CAA	2	6	227597	227602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493801
3587	NC_008526	ATCG	2	8	227659	227666	25 %	25 %	25 %	25 %	116493801
3588	NC_008526	CTTG	2	8	227687	227694	0 %	50 %	25 %	25 %	116493801
3589	NC_008526	GAG	2	6	227698	227703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493801
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3591	NC_008526	TCAT	2	8	227810	227817	25 %	50 %	0 %	25 %	116493801
3592	NC_008526	AAT	2	6	227877	227882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493801
3593	NC_008526	ACC	2	6	227957	227962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493801
3594	NC_008526	GTT	2	6	227985	227990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493801
3595	NC_008526	A	7	7	228539	228545	100 %	0 %	0 %	0 %	116493802
3596	NC_008526	CTTT	2	8	228571	228578	0 %	75 %	0 %	25 %	116493802
3597	NC_008526	GTG	2	6	228609	228614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493802
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3599	NC_008526	GATT	2	8	228666	228673	25 %	50 %	25 %	0 %	116493802
3600	NC_008526	TGA	2	6	228774	228779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493802
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3603	NC_008526	ATTT	2	8	228886	228893	25 %	75 %	0 %	0 %	116493802
3604	NC_008526	CGC	2	6	228949	228954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493802
3605	NC_008526	TGA	2	6	229006	229011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493802
3606	NC_008526	TTC	2	6	229067	229072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493802
3607	NC_008526	TCT	2	6	229089	229094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493802
3608	NC_008526	TTA	2	6	229125	229130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493802
3609	NC_008526	TATC	2	8	229200	229207	25 %	50 %	0 %	25 %	116493802
3610	NC_008526	GTC	2	6	229277	229282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493802
3611	NC_008526	ACG	2	6	229336	229341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493802
3612	NC_008526	T	7	7	229379	229385	0 %	100 %	0 %	0 %	116493802
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3619	NC_008526	TTC	2	6	229700	229705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493802
3620	NC_008526	CTT	2	6	229825	229830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493802
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3622	NC_008526	ATG	2	6	230130	230135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493803
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3744	NC_008526	CCT	2	6	236733	236738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116493808
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3861	NC_008526	AGTTG	2	10	243877	243886	20 %	40 %	40 %	0 %	116493815
3862	NC_008526	TTG	2	6	243997	244002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493815
3863	NC_008526	TCCA	2	8	244088	244095	25 %	25 %	0 %	50 %	116493815
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3986	NC_008526	TGC	2	6	250814	250819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493820
3987	NC_008526	GCA	2	6	250821	250826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493820
3988	NC_008526	GCT	2	6	250833	250838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493820
3989	NC_008526	TGT	2	6	250839	250844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493820
3990	NC_008526	TGT	2	6	250851	250856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493820
3991	NC_008526	CAG	2	6	250864	250869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493820
3992	NC_008526	CAG	2	6	250879	250884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493820
3993	NC_008526	CTG	2	6	250894	250899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493820
3994	NC_008526	CAG	2	6	250909	250914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493820
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3997	NC_008526	TGC	2	6	250970	250975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493820
3998	NC_008526	T	6	6	251015	251020	0 %	100 %	0 %	0 %	116493820
3999	NC_008526	ACT	2	6	251099	251104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493820
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