MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008526	CGTTG	2	10	192000	192009	0 %	40 %	40 %	20 %	116493759
3002	NC_008526	GCA	2	6	192040	192045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493759
3003	NC_008526	GACA	2	8	192062	192069	50 %	0 %	25 %	25 %	116493759
3004	NC_008526	TCG	2	6	192141	192146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493759
3005	NC_008526	CG	3	6	192164	192169	0 %	0 %	50 %	50 %	116493759
3006	NC_008526	TGC	2	6	192170	192175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493759
3007	NC_008526	TAC	3	9	192202	192210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493759
3008	NC_008526	TGG	2	6	192251	192256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493759
3009	NC_008526	AGC	2	6	192279	192284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493759
3010	NC_008526	TTA	2	6	192286	192291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493759
3011	NC_008526	CAA	2	6	192361	192366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493759
3012	NC_008526	A	7	7	192500	192506	100 %	0 %	0 %	0 %	116493759
3013	NC_008526	AGC	2	6	192577	192582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493759
3014	NC_008526	GCA	2	6	192620	192625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493759
3015	NC_008526	GGT	2	6	192631	192636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493759
3016	NC_008526	GGC	2	6	192643	192648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493759
3017	NC_008526	CGG	2	6	192850	192855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493760
3018	NC_008526	GAT	2	6	192859	192864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493760
3019	NC_008526	CCA	2	6	192957	192962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493760
3020	NC_008526	CTTA	2	8	192966	192973	25 %	50 %	0 %	25 %	116493760
3021	NC_008526	AGATG	2	10	192976	192985	40 %	20 %	40 %	0 %	116493760
3022	NC_008526	ACC	2	6	193022	193027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493760
3023	NC_008526	T	6	6	193107	193112	0 %	100 %	0 %	0 %	116493760
3024	NC_008526	ATG	2	6	193277	193282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493760
3025	NC_008526	GTT	2	6	193306	193311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493760
3026	NC_008526	TGA	2	6	193398	193403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493760
3027	NC_008526	GCA	3	9	193415	193423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493760
3028	NC_008526	CGCT	2	8	193476	193483	0 %	25 %	25 %	50 %	116493760
3029	NC_008526	CAT	2	6	193519	193524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493760
3030	NC_008526	TGC	2	6	193530	193535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493760
3031	NC_008526	CAA	2	6	193536	193541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493760
3032	NC_008526	A	6	6	193630	193635	100 %	0 %	0 %	0 %	116493761
3033	NC_008526	TGA	2	6	193650	193655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493761
3034	NC_008526	ATT	2	6	193714	193719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493761
3035	NC_008526	TGA	2	6	193835	193840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493761
3036	NC_008526	TCT	2	6	193847	193852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493761
3037	NC_008526	TATG	2	8	193924	193931	25 %	50 %	25 %	0 %	116493761
3038	NC_008526	ACG	2	6	193936	193941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493761
3039	NC_008526	CAT	2	6	194081	194086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493762
3040	NC_008526	CGA	2	6	194130	194135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493762
3041	NC_008526	GAA	2	6	194138	194143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493762
3042	NC_008526	GAT	2	6	194226	194231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493762
3043	NC_008526	AAT	2	6	194248	194253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493762
3044	NC_008526	ACC	2	6	194546	194551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493763
3045	NC_008526	CCA	2	6	194571	194576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493763
3046	NC_008526	ATG	2	6	194604	194609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493763
3047	NC_008526	AC	3	6	194737	194742	50 %	0 %	0 %	50 %	116493763
3048	NC_008526	TAA	2	6	194832	194837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493763
3049	NC_008526	CAG	3	9	194889	194897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493763
3050	NC_008526	ATGA	2	8	194964	194971	50 %	25 %	25 %	0 %	116493763
3051	NC_008526	ATC	2	6	195288	195293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493764
3052	NC_008526	CAG	2	6	195312	195317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493764
3053	NC_008526	CA	3	6	195329	195334	50 %	0 %	0 %	50 %	116493764
3054	NC_008526	ACG	2	6	195365	195370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493764
3055	NC_008526	TGA	2	6	195401	195406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493764
3056	NC_008526	TCA	2	6	195416	195421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493764
3057	NC_008526	T	6	6	195432	195437	0 %	100 %	0 %	0 %	116493764
3058	NC_008526	TTCAT	2	10	195463	195472	20 %	60 %	0 %	20 %	116493764
3059	NC_008526	AGC	2	6	195738	195743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493765
3060	NC_008526	CAA	2	6	195801	195806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493765
3061	NC_008526	GGC	2	6	195854	195859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493765
3062	NC_008526	GAA	2	6	195869	195874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493765
3063	NC_008526	TAT	2	6	195959	195964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493765
3064	NC_008526	GTT	2	6	195991	195996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493765
3065	NC_008526	GGC	2	6	196009	196014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493765
3066	NC_008526	CAAG	2	8	196063	196070	50 %	0 %	25 %	25 %	116493765
3067	NC_008526	GCA	2	6	196088	196093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493765
3068	NC_008526	GAA	2	6	196198	196203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493766
3069	NC_008526	TTC	2	6	196210	196215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493766
3070	NC_008526	TGATTT	2	12	196239	196250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116493766
3071	NC_008526	CGC	2	6	196251	196256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493766
3072	NC_008526	TGT	2	6	196293	196298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493766
3073	NC_008526	TAAAGA	2	12	196320	196331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116493766
3074	NC_008526	T	6	6	196346	196351	0 %	100 %	0 %	0 %	116493766
3075	NC_008526	T	6	6	196532	196537	0 %	100 %	0 %	0 %	116493767
3076	NC_008526	GCT	2	6	196748	196753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493768
3077	NC_008526	GTCA	2	8	196779	196786	25 %	25 %	25 %	25 %	116493768
3078	NC_008526	TG	3	6	196832	196837	0 %	50 %	50 %	0 %	116493768
3079	NC_008526	TCA	2	6	196957	196962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493768
3080	NC_008526	ATG	2	6	197037	197042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493768
3081	NC_008526	TGG	2	6	197152	197157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493768
3082	NC_008526	GCCA	2	8	197250	197257	25 %	0 %	25 %	50 %	116493768
3083	NC_008526	GGTG	2	8	197277	197284	0 %	25 %	75 %	0 %	116493768
3084	NC_008526	TGT	2	6	197447	197452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493768
3085	NC_008526	GCC	2	6	197509	197514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493768
3086	NC_008526	GT	3	6	197562	197567	0 %	50 %	50 %	0 %	116493768
3087	NC_008526	GCA	2	6	197638	197643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493768
3088	NC_008526	TGC	2	6	197661	197666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493768
3089	NC_008526	GAT	2	6	198328	198333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493769
3090	NC_008526	GGCAT	2	10	198369	198378	20 %	20 %	40 %	20 %	116493769
3091	NC_008526	AAG	2	6	198394	198399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493769
3092	NC_008526	CAT	2	6	198466	198471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493769
3093	NC_008526	CAT	2	6	198514	198519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493769
3094	NC_008526	CAG	2	6	198524	198529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493769
3095	NC_008526	TTGA	2	8	198598	198605	25 %	50 %	25 %	0 %	116493769
3096	NC_008526	ATG	2	6	198845	198850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493770
3097	NC_008526	ATC	2	6	198869	198874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493770
3098	NC_008526	GGCT	2	8	198929	198936	0 %	25 %	50 %	25 %	116493770
3099	NC_008526	CGG	2	6	198949	198954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493770
3100	NC_008526	CGGCA	2	10	198973	198982	20 %	0 %	40 %	40 %	116493770
3101	NC_008526	CAT	2	6	199045	199050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493770
3102	NC_008526	CGT	2	6	199051	199056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493770
3103	NC_008526	AGG	2	6	199101	199106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493770
3104	NC_008526	CAT	2	6	199145	199150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493771
3105	NC_008526	CAA	2	6	199230	199235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493771
3106	NC_008526	TCA	2	6	199294	199299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493771
3107	NC_008526	GTT	2	6	199413	199418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493771
3108	NC_008526	AAG	2	6	199464	199469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493771
3109	NC_008526	GAA	2	6	199542	199547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493771
3110	NC_008526	GCCA	2	8	199613	199620	25 %	0 %	25 %	50 %	116493771
3111	NC_008526	GCA	2	6	199857	199862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493772
3112	NC_008526	GGCT	2	8	199863	199870	0 %	25 %	50 %	25 %	116493772
3113	NC_008526	GCAT	2	8	199898	199905	25 %	25 %	25 %	25 %	116493772
3114	NC_008526	GTTG	2	8	199912	199919	0 %	50 %	50 %	0 %	116493772
3115	NC_008526	CCG	2	6	199921	199926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493772
3116	NC_008526	AGC	2	6	199990	199995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493773
3117	NC_008526	A	6	6	200064	200069	100 %	0 %	0 %	0 %	116493773
3118	NC_008526	GA	3	6	200088	200093	50 %	0 %	50 %	0 %	116493773
3119	NC_008526	GAT	2	6	200122	200127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493773
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3121	NC_008526	AAC	2	6	200262	200267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493773
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3134	NC_008526	GAT	2	6	201220	201225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493775
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3364	NC_008526	TTG	2	6	214006	214011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493790
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3483	NC_008526	GAA	2	6	220838	220843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493796
3484	NC_008526	TCC	2	6	221112	221117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116493796
3485	NC_008526	GTT	2	6	221191	221196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493796
3486	NC_008526	CAT	2	6	221213	221218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493796
3487	NC_008526	TTGA	2	8	221228	221235	25 %	50 %	25 %	0 %	116493796
3488	NC_008526	TTG	2	6	221437	221442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493797
3489	NC_008526	TTC	2	6	221567	221572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493797
3490	NC_008526	CAA	2	6	221581	221586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493797
3491	NC_008526	GCA	2	6	221589	221594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493797
3492	NC_008526	TTG	2	6	221651	221656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493797
3493	NC_008526	ATC	2	6	221718	221723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493797
3494	NC_008526	CG	3	6	221728	221733	0 %	0 %	50 %	50 %	116493797
3495	NC_008526	TG	3	6	221742	221747	0 %	50 %	50 %	0 %	116493797
3496	NC_008526	CAA	2	6	221830	221835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493797
3497	NC_008526	GTT	2	6	221931	221936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493797
3498	NC_008526	T	6	6	221965	221970	0 %	100 %	0 %	0 %	116493797
3499	NC_008526	ACTCA	2	10	221999	222008	40 %	20 %	0 %	40 %	116493797
3500	NC_008526	ATC	2	6	222023	222028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493797

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