MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008526	GATG	2	8	96484	96491	25 %	25 %	50 %	0 %	116493673
1502	NC_008526	A	7	7	96528	96534	100 %	0 %	0 %	0 %	116493674
1503	NC_008526	ATC	2	6	96540	96545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493674
1504	NC_008526	AGG	2	6	96553	96558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493674
1505	NC_008526	CGA	2	6	96569	96574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493674
1506	NC_008526	T	6	6	96582	96587	0 %	100 %	0 %	0 %	116493674
1507	NC_008526	TGG	2	6	96741	96746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493675
1508	NC_008526	GCC	2	6	96761	96766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493675
1509	NC_008526	GCT	2	6	96890	96895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493675
1510	NC_008526	CGC	2	6	96913	96918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493675
1511	NC_008526	GCT	2	6	97019	97024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493675
1512	NC_008526	A	6	6	97407	97412	100 %	0 %	0 %	0 %	116493676
1513	NC_008526	TAT	2	6	97451	97456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493676
1514	NC_008526	TGG	2	6	97493	97498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493676
1515	NC_008526	AGC	2	6	97529	97534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493676
1516	NC_008526	GAA	2	6	97551	97556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493676
1517	NC_008526	TGT	2	6	97565	97570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493676
1518	NC_008526	CTA	2	6	97598	97603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493676
1519	NC_008526	AC	3	6	97619	97624	50 %	0 %	0 %	50 %	116493676
1520	NC_008526	CAG	2	6	97627	97632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493676
1521	NC_008526	TCT	2	6	97674	97679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493676
1522	NC_008526	TGA	2	6	97685	97690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493676
1523	NC_008526	ATG	2	6	97738	97743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493676
1524	NC_008526	CTG	2	6	97807	97812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493677
1525	NC_008526	GAT	2	6	97866	97871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493677
1526	NC_008526	CAAAA	2	10	97950	97959	80 %	0 %	0 %	20 %	116493677
1527	NC_008526	AGC	2	6	97973	97978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493677
1528	NC_008526	ATT	2	6	97981	97986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493677
1529	NC_008526	TTC	2	6	98041	98046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493677
1530	NC_008526	TATG	2	8	98162	98169	25 %	50 %	25 %	0 %	116493677
1531	NC_008526	TAA	2	6	98208	98213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493677
1532	NC_008526	GGCT	2	8	98222	98229	0 %	25 %	50 %	25 %	116493677
1533	NC_008526	A	6	6	98278	98283	100 %	0 %	0 %	0 %	116493677
1534	NC_008526	TAC	2	6	98309	98314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493677
1535	NC_008526	TA	3	6	98318	98323	50 %	50 %	0 %	0 %	116493677
1536	NC_008526	CCG	2	6	98333	98338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493677
1537	NC_008526	T	6	6	98355	98360	0 %	100 %	0 %	0 %	116493677
1538	NC_008526	ATTTC	2	10	98476	98485	20 %	60 %	0 %	20 %	116493677
1539	NC_008526	TTC	2	6	98545	98550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493677
1540	NC_008526	GAA	2	6	98628	98633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493677
1541	NC_008526	TTGA	2	8	98642	98649	25 %	50 %	25 %	0 %	116493677
1542	NC_008526	CTGA	2	8	99133	99140	25 %	25 %	25 %	25 %	116493678
1543	NC_008526	TAA	2	6	99153	99158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493678
1544	NC_008526	A	6	6	99166	99171	100 %	0 %	0 %	0 %	116493678
1545	NC_008526	T	7	7	99344	99350	0 %	100 %	0 %	0 %	116493678
1546	NC_008526	T	6	6	99353	99358	0 %	100 %	0 %	0 %	116493678
1547	NC_008526	T	6	6	99419	99424	0 %	100 %	0 %	0 %	116493678
1548	NC_008526	ATT	2	6	99427	99432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493678
1549	NC_008526	AAG	2	6	99434	99439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493678
1550	NC_008526	ACC	2	6	99470	99475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493678
1551	NC_008526	ATG	3	9	99492	99500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493678
1552	NC_008526	CACGAT	2	12	99562	99573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116493678
1553	NC_008526	TCA	2	6	99609	99614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493678
1554	NC_008526	ACG	2	6	99719	99724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493678
1555	NC_008526	GGTA	2	8	99740	99747	25 %	25 %	50 %	0 %	116493678
1556	NC_008526	GAA	2	6	99784	99789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493678
1557	NC_008526	TAC	2	6	99927	99932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493678
1558	NC_008526	TTC	2	6	99966	99971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493678
1559	NC_008526	CTT	2	6	99986	99991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493678
1560	NC_008526	AAGA	2	8	100166	100173	75 %	0 %	25 %	0 %	116493678
1561	NC_008526	TAAA	2	8	100338	100345	75 %	25 %	0 %	0 %	116493678
1562	NC_008526	GA	3	6	100420	100425	50 %	0 %	50 %	0 %	116493678
1563	NC_008526	AGAA	2	8	100441	100448	75 %	0 %	25 %	0 %	116493678
1564	NC_008526	T	6	6	100483	100488	0 %	100 %	0 %	0 %	116493678
1565	NC_008526	A	8	8	100533	100540	100 %	0 %	0 %	0 %	116493678
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1567	NC_008526	TTGC	2	8	100580	100587	0 %	50 %	25 %	25 %	116493678
1568	NC_008526	A	6	6	100598	100603	100 %	0 %	0 %	0 %	116493678
1569	NC_008526	GTAT	2	8	100611	100618	25 %	50 %	25 %	0 %	116493678
1570	NC_008526	TTTG	2	8	100671	100678	0 %	75 %	25 %	0 %	116493678
1571	NC_008526	T	6	6	101420	101425	0 %	100 %	0 %	0 %	116493679
1572	NC_008526	GATC	2	8	101518	101525	25 %	25 %	25 %	25 %	116493679
1573	NC_008526	ATG	2	6	101565	101570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493679
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1575	NC_008526	AAAT	3	12	101619	101630	75 %	25 %	0 %	0 %	116493679
1576	NC_008526	ATG	2	6	101649	101654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493679
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1583	NC_008526	TGC	2	6	101896	101901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493679
1584	NC_008526	TGG	2	6	101914	101919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493679
1585	NC_008526	CAT	2	6	102077	102082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493680
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1592	NC_008526	GGT	2	6	102810	102815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493681
1593	NC_008526	ATT	2	6	102890	102895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493681
1594	NC_008526	ATGA	2	8	102955	102962	50 %	25 %	25 %	0 %	116493681
1595	NC_008526	TCA	2	6	103013	103018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493681
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1597	NC_008526	CAAG	2	8	103078	103085	50 %	0 %	25 %	25 %	116493681
1598	NC_008526	GGCGAT	2	12	103098	103109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116493681
1599	NC_008526	TTG	2	6	103170	103175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493681
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1603	NC_008526	AATTTT	2	12	103905	103916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493681
1604	NC_008526	TAC	2	6	103959	103964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493681
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1606	NC_008526	TTG	2	6	104080	104085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493682
1607	NC_008526	TGC	2	6	104134	104139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493682
1608	NC_008526	TGT	2	6	104242	104247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493682
1609	NC_008526	TGT	2	6	104269	104274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493682
1610	NC_008526	GT	3	6	104314	104319	0 %	50 %	50 %	0 %	116493682
1611	NC_008526	GCA	2	6	104426	104431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493682
1612	NC_008526	AACCA	2	10	104470	104479	60 %	0 %	0 %	40 %	116493682
1613	NC_008526	GTT	2	6	104630	104635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493682
1614	NC_008526	TTGG	2	8	104636	104643	0 %	50 %	50 %	0 %	116493682
1615	NC_008526	CTT	2	6	104805	104810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493683
1616	NC_008526	T	7	7	104809	104815	0 %	100 %	0 %	0 %	116493683
1617	NC_008526	GCCAT	2	10	104824	104833	20 %	20 %	20 %	40 %	116493683
1618	NC_008526	ATG	2	6	104844	104849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493683
1619	NC_008526	AAGGC	2	10	104871	104880	40 %	0 %	40 %	20 %	116493683
1620	NC_008526	GAAA	2	8	104935	104942	75 %	0 %	25 %	0 %	116493683
1621	NC_008526	T	6	6	104969	104974	0 %	100 %	0 %	0 %	116493683
1622	NC_008526	AAC	2	6	104982	104987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493683
1623	NC_008526	CTTG	2	8	105043	105050	0 %	50 %	25 %	25 %	116493683
1624	NC_008526	ATC	2	6	105069	105074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493683
1625	NC_008526	TGA	2	6	105100	105105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493683
1626	NC_008526	GAC	2	6	105107	105112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493683
1627	NC_008526	CGA	2	6	105172	105177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493683
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1629	NC_008526	TCA	2	6	105282	105287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493683
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1651	NC_008526	GAT	2	6	106294	106299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493685
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1658	NC_008526	GTTT	2	8	106744	106751	0 %	75 %	25 %	0 %	116493686
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1987	NC_008526	GCG	2	6	125000	125005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493698
1988	NC_008526	GACT	2	8	125041	125048	25 %	25 %	25 %	25 %	116493698
1989	NC_008526	CGC	2	6	125097	125102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493698
1990	NC_008526	ACA	2	6	125134	125139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493698
1991	NC_008526	CGC	2	6	125163	125168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493698
1992	NC_008526	ATG	2	6	125206	125211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493698
1993	NC_008526	TGC	2	6	125258	125263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493698
1994	NC_008526	GCCA	2	8	125279	125286	25 %	0 %	25 %	50 %	116493698
1995	NC_008526	AGC	3	9	125308	125316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493698
1996	NC_008526	TGTGT	2	10	125393	125402	0 %	60 %	40 %	0 %	116493698
1997	NC_008526	CG	3	6	125408	125413	0 %	0 %	50 %	50 %	116493698
1998	NC_008526	GATGGG	2	12	125435	125446	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116493698
1999	NC_008526	TGAT	2	8	125506	125513	25 %	50 %	25 %	0 %	116493698
2000	NC_008526	TGG	2	6	125575	125580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493698

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