MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008526	ATTAC	2	10	326146	326155	40 %	40 %	0 %	20 %	116493892
5002	NC_008526	TGAT	2	8	326176	326183	25 %	50 %	25 %	0 %	116493892
5003	NC_008526	AAG	2	6	326262	326267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493892
5004	NC_008526	ATC	2	6	326337	326342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493892
5005	NC_008526	CGAT	2	8	326356	326363	25 %	25 %	25 %	25 %	116493892
5006	NC_008526	ATT	2	6	326365	326370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493892
5007	NC_008526	TCA	2	6	326404	326409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493892
5008	NC_008526	CAA	2	6	326439	326444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493892
5009	NC_008526	AGA	2	6	326582	326587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493893
5010	NC_008526	TCA	2	6	326637	326642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493893
5011	NC_008526	ACGG	2	8	326654	326661	25 %	0 %	50 %	25 %	116493893
5012	NC_008526	CAT	2	6	326663	326668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493893
5013	NC_008526	CGG	2	6	326674	326679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493893
5014	NC_008526	TTG	2	6	326749	326754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493893
5015	NC_008526	AAC	2	6	326819	326824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493893
5016	NC_008526	TAT	2	6	327101	327106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493894
5017	NC_008526	CTG	2	6	327216	327221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493894
5018	NC_008526	TAT	2	6	327232	327237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493894
5019	NC_008526	CAG	2	6	327238	327243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493894
5020	NC_008526	ATT	2	6	327252	327257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493894
5021	NC_008526	GAAAT	2	10	327370	327379	60 %	20 %	20 %	0 %	116493894
5022	NC_008526	AT	3	6	327443	327448	50 %	50 %	0 %	0 %	116493894
5023	NC_008526	TGT	2	6	327469	327474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493894
5024	NC_008526	CGG	2	6	327497	327502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493894
5025	NC_008526	GCCA	2	8	327578	327585	25 %	0 %	25 %	50 %	116493894
5026	NC_008526	TC	3	6	327767	327772	0 %	50 %	0 %	50 %	116493894
5027	NC_008526	TGT	2	6	327779	327784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493894
5028	NC_008526	ATT	2	6	327794	327799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493894
5029	NC_008526	ATG	2	6	327876	327881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493894
5030	NC_008526	TAAC	2	8	328135	328142	50 %	25 %	0 %	25 %	116493894
5031	NC_008526	TTC	2	6	328143	328148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493894
5032	NC_008526	CGG	2	6	328184	328189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493894
5033	NC_008526	CCG	2	6	328190	328195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493894
5034	NC_008526	CAT	2	6	328202	328207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493894
5035	NC_008526	GGC	2	6	328209	328214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493894
5036	NC_008526	TCA	2	6	328231	328236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493894
5037	NC_008526	TTG	2	6	328239	328244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493894
5038	NC_008526	GCT	2	6	328250	328255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493894
5039	NC_008526	AAAG	2	8	328369	328376	75 %	0 %	25 %	0 %	116493894
5040	NC_008526	TTTA	2	8	328398	328405	25 %	75 %	0 %	0 %	116493895
5041	NC_008526	AAAG	2	8	328407	328414	75 %	0 %	25 %	0 %	116493895
5042	NC_008526	CAAT	2	8	328452	328459	50 %	25 %	0 %	25 %	116493895
5043	NC_008526	GCT	3	9	328477	328485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493895
5044	NC_008526	A	6	6	328492	328497	100 %	0 %	0 %	0 %	116493895
5045	NC_008526	GGC	2	6	328500	328505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493895
5046	NC_008526	GAC	2	6	328509	328514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493895
5047	NC_008526	GAT	2	6	328534	328539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493895
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5049	NC_008526	ATG	2	6	328721	328726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493895
5050	NC_008526	GTT	2	6	328802	328807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493895
5051	NC_008526	CTA	2	6	328826	328831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493896
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5053	NC_008526	GAA	2	6	329004	329009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493896
5054	NC_008526	TTG	2	6	329012	329017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493896
5055	NC_008526	AAG	2	6	329099	329104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493896
5056	NC_008526	GAA	2	6	329251	329256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493896
5057	NC_008526	AAGG	2	8	329269	329276	50 %	0 %	50 %	0 %	116493896
5058	NC_008526	CAA	2	6	329293	329298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493896
5059	NC_008526	CTT	2	6	329307	329312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493896
5060	NC_008526	CAC	2	6	329356	329361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493896
5061	NC_008526	TCAAA	2	10	329369	329378	60 %	20 %	0 %	20 %	116493896
5062	NC_008526	GAA	2	6	329404	329409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493896
5063	NC_008526	CGG	2	6	329445	329450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493896
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5066	NC_008526	GTTG	2	8	329530	329537	0 %	50 %	50 %	0 %	116493896
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5070	NC_008526	ATG	2	6	329805	329810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493897
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5073	NC_008526	TAC	2	6	330009	330014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493897
5074	NC_008526	ATC	2	6	330229	330234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493897
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5077	NC_008526	GCAA	2	8	330916	330923	50 %	0 %	25 %	25 %	116493898
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5089	NC_008526	GCA	3	9	331474	331482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493898
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5094	NC_008526	TAT	2	6	331693	331698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493899
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5109	NC_008526	AGCAT	2	10	332419	332428	40 %	20 %	20 %	20 %	116493899
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5242	NC_008526	GAC	2	6	344202	344207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493911
5243	NC_008526	GAT	2	6	344254	344259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493911
5244	NC_008526	ATC	2	6	344317	344322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493911
5245	NC_008526	ATA	2	6	344378	344383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493911
5246	NC_008526	CGCA	2	8	344455	344462	25 %	0 %	25 %	50 %	116493911
5247	NC_008526	ACA	2	6	344484	344489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493911
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5251	NC_008526	CGA	2	6	344626	344631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493911
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5263	NC_008526	T	6	6	345176	345181	0 %	100 %	0 %	0 %	116493912
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5295	NC_008526	TTGA	2	8	347807	347814	25 %	50 %	25 %	0 %	116493916
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5350	NC_008526	CGAT	2	8	350503	350510	25 %	25 %	25 %	25 %	116493917
5351	NC_008526	GATTT	2	10	350650	350659	20 %	60 %	20 %	0 %	116493917
5352	NC_008526	GAA	2	6	350720	350725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493917
5353	NC_008526	A	6	6	350724	350729	100 %	0 %	0 %	0 %	116493917
5354	NC_008526	CGTCAG	2	12	351108	351119	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116493917
5355	NC_008526	TTC	2	6	351166	351171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493917
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5357	NC_008526	GAC	2	6	351254	351259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493917
5358	NC_008526	AAG	2	6	351273	351278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493917
5359	NC_008526	TGC	2	6	351686	351691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493917
5360	NC_008526	CCATT	2	10	351724	351733	20 %	40 %	0 %	40 %	116493917
5361	NC_008526	ATG	2	6	351763	351768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493917
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5474	NC_008526	CA	3	6	361624	361629	50 %	0 %	0 %	50 %	116493928
5475	NC_008526	CAACC	2	10	361654	361663	40 %	0 %	0 %	60 %	116493928
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5483	NC_008526	GTC	2	6	362053	362058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493928
5484	NC_008526	TGA	2	6	362133	362138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493928
5485	NC_008526	GGC	2	6	362177	362182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493928
5486	NC_008526	TCA	2	6	362187	362192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493928
5487	NC_008526	GTTTG	2	10	362226	362235	0 %	60 %	40 %	0 %	116493928
5488	NC_008526	AGG	2	6	362255	362260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493928
5489	NC_008526	ATG	2	6	362327	362332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493928
5490	NC_008526	GAA	2	6	362343	362348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493928
5491	NC_008526	CGC	2	6	362451	362456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493928
5492	NC_008526	TCA	2	6	362504	362509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493928
5493	NC_008526	CTT	2	6	362553	362558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493928
5494	NC_008526	CA	3	6	362941	362946	50 %	0 %	0 %	50 %	116493929
5495	NC_008526	AGCCA	2	10	362986	362995	40 %	0 %	20 %	40 %	116493929
5496	NC_008526	AGA	2	6	363024	363029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493929
5497	NC_008526	GGT	2	6	363141	363146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493929
5498	NC_008526	GCT	2	6	363159	363164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493929
5499	NC_008526	TGG	2	6	363262	363267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493929
5500	NC_008526	CTA	2	6	363425	363430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493929

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