MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 4440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008511	ACAT	2	8	234844	234851	50 %	25 %	0 %	25 %	116332626
3502	NC_008511	GAC	2	6	235019	235024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332626
3503	NC_008511	T	6	6	235025	235030	0 %	100 %	0 %	0 %	116332626
3504	NC_008511	GGTTC	2	10	235085	235094	0 %	40 %	40 %	20 %	116332626
3505	NC_008511	TGTT	2	8	235119	235126	0 %	75 %	25 %	0 %	116332626
3506	NC_008511	CTT	2	6	235184	235189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332626
3507	NC_008511	GAAC	2	8	235246	235253	50 %	0 %	25 %	25 %	116332626
3508	NC_008511	TTC	2	6	235260	235265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332626
3509	NC_008511	CTT	2	6	235266	235271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332626
3510	NC_008511	TG	3	6	235333	235338	0 %	50 %	50 %	0 %	116332626
3511	NC_008511	GATC	2	8	235343	235350	25 %	25 %	25 %	25 %	116332626
3512	NC_008511	TCGGAA	2	12	235366	235377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116332626
3513	NC_008511	CTT	2	6	235451	235456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332626
3514	NC_008511	AGA	2	6	235500	235505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332626
3515	NC_008511	GA	3	6	235563	235568	50 %	0 %	50 %	0 %	116332626
3516	NC_008511	TGA	2	6	235573	235578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332626
3517	NC_008511	AGAAT	2	10	235582	235591	60 %	20 %	20 %	0 %	116332626
3518	NC_008511	GAAAA	2	10	235611	235620	80 %	0 %	20 %	0 %	116332626
3519	NC_008511	TGA	2	6	235629	235634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332626
3520	NC_008511	ACGC	2	8	235700	235707	25 %	0 %	25 %	50 %	116332626
3521	NC_008511	AG	3	6	235712	235717	50 %	0 %	50 %	0 %	116332626
3522	NC_008511	GCCA	2	8	235774	235781	25 %	0 %	25 %	50 %	116332626
3523	NC_008511	TTC	2	6	235839	235844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332626
3524	NC_008511	TTC	2	6	235860	235865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332626
3525	NC_008511	AT	3	6	235970	235975	50 %	50 %	0 %	0 %	116332627
3526	NC_008511	GAA	2	6	236021	236026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332627
3527	NC_008511	CAAA	2	8	236061	236068	75 %	0 %	0 %	25 %	116332627
3528	NC_008511	TTC	2	6	236079	236084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332627
3529	NC_008511	AAAG	2	8	236113	236120	75 %	0 %	25 %	0 %	116332627
3530	NC_008511	TCC	2	6	236137	236142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332627
3531	NC_008511	A	7	7	236271	236277	100 %	0 %	0 %	0 %	116332627
3532	NC_008511	ATA	2	6	236863	236868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332628
3533	NC_008511	TTC	2	6	236925	236930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332628
3534	NC_008511	TAT	2	6	236951	236956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332628
3535	NC_008511	CAA	2	6	237023	237028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332628
3536	NC_008511	CAA	2	6	237031	237036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332628
3537	NC_008511	A	7	7	237035	237041	100 %	0 %	0 %	0 %	116332628
3538	NC_008511	GAA	2	6	237097	237102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332628
3539	NC_008511	GAA	2	6	237152	237157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332628
3540	NC_008511	A	6	6	237167	237172	100 %	0 %	0 %	0 %	116332628
3541	NC_008511	GAA	2	6	237223	237228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332628
3542	NC_008511	T	6	6	237232	237237	0 %	100 %	0 %	0 %	116332628
3543	NC_008511	AAT	2	6	237251	237256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332628
3544	NC_008511	T	6	6	237620	237625	0 %	100 %	0 %	0 %	116332629
3545	NC_008511	ACAT	2	8	237688	237695	50 %	25 %	0 %	25 %	116332629
3546	NC_008511	TTC	2	6	237809	237814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332629
3547	NC_008511	T	6	6	237890	237895	0 %	100 %	0 %	0 %	116332629
3548	NC_008511	T	6	6	237961	237966	0 %	100 %	0 %	0 %	116332630
3549	NC_008511	GGA	2	6	237967	237972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332630
3550	NC_008511	CTT	2	6	238134	238139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332630
3551	NC_008511	TTCG	2	8	238202	238209	0 %	50 %	25 %	25 %	116332630
3552	NC_008511	GAC	2	6	238221	238226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332630
3553	NC_008511	GT	3	6	238272	238277	0 %	50 %	50 %	0 %	116332630
3554	NC_008511	T	7	7	238373	238379	0 %	100 %	0 %	0 %	116332630
3555	NC_008511	TCA	2	6	238389	238394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332630
3556	NC_008511	T	9	9	238506	238514	0 %	100 %	0 %	0 %	116332630
3557	NC_008511	TTTG	2	8	238587	238594	0 %	75 %	25 %	0 %	116332630
3558	NC_008511	AT	3	6	238644	238649	50 %	50 %	0 %	0 %	116332630
3559	NC_008511	TTCCA	2	10	238703	238712	20 %	40 %	0 %	40 %	116332630
3560	NC_008511	TAA	2	6	238791	238796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332630
3561	NC_008511	T	7	7	238828	238834	0 %	100 %	0 %	0 %	116332630
3562	NC_008511	CAT	2	6	238867	238872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332630
3563	NC_008511	TC	3	6	238910	238915	0 %	50 %	0 %	50 %	116332630
3564	NC_008511	TCCGAA	2	12	239080	239091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116332630
3565	NC_008511	ATCC	2	8	239123	239130	25 %	25 %	0 %	50 %	116332630
3566	NC_008511	TTCA	2	8	239140	239147	25 %	50 %	0 %	25 %	116332630
3567	NC_008511	A	6	6	239228	239233	100 %	0 %	0 %	0 %	116332630
3568	NC_008511	TCC	2	6	239281	239286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332630
3569	NC_008511	A	6	6	239287	239292	100 %	0 %	0 %	0 %	116332630
3570	NC_008511	TTC	2	6	239346	239351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332630
3571	NC_008511	CCTT	2	8	239359	239366	0 %	50 %	0 %	50 %	116332630
3572	NC_008511	TGA	2	6	239369	239374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332630
3573	NC_008511	TCC	2	6	239455	239460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332630
3574	NC_008511	CA	3	6	239474	239479	50 %	0 %	0 %	50 %	116332630
3575	NC_008511	TTCT	2	8	239535	239542	0 %	75 %	0 %	25 %	116332630
3576	NC_008511	CAA	2	6	239688	239693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332630
3577	NC_008511	TG	3	6	239738	239743	0 %	50 %	50 %	0 %	116332630
3578	NC_008511	AAT	2	6	239846	239851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332630
3579	NC_008511	ATA	2	6	239858	239863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332630
3580	NC_008511	GAATT	2	10	240002	240011	40 %	40 %	20 %	0 %	116332631
3581	NC_008511	AAT	2	6	240040	240045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332631
3582	NC_008511	AG	3	6	240087	240092	50 %	0 %	50 %	0 %	116332631
3583	NC_008511	AG	3	6	240151	240156	50 %	0 %	50 %	0 %	116332631
3584	NC_008511	T	6	6	240170	240175	0 %	100 %	0 %	0 %	116332631
3585	NC_008511	T	10	10	240186	240195	0 %	100 %	0 %	0 %	116332631
3586	NC_008511	CT	3	6	240253	240258	0 %	50 %	0 %	50 %	116332631
3587	NC_008511	CCTTC	2	10	240264	240273	0 %	40 %	0 %	60 %	116332631
3588	NC_008511	CTC	2	6	240298	240303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332631
3589	NC_008511	ACT	2	6	240321	240326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332631
3590	NC_008511	GTCG	2	8	240332	240339	0 %	25 %	50 %	25 %	116332631
3591	NC_008511	GAA	2	6	240358	240363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332631
3592	NC_008511	CTC	2	6	240382	240387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332631
3593	NC_008511	TCCA	2	8	240404	240411	25 %	25 %	0 %	50 %	116332631
3594	NC_008511	GAA	2	6	240444	240449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332631
3595	NC_008511	A	6	6	240485	240490	100 %	0 %	0 %	0 %	116332631
3596	NC_008511	TCGG	2	8	240534	240541	0 %	25 %	50 %	25 %	116332631
3597	NC_008511	TTCT	2	8	240543	240550	0 %	75 %	0 %	25 %	116332631
3598	NC_008511	AAGT	2	8	240578	240585	50 %	25 %	25 %	0 %	116332631
3599	NC_008511	CGT	2	6	240596	240601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332631
3600	NC_008511	CTA	2	6	240637	240642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332631
3601	NC_008511	T	6	6	240671	240676	0 %	100 %	0 %	0 %	116332631
3602	NC_008511	CATT	2	8	240715	240722	25 %	50 %	0 %	25 %	116332631
3603	NC_008511	TCGCGG	2	12	240733	240744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116332631
3604	NC_008511	GAT	2	6	240770	240775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332631
3605	NC_008511	TGAAT	2	10	240784	240793	40 %	40 %	20 %	0 %	116332631
3606	NC_008511	GAA	2	6	240808	240813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332631
3607	NC_008511	CTC	3	9	240838	240846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332631
3608	NC_008511	TGC	2	6	241749	241754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332632
3609	NC_008511	CAA	2	6	241757	241762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332632
3610	NC_008511	TCC	2	6	241770	241775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332632
3611	NC_008511	GAA	2	6	242056	242061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332632
3612	NC_008511	GCC	2	6	242076	242081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332632
3613	NC_008511	GAA	2	6	242082	242087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332632
3614	NC_008511	GTC	2	6	242103	242108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332632
3615	NC_008511	TTTC	2	8	242125	242132	0 %	75 %	0 %	25 %	116332632
3616	NC_008511	GCC	2	6	242166	242171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332632
3617	NC_008511	ATA	2	6	242185	242190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332632
3618	NC_008511	AAG	2	6	242198	242203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332632
3619	NC_008511	GATCG	2	10	242244	242253	20 %	20 %	40 %	20 %	116332632
3620	NC_008511	GGA	2	6	242272	242277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332632
3621	NC_008511	GAT	2	6	242288	242293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332632
3622	NC_008511	TCA	2	6	242297	242302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332632
3623	NC_008511	GTA	2	6	242358	242363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332632
3624	NC_008511	GAC	2	6	242484	242489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332632
3625	NC_008511	TCC	2	6	242502	242507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332632
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3750	NC_008511	ATGGGA	2	12	254363	254374	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116332641
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3763	NC_008511	GAA	2	6	255360	255365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332642
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3864	NC_008511	T	6	6	260884	260889	0 %	100 %	0 %	0 %	116332649
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3869	NC_008511	GAATC	2	10	261029	261038	40 %	20 %	20 %	20 %	116332649
3870	NC_008511	CAT	2	6	261044	261049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332649
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3902	NC_008511	ATC	2	6	264743	264748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332652
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3917	NC_008511	TACG	2	8	265628	265635	25 %	25 %	25 %	25 %	116332653
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3989	NC_008511	CAA	2	6	269774	269779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332656
3990	NC_008511	ATCG	2	8	269818	269825	25 %	25 %	25 %	25 %	116332656
3991	NC_008511	CAT	2	6	269873	269878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332656
3992	NC_008511	A	6	6	269934	269939	100 %	0 %	0 %	0 %	116332656
3993	NC_008511	T	6	6	270014	270019	0 %	100 %	0 %	0 %	116332656
3994	NC_008511	CTC	2	6	270134	270139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332656
3995	NC_008511	T	7	7	270151	270157	0 %	100 %	0 %	0 %	116332656
3996	NC_008511	ATCGGA	2	12	270180	270191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116332656
3997	NC_008511	CGG	2	6	270227	270232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332656
3998	NC_008511	TTC	2	6	270268	270273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332656
3999	NC_008511	TCC	2	6	270288	270293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332656
4000	NC_008511	GTT	2	6	270358	270363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332656

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