MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 4440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008511	GCCT	2	8	136361	136368	0 %	25 %	25 %	50 %	116332551
2002	NC_008511	AAC	2	6	136418	136423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332551
2003	NC_008511	ACA	2	6	136425	136430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332551
2004	NC_008511	TTGTT	2	10	136433	136442	0 %	80 %	20 %	0 %	116332551
2005	NC_008511	CGG	2	6	136450	136455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332551
2006	NC_008511	A	7	7	136472	136478	100 %	0 %	0 %	0 %	116332551
2007	NC_008511	TC	3	6	136479	136484	0 %	50 %	0 %	50 %	116332551
2008	NC_008511	TCGGAG	2	12	136501	136512	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116332551
2009	NC_008511	ATCG	2	8	136592	136599	25 %	25 %	25 %	25 %	116332551
2010	NC_008511	ATC	2	6	136601	136606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332551
2011	NC_008511	CGGGAG	2	12	136648	136659	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116332551
2012	NC_008511	CCG	2	6	136668	136673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332551
2013	NC_008511	G	6	6	136682	136687	0 %	0 %	100 %	0 %	116332551
2014	NC_008511	TCT	2	6	136692	136697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332551
2015	NC_008511	CGAAT	2	10	136834	136843	40 %	20 %	20 %	20 %	116332551
2016	NC_008511	AGA	2	6	136979	136984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332552
2017	NC_008511	GCC	2	6	137139	137144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332552
2018	NC_008511	TTGATG	2	12	137160	137171	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116332552
2019	NC_008511	T	7	7	137177	137183	0 %	100 %	0 %	0 %	116332552
2020	NC_008511	AAG	2	6	137184	137189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332552
2021	NC_008511	CCA	2	6	137233	137238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116332552
2022	NC_008511	ATATTA	2	12	137247	137258	50 %	50 %	0 %	0 %	116332552
2023	NC_008511	TCT	2	6	137265	137270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332552
2024	NC_008511	GGAG	2	8	137279	137286	25 %	0 %	75 %	0 %	116332552
2025	NC_008511	GCG	2	6	137449	137454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332553
2026	NC_008511	AAG	2	6	137460	137465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332553
2027	NC_008511	CTT	2	6	137648	137653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332553
2028	NC_008511	AT	4	8	137718	137725	50 %	50 %	0 %	0 %	116332553
2029	NC_008511	TTCT	2	8	137843	137850	0 %	75 %	0 %	25 %	116332553
2030	NC_008511	CA	3	6	138034	138039	50 %	0 %	0 %	50 %	116332554
2031	NC_008511	TAC	2	6	138212	138217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332554
2032	NC_008511	GCT	2	6	138328	138333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332554
2033	NC_008511	T	6	6	138401	138406	0 %	100 %	0 %	0 %	116332554
2034	NC_008511	TTCG	2	8	138432	138439	0 %	50 %	25 %	25 %	116332554
2035	NC_008511	ACC	2	6	138564	138569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116332555
2036	NC_008511	TAATG	2	10	138578	138587	40 %	40 %	20 %	0 %	116332555
2037	NC_008511	AGA	2	6	138620	138625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332555
2038	NC_008511	GAA	2	6	138692	138697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332555
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2040	NC_008511	TAAG	2	8	138902	138909	50 %	25 %	25 %	0 %	116332555
2041	NC_008511	TGA	2	6	138964	138969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332555
2042	NC_008511	GAGC	2	8	139021	139028	25 %	0 %	50 %	25 %	116332555
2043	NC_008511	TCCGG	2	10	139038	139047	0 %	20 %	40 %	40 %	116332555
2044	NC_008511	ATC	2	6	139136	139141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332555
2045	NC_008511	ATT	2	6	139205	139210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332555
2046	NC_008511	AAT	2	6	139213	139218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332555
2047	NC_008511	CTC	2	6	139381	139386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332555
2048	NC_008511	CTT	2	6	139513	139518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332555
2049	NC_008511	CCG	2	6	139611	139616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332555
2050	NC_008511	AATTT	2	10	139617	139626	40 %	60 %	0 %	0 %	116332555
2051	NC_008511	TCG	2	6	139630	139635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332555
2052	NC_008511	GTA	2	6	139646	139651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332555
2053	NC_008511	ATT	2	6	139727	139732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332555
2054	NC_008511	CGCT	2	8	139861	139868	0 %	25 %	25 %	50 %	116332555
2055	NC_008511	TTTTG	2	10	139869	139878	0 %	80 %	20 %	0 %	116332555
2056	NC_008511	GGA	2	6	140073	140078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332555
2057	NC_008511	GGC	2	6	140318	140323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332555
2058	NC_008511	AG	3	6	140326	140331	50 %	0 %	50 %	0 %	116332555
2059	NC_008511	A	6	6	140337	140342	100 %	0 %	0 %	0 %	116332555
2060	NC_008511	TTCGAT	2	12	140375	140386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116332555
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2062	NC_008511	GTT	2	6	140402	140407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332555
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2065	NC_008511	AGT	2	6	140560	140565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332555
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2067	NC_008511	TCGA	2	8	140616	140623	25 %	25 %	25 %	25 %	116332555
2068	NC_008511	GTT	2	6	140695	140700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332555
2069	NC_008511	TTGA	2	8	140721	140728	25 %	50 %	25 %	0 %	116332555
2070	NC_008511	CCG	2	6	140742	140747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332555
2071	NC_008511	TGG	2	6	140755	140760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116332555
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2073	NC_008511	TAC	2	6	140962	140967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332555
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2079	NC_008511	TA	3	6	141174	141179	50 %	50 %	0 %	0 %	116332556
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2088	NC_008511	ACATG	2	10	141738	141747	40 %	20 %	20 %	20 %	116332557
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2090	NC_008511	A	6	6	141865	141870	100 %	0 %	0 %	0 %	116332557
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2092	NC_008511	GAAAA	2	10	142139	142148	80 %	0 %	20 %	0 %	116332558
2093	NC_008511	TAC	2	6	142217	142222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332558
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2095	NC_008511	GAA	2	6	142362	142367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332558
2096	NC_008511	A	6	6	142397	142402	100 %	0 %	0 %	0 %	116332558
2097	NC_008511	AAAG	2	8	142404	142411	75 %	0 %	25 %	0 %	116332558
2098	NC_008511	CTGAT	2	10	143037	143046	20 %	40 %	20 %	20 %	116332559
2099	NC_008511	GGC	2	6	143047	143052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332559
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2101	NC_008511	AG	3	6	143247	143252	50 %	0 %	50 %	0 %	116332559
2102	NC_008511	ATCC	2	8	143274	143281	25 %	25 %	0 %	50 %	116332559
2103	NC_008511	A	7	7	143297	143303	100 %	0 %	0 %	0 %	116332559
2104	NC_008511	CTTGT	2	10	143343	143352	0 %	60 %	20 %	20 %	116332559
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2108	NC_008511	AGAT	2	8	143547	143554	50 %	25 %	25 %	0 %	116332559
2109	NC_008511	CTC	2	6	143578	143583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332559
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2111	NC_008511	T	7	7	143717	143723	0 %	100 %	0 %	0 %	116332559
2112	NC_008511	GA	3	6	143728	143733	50 %	0 %	50 %	0 %	116332559
2113	NC_008511	T	6	6	143842	143847	0 %	100 %	0 %	0 %	116332559
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2124	NC_008511	GGC	2	6	144324	144329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332560
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2126	NC_008511	TCT	2	6	144520	144525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332560
2127	NC_008511	GGA	2	6	144531	144536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332560
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2235	NC_008511	TTATC	2	10	149785	149794	20 %	60 %	0 %	20 %	116332563
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2242	NC_008511	GAA	2	6	150124	150129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332564
2243	NC_008511	TTA	2	6	150149	150154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332564
2244	NC_008511	AAC	2	6	150200	150205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332564
2245	NC_008511	TGA	2	6	150248	150253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332564
2246	NC_008511	TTTC	2	8	150341	150348	0 %	75 %	0 %	25 %	116332564
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2497	NC_008511	AGAGA	2	10	171091	171100	60 %	0 %	40 %	0 %	116332578
2498	NC_008511	TCA	3	9	171103	171111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332578
2499	NC_008511	TCC	2	6	171206	171211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332578
2500	NC_008511	GGC	2	6	171227	171232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332578

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