MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 4440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008511	ATT	2	6	27825	27830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332470
502	NC_008511	TAA	2	6	27851	27856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332470
503	NC_008511	CTT	2	6	27857	27862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332470
504	NC_008511	GCG	2	6	27867	27872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332470
505	NC_008511	ATA	2	6	27894	27899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332470
506	NC_008511	TTG	2	6	27908	27913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332470
507	NC_008511	TC	3	6	27985	27990	0 %	50 %	0 %	50 %	116332470
508	NC_008511	TGT	2	6	28000	28005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332470
509	NC_008511	A	6	6	28039	28044	100 %	0 %	0 %	0 %	116332470
510	NC_008511	CT	3	6	28089	28094	0 %	50 %	0 %	50 %	116332470
511	NC_008511	TAG	2	6	28134	28139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332470
512	NC_008511	T	6	6	28166	28171	0 %	100 %	0 %	0 %	116332470
513	NC_008511	CAA	2	6	28211	28216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332470
514	NC_008511	AGA	2	6	28217	28222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332470
515	NC_008511	T	8	8	28238	28245	0 %	100 %	0 %	0 %	116332470
516	NC_008511	TTA	2	6	28289	28294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332470
517	NC_008511	TCC	2	6	28327	28332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332470
518	NC_008511	CAA	2	6	28457	28462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332470
519	NC_008511	GAT	2	6	28574	28579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332470
520	NC_008511	T	6	6	29796	29801	0 %	100 %	0 %	0 %	116332471
521	NC_008511	GAA	2	6	29802	29807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332471
522	NC_008511	A	6	6	29827	29832	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
523	NC_008511	AGGA	2	8	29848	29855	50 %	0 %	50 %	0 %	116332471
524	NC_008511	TGGA	2	8	29950	29957	25 %	25 %	50 %	0 %	116332471
525	NC_008511	A	7	7	29960	29966	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
526	NC_008511	AAAT	2	8	30003	30010	75 %	25 %	0 %	0 %	116332471
527	NC_008511	AAAGAA	2	12	30048	30059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116332471
528	NC_008511	AAAC	2	8	30060	30067	75 %	0 %	0 %	25 %	116332471
529	NC_008511	A	6	6	30081	30086	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
530	NC_008511	AGA	2	6	30097	30102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332471
531	NC_008511	GAC	2	6	30136	30141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332471
532	NC_008511	TTC	2	6	30208	30213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332471
533	NC_008511	A	6	6	30224	30229	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
534	NC_008511	GAA	2	6	30274	30279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332471
535	NC_008511	A	7	7	30278	30284	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
536	NC_008511	TCGA	2	8	30308	30315	25 %	25 %	25 %	25 %	116332471
537	NC_008511	AAG	2	6	30320	30325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332471
538	NC_008511	A	6	6	30359	30364	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
539	NC_008511	A	8	8	30383	30390	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
540	NC_008511	T	6	6	30403	30408	0 %	100 %	0 %	0 %	116332471
541	NC_008511	AGGAA	2	10	30437	30446	60 %	0 %	40 %	0 %	116332471
542	NC_008511	AG	3	6	30468	30473	50 %	0 %	50 %	0 %	116332471
543	NC_008511	A	6	6	30569	30574	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
544	NC_008511	AAT	2	6	30621	30626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332471
545	NC_008511	A	7	7	30647	30653	100 %	0 %	0 %	0 %	116332471
546	NC_008511	GAA	2	6	30659	30664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332471
547	NC_008511	T	7	7	30841	30847	0 %	100 %	0 %	0 %	116332471
548	NC_008511	GGA	2	6	30850	30855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332471
549	NC_008511	AAG	2	6	30856	30861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332471
550	NC_008511	GT	3	6	30873	30878	0 %	50 %	50 %	0 %	116332471
551	NC_008511	AT	3	6	30918	30923	50 %	50 %	0 %	0 %	116332471
552	NC_008511	TAT	2	6	30925	30930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332471
553	NC_008511	GGA	2	6	31072	31077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332472
554	NC_008511	AAG	2	6	31088	31093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332472
555	NC_008511	ATGT	2	8	31111	31118	25 %	50 %	25 %	0 %	116332472
556	NC_008511	T	8	8	31142	31149	0 %	100 %	0 %	0 %	116332472
557	NC_008511	A	6	6	31155	31160	100 %	0 %	0 %	0 %	116332472
558	NC_008511	TGA	2	6	31181	31186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332472
559	NC_008511	T	7	7	31197	31203	0 %	100 %	0 %	0 %	116332472
560	NC_008511	GTT	2	6	31215	31220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332472
561	NC_008511	ACA	2	6	31290	31295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332472
562	NC_008511	CTT	2	6	31381	31386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332472
563	NC_008511	GAA	2	6	31399	31404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332472
564	NC_008511	AAG	3	9	31987	31995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332473
565	NC_008511	A	7	7	32006	32012	100 %	0 %	0 %	0 %	116332473
566	NC_008511	CGA	2	6	32017	32022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332473
567	NC_008511	CTT	2	6	32061	32066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332473
568	NC_008511	ACT	2	6	32165	32170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332473
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570	NC_008511	GGC	2	6	32251	32256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332473
571	NC_008511	CAAAAA	2	12	32270	32281	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116332473
572	NC_008511	TGC	2	6	32293	32298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332473
573	NC_008511	TTC	2	6	32302	32307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332473
574	NC_008511	CTT	2	6	32313	32318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332473
575	NC_008511	TTC	2	6	32347	32352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332473
576	NC_008511	GAG	2	6	32391	32396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332473
577	NC_008511	CGGTAA	2	12	32418	32429	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116332473
578	NC_008511	CAA	2	6	32458	32463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332473
579	NC_008511	AT	3	6	32516	32521	50 %	50 %	0 %	0 %	116332473
580	NC_008511	AAAAC	2	10	32652	32661	80 %	0 %	0 %	20 %	116332474
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582	NC_008511	AGAAA	2	10	32756	32765	80 %	0 %	20 %	0 %	116332474
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587	NC_008511	A	6	6	33031	33036	100 %	0 %	0 %	0 %	116332474
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590	NC_008511	A	6	6	33142	33147	100 %	0 %	0 %	0 %	116332474
591	NC_008511	GAAAA	2	10	33202	33211	80 %	0 %	20 %	0 %	116332475
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594	NC_008511	A	6	6	33254	33259	100 %	0 %	0 %	0 %	116332475
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598	NC_008511	TAT	2	6	33464	33469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332475
599	NC_008511	CAA	2	6	33480	33485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332475
600	NC_008511	CGG	2	6	33507	33512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332475
601	NC_008511	GTT	2	6	33650	33655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332475
602	NC_008511	CT	3	6	33660	33665	0 %	50 %	0 %	50 %	116332475
603	NC_008511	ATC	2	6	33677	33682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332475
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605	NC_008511	CGAT	2	8	33762	33769	25 %	25 %	25 %	25 %	116332475
606	NC_008511	TTAC	2	8	33812	33819	25 %	50 %	0 %	25 %	116332475
607	NC_008511	CTT	2	6	33831	33836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332475
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609	NC_008511	GAA	2	6	33932	33937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332475
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612	NC_008511	CAA	2	6	34154	34159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332475
613	NC_008511	GAA	2	6	34195	34200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332475
614	NC_008511	GGTT	2	8	34307	34314	0 %	50 %	50 %	0 %	116332475
615	NC_008511	TCA	2	6	34374	34379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332475
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618	NC_008511	GTA	2	6	34756	34761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332476
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620	NC_008511	AG	3	6	34798	34803	50 %	0 %	50 %	0 %	116332476
621	NC_008511	A	6	6	34815	34820	100 %	0 %	0 %	0 %	116332476
622	NC_008511	TCA	2	6	34825	34830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332476
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628	NC_008511	TCT	2	6	35510	35515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332477
629	NC_008511	CCGA	2	8	35586	35593	25 %	0 %	25 %	50 %	116332477
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